Cycle cellulaire 2, apoptose et mitochondries Flashcards
Quelle est la différence entre l’Activité de l’APC et du complexe SCF
APC: activé au début de la phase M et reste actif en phase G1
SCF: activé à la fin de la phase G1 jusqu’à la phase S et G2
Quelle enzyme post-traductionnelle vient en action lors de l’APC et le complèxe SCF
ubiquitine ligase
Quelle est la différence entre le complexe APC et le complèxe SCF par rapport aux étapes du cycle cellulaire
APC: durant la mitose
SCF: durant la phase S
Quelles sont les deux sous-unités du complèxe SCF et APC
catalytique
de spécifité de substrat
Quelles substrats sont reconnues par le complèxe SCF (2)
Cycline G1
Cycline G1/S
Quelles substrats sont reconnues par le complèxe APC (2)
Cycline-M
Sécurine
Est ce que la dégradation des substrats des complexes SCF et APC se font en même temps
Non
Quels points de contrôle retrouvons-nous a la phase G1 et S
ADN endommangé
Adn endommagé ou incomplètement répliqué
Quelle point de controle retrouvons nous a la transition metaphase-anaphase
chromosome mal attaché au fuseau mitotique
Acronyme pour une réponse au dommage à l’ADN
DDR
Qu’est ce qui peut endommager une protéine
rayon X
Étapes de la réponse au dommage de l’ADN (avant de rentrer dans le cycle S)
- Cellule reconnait dommage à l’ADN et active deux protéines kinases: ATM et ATR
- Atm et ATR phosphorylisent histone yH2AX et p53
- p53 est stabilisé par la phosphorylation et s’active
- p53 transcrit le gène p21 de l’ADN qui est transcrit et traduit en p21
- p21 inhibe l’activité de la Cdk-G1/S et Cdk/S
- le cycle cellulaire est bloqué avant de rentré dans la phase S
Pourquoi est-ce que la p53 est activé par phosphorylation
Car elle est normalement instable (produite et dégradé dans la cellule continuellement) avant sa phosphorylation
À part la p53, quelle autre protéine est phosphorylée et quelle est son action
histone yH2AX
recrutement de protéines de réparation à l’ADN au site de dommage
Que se passe il lorsque l’ADN est réparer (DDR)
p53 et p21 sont dégradés
Cdk-G1/S et Cdk-S activés
(phase S recommence)
Après réparation de l’ADN, qu’est ce qui dégrade p53 et p21
Complexe SCF et protéosomes par ubiquitynation
Qu’est ce qui s’assure que l’ADN n’est répliqué qu’une seule fois
Cdk-S
Qu’est ce qui déclanche la phase S
Cdk-S
Qu’est ce que la Cdc6
protéine importante de la réplication de l’ADN nécessaire pour l’activation de la réplication
Où se lie la Cdc6 dans la phase G1
sur un complexe de reconnaissance de l’origine se trouvant sur l’origine de réplication
Étapes du mode d’action de la Cdc6
- Cdk-S déclanche la phase S et initie la réplication
- Ceci phosphorylise la Cdc6 et la dégrade lors de la réplication
- Permet d’assembler la fourche de réplication
Rôle de la dégradation de la Cdc6 lors de la réplication de l’ADN dans la phase S
origine de réplication ne peut qu’initier la réplication une fois
3 mécanismes qui inhibent la Cdk
Dégradation de cycline (APC et SCF) Cdk-M et Cdk-G1 et CdkG1-S
Inhibition de cycline (ATM ATR) Cdk-G1/S et Cdk-S
Phosphorylation de Cdk-M
Que permet la phosphorylation des Cdk-M
Active et inhibe les Cdk-M dépendamment du phophate enlever dans la dernière étape
Quel phosphate doit être enlever par la phosphatase pour activer la Cdk
celle du site inhibiteur, soit mise par la kinase Wee 1
Quel phosphate doit être enlever par la phosphatase pour inhiber la Cdk
celle du site activateur, soit mise par la kinase Cak
Quel type de Cdk est activée/inhibée par phosphorylation
Cdk-M
Étapes de l’activation/inhibition de la Cdk-M par phosphorylation
1.Cdk-M inactive est phosphorylée par une kinase inhibitrice Wee 1 et une kinase activatrice Cak (donc ajout de deux phosphates) sur deux sites différents
2. Phosphatase activatrice enleve le phosphate inhibitrice (celle de Wee 1) et donc active la Cdk-M
OU
Phosphatase inhibitrice enleve le phosphate activateur (celle de Cak) et donc active la Cdk-M
Durant quelle partie du cycle se produit la phosphorylation de Cdk-M
Pendant la transition G2/M
Comment est-ce que la Cdk-M assure que la transition G2/M se fait comme un interrupteur
Cdk-M active son activateur, la phosphatase Cdc25 qui force une boucle de rétrocontrôle positif et renforce l’activation de Cdk-M
Quand est ce que la phosphatase Cdc25 (phosphatase activatrice) est plus performante
lorsqu’elle est phosphorylée par la Cdk-M
Que fait la Cdc25 pour activer d’avantage de Cdk-M lors du rétrocontrôle positif
élimine les groupements phosphate inhibiteurs (car phosphatase activatrice) de la sous-unité inhibitrice de la Cdk-M
Comment s’active le complexe Cdk-M avant l’entrée en mitose (2)
via phosphorylation par CAK et WEE 1 et déphosphorylation par Cdc25
Qu’est ce que la quiescence
Pause réversible régulée par des signaux qui arrive lorsque l’environnement de la transition G1/S n’est pas propice
Est-ce que la dégradation est réversible
Non
Où se trouve la quiescence
de G1/S
qu’est ce qu’un mitogène
signal qui stimule l’entrée dans le cycle cellulaire
Qu’est ce qui permet le frein de l’activation des gènes de la prolifération cellulaire
protéine Rétinoblastome (rb).
Que ce passe il lors de l’absence de mitogène
- Récepteur de mitogène inactif, car aucun mitogène
- Protéine Rb active inhibe la transcription du gène cible en se liant à la protéine régulatrice de transcription inactivée
Que ce passe il lors de présence d’un mitogène
- Récepteur de mitogène est activé
- Récepteur envoie un signal au Cdk-G1 et Cdk-G1/S de s’activer
- La protéine rb qui inhibait la transcription va être phosphorylée par les Cdk-G1 et CdkG1/S
- La protéine Rb est inactivée et le régulateur de transcription peut se lié à l’ADN
- Transcription et traduction du gène = prolifération cellulaire (entrée en S)
Lien entre Rb et p53 avec le cancer
sont des surpresseurs de tumeurs
pourquoi dit ont que rb et p53 sont des supresseurs de tumeurs
lorsque rb et p53 sont inactivés, il peut y avoir prolifération non-controlée
lorsque rb et p53 sont activés, ils agissent comme frein de la prolifération (quiescence et DDR)
Que ce passe il en absence de Rb
même lorsqu’il n’y a pas présence d’un mitogène, les régulateurs de transcription sont actifs et donc prolifération non-controlée
Qu’est ce qu’une mutation activatrice
Récepteur de mitogène active les gènes de la prolifération cellulaire sans mitogène
Pourquoi dit ont que les récepteurs sont des proto-oncogènes
Il peut subir une mutation activatrice et donc former des tumeurs cancéreuses
Lorsque le proto-oncogène est muté et provoque un cancer, on parle d’oncogène
Où s’arrête le cycle cellulaire si l’ADN est endommagé
G1
Que ce passe il si le dommage de l’ADN est très sévère
lie à la sénescence cellulaire en recrutant un inhibiteur plus fort (p16)
Qu’est ce que le p16
inhibiteur plus fort que le p21 qui bloque le cycle cellulaire de manière irréversible lorsque le dommage de l’ADN est beaucoup trop sévère
Qu’offre la sénescence cellulaire à court et long terme
Court: protection contre le cancer
Long: conséquences négatives (cancer, vieillissement tissulaire)
Vrai ou faux: la sénéscence cellulaire augmente avec le temps
oui, en vieillisant
Comment est-ce que les défauts des télomères (bout d’un chromosome) provoque la sénéscence cellulaire
Le telomère se raccourcit normalement à chaque division cellulaire
Si la cellule effectue plus de cycle cellulaire que normal, le télomère se raccourcit trop et active le DDR et sénéscence
Que développe la cellule sénescente
SASP
Que contient le SASP développé par la cellule sénescente
sécretions de cytokines pro-inflammatoires
3 effets du SASP sur le corps
peut induire la sénescence de d’autres cellules
recruter des cellules immunitaires pour promouvoir l’inflammation
modifier les tissus envoisinant
qu’est ce que l’apoptose
mécanisme essentiel du développement et du contrôle du nombre de cellules des tissus et qui protège contre le dommage
est ce que l’apoptose est un processus actif
oui
différence entre apoptose et nécrose
apoptose: mort cellulaire programmée par signal, normal
nécrose: incapacité des cellules de fournir de l’atp, pathologique
Où se trouve la phosphaltidylsérine lors de l’apoptose
feuillet externe (pour que l’élimination cellulaire apoptotique puisse être reconnue par les macrophages)
Que ce passe il au noyau et à la chromatine de la cellule lors de l’apoptose
chromatine condensée
noyau fragmentée
Que ce passe il aux phospholipides de la membrane plasmique de la cellule lors de l’apoptose
perte de l’asymétrie des phospholipides
Qu’est ce qu’un corps apoptotique
fragments de cellules lors de l’apoptose contenant du matériel nucléaire
Que ce passe il aux crops apoptotiques lors de l’apoptose
ils sont phagocytés
Que ce passe il au cytoplasme de la cellule lors de l’apoptose
boutons cytoplasmiques bourgeonnent à la membrane plasmique et se libèrent
2 voies qui induisent l’apoptose
intrinsèque (horloge interne, dommage ADN, perte d’intéractions ou signaux de survie)
extrinsèque (ligands/hormones)
Quelle protéine inhibe l’apoptose cellulaire
Bcl2
Est-ce que la bcl2 est proto-oncogène
oui, cellules csncéreuses peuvent l’exprimer pour contrôler
comment est ce que le développement du corps s’assure que toutes les connections neuronales appropriés sont faites
apoptose de la surproduction de neurones lors du développement
Quelle est la famille de protéase (dégradation) de suicide qui fait partie de l’apoptose cellulaire
caspases
forme inactive des caspases
pro-caspases
Comment s’active les caspases
Deux molécules de procaspases inactives sont clivées et associés pour former une molécule de caspase active
Après qu’une caspase soient activée, que fait elle
Elle clive et active d’autres pro-caspases dans une cascade
Quel est la première caspase de la cascade de caspases à être activée toujours
caspase-9
Que ce passe il lors de cette cascade de caspases
Les composantes de la cellule sont clivées (suicide cellulaire)
Si la caspase-9 est toujours la première à être formée, qu’est ce qui envoie le signal qui induit son activation
mitochondries
Étapes de l’activation de la caspase-9
- libération du cytochrome C des mitochondries
- cytochrome C se lie à une protéine adaptatrice et l’active
- plusieurs de ces complexes forme une structures qui recrute les procaspases-9 dans une structure nommé l’apoptosome
- procaspases 9 s’active dans l’apoptosome et devient caspase9, qui induit une cascade
Qu’est ce que l’apoptosome
structure formée des complexes cytochrome-C/protéine adaptatrice et des procaspases 9 pour permettre leur activation en caspase 9
Autre voie à part intrinsèque et extrinsèque qui peut induire l’apoptose
voie perforin et granzyme
Que ce passe il lors de l’apoptose par voie perforin et granzyne
Cellules T cytotoxiques reconnaissent une cellule cible et libèrent des vésicules contenant des perforin et granzyne
Rôle des perforin et granzyne
Protéine qui forme une pore dans la membrane plasmique de la cellule cible à travers laquelle les granzynes vont passer pour mener à l’apoptose cellule cible
Qu’est ce que la ferroptose
Autre mort cellulaire qui dépend du fer
Quelles voies implique la ferroptose
Implique des voies antioxydatives (normalement réduisent les espèces réactives d’oxygène)
Que ce passe il lors de la ferroptose
ROS mène à la peroxydation (oxydation maximale) des phospholipides et mène à la rupture de la membrane plasmique
2 membranes des mitochondries
interne
externe
Qu’est ce que la crête d’une mitochondrie
membrane interne replier
Quel est le siège principal de la production d’ATP
mitochondries
Quelle membrane est plus perméable entre externe et interne
Externe: perméable (canaux et pores perméable)
Interne : imperméable
Quelle substance est très imperméable à la membrane interne des mitochondries
très imperméable aux H+
Que contient la matrice des mitochondries
ribosomes
ADN mitochondrial
Est ce que l’ADN des mitochondries est composé d’histones
non
Où se trouvent la plupart des gènes mitochondrials
dans le génome nucléaire (il y en a juste 13 dans la matrice mitochondriale)
Comment est-ce que les protéines mitochondriales viennent dans la mmitochondrie si la plupart sont codés dans le génome nucléaire
Importé grâce à un signal d’import par des complexes de transport mitochondrial après avoir été traduite par étiquette
Qu’est ce qui permet le mouvement des spermatozoides
mitochdondries
Que ce passe-il aux mitochondries lors de la fécondation
Suite à la fécondation, les mitochondries paternelles sont dégradés dans l’ovocyte
Il ne reste que les génômes mitochondrials maternelles
Pourquoi est ce qu’il y a des maladies mitochondriales qui peuvent être hérités
Les mitochondries maternelles sont sélectionnés au hasard lors de la fécondation, donc dépendemment de ceux sélectionné, l’enfant peut avoir plus de symptome que la mère
Fonction principale de la mitochondrie
synthèse ATP via chaine respiratoire
Quelle partie de la respiration cellulaire se produit dans la matrice mitochondriale
cycle de krebs
Que produit le cycle de Krebs
nutriments sous forme d’Acétyl-CoA en NADH et succinate pour la chaine respiratoire
Quelle partie de la respiration cellulaire se produit dans la membrane interne de la mitochondrie
chaine respiratoire (de transport d’électrons)
Principe de la chaine respiratoire
énergie du transport d’électrons est utilisée pour générer un gradient électrochimique de protons H+ à travers la membrane interne (vers l’extérieur) qui sont ensuite pompé vers l’intérieur en produisant de l’énergie utilisé pour générer de l’ATP par l’ATP synthase
Quelle énergie utilise la pompe à protons qui envoie des protons de l’interieur vers l’extérieur de la membrane interne
énergie du transport d’électrons
Qu’utilise l’ATP synthase pour produire de l’ATP
gradient de protons
2 actions que peut effectuer l’ATP synthase
phosphorylation de l’ADP en ATP
hydrolise de l’ATP en ADP
Vers ou vont les protons lors de la phosphorylation de l’ADP en ATP de la pompe ATP synthase
Extérieur vers l’intérieur
Vers ou vont les protons lors de l’hydrolise de l’ATP en ADP de la pompe ATP synthase
Intérieur vers extérieur
Qu’est ce que la cardiolipine
phospholipide spécifique des membranes des bactéries et des mitochondries
Sur quelle membrane de la mitochondrie se trouve principalement les cardiolipine
membrane interne
Rôle des cardiolipines
essentiel à la chaine respiratoire et maintient l’imperméabilité aux H+ (oblige les protons à passer via l’ATP synthase)
Quelle protéine régule la fusion des mitochondries
Mitofusin (se reconnaissent et mènent à la fusion des mitochondries)
Quelle protéine régule la fission des mitochondries
Drp1 (dynamin related protein 1) (forme un anneau autour de la mitochondrie)
Durant quelle phase du cycle cellulaire est ce que la Drp1 est la plus active
en mitose (fission)
Quand est-ce que la Drp1 est dégradé dans le cycle cellulaire
À la fin de la mitose/entrée en G1
Qu’est ce qui dégrade la Drp1
Apc et protéosomes
Vrai ou faux: les nutriments régulent la fission et fusion des mitochondries
Vrai
Différence entre les mitochondries durant la famine et obésité
Famine: formes filamenteuses, plus efficace à former de l’ATP
Obésité: formes en graines, moins efficace à former de l’ATP
Où se produit la thermogénèse
tissu adipeux brun
Quelle protéine sert de canal de protons dans les mitochondries des adipocytes bruns
protéine de découplage (UCP1)
Rôle de UCP1 (protéine de découplage) dans le tissu adipeux brun
Canal par lequel les protons vont passer au lieu de passer via l’ATP synthase dans le tissu adipeux brun
Que génère l’UCP1 (protéine de découplage)
Chaleur (gradient de H+ utilisé pour générer la chaleur au lieu de l’ATP)
Quel est le messager primaire de la cellule qui se lie au récepteur des mitochondries des adipocytes brun et qui génère de la chaleur lorsqu’on a froid
Norépinéphrine
2 voies qui génèrent de la chaleur par thermorégulation
Lipolyse qui relâche des acides gras (UPC1)
Fission des mitochondries (phosphorylation des Drp1)
