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Médecine moléculaire et microscopique > ARNs non codants > Flashcards

ARNs non codants Flashcards

1
Q

Qu’est ce qu’un ARN non codant

A

une molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine (ARNnc)

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Q

6 types d’ARNnc

A

ARNr
ARNt
snARN
snoARN
iARN
IncARN

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3
Q

2 types de iARN (ARN interference)

A

siARN
miARN

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4
Q

Quels ARN non codants régulent l’expression des gènes

A

miARN
siARN
lncARN

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Q

Différence entre les sncARN et les lncARN

A

snc: small non coding (moins de 200 nucléotides)
lnc: large non coding (plus que 200 nucléotides)

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6
Q

Fonctions des miARN, siARN et lncARN

A

régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm
formation de l’hétérochromatine (modification histones et méthylation)
silençage des gènes

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7
Q

Quels ARN non codants sont impliqués dans des phénomènes épigénétiques

A

lncARN et miARN

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8
Q

fonction des ARN d’interférence (iARN)

A

défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites comme les virus et transposons

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9
Q

comment est ce que les iARN (arn d’interference) se défendent contre les séquences nucléotidiques parasites

A

molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées

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10
Q

lors d’approches thérapeuthiques, rôle des siRNA synthétiques

A

inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêts spécifiques

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11
Q

combien de nucléotides compose un miARN

A

environ 22

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12
Q

Fonction des miARN

A

inhibent l’expression génétique en ciblant des ARNm

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13
Q

Comment sont silenciées les molécules d’ARNm ciblées par les miARN (3 façons)

A

clivage brin ARNm en 2
déstabilisation par clivage de la queue poly-A
réduction de l’efficacité de la tradcution de l’ARNm en protéine

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14
Q

Comment fonctionnent les miARN pour inhiber l’expression génétique

A

cible un ARNm par appariemment de bases avec les séquences complémentaires

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15
Q

Qu’est ce qui transcrit les gènes de miARN

A

ARN polymérase II

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16
Q

La transcription d’un gène miARN par l’ARN polymérase II donne…

A

pri-miRNA

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17
Q

Composition d’un précurseur pri-miARN

A

1-6 précurseurs de miARN nommés pré-miARN qui ont tous une structure en tige-boucle

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18
Q

Étapes de la maturation dans le noyau des miARN dans le noyau

A
  1. Transcription du gène en pri-miRNA qui contient des précurseurs en tige-boucle de miRNA (pré-miRNA)
  2. DGCR8 reconnait tige-boucle (ARN double-brin) des pri-miRNA
  3. Recrutement de l’enzyme Drosha pour former le complexe microprocesseur
  4. Drosha découpe les pré-miRNA (ARN double brin) et les libère des pri-miRNA
  5. Ce pré-miRNA contient 2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’
  6. Les pré-miRNA sont exportées par exportin-5 par reconnaissance des 2 nucléotides laissés à l’extrémité 3’
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19
Q

De quoi dépend le transport vers le cytoplasme par exportine-5 du pré-miRNA se trouvant initialement dans le noyau

A

du GTP lié à la protéine Ran-GTP

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20
Q

Quelle enzymes forment le complexe microprocesseur

A

DGCR8 et Drosha

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21
Q

Quel est l’équivalent du DGCR8 qui reconnait le pri-miRNA pour les invertébrés

A

Pasha

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22
Q

Fonction du Drosha

A

découpe les pré-miRNA à partir du pri-miRNA (CROPPING)

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23
Q

Que contient le produit résultant du cropping par l’enzyme Drosha à ses extrémités

A

2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’

24
Q

Quelle enzyme s’Occupe de l’exportation des pré-miRNA du noyau vers le cytoplasme

A

Exportin-5

25
Q

Comment est ce que l’enzyme exportin-5 reconnait le pré-miRNA près à être exporté vers le cytoplasme

A

grâce aux 2 nucléotides laissés à l’extrémité 3’ du pré-miRNA lors du cropping par le Drosha

26
Q

Que ce passe il après maturation dans le noyau lors de la biogénèse des miRNA

A

dicing

27
Q

En quoi consiste l’étape de dicing lors de la biogénèse des mirRNA

A

l’enzyme dicer processe la tige-boucle pré-miRNA en coupant la boucle et donnant un ARN double brin imparfait d’environ 22 nucléotides

28
Q

Quelle type d’enzyme est un dicer

A

endoribonucléase

29
Q

De quoi est formé le double brin d’ARN formé par le dicer lors de la maturation dans le cytoplasme

A

duplex de miARN et miARN*

30
Q

Quel brin du duplex représente le miRNA après le dicing

A

brin guide

31
Q

Quel brin du duplex représente le miRNA* après le dicing

A

brin passager

32
Q

Que ce passe il après l’étape du dicing dans la biogénèse des miRNA

A

L’enzyme argonaute choisi un seul des deux brins, le brin guide, formant avec d’autres protéines le complexe RISC

33
Q

Qu’est ce que le RISC

A

RNA-induced silencing complex

34
Q

Fonction du RISC

A

ou le miRNA et sa cible d’ARNm intéragissent

35
Q

Composantes du RISC

A

miRNA mature
Argonaute
protéines

36
Q

Fonction de l’argonaute dans le complexe RISC

A

lie le miRNA mature au RISC
assurer l’interaction du miARN avec les ARNm cibles

37
Q

Type d’argonaute qui clive directement les ARNm cibles du miRNA

A

ago2

38
Q

2 mécanismes d’action possible des miRNAs

A

appariement parfait entre le miRNA et l’ARNm cible
appariement imparfait ou partiel

39
Q

Que ce passe il lorsque l’appariement entre le miRNA et l’ARNm cible est parfait

A

slicing: le ARNm cible est clivé par RISC puis dégradé par hydrolyse de l’ATP en ADP

40
Q

Que ce passe il lorsque l’appariement entre le miRNA et l’ARNm cible n’est pas parfait

A

l’argonaute ne sclice pas, la traduction est inhibée et le ARNm est déstabilisé
ceci envoie ARNm vers les P-bodies ou ils sont dégradés

41
Q

Qu’est ce que les P-bodies

A

structures cytosoliques dynamiques cntenant l’enzyme Dcp1 ainsi que des enzymes de dégradation des ARNm

42
Q

Fonction des P-bodies

A

dégradation des ARNm lorsque l’appariement entre le miRNA et l’ARNm cible n’est pas parfait

43
Q

À part se faire dégrader par les P-bodies, que peut il se passer lorsque les miRNA ne sont pas parfaitement complémentaire au ARNm cible

A

inhibation de la traduction
accélération de la déadénylation
réactions chimiques de modification d’histones et d’ADN

44
Q

Qu’entraine l’accélération de la déadénylation par les miRNA qui ne sont pas parfaitement complémentaire aux ARNm

A

dégradation précoce des ARNm

45
Q

La majorité des miARN sont intracellulaire ou extracellulaire

A

intracellulaire

46
Q

Est-ce que les lncRNA codent pour des protéines

A

non

47
Q

Où est ce que les lncRNA sont généralement plus enrichis

A

dans le noyau

48
Q

Comment est ce que les lncRNA sont transcrits et maturé

A

comme les mRNA codants pour des protéines, excepté la traduction

49
Q

comment est ce que les gènes de lncRNA sont définis

A

par leur position relative aux gènes codants qui sont situés à leur proximité

50
Q

4 types de classification des lncRNA selon leur position relative aux gènes codants

A

lncRNA intergénique
lncRNA antisens
lncRNA introniques
lncRNA divergents

51
Q

Qu’est ce qu’un lncRNA intergénique

A

localisés dans une région entre gènes

52
Q

Qu’est ce qu’un lncRNA antisens

A

lncRNA transcrits dans la direction opposée d’un gène codant et dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant associé

53
Q

Qu’est ce qu’un lncRNA intronique

A

contenus dans un intron d’un gène codant

54
Q

Qu’est ce qu’un lncRNA divergent

A

transcrit de facon divergente au promoteur d’Un gène codant (direction opposée), mais ne se croisent pas

55
Q

4 rôles des lncARN

A

dirigent les modification de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques
déplacent des régulateurs de l’expression des séquences silencers ou enhancer
compétition avec des miRNA (protection contre dégradation des ARNm)
module l’épissage et interfère avec la traduction

56
Q

Est ce que les lncRNA doivent être proche d’un gène pour pouvoir avoir une action dessus

A

non, le gène peut être voisin ou distal

Médecine moléculaire et microscopique (30 decks)

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