ARNs non codants Flashcards

1
Q

Qu’est ce qu’un ARN non codant

A

une molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine (ARNnc)

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Q

6 types d’ARNnc

A

ARNr
ARNt
snARN
snoARN
iARN
IncARN

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Q

2 types de iARN (ARN interference)

A

siARN
miARN

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4
Q

Quels ARN non codants régulent l’expression des gènes

A

miARN
siARN
lncARN

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Q

Différence entre les sncARN et les lncARN

A

snc: small non coding (moins de 200 nucléotides)
lnc: large non coding (plus que 200 nucléotides)

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6
Q

Fonctions des miARN, siARN et lncARN

A

régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm
formation de l’hétérochromatine (modification histones et méthylation)
silençage des gènes

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7
Q

Quels ARN non codants sont impliqués dans des phénomènes épigénétiques

A

lncARN et miARN

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8
Q

fonction des ARN d’interférence (iARN)

A

défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites comme les virus et transposons

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9
Q

comment est ce que les iARN (arn d’interference) se défendent contre les séquences nucléotidiques parasites

A

molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées

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10
Q

lors d’approches thérapeuthiques, rôle des siRNA synthétiques

A

inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêts spécifiques

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11
Q

combien de nucléotides compose un miARN

A

environ 22

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12
Q

Fonction des miARN

A

inhibent l’expression génétique en ciblant des ARNm

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13
Q

Comment sont silenciées les molécules d’ARNm ciblées par les miARN (3 façons)

A

clivage brin ARNm en 2
déstabilisation par clivage de la queue poly-A
réduction de l’efficacité de la tradcution de l’ARNm en protéine

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14
Q

Comment fonctionnent les miARN pour inhiber l’expression génétique

A

cible un ARNm par appariemment de bases avec les séquences complémentaires

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15
Q

Qu’est ce qui transcrit les gènes de miARN

A

ARN polymérase II

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16
Q

La transcription d’un gène miARN par l’ARN polymérase II donne…

A

pri-miRNA

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17
Q

Composition d’un précurseur pri-miARN

A

1-6 précurseurs de miARN nommés pré-miARN qui ont tous une structure en tige-boucle

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18
Q

Étapes de la maturation dans le noyau des miARN dans le noyau

A
  1. Transcription du gène en pri-miRNA qui contient des précurseurs en tige-boucle de miRNA (pré-miRNA)
  2. DGCR8 reconnait tige-boucle (ARN double-brin) des pri-miRNA
  3. Recrutement de l’enzyme Drosha pour former le complexe microprocesseur
  4. Drosha découpe les pré-miRNA (ARN double brin) et les libère des pri-miRNA
  5. Ce pré-miRNA contient 2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’
  6. Les pré-miRNA sont exportées par exportin-5 par reconnaissance des 2 nucléotides laissés à l’extrémité 3’
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19
Q

De quoi dépend le transport vers le cytoplasme par exportine-5 du pré-miRNA se trouvant initialement dans le noyau

A

du GTP lié à la protéine Ran-GTP

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20
Q

Quelle enzymes forment le complexe microprocesseur

A

DGCR8 et Drosha

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21
Q

Quel est l’équivalent du DGCR8 qui reconnait le pri-miRNA pour les invertébrés

A

Pasha

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22
Q

Fonction du Drosha

A

découpe les pré-miRNA à partir du pri-miRNA (CROPPING)

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23
Q

Que contient le produit résultant du cropping par l’enzyme Drosha à ses extrémités

A

2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’

24
Q

Quelle enzyme s’Occupe de l’exportation des pré-miRNA du noyau vers le cytoplasme

A

Exportin-5

25
Comment est ce que l'enzyme exportin-5 reconnait le pré-miRNA près à être exporté vers le cytoplasme
grâce aux 2 nucléotides laissés à l'extrémité 3' du pré-miRNA lors du cropping par le Drosha
26
Que ce passe il après maturation dans le noyau lors de la biogénèse des miRNA
dicing
27
En quoi consiste l'étape de dicing lors de la biogénèse des mirRNA
l'enzyme dicer processe la tige-boucle pré-miRNA en coupant la boucle et donnant un ARN double brin imparfait d'environ 22 nucléotides
28
Quelle type d'enzyme est un dicer
endoribonucléase
29
De quoi est formé le double brin d'ARN formé par le dicer lors de la maturation dans le cytoplasme
duplex de miARN et miARN*
30
Quel brin du duplex représente le miRNA après le dicing
brin guide
31
Quel brin du duplex représente le miRNA* après le dicing
brin passager
32
Que ce passe il après l'étape du dicing dans la biogénèse des miRNA
L'enzyme argonaute choisi un seul des deux brins, le brin guide, formant avec d'autres protéines le complexe RISC
33
Qu'est ce que le RISC
RNA-induced silencing complex
34
Fonction du RISC
ou le miRNA et sa cible d'ARNm intéragissent
35
Composantes du RISC
miRNA mature Argonaute protéines
36
Fonction de l'argonaute dans le complexe RISC
lie le miRNA mature au RISC assurer l'interaction du miARN avec les ARNm cibles
37
Type d'argonaute qui clive directement les ARNm cibles du miRNA
ago2
38
2 mécanismes d'action possible des miRNAs
appariement parfait entre le miRNA et l'ARNm cible appariement imparfait ou partiel
39
Que ce passe il lorsque l'appariement entre le miRNA et l'ARNm cible est parfait
slicing: le ARNm cible est clivé par RISC puis dégradé par hydrolyse de l'ATP en ADP
40
Que ce passe il lorsque l'appariement entre le miRNA et l'ARNm cible n'est pas parfait
l'argonaute ne sclice pas, la traduction est inhibée et le ARNm est déstabilisé ceci envoie ARNm vers les P-bodies ou ils sont dégradés
41
Qu'est ce que les P-bodies
structures cytosoliques dynamiques cntenant l'enzyme Dcp1 ainsi que des enzymes de dégradation des ARNm
42
Fonction des P-bodies
dégradation des ARNm lorsque l'appariement entre le miRNA et l'ARNm cible n'est pas parfait
43
À part se faire dégrader par les P-bodies, que peut il se passer lorsque les miRNA ne sont pas parfaitement complémentaire au ARNm cible
inhibation de la traduction accélération de la déadénylation réactions chimiques de modification d'histones et d'ADN
44
Qu'entraine l'accélération de la déadénylation par les miRNA qui ne sont pas parfaitement complémentaire aux ARNm
dégradation précoce des ARNm
45
La majorité des miARN sont intracellulaire ou extracellulaire
intracellulaire
46
Est-ce que les lncRNA codent pour des protéines
non
47
Où est ce que les lncRNA sont généralement plus enrichis
dans le noyau
48
Comment est ce que les lncRNA sont transcrits et maturé
comme les mRNA codants pour des protéines, excepté la traduction
49
comment est ce que les gènes de lncRNA sont définis
par leur position relative aux gènes codants qui sont situés à leur proximité
50
4 types de classification des lncRNA selon leur position relative aux gènes codants
lncRNA intergénique lncRNA antisens lncRNA introniques lncRNA divergents
51
Qu'est ce qu'un lncRNA intergénique
localisés dans une région entre gènes
52
Qu'est ce qu'un lncRNA antisens
lncRNA transcrits dans la direction opposée d'un gène codant et dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant associé
53
Qu'est ce qu'un lncRNA intronique
contenus dans un intron d'un gène codant
54
Qu'est ce qu'un lncRNA divergent
transcrit de facon divergente au promoteur d'Un gène codant (direction opposée), mais ne se croisent pas
55
4 rôles des lncARN
dirigent les modification de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques déplacent des régulateurs de l'expression des séquences silencers ou enhancer compétition avec des miRNA (protection contre dégradation des ARNm) module l'épissage et interfère avec la traduction
56
Est ce que les lncRNA doivent être proche d'un gène pour pouvoir avoir une action dessus
non, le gène peut être voisin ou distal