ARNs non codants Flashcards
Qu’est ce qu’un ARN non codant
une molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine (ARNnc)
6 types d’ARNnc
ARNr
ARNt
snARN
snoARN
iARN
IncARN
2 types de iARN (ARN interference)
siARN
miARN
Quels ARN non codants régulent l’expression des gènes
miARN
siARN
lncARN
Différence entre les sncARN et les lncARN
snc: small non coding (moins de 200 nucléotides)
lnc: large non coding (plus que 200 nucléotides)
Fonctions des miARN, siARN et lncARN
régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm
formation de l’hétérochromatine (modification histones et méthylation)
silençage des gènes
Quels ARN non codants sont impliqués dans des phénomènes épigénétiques
lncARN et miARN
fonction des ARN d’interférence (iARN)
défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites comme les virus et transposons
comment est ce que les iARN (arn d’interference) se défendent contre les séquences nucléotidiques parasites
molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées
lors d’approches thérapeuthiques, rôle des siRNA synthétiques
inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêts spécifiques
combien de nucléotides compose un miARN
environ 22
Fonction des miARN
inhibent l’expression génétique en ciblant des ARNm
Comment sont silenciées les molécules d’ARNm ciblées par les miARN (3 façons)
clivage brin ARNm en 2
déstabilisation par clivage de la queue poly-A
réduction de l’efficacité de la tradcution de l’ARNm en protéine
Comment fonctionnent les miARN pour inhiber l’expression génétique
cible un ARNm par appariemment de bases avec les séquences complémentaires
Qu’est ce qui transcrit les gènes de miARN
ARN polymérase II
La transcription d’un gène miARN par l’ARN polymérase II donne…
pri-miRNA
Composition d’un précurseur pri-miARN
1-6 précurseurs de miARN nommés pré-miARN qui ont tous une structure en tige-boucle
Étapes de la maturation dans le noyau des miARN dans le noyau
- Transcription du gène en pri-miRNA qui contient des précurseurs en tige-boucle de miRNA (pré-miRNA)
- DGCR8 reconnait tige-boucle (ARN double-brin) des pri-miRNA
- Recrutement de l’enzyme Drosha pour former le complexe microprocesseur
- Drosha découpe les pré-miRNA (ARN double brin) et les libère des pri-miRNA
- Ce pré-miRNA contient 2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’
- Les pré-miRNA sont exportées par exportin-5 par reconnaissance des 2 nucléotides laissés à l’extrémité 3’
De quoi dépend le transport vers le cytoplasme par exportine-5 du pré-miRNA se trouvant initialement dans le noyau
du GTP lié à la protéine Ran-GTP
Quelle enzymes forment le complexe microprocesseur
DGCR8 et Drosha
Quel est l’équivalent du DGCR8 qui reconnait le pri-miRNA pour les invertébrés
Pasha
Fonction du Drosha
découpe les pré-miRNA à partir du pri-miRNA (CROPPING)
Que contient le produit résultant du cropping par l’enzyme Drosha à ses extrémités
2 nucléotides non-appariés à son extrémité 3’
Quelle enzyme s’Occupe de l’exportation des pré-miRNA du noyau vers le cytoplasme
Exportin-5
Comment est ce que l’enzyme exportin-5 reconnait le pré-miRNA près à être exporté vers le cytoplasme
grâce aux 2 nucléotides laissés à l’extrémité 3’ du pré-miRNA lors du cropping par le Drosha
Que ce passe il après maturation dans le noyau lors de la biogénèse des miRNA
dicing
En quoi consiste l’étape de dicing lors de la biogénèse des mirRNA
l’enzyme dicer processe la tige-boucle pré-miRNA en coupant la boucle et donnant un ARN double brin imparfait d’environ 22 nucléotides
Quelle type d’enzyme est un dicer
endoribonucléase
De quoi est formé le double brin d’ARN formé par le dicer lors de la maturation dans le cytoplasme
duplex de miARN et miARN*
Quel brin du duplex représente le miRNA après le dicing
brin guide
Quel brin du duplex représente le miRNA* après le dicing
brin passager
Que ce passe il après l’étape du dicing dans la biogénèse des miRNA
L’enzyme argonaute choisi un seul des deux brins, le brin guide, formant avec d’autres protéines le complexe RISC
Qu’est ce que le RISC
RNA-induced silencing complex
Fonction du RISC
ou le miRNA et sa cible d’ARNm intéragissent
Composantes du RISC
miRNA mature
Argonaute
protéines
Fonction de l’argonaute dans le complexe RISC
lie le miRNA mature au RISC
assurer l’interaction du miARN avec les ARNm cibles
Type d’argonaute qui clive directement les ARNm cibles du miRNA
ago2
2 mécanismes d’action possible des miRNAs
appariement parfait entre le miRNA et l’ARNm cible
appariement imparfait ou partiel
Que ce passe il lorsque l’appariement entre le miRNA et l’ARNm cible est parfait
slicing: le ARNm cible est clivé par RISC puis dégradé par hydrolyse de l’ATP en ADP
Que ce passe il lorsque l’appariement entre le miRNA et l’ARNm cible n’est pas parfait
l’argonaute ne sclice pas, la traduction est inhibée et le ARNm est déstabilisé
ceci envoie ARNm vers les P-bodies ou ils sont dégradés
Qu’est ce que les P-bodies
structures cytosoliques dynamiques cntenant l’enzyme Dcp1 ainsi que des enzymes de dégradation des ARNm
Fonction des P-bodies
dégradation des ARNm lorsque l’appariement entre le miRNA et l’ARNm cible n’est pas parfait
À part se faire dégrader par les P-bodies, que peut il se passer lorsque les miRNA ne sont pas parfaitement complémentaire au ARNm cible
inhibation de la traduction
accélération de la déadénylation
réactions chimiques de modification d’histones et d’ADN
Qu’entraine l’accélération de la déadénylation par les miRNA qui ne sont pas parfaitement complémentaire aux ARNm
dégradation précoce des ARNm
La majorité des miARN sont intracellulaire ou extracellulaire
intracellulaire
Est-ce que les lncRNA codent pour des protéines
non
Où est ce que les lncRNA sont généralement plus enrichis
dans le noyau
Comment est ce que les lncRNA sont transcrits et maturé
comme les mRNA codants pour des protéines, excepté la traduction
comment est ce que les gènes de lncRNA sont définis
par leur position relative aux gènes codants qui sont situés à leur proximité
4 types de classification des lncRNA selon leur position relative aux gènes codants
lncRNA intergénique
lncRNA antisens
lncRNA introniques
lncRNA divergents
Qu’est ce qu’un lncRNA intergénique
localisés dans une région entre gènes
Qu’est ce qu’un lncRNA antisens
lncRNA transcrits dans la direction opposée d’un gène codant et dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant associé
Qu’est ce qu’un lncRNA intronique
contenus dans un intron d’un gène codant
Qu’est ce qu’un lncRNA divergent
transcrit de facon divergente au promoteur d’Un gène codant (direction opposée), mais ne se croisent pas
4 rôles des lncARN
dirigent les modification de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques
déplacent des régulateurs de l’expression des séquences silencers ou enhancer
compétition avec des miRNA (protection contre dégradation des ARNm)
module l’épissage et interfère avec la traduction
Est ce que les lncRNA doivent être proche d’un gène pour pouvoir avoir une action dessus
non, le gène peut être voisin ou distal
