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Médecine moléculaire et microscopique > Le trafic membranaire intracellulaire > Flashcards

Le trafic membranaire intracellulaire Flashcards

1
Q

Quels organites de la cellule ont une membrane

A

Endosome
Peroxysome
Lysosome
Appareil de Golgi
Réticulum endoplasmique

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Q

2 voies principales du trafic membranaire

A

endosomale
sécrétion

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Q

Comment est ce que la cellule équilibre l’importation du matériel avec l’exportation

A

Est à la fois le compartiment donneur pour l’endocytose et le compartiment cible pour la sécrétion via exocytose

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4
Q

État du cytoplasme où se produit le transport membranaire

A

dense

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5
Q

Concept principal de la voie endosomale

A

formation de vésicules

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6
Q

Concept principal de la voie de sécrétion

A

fusion des vésicules

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7
Q

Que permet l’équilibre entre l’import et l’export des matériels cellulaires

A

Maintien la taille de la cellule et de ces organites

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8
Q

Fonction des vésicules

A

servent comme intermédiaire de transport de molécules de chargements entre les différents compartiments

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9
Q

Principe général du transport vésiculaire

A

Compartiment donneur forme un vésicule par bourgeonnement de sa membrane via des protéines qui ensuite va se fusionner à la membrane du compartiment cible

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10
Q

Qu’est ce que l’exocytose

A

Tout ce qui se trouve dans la lumière du vésicule va être relâcher par sa fusion avec la membrane plasmique

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11
Q

Qu’est ce que l’endocytose

A

Composantes extracellulaire entre dans la cellule par formation de vésicules à partir de sa membrane plasmique

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12
Q

Que ce passe il au feuillet face à la lumière du vésicule lorsqu’il se fusionne avec la membrane plasmique (exocytose)

A

Il devient le feuillet externe de la bicouche de la membrane plasmique

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13
Q

Que ce passe il au feuillet externe de la bicouche de la membrane plasmique lorsqu’elle capte les substances (endocytose)

A

Il devient le feuillet face à la lumière du vésicule

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14
Q

3 mécanismes d’internalisation à la membrane plasmique

A

Phagocytose
Macropinocytose
Endocytose

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15
Q

3 types de mécanismes d’endocytose

A

Dépendante de la clathrine
Dépendante de la cavéoline
Indépendante de la cavéoline et la clathrine

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16
Q

Quel type de substance est phagocyté

A

Particules larges

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17
Q

Quel type de substance est internalisé par macropinocytose

A

liquides non-spécifiques

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18
Q

Quel type de substance est internalisé par endocytose dépendante de la clathrine

A

particules de taille moyenne spécifiques

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19
Q

Quel type de substance est internalisé par endocytose dépendante de la cavéoline et indépendante

A

particules de petite taille non spécifique

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20
Q

Partie de la cellule qui capte les grosses particules lors de la phagocytose

A

pseudopodes

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21
Q

Les pseudopodes sont dépendants de quoi

A

actine, soit leur polymérisation à la membrane plasmique

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22
Q

Expliquez l’internalisation par phagocytose

A

Pseudopodes enveloppent la grosse particule par ses pseudopodes à l’aide de la polymérisation d’actine, qui forme un vésicule ensuite dégéré par les lysosomes

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23
Q

Quel est un signal reconnu par les macrophages lors de l’apoptose

A

Perte de l’asymmétrie de la membrane = PS se retrouve sur la membrane externe des corps apoptotiques (signal de se faire phagocyté par macrophages)

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24
Q

Principe de la macropinocytose

A

Ingestion de gouttelettes de fluide avec nutriments par une extension de son cytoplasme par la polymérisation de l’actine autour d’une région de la membrane activée par PIP3, qui forme un vésicule digérer par les endosomes précoces

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25
Q

Quel phospholipide active la région au centre du cercle de polymérisation d’actine

A

PIP3

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26
Q

Étapes de l’endocytose médiée par récepteurs/dépendants de la clathrine

A
  1. Récepteur de chargement se trouvant sur la membrane plasmique reconnait une molécule de chargement
  2. Ceci recrute des adaptines (adapteurs de clathrines) qui recrutent des clathrines
  3. Ceci déforme la membrane plasmique
  4. Ces recrutements forment un manteau de clathrines qui se polymérisent (donne la forme du vésicule)
  5. La base du manteau de clathrines recrute la dynamine qui permet la scission du manteau de clathrines par hydrolyse de la GTP
  6. Le vésicule mantelé de clathrines élimine sont manteau par l’hydrolyse d’ATP et créer un vésicule
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27
Q

Différence entre l’énergie utilisé pour la scission du vésicule mantelé et pour l’élimination du manteau de l’endocytose dépendant de la clathrine

A

Scission par dynamine: hydrolyse GTP
Perte du manteau: hydrolyse ATP

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28
Q

Sous quelle forme se trouve la clathrine dans le cytosol

A

triskèle

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29
Q

Sous quelle forme se trouve les polymères de clathrines dans le cytosol (formation du vésicule)

A

treillis polyédrale (en forme de ballon de soccer)

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30
Q

Qu’est ce qui donne la forme à la membrane plasmique lors de l’endocytose dépendant de clathrines

A

Polymérisation des clathrines

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31
Q

Quelle protéine régule la scission du vésicule lors de l’endocytose dépendant de clathrines

A

dynamine

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32
Q

Quelle protéine facilite la formation d’un vésicule mantelée de clathrines

A

actine

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33
Q

Quels vésicules sont plus petits entre ceux médié par la clathrine et ceux médié par la cavéoline

A

Cavéoline

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34
Q

Que forme les cavéoline (endocytose)

A

cavéolae

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35
Q

Où s’associe habituellement les cavéolines sur la membrane plasmique

A

avec les radeaux lipidiques

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36
Q

Est ce que les clatherines forment uniquement des vésicules à la membrane plasmique

A

Non, elle forme aussi des vésicules à l’appareil de golgi

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37
Q

Où s’insère les cavéoline sur la membrane plasmique

A

Dans le feuillet interne de la bicouche

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38
Q

Qu’est ce qu’un endosome

A

vésicule entourée d’une simple membrane qui proviennent de la membrane plasmique suite à l’endocytose

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39
Q

Comment maturent les endosomes

A

en devenant de plus en plus acide

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40
Q

Expliquez la maturation des endosomes vers les lysosomes

A
  1. les vésicules endocytés se fusionnent ensemble pour former l’endosome précoce
  2. endosome précoce libère un corps multi-vésiculaire qui est transporté par des microtubules vers l’endosome tardif
  3. endosome tardif mature en endolysosome puis ensuite en lysosome
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41
Q

Structure la plus acide de la maturation des endosomes

A

lysosome (ph5)

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42
Q

Que représente un endosome précoce lors de la maturation des endosome

A

site de tri

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43
Q

Qu’est ce qu’un corps multi-vésiculaire

A

Cellule contenant plusieurs vésicules

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44
Q

3 maturations possibles des endosomes précoces (tri)

A
  1. endosome de recyclage (revient vers la membrane plasmique)
  2. réseau trans golgien (bidirectionnel)
  3. endosome tardif (maturation en lysosome)
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45
Q

Qu’est ce qu’un LDL

A

lipoprotéine de basse densité

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46
Q

Rôle des LDL

A

permettent le transport de cholestérol dans la cellule

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47
Q

Mécanisme de transport de cholestérol via les lipoprotéines (LDL)

A
  1. Récepteur de LDL à la membrane plasmique r reconnaissent le LDL contenant le cholestérol
  2. Initie l’endocytose dépendant de clathrines
  3. Vésicules se fusionnent avec l’endosome précoce
  4. Certains vésicules s’acidifient et deviennent des lysosomes contenant des LDL + cholestérol
  5. Certains vésicules contenant les récepteurs sont recyclés
  6. Les lysosomes dégradent les LDL et libèrent le cholestérol dans la cellule
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48
Q

Pour quelle raison est ce que les lysosomes doivent maturé en structure acide pour pouvoir fonctionner

A

ces enzymes de dégradation, les hydrolases acides, sont seulement activent à un ph de 5

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49
Q

Comment est ce que les lysosomes maintiennent leur acidité

A

Via une pompe V-ATPase qui utilise l’hydrolysation de l’ATP pour faire entrer des ions H+ dans les lysosomes

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50
Q

Qu’est ce qu’un exosome

A

vésicule extracellulaire qui provient du système endosomal

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51
Q

Où dans l’étape de maturation des endosomes peut il y avoir formation d’un exosome

A

L’endosome tardif peut devenir un lysosome ou des exosomes

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52
Q

Comment sont libérés les exosomes dans le milieu extra-cellulaire

A

Par fusion d’un endosome tardif (corps multi vésiculaire) à la membrane plasmique

53
Q

Comment se forment les multiples corps vésiculaires dans l’endosome tardif

A

par bourgeonnement de sa membrane

54
Q

les lysosomes reçoivent leur matériel à désintégrer de 3 sources:

A

phagocytose (phagosome)
endocytose (endosome)
autophagie (autophagosome)

55
Q

qu’est ce que l’autophagie

A

mécanisme qui entoure en membrane des régions de cytoplasme, des aggrégats protéiques et certains organites permettant leur dégradation via la fusion avec des lysosomes (forment leur propre membrane)

56
Q

Exemple de l’autophagie d’une mitochondrie (mitophagie)

A

La cellule forme une double bicouche (membrane) autour de la mitochondrie, formant l’intermédiaire phagophore, puis l’autophagosome, qui va se fusionner avec les lysosomes

57
Q

Quelle structure constitue un autophagosome

A

double membrane

58
Q

Qu’est ce qu’un phagophore

A

préliminaire à la formation d’un autophagosome

59
Q

Comment est formé un peroxysome

A

s’assemble via le recrutement de protéines et la fusion des vésicules en provenance du réticulum endoplasmique

60
Q

Que ce passe-il à la bicouche de l’autophagosome durant sa fusion avec le lysosome

A

Le membrane externe devient la membrane du lysosome
Le membrane interne est digérer par le lysosome

61
Q

Comment est-ce que le mécanisme d’autophagie réagit contre la déprivation de nutriments

A

La cellule autodigère des cellules moins essentielles par l’autophagie et recycle les composantes pour qu’elles soient utilisés pour promouvoir la survie de cellules plus importantes

62
Q

Qu’est ce qu’un peroxysome

A

Organite sphérique à simple membrane important au métabolisme et la détoxification

63
Q

Est ce que les peroxysomes sont former des membranes des endosomes

A

Non, ils ne font pas partie du système endo-lysosomal

64
Q

Rôle au maintien du métabolisme des peroxysomes

A

oxidation des acides gras

65
Q

Rôle de détoxyfication des peroxysomes

A

production et dégradation du H2O2 et des ROS

66
Q

Source des peroxysomes

A

Bourgeonnement du réticulum endoplasmique

67
Q

Maturation des peroxysomes (2 façon)

A

Croissance puis import de protéines pour étiquetter les peroxysomes
Sinon, fission par dynamine

68
Q

Typiquement, que ce passe il au récepteur lié à un ligand à la membrane plasmique lors de l’endocytose

A

Il sera endocyté avec son ligand, mais ils n’ont pas la même maturation (tri dans l’endosome précoce)
Récepteur recyclé vers la membrane plasmique
Ligand dégradé dans les lysosomes

69
Q

Quel groupe de protéines permet la fusion de vésicules a la membrane plasmique

A

les protéines SNARE

70
Q

2 types de SNARE qui permettent la fusion de vésicules à la membrane plasmique

A

v-SNARE
t-SNARE

71
Q

Où se trouvent les protéines SNARE

A

dans la membrane plasmique (entre les deux couches de la bicouche)

72
Q

Expliquez comment est gardé l’asymétrie de la membrane lors de sa fusion avec un vésicule (bichouche)

A

Le feuillet du côté cytosole du vésicule se fusionne avec le feuillet interne de la membrane
Le feuillet du coté luminère du vésicule se fusionne avec le feuillet externe de la membrane
(INTÉRIEUR DU VÉSICULE = EXTÉRIEUR DE LA CELLULE)

73
Q

Que ce passe ils aux substances dans les vésicules lors de la fusion d’un vésicule à la membrane lors de l’exocytose

A

Ils sont expulsé vers l’extérieur de la cellule

74
Q

Lors de l’exocytose, sur quelle structure se trouve la protéine v-snare

A

le vésicule

75
Q

Lors de l’exocytose, sur quelle structure se trouve la protéine t-snare

A

la membrane cyble

76
Q

De quoi dépend le désassemblage des 2 protéines SNARE

A

hydrolyse de l’ATP (mécanisme de prend pas d’énergie, mais besoin pour dissocier le complexe)

77
Q

Fonction de RAB-GTP lors de l’exocytose

A

reconnait des protéines d’attachement qui viennent lié la membrane et le vésicule avant l’appareillage entre les deux protéines SNARE (entrelacent)

78
Q

Étapes de l’exocytose

A
  1. Vésicule contenant une protéine v-snare ainsi qu’un récepteur et son cargo/ligant se lie à une protéine RAB-GTP
  2. RAB-GTP recrute une protéine d’attachement qui lie la membrane cible au vésicule
  3. Le vésicule s’approche de la membrane grâce à ses protéines d’attachement et le v-snare s’appareille avec le t-snare de la membrane cible
  4. Les SNARE permettent la fusion du vésicule de la membrane et sont ensuite dégradé par hydrolyse de l’ATP
79
Q

Quelles protéines régulent l’activité et l’inactivité des protéines RAB

A

Phosphorylation par GEF (inactive à active)
Hydrolyse par GAP (active a inactive)

80
Q

Sur quel feuillet se trouve le PI

A

interne/cytoplasmique

81
Q

Comment sont formés les variantes de PI

A

par phosphorylation par des kinases

82
Q

À quoi servent les PI lors l’endo et exocytose

A

signalisation: façon que les cellules distinguent les compartiments, donc recrutent les bonnes protéines selon la membrane

83
Q

Qu’est ce que la voie de sécrétion/biosynthèse

A

Lieu de passage des protéines nouvellement synthétisées au RER destinées à la membrane plasmique, à l’exportation par sécrétion ou
encore à d’autres organites comme les lysosomes

84
Q

Qu’est ce que le réticulum endoplasmique

A

citerne/sac membranaire qui entoure le noyau

85
Q

2 composantes du réticulum endoplasmique

A

rugueux (ribosomes)
lisse (sans ribosome)

86
Q

Qu’est ce que le réticulum endoplasmique lisse

A

réseau de tubules sans ribosomes en continuité avec le RER

87
Q

Rôles du réticulum endoplasmique lisse

A

synthèse lipidique
réservoir de calcium

88
Q

Qu’est ce que le réticulum endoplasmique rugueux

A

réseau de citernes avec ribosomes en continuité avec le REL

89
Q

Rôles du réticulum endoplasmique rugueux

A

synthèse protéique
repliement des protéines
controle de qualité
glycosylation des protéines

90
Q

2 composantes des ribosomes

A

ARNr et protéines

91
Q

Rôle des ARNr

A

essentiel pour la traduction des ARNm en protéines

92
Q

Rôle du ribosome dans la traduction des protéines

A

ribosome se déplace 5’ 3’ en lisant chaque codon de 3 nucléotides

93
Q

Qu’est ce qu’un polysome

A

multiples ribosomes en train de traduire le même ARNm simultanément

94
Q

Si les ribosomes sont dans le cytoplasme, comment produire des protéines destinées à être sécrétées hors de la cellule ou à être insérer dans la membrane plasmique

A

les protéines ont une séquence signal N-terminal qui dirige le ribosome au réticulum endoplasmique (qui est en continuité avec la membrane plasmique)

95
Q

Différence entre les protéines traduites par les ribosomes libres dans le cytosol et ceux attaché au RE

A

Libre: ARNm reste libre dans le cytosol et code pour des protéines cytosoliques, mitochondriales, nucléaires, etc
RE: ARNm reste lié à la membrane du REà cause de la séquence signal des protéines et sont soit sécrétées, transmembranaires ou fonctionnent dans le système endomembranaire

96
Q

Étapes de la traduction d’une protéine transmembranaire

A
  1. ribosome commence à traduire ARNm en protéine, séquence signal se forme
  2. La séquence signal N-terminale des protéines indique qu’elles sont destinées à être sécrétées ou transmembranaires
  3. Cette séquence est reconnue par une particule de reconnaissance SRP
  4. Un récepteur de SRP reconnait le complexe formé et recrute le ribosome à la membrane du réticulum endoplasmique
  5. Le SRP est recyclé et la chaine de polypeptides traduite passe par un canal de translocation (translocon)
  6. La séquence signal N-terminale reste accroché au translocon lors de la traduction par le ribosome
  7. Un signal hydrophobe d’arrêt de transfer termine la traduction et s’accroche aussi au translocon
  8. Une peptidase clive le signal N-terminal et éjecte le translocon = protéine transmembranaire
97
Q

2 mécanismes de glycolysation des protéines

A

N-glycolysation
O-glycolysation

98
Q

Ou se produit les deux mécanismes de glycolysation

A

N-glycolysation: lumière du RE
O-glycolysation: appareil de Golgi

99
Q

Quand est ce que les précurseurs du glycocalyx sont ajoutés dans la lumière du réticulum endoplasmique

A

pendant la traduction

100
Q

Qu’implique le mécanisme de N-glycosylation

A

ajout de chaine -ose liés à un NITROGÈNE d’asparagine

101
Q

Qu’implique le mécanisme de O-glycosylation

A

ajout de chaine -ose liés à un OXYGÈNE de la sérine/thréonine

102
Q

Fonction de la protéine calnexine du RE

A

Retient les glycoprotéines incorrectement repliées et les empêche de quitter vers l’appareil de golgi pour facilité leur repliement

103
Q

Que ce passe il si une protéine n’est pas correctement repliée au niveau des calnexines

A

Protéine avec chaine de 3 glucose devrait normalement perdre 2 glucose par une enzyme, ensuite être reconnue par la calnexine, perd un glucose par la glucosidase et puis passer vers l’appareil de golgi
Si elle ne perd pas 3 glucoses, la calnexine la retient et l’empêche de quitter la lumière du RE

104
Q

Que ce oasse il aux protéines mal repliés après reconnaissance par les calnexines

A

Passent par le translocon vers le cytosol de la cellule, puis est dégradé par ubiquitination

105
Q

Quel organite symbolise la porte d’entrée de la voie de sécrétion

A

RE

106
Q

Que cause une augmentation de protéines mal répliquées dans la lumière de RE

A

protéine mal répliquée se lie au récepteur IRE1 qui envoie un signal au régulateur de transcription XBP1 qui passe dans le noyau et active la transcription de gène de calnexines

107
Q

Nom du récepteur qui capte quand il y a trop de protéines mal répliquées

A

IRE1

108
Q

Nom de la protéine qui régule la transcription de chaperons (calnexines)

A

XBP1

109
Q

Quand est ce que la protéine est libre de quitter le RE

A

lorsqu’elle n’a plus de glucose (tout enlevé par glucosidase)

110
Q

Lorsque les protéines quittent le réticulum endoplasmique, ou vont elles

A

Dans l’appareil de Golgi (série de citernes)

111
Q

Quelles composantes de l’appareil de Golgi sont traversées par le flux net de transport des protéines

A

CIS
MÉDIANE
TRANS

112
Q

Que retrouvons nous entre le RE et l’appareil de golgi

A

compartiment intermédiaire RE-golgien

113
Q

Fonction du compartiment intermédiaire RE-golgien

A

permet le transport des protéines du réticulum endoplasmique vers l’appareil de Golgi, ainsi que le trafic rétrograde des protéines du Golgi vers le réticulum endoplasmique

114
Q

2 types de transport du compartiment intermédiaire RE-golgien

A

antérograde (vers appareil de golgi CIS)
rétrograde (vers RE)

115
Q

Quelle protéine permet la formation de vésicules de transport antérograde dans le compartiment intermédiaire RE-golgien

A

COPII

116
Q

Quelle protéine permet la formation de vésicules de transport rétrograde dans le compartiment intermédiaire RE-golgien

A

COPI

117
Q

Rôle des microtubules dans le compartiment intermédiaire RE-golgien

A

régule le transport antérograde et rétrograde des vésicules

118
Q

Quelle protéine forme les vésicules de transport dans la direction de défault

A

COPII

119
Q

Que forme les vésicules de transport partant du RE

A

structures plus tubulaires qui se déplacent vers le réseau cis-golgien

120
Q

Que font les COPI et COPII pour donner la forme des vésicules

A

Forment des manteaux autour des bourgeonnements de la membrane

121
Q

Rôle de l’appareil de Golgi

A

Maturation des protéines produites dans le RER par glycosylation
Étiquetage des protéines pour donner destination
Triage des protéines dans des vésicules ou granules de sécrétion

122
Q

Comment sont transportés les vésicules et granules formés dans l’appareil de golgi pour se rendre à leur destination

A

par des microtubules (kinésine et dinéine)

123
Q

3 chemins possibles après le tri dans l’appareil de golgi

A

lysosomes
membrane plasmique
vésicule de sécrétion

124
Q

Est-ce qu’il y a glycosylation dans l’appareil de Golgi

A

Oui, il se termine la apres avoir commencer dans le RE

125
Q

2 types de sécrétions à partir de l’appareil de golgi

A

constitutive
régulée

126
Q

quel type de sécrétion est faite par toute les cellules en permanence

A

constitutive

127
Q

quel type de sécrétion est faite uniquement par les cellules sécrétoires suite à un signal extracellulaire

A

régulée

128
Q

Au niveau de quelle partie de l’appareil de golgi se fait le tri

A

réseau trans golgien

Médecine moléculaire et microscopique (30 decks)

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