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Médecine moléculaire et microscopique > Transcription de l'ADN > Flashcards

Transcription de l'ADN Flashcards

1
Q

La trancription implique la synthèse de … à partir de …

A

ARN
ADN

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Q

La traduction implique la synthèse de … à partir de …

A

Protéines
ARN

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3
Q

Produit final de la transcription

A

polymère de ribonucléotides (ARN)

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4
Q

Qu’est ce qui synthétise le produit final de la transcription

A

ARN polymérase

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5
Q

Dans quelle direction transcrit l’ARN polymérase

A

5’ à 3’

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6
Q

Comment classifie on les deux brins d’ADN qui sont utilisés lors de la transcription d’ARN à partir d’ADN

A

un brin codant
un brin matrice

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7
Q

Quel brin d’ADN est-ce que l’ARN polymérase synthétise une copie complémentaire

A

le brin matrice

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8
Q

Quel brin d’ADN est celui qui est identique à l’ARN transcrit

A

le brin codant

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9
Q

Différence entre une ribose et une désoxyribose

A

Ribose: OH sur le carbone 2
Désoxyribose: aucun OH sur le carbone 2

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10
Q

Différence entre l’uracil et la thymine

A

Uracil: CH
Thymine: CH3

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11
Q

Qu’est ce qui cause les structures secondaires et tertiaires de l’ARN

A

Intéractions entre ses bases

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12
Q

Qu’est ce qu’un pseudoknot

A

Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles

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13
Q

Fonction des structures secondaires et tertiaires

A

Limite la traduction
Stabilisé la structure

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14
Q

Effet de l’ARN polymérase sur la double hélice d’ADN lors de la trancription

A

Déroule l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN
Reforme la double hélice en arrière de l’ARN polymérase

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15
Q

Que retrouvons nous dans l’ARN polymérase lors de la polymérisation

A

Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement (hétéroduplex)

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16
Q

Comment est ce que l’ARN polymérase synthétise l’ARN

A

en copiant le brin codant d’ADN à l’aide du brin matrice d’ADN

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17
Q

De quel côté est lu le brin matrice lors de la transcription de l’ARN

A

3’ à 5’

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18
Q

Est-ce que l’ARN polymérase nécessite une ammorce pour la transcription

A

non

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19
Q

Comparer la précision des polymérases entre la transcription de l’ARN et la réplication de l’ADN

A

Transcription: pas autaut
Réplication: plus

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20
Q

Pourquoi est-ce que l’ADN polymérase est plus précis que l’ARN polymérase

A

Car les ARN ont des durée de vie limités, donc on peut se permettre des erreurs plus fréquentes

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21
Q

Quel type de lien créer l’ARN polymérase

A

phosphodiester entre les nucléotides dans son site actif

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22
Q

Qu’est ce qui indique à l’ARN polymérase ou commencer la transcription

A

promoteur (une séquence d’initiation)

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23
Q

Qu’est ce qui indique à l’ARN polymérase ou terminer la transcription

A

terminateur (une séquence de terminaison)

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24
Q

Chez les procaryotes, qu’est ce qui forme le complexe d’initiation de la transcription

A

L’ARN polymérase avec le facteur sigma

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25
Q

Qu’est ce qu’un facteur

A

Une protéine

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26
Q

Où est recruté le complexe d’initiation (ARN polymérase et facteur sigma)

A

Au niveau du promoteur

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27
Q

3 étapes de la transcription

A

Initiation
Élongation
Terminaison

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28
Q

Étapes détaillées du cycle de la transcription chez les procaryotes

A
  1. L’ARN polymérase et la facteur sigma sont recrutés au niveau du promoteur
  2. Le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant la transcription et le complexe se fixe au promoteur
  3. La transcription débute par la synthèse d’ARN par l’ARN polymérase du coté 5’ 3’
  4. Le facteur sigma est relâché quelques 10 nucléotides après l’initiation de la transcription
  5. La polymérisation d’ARN continue (élongation)
  6. Rencontre avec le terminateur induit un changement de forme de l’ARN et indique à l’ARN polymérase de se détacher, libérant l’ADN
  7. ARN polymérase retrouve un autre facteur sigma pour enclancher une nouvelle transcription
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29
Q

Que représente une séquence consensus

A

les résultats d’alignements de séquences multiples dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres

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30
Q

Quelle est la séquences consensus des procaryotes au niveau de la position -35

A

TTGACAT

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31
Q

Quelle est la séquences consensus des procaryotes au niveau de la position -10

A

TATAAT

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32
Q

Fonction du facteur sigma

A

permet la sélection du promoteur du gène à transcrire

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33
Q

Est ce que le facteur sigma se lie avant ou après que l’ARN polymérase se lie au promoteur pour la transcription

A

avant

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34
Q

Que permet les séquences consensus -35 et -10

A

Indique à l’ARN polymérase le sens de transcription, oriente le complexe
Indique le brin à utilisé

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35
Q

Qu’est ce qui augmente la force d’un promoteur, soit son affinité avec le facteur sigma

A

Pluse la séquence d’acides nucléiques est similaire à une séquence consensus idéale analysée

36
Q

Entre -35 et -10, quel séquence consensus est un repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription

A

-10 (TATAAT)

37
Q

Qu’est ce qui permet la reconnaissance entre l’ARN polymérase et le facteur sigma au niveau du promoteur

A

liaisons chimiques faibles

38
Q

Que retrouvons nous au niveau du terminateur du brin matrice ADN

A

Une séquence d’acides aminés qui, lorsque synthétisé par l’ARN polymérase, permet un changement de forme en TIGE-BOUCLE d’ARN et qui expulse l’ARN polymérase (termine la transcription)

39
Q

En quoi est riche la séquence d’acides aminés de la tige bouche de l’ARN synthétisé lors de la transcription

A

riche en liens G-C suivi d’une série de U, car les 3 liaisons hydrogène très stable de la tige bouche induit l’expulsion de la polymérase

40
Q

Quel type d’ARN polymérase synthétise les ARNm

A

ARN polymérase II

41
Q

Pour quoi code les ARNm

A

protéines

42
Q

Quel type d’ARN polymérase synthétise les ARNr

A

ARN polymérase I

43
Q

Que compose les ribosomes

A

ARNr

44
Q

Quel type d’ARN polymérase synthétise les ARNt

A

ARN polymérase III

45
Q

Fonction des ARNt

A

adaptateur lors de la synthèse protéique

46
Q

Quel type d’ARN polymérase synthétise les petits ARN utilisés dans différents processus cellulaires

A

ARN polymérase III

47
Q

Où se trouve le promoteur eucaryote typique de l’ARN polymérase II

A

-25

48
Q

Nom du promoteur eucaryote typique de l’ARN polymérase II

A

boîte TATA (TATAAA)

49
Q

Qu’est ce que le GTF et que font ils

A

facteurs généraux de la transcription qui reconnaissent et se lient aux séquences TATA box pour former le complexe d’initiation de la transcription avec l’ARN polymérase II

50
Q

Nommez 5 facteurs généraux de la transcription

A

TFIID
TFIIB
TFIIF
TFIIE
TFIIH

51
Q

2 composantes du facteur généraux de la transcription (GTF) TFIID

A

TBD
TAF

52
Q

Fonction du TFIID (TBD + TAF)

A

TBD: reconnait la TATA box
TAF: reconnait d’autres séquences près du promoteur

53
Q

Fonction du TFIIB

A

reconnait le BRE des promoteurs, positionne l’ARN polymérase au promoteur

54
Q

Fonction du TFIIF

A

stabilize l’interaction des autres facteurs avec l’ARN polymérase

55
Q

Fonction du TFIIE

A

attire et régule TFIIH

56
Q

Fonction du TFIIH

A

permet initiation de la transcription

57
Q

2 séquences d’ADN qui font partie du promoteur basal et qui augmentent sont efficacité et leur position

A

CAAT box (-80)
GC box (-100)

58
Q

Fonction des 2 séquences d’ADN CAAT box et GC box

A

Augmentent l’éfficacité du promoteur en augmentant la stabilité des facteurs protéiques avec l’ADN
Impliqués dans la régulation de la transcription des gènes

59
Q

Qu’est ce que des enhancers/sliencers

A

séquences d’ADN qui sont impliquées dans la régulation des gènes qui reçoivent des facteurs spécifiques d’activation ou d’inhibition

60
Q

Est ce que les séquences d’ADN enhancers/sliencers doivent se trouver proche du promoteur pour avoir un effet sur la transcription

A

Non il y a des GTF qui sont liés au TATA box qui s’occupe de recevoir les signaux de ces séquences d’ADN

61
Q

Que nécessite l’ARN polymérase II chez les eucaryotes pour initier la transcription

A

des facteurs protéiques et des signaux dans l’ADN (GTF et silencers/enhancers)

62
Q

Étapes de l’initiation de la transcription de l’ARNm par la polymérase II des eucaryotes

A
  1. Reconnaissance de la boite TATA par TFIID (contenant TBP)
  2. Recrutement de TFIIB par TFIID
  3. Recrutement de l’ARN polymérase II et de TFIIF, TFIIE, TFIIH
  4. Ceci forme le complexe d’initiation de la transcription
  5. Commencement de la transcription
63
Q

Est-ce que l’ARN polymérase peut reconnaitre la boite TATA

A

Non, elle doit être lié à la boîte TATA via les GTF pour pouvoir reconnaitre le promoteur

64
Q

Quels sont les premiers facteurs généraux de transcription (GTF) qui s’associent à l’ADN du promoteur TATA (eucaryotes)

A

TFIID et TFIIB

65
Q

Quel GTF cause une séparation des deux brins de l’ADN (fonction hélicase)

A

TFIIH

66
Q

Quel GTF effectue une phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase (fonction kinase)

A

TFIIH

67
Q

Quel est le signal de départ de l’ARN polymérase

A

libération des GTF:
TFIIB, TFIIE, TFIIF ET TFIIH

68
Q

Qu’est ce qui entraine la libération des GTF pour commencer la transcription

A

la phosphorylation de l’ARN polymérase par la TFIIH

69
Q

Quel est le seul GTF qui n’est pas libérer au signal de départ de la transcription

A

TFIID avec sa composante TBD (son présent dans le processus d’élongation)

70
Q

Quelle séquence de l’ADN matrice est transcrite par l’ARN polymérase et lui donne un signal de se détacher (terminaison)

A

AAUAAA

71
Q

Qu’est ce qu’une demi-vie des ARN

A

temps que ça prend pour arriver à 50% de la quantité initiale (PAS LA MOITIÉ DE LA VITESSE)

72
Q

Que permet la régulation de la transcription

A

l’expression du gène au bon moment selon les besoins de la cellule
(permet adaptation aux conditions changeantes)

73
Q

Durant quelle étape de la transcription est ce que un gène est régulé

A

initiation

74
Q

Qu’est ce qui change la vitesse d’élongation de la transcription

A

Rien, elle reste toujours pareil

75
Q

Qu’est ce qui peut réguler la transcription durant l’initiation

A

Les GTF et la séquence du promoteur

76
Q

2 séquences sur le gène qui permettent de réguler la transcription de l’ARN

A

enhancers
sliencers

77
Q

Quels facteurs se lient sur les enhancers et silencers

A

activateurs
répresseurs
(favorise et empêche l’assemblage de l’ARN polymérase et des protéines de transcription au niveau du promoteur)

78
Q

Comment est-ce que les activateurs et répresseurs ont un effet sur la transcription

A

leur lien avec des séquences spécifiques de nucléotides entraine un changement de conformation de l’ADN, résultant en activation ou inhibition de la transcription

79
Q

3 manière de stimulé la transcription à l’aide des facteurs d’activation

A
  1. recruter des facteurs GTF de la transcription et l’ARN polymérase
  2. attirer des complexe de remodelage de la chromatine (décondense)
  3. attirer des modificateurs chimiques de la chromatine
    (RÉPRESSEURS FONT LE CONTRAIRE)
80
Q

Qu’est ce qu’un facteur de transcription

A

protéine qui lie ADN et influence la transcription

81
Q

2 composantes de chaque facteur de transcription

A

un domaine de liaison à l’ADN (BDB)
un domaine d’activation ou répression (TAD= activation)

82
Q

Que font les facteurs de transcriptions

A

agissent en complexe protéique qui s’associe au région régulatrice du gène (proche ou loin) et déterminent la vitesse d’initiation de la transcription (PAS ÉLONGATION)

83
Q

Est ce que le complexe protéique d’initiation de la transcription (ARN pol + GTF) change selon le gène

A

Non

84
Q

Est ce que les facteurs de transcription et complexes protéiques spécifiques changent selon le gène

A

Oui, ils se lient aux région régulatrices du gène et ont une combinaison spécifique dépendamment du gène

85
Q

Dans l’acétylation des histones, que fait le facteur de transcription activateur et inhibiteur

A

activateur: recrute acétylase d’histone
inhibiteur: recrute désacétylase d’histone

86
Q

Dans le remodelage de la chromatine, que fait le facteur de transcription activateur

A

recrute le complexe protéique de remodelage de la chromatine

87
Q

Après que la chromatine soit décondensée, comment débute la transcription

A

recrutement de GTF et de l’ARN polymérase

Médecine moléculaire et microscopique (30 decks)

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