Transcription de l'ADN Flashcards
La trancription implique la synthèse de … à partir de …
ARN
ADN
La traduction implique la synthèse de … à partir de …
Protéines
ARN
Produit final de la transcription
polymère de ribonucléotides (ARN)
Qu’est ce qui synthétise le produit final de la transcription
ARN polymérase
Dans quelle direction transcrit l’ARN polymérase
5’ à 3’
Comment classifie on les deux brins d’ADN qui sont utilisés lors de la transcription d’ARN à partir d’ADN
un brin codant
un brin matrice
Quel brin d’ADN est-ce que l’ARN polymérase synthétise une copie complémentaire
le brin matrice
Quel brin d’ADN est celui qui est identique à l’ARN transcrit
le brin codant
Différence entre une ribose et une désoxyribose
Ribose: OH sur le carbone 2
Désoxyribose: aucun OH sur le carbone 2
Différence entre l’uracil et la thymine
Uracil: CH
Thymine: CH3
Qu’est ce qui cause les structures secondaires et tertiaires de l’ARN
Intéractions entre ses bases
Qu’est ce qu’un pseudoknot
Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles
Fonction des structures secondaires et tertiaires
Limite la traduction
Stabilisé la structure
Effet de l’ARN polymérase sur la double hélice d’ADN lors de la trancription
Déroule l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN
Reforme la double hélice en arrière de l’ARN polymérase
Que retrouvons nous dans l’ARN polymérase lors de la polymérisation
Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement (hétéroduplex)
Comment est ce que l’ARN polymérase synthétise l’ARN
en copiant le brin codant d’ADN à l’aide du brin matrice d’ADN
De quel côté est lu le brin matrice lors de la transcription de l’ARN
3’ à 5’
Est-ce que l’ARN polymérase nécessite une ammorce pour la transcription
non
Comparer la précision des polymérases entre la transcription de l’ARN et la réplication de l’ADN
Transcription: pas autaut
Réplication: plus
Pourquoi est-ce que l’ADN polymérase est plus précis que l’ARN polymérase
Car les ARN ont des durée de vie limités, donc on peut se permettre des erreurs plus fréquentes
Quel type de lien créer l’ARN polymérase
phosphodiester entre les nucléotides dans son site actif
Qu’est ce qui indique à l’ARN polymérase ou commencer la transcription
promoteur (une séquence d’initiation)
Qu’est ce qui indique à l’ARN polymérase ou terminer la transcription
terminateur (une séquence de terminaison)
Chez les procaryotes, qu’est ce qui forme le complexe d’initiation de la transcription
L’ARN polymérase avec le facteur sigma
Qu’est ce qu’un facteur
Une protéine
Où est recruté le complexe d’initiation (ARN polymérase et facteur sigma)
Au niveau du promoteur
3 étapes de la transcription
Initiation
Élongation
Terminaison
Étapes détaillées du cycle de la transcription chez les procaryotes
- L’ARN polymérase et la facteur sigma sont recrutés au niveau du promoteur
- Le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant la transcription et le complexe se fixe au promoteur
- La transcription débute par la synthèse d’ARN par l’ARN polymérase du coté 5’ 3’
- Le facteur sigma est relâché quelques 10 nucléotides après l’initiation de la transcription
- La polymérisation d’ARN continue (élongation)
- Rencontre avec le terminateur induit un changement de forme de l’ARN et indique à l’ARN polymérase de se détacher, libérant l’ADN
- ARN polymérase retrouve un autre facteur sigma pour enclancher une nouvelle transcription
Que représente une séquence consensus
les résultats d’alignements de séquences multiples dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres
Quelle est la séquences consensus des procaryotes au niveau de la position -35
TTGACAT
Quelle est la séquences consensus des procaryotes au niveau de la position -10
TATAAT
Fonction du facteur sigma
permet la sélection du promoteur du gène à transcrire
Est ce que le facteur sigma se lie avant ou après que l’ARN polymérase se lie au promoteur pour la transcription
avant
Que permet les séquences consensus -35 et -10
Indique à l’ARN polymérase le sens de transcription, oriente le complexe
Indique le brin à utilisé
Qu’est ce qui augmente la force d’un promoteur, soit son affinité avec le facteur sigma
Pluse la séquence d’acides nucléiques est similaire à une séquence consensus idéale analysée
Entre -35 et -10, quel séquence consensus est un repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription
-10 (TATAAT)
Qu’est ce qui permet la reconnaissance entre l’ARN polymérase et le facteur sigma au niveau du promoteur
liaisons chimiques faibles
Que retrouvons nous au niveau du terminateur du brin matrice ADN
Une séquence d’acides aminés qui, lorsque synthétisé par l’ARN polymérase, permet un changement de forme en TIGE-BOUCLE d’ARN et qui expulse l’ARN polymérase (termine la transcription)
En quoi est riche la séquence d’acides aminés de la tige bouche de l’ARN synthétisé lors de la transcription
riche en liens G-C suivi d’une série de U, car les 3 liaisons hydrogène très stable de la tige bouche induit l’expulsion de la polymérase
Quel type d’ARN polymérase synthétise les ARNm
ARN polymérase II
Pour quoi code les ARNm
protéines
Quel type d’ARN polymérase synthétise les ARNr
ARN polymérase I
Que compose les ribosomes
ARNr
Quel type d’ARN polymérase synthétise les ARNt
ARN polymérase III
Fonction des ARNt
adaptateur lors de la synthèse protéique
Quel type d’ARN polymérase synthétise les petits ARN utilisés dans différents processus cellulaires
ARN polymérase III
Où se trouve le promoteur eucaryote typique de l’ARN polymérase II
-25
Nom du promoteur eucaryote typique de l’ARN polymérase II
boîte TATA (TATAAA)
Qu’est ce que le GTF et que font ils
facteurs généraux de la transcription qui reconnaissent et se lient aux séquences TATA box pour former le complexe d’initiation de la transcription avec l’ARN polymérase II
Nommez 5 facteurs généraux de la transcription
TFIID
TFIIB
TFIIF
TFIIE
TFIIH
2 composantes du facteur généraux de la transcription (GTF) TFIID
TBD
TAF
Fonction du TFIID (TBD + TAF)
TBD: reconnait la TATA box
TAF: reconnait d’autres séquences près du promoteur
Fonction du TFIIB
reconnait le BRE des promoteurs, positionne l’ARN polymérase au promoteur
Fonction du TFIIF
stabilize l’interaction des autres facteurs avec l’ARN polymérase
Fonction du TFIIE
attire et régule TFIIH
Fonction du TFIIH
permet initiation de la transcription
2 séquences d’ADN qui font partie du promoteur basal et qui augmentent sont efficacité et leur position
CAAT box (-80)
GC box (-100)
Fonction des 2 séquences d’ADN CAAT box et GC box
Augmentent l’éfficacité du promoteur en augmentant la stabilité des facteurs protéiques avec l’ADN
Impliqués dans la régulation de la transcription des gènes
Qu’est ce que des enhancers/sliencers
séquences d’ADN qui sont impliquées dans la régulation des gènes qui reçoivent des facteurs spécifiques d’activation ou d’inhibition
Est ce que les séquences d’ADN enhancers/sliencers doivent se trouver proche du promoteur pour avoir un effet sur la transcription
Non il y a des GTF qui sont liés au TATA box qui s’occupe de recevoir les signaux de ces séquences d’ADN
Que nécessite l’ARN polymérase II chez les eucaryotes pour initier la transcription
des facteurs protéiques et des signaux dans l’ADN (GTF et silencers/enhancers)
Étapes de l’initiation de la transcription de l’ARNm par la polymérase II des eucaryotes
- Reconnaissance de la boite TATA par TFIID (contenant TBP)
- Recrutement de TFIIB par TFIID
- Recrutement de l’ARN polymérase II et de TFIIF, TFIIE, TFIIH
- Ceci forme le complexe d’initiation de la transcription
- Commencement de la transcription
Est-ce que l’ARN polymérase peut reconnaitre la boite TATA
Non, elle doit être lié à la boîte TATA via les GTF pour pouvoir reconnaitre le promoteur
Quels sont les premiers facteurs généraux de transcription (GTF) qui s’associent à l’ADN du promoteur TATA (eucaryotes)
TFIID et TFIIB
Quel GTF cause une séparation des deux brins de l’ADN (fonction hélicase)
TFIIH
Quel GTF effectue une phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase (fonction kinase)
TFIIH
Quel est le signal de départ de l’ARN polymérase
libération des GTF:
TFIIB, TFIIE, TFIIF ET TFIIH
Qu’est ce qui entraine la libération des GTF pour commencer la transcription
la phosphorylation de l’ARN polymérase par la TFIIH
Quel est le seul GTF qui n’est pas libérer au signal de départ de la transcription
TFIID avec sa composante TBD (son présent dans le processus d’élongation)
Quelle séquence de l’ADN matrice est transcrite par l’ARN polymérase et lui donne un signal de se détacher (terminaison)
AAUAAA
Qu’est ce qu’une demi-vie des ARN
temps que ça prend pour arriver à 50% de la quantité initiale (PAS LA MOITIÉ DE LA VITESSE)
Que permet la régulation de la transcription
l’expression du gène au bon moment selon les besoins de la cellule
(permet adaptation aux conditions changeantes)
Durant quelle étape de la transcription est ce que un gène est régulé
initiation
Qu’est ce qui change la vitesse d’élongation de la transcription
Rien, elle reste toujours pareil
Qu’est ce qui peut réguler la transcription durant l’initiation
Les GTF et la séquence du promoteur
2 séquences sur le gène qui permettent de réguler la transcription de l’ARN
enhancers
sliencers
Quels facteurs se lient sur les enhancers et silencers
activateurs
répresseurs
(favorise et empêche l’assemblage de l’ARN polymérase et des protéines de transcription au niveau du promoteur)
Comment est-ce que les activateurs et répresseurs ont un effet sur la transcription
leur lien avec des séquences spécifiques de nucléotides entraine un changement de conformation de l’ADN, résultant en activation ou inhibition de la transcription
3 manière de stimulé la transcription à l’aide des facteurs d’activation
- recruter des facteurs GTF de la transcription et l’ARN polymérase
- attirer des complexe de remodelage de la chromatine (décondense)
- attirer des modificateurs chimiques de la chromatine
(RÉPRESSEURS FONT LE CONTRAIRE)
Qu’est ce qu’un facteur de transcription
protéine qui lie ADN et influence la transcription
2 composantes de chaque facteur de transcription
un domaine de liaison à l’ADN (BDB)
un domaine d’activation ou répression (TAD= activation)
Que font les facteurs de transcriptions
agissent en complexe protéique qui s’associe au région régulatrice du gène (proche ou loin) et déterminent la vitesse d’initiation de la transcription (PAS ÉLONGATION)
Est ce que le complexe protéique d’initiation de la transcription (ARN pol + GTF) change selon le gène
Non
Est ce que les facteurs de transcription et complexes protéiques spécifiques changent selon le gène
Oui, ils se lient aux région régulatrices du gène et ont une combinaison spécifique dépendamment du gène
Dans l’acétylation des histones, que fait le facteur de transcription activateur et inhibiteur
activateur: recrute acétylase d’histone
inhibiteur: recrute désacétylase d’histone
Dans le remodelage de la chromatine, que fait le facteur de transcription activateur
recrute le complexe protéique de remodelage de la chromatine
Après que la chromatine soit décondensée, comment débute la transcription
recrutement de GTF et de l’ARN polymérase
