Maturation des ARN Flashcards
En quoi consiste la maturation de pré-ARNm
Addition de la coiffe en 5’
Épissage des introns
Polyadénylation
Que fait l’ARN pol autre que la transcription
Recrute via sa queue phosphorylée des protéines impliquées dans la maturation de l’ARN en voie de synthèse (co-transcriptionnel)
Quand se fait l’addition de la coiffe
quand ARN atteint 25 nucléotides
De quoi est composé la coiffe
7-méthyl-guanosine
Comment se fait l’ajout de la coiffe
Par la Capping Enzyme (CE) au bout 5’
Liaison 5’ vers 5’ inhabituelle (par 3 phosphates) au début de l’ARN résulte en un ARN plus résistant aux nucléases qui digèrent 5’-3’
Fonctions de la coiffe
Stabilité (protection contre exonucléases du cytoplasme)
Facilite l’export de l’ARNm vers le cytoplasme
Stimule la traduction par les ribosomes
Comment se fait l’addition de la séquence poly-A
En 3’
Les facteurs de clivage portés par la queue phosphorylée de l’ARN pol sont transférées sur la séquence AUAAA qui sert de signal au clivage et addition de la queue
Recrutement de la poly-A polymérase (PAP) au bout 3’ qui ajoute les A.
Recrutement de protéines liant le poly-A qui assurent la stabilité de la queue de poly-A (PABP: poly A binding proteins)
Quels sont les facteurs de clivage
CPSF: clevage/polyadenylation specificity factor
CstF: cleavage stimulation factor
Que fait la queue poly-A
Hausse la stabilité de l’ARNm en protégeant le bout 3’ même s’il y a dégradation progressive de la queue dans le cytoplasme
Facilite son exportation vers le cytoplasme
Favorise la traduction en identifiant les molécules d’ARNm matures prêtes à être traduites
Que contiennent souvent les permiers et derniers exons
Séquences non-condantes
5’ UTR et 3’ UTR
Qu’est-ce que l’épissage
Processus par lequel les introns sont excisés et les exons reliés entre eux pour donner naissance à l’ARNm mature
Que peuvent causer des failles dans l’épissage à cause des mutations dans les pré-ARNm
Nombreuses pathologies comme cancers, maladies neuromusculaires, thalassémie, maladies neurodégénératives etc
Que font les séquences spécifiques pour exciser un intron
Identifient les jct 5’ et 3’ des introns et sont reconnues par des petits ribonucléoprotéines nucléaires (snRNP) qui assistent la coupure de l’ARN aux jonctions intron-exon et relient les exons entre eux de façon covalente
Ou se trouve le point de branchement d’un intro
Environ 30 nucléotides avant la fin
Qu’Est-ce que le site donneur
Passage exon à intron
Qu’est-ce que le site accepteur
Passage intron à exon
Décrit le processus général de l’épissage
- A du point de branchement de l’intron attaque l’extrémité 5’ de l’intron au point d’épissage, et coupe le squelette sucre-phosphate.
- L’extrémité 5’ coupée de l’intron se lie de façon covalente au 2’OH du ribose de l’A pour former une structure branchée en forme de lasso
- L’extrémité 3’OH libre de l’exon 1 réagit avec le 5’ de l’exon 2, reliant les 2 exons ensemble pour former une séquence codante continue et libérant l’intron sous forme de lasso qui sera ensuite dégradé
Décrit le rôle des snRNP
- U1 snRNP possédant de l’ARN complémentaire aux séquences d’ARN se lie à la jonction exon1/intron. U2 snRNP se lie aussi par complémentarité à la séquence entourant le branch site
- Recrutement des snRNP U4/U6 et U5. U5snRNP force l’association de U1 et U2 amène l’adénine de la séquence UAAC.Structure favorable pour la formation du lasso mais pas de lien convalent encore entre les exons
- Relachement de U1 et U4. l’Adénine du site de branchement attaque le G en 5’ de l’intron, formation du lasso
- L’extrémité 3’OH de l’exon 1 attaque le premier nucléotide (G) de l’exon 2 en hydrolysant le lien phosphodiester entre l’intron et l’exon 2, ligation des exons
- Les snRNP sont libérés pour être recyclés tandis que les introns sont dégradés dans le noyau
Comment s’explique la diversité des protéines si nous avons seulement 30 000 gènes
Épissage alternatif qui est tissu spécifique
Qu’est-ce que l’épissage alternatif
Un transcrit primaire peut être épissé différement selon le type cellulaire
Durant épissage alternatif, on peut avoir élimination ou inclusion de certains exons, produisant différents ARNm qui seront traduits en différentes protéines (ayant des modules identiques et différents)
Donne un exemple d’épissage alternatif
L’alpha-tropomyosine est une protéine super-enroulée qui contrôle la contraction dans les cellules musculaires régulant les interactions entre actine et myosine
Dans les cellules non-musculaires, elle a des roles dans la régulation du cytosquelette
Qu’est-ce que la régulation positive
Activateur de l’épissage mène à l’exclusion d’un intron dans l’ARNm mature
Qu’est-ce que la régulation négative
Réresseur de l’épissage inclus un intron dans l’ARNm mature
Pourquoi seuls les ARNm matures sortent du noyau
PCQ le complexe de pores nucléaires reconnait et exporte seulement les ARNm ayant terminé leur maturation
Un ensemble de protéines signale que la maturation est correcte et prêt à l’exportation: protéine de liaison à la poly-A (PABP), protéine de liaison à la coiffe (cap-binding protein) et un complexe de protéies qui se lie à la jonction d’exons (EJC)
Quelle est l’étape principale pour la régulation de la plupart des gènes
Transcription
