Maturation des ARN

Question 1

En quoi consiste la maturation de pré-ARNm

Answer 1

Addition de la coiffe en 5’
Épissage des introns
Polyadénylation

Question 2

Que fait l’ARN pol autre que la transcription

Answer 2

Recrute via sa queue phosphorylée des protéines impliquées dans la maturation de l’ARN en voie de synthèse (co-transcriptionnel)

Question 3

Quand se fait l’addition de la coiffe

Answer 3

quand ARN atteint 25 nucléotides

Question 4

De quoi est composé la coiffe

Answer 4

7-méthyl-guanosine

Question 5

Comment se fait l’ajout de la coiffe

Answer 5

Par la Capping Enzyme (CE) au bout 5’
Liaison 5’ vers 5’ inhabituelle (par 3 phosphates) au début de l’ARN résulte en un ARN plus résistant aux nucléases qui digèrent 5’-3’

Question 6

Fonctions de la coiffe

Answer 6

Stabilité (protection contre exonucléases du cytoplasme)
Facilite l’export de l’ARNm vers le cytoplasme
Stimule la traduction par les ribosomes

Question 7

Comment se fait l’addition de la séquence poly-A

Answer 7

En 3’
Les facteurs de clivage portés par la queue phosphorylée de l’ARN pol sont transférées sur la séquence AUAAA qui sert de signal au clivage et addition de la queue
Recrutement de la poly-A polymérase (PAP) au bout 3’ qui ajoute les A.
Recrutement de protéines liant le poly-A qui assurent la stabilité de la queue de poly-A (PABP: poly A binding proteins)

Question 8

Quels sont les facteurs de clivage

Answer 8

CPSF: clevage/polyadenylation specificity factor
CstF: cleavage stimulation factor

Question 9

Que fait la queue poly-A

Answer 9

Hausse la stabilité de l’ARNm en protégeant le bout 3’ même s’il y a dégradation progressive de la queue dans le cytoplasme
Facilite son exportation vers le cytoplasme
Favorise la traduction en identifiant les molécules d’ARNm matures prêtes à être traduites

Question 10

Que contiennent souvent les permiers et derniers exons

Answer 10

Séquences non-condantes
5’ UTR et 3’ UTR

Question 11

Qu’est-ce que l’épissage

Answer 11

Processus par lequel les introns sont excisés et les exons reliés entre eux pour donner naissance à l’ARNm mature

Question 12

Que peuvent causer des failles dans l’épissage à cause des mutations dans les pré-ARNm

Answer 12

Nombreuses pathologies comme cancers, maladies neuromusculaires, thalassémie, maladies neurodégénératives etc

Question 13

Que font les séquences spécifiques pour exciser un intron

Answer 13

Identifient les jct 5’ et 3’ des introns et sont reconnues par des petits ribonucléoprotéines nucléaires (snRNP) qui assistent la coupure de l’ARN aux jonctions intron-exon et relient les exons entre eux de façon covalente

Question 14

Ou se trouve le point de branchement d’un intro

Answer 14

Environ 30 nucléotides avant la fin

Question 15

Qu’Est-ce que le site donneur

Answer 15

Passage exon à intron

Question 16

Qu’est-ce que le site accepteur

Answer 16

Passage intron à exon

Question 17

Décrit le processus général de l’épissage

Answer 17

1. A du point de branchement de l’intron attaque l’extrémité 5’ de l’intron au point d’épissage, et coupe le squelette sucre-phosphate.
2. L’extrémité 5’ coupée de l’intron se lie de façon covalente au 2’OH du ribose de l’A pour former une structure branchée en forme de lasso
3. L’extrémité 3’OH libre de l’exon 1 réagit avec le 5’ de l’exon 2, reliant les 2 exons ensemble pour former une séquence codante continue et libérant l’intron sous forme de lasso qui sera ensuite dégradé

Question 18

Décrit le rôle des snRNP

Answer 18

1. U1 snRNP possédant de l’ARN complémentaire aux séquences d’ARN se lie à la jonction exon1/intron. U2 snRNP se lie aussi par complémentarité à la séquence entourant le branch site
2. Recrutement des snRNP U4/U6 et U5. U5snRNP force l’association de U1 et U2 amène l’adénine de la séquence UAAC.Structure favorable pour la formation du lasso mais pas de lien convalent encore entre les exons
3. Relachement de U1 et U4. l’Adénine du site de branchement attaque le G en 5’ de l’intron, formation du lasso
4. L’extrémité 3’OH de l’exon 1 attaque le premier nucléotide (G) de l’exon 2 en hydrolysant le lien phosphodiester entre l’intron et l’exon 2, ligation des exons
5. Les snRNP sont libérés pour être recyclés tandis que les introns sont dégradés dans le noyau

Question 19

Comment s’explique la diversité des protéines si nous avons seulement 30 000 gènes

Answer 19

Épissage alternatif qui est tissu spécifique

Question 20

Qu’est-ce que l’épissage alternatif

Answer 20

Un transcrit primaire peut être épissé différement selon le type cellulaire
Durant épissage alternatif, on peut avoir élimination ou inclusion de certains exons, produisant différents ARNm qui seront traduits en différentes protéines (ayant des modules identiques et différents)

Question 21

Donne un exemple d’épissage alternatif

Answer 21

L’alpha-tropomyosine est une protéine super-enroulée qui contrôle la contraction dans les cellules musculaires régulant les interactions entre actine et myosine
Dans les cellules non-musculaires, elle a des roles dans la régulation du cytosquelette

Question 22

Qu’est-ce que la régulation positive

Answer 22

Activateur de l’épissage mène à l’exclusion d’un intron dans l’ARNm mature

Question 23

Qu’est-ce que la régulation négative

Answer 23

Réresseur de l’épissage inclus un intron dans l’ARNm mature

Question 24

Pourquoi seuls les ARNm matures sortent du noyau

Answer 24

PCQ le complexe de pores nucléaires reconnait et exporte seulement les ARNm ayant terminé leur maturation
Un ensemble de protéines signale que la maturation est correcte et prêt à l’exportation: protéine de liaison à la poly-A (PABP), protéine de liaison à la coiffe (cap-binding protein) et un complexe de protéies qui se lie à la jonction d’exons (EJC)

Question 25

Quelle est l’étape principale pour la régulation de la plupart des gènes

Answer 25

Transcription