ADN - Concepts à retenir Flashcards
Quelles sont les bases qui composent l’ADN et les bases qui composent l’ARN?
ADN: AT - CG
ARN: AU - CG
Quels sont les appariements de bases dans l’ADN et dans l’ARN?
ADN: AT - CG
ARN: AU - CG
Quels sont les sucres dans l’ADN et dans l’ARN?
ADN: Désoxyribose
ARN: Ribose
Qu’est-ce qu’un lien phosphodiester?
Lien entre les carbones 5’ et 3’ des sucres
Qu’est-ce que la polarité de l’ADN?
La direction des brins
Phosphates confèrent une charge négative à l’ADN
Pourquoi l’ADN est double brin?
Sucres et phosphates à l’extérieur de l’hélice / Base ayant une complémentarité se retrouvent à l’intérieur / Plus facile de retrouver les erreurs de complémentarité
Comment les brins sont orientés dans la double hélice?
Antiparallèles et complémentaires
Combien de paires de bases par tour d’hélice?
10 paires de nucléotides par tour d’hélice
Quelles sont les protéines se lient à l’ADN?
Protéines basiques (positives)
Quelle liaison entres les bases est la plus forte?
Liaison CG plus forte que la liaison AT (car plus de ponts-H)
Dans quel direction la réplication est effectuée?
Sens 5’ vers 3’
Quelle sont les caractéristiques d’une origine de réplication?
Riche en AT
Quelle est la chaine d’actions pour démarrer une origine de réplication?
Protéines d’initiation, hélices, primase, complexe primasse-hélicase
Qu’est-ce que le brin avancé et le brin tardif?
Brin conducteur: synthèse ADN à partir d’une seule amorce
Brin retardé : synthèse discontinue sous formes de courts fragments (d’Okasaki)
Quelles sont les enzymes impliquées dans la réplication?
Primase (crée amorce ARN)
ADN polymérase III (utilise amorce pour faire ADN)
ADN polymérase I (enlève amorce ARN pour ADN)
ADN ligase ((Lie bouts d’ADN en créant lien phosphodiester avec ATP)
(Enlève Nick))
Sliding clamp (Maintient ADN poly. avec ADN
SSB (empêche ADN simple brin de se fixer à sa complémentaire)
Quelles sont les caractéristiques des ADN polymérases?
5’ vers 3’
Requiert amorce
Requiert matrice
Quelles sont les caractéristiques des ARN polymérases?
Ne requiert pas d’amorce pour faire ribonucléotides
Synthétise des amorces d’ARN à partir d’une matrice d’ADN
Qu’est-ce qu’un fragment d’Okazaki et comment est-il généré?
Fragment d’ADN fait par la polymérase, mais qui ne sont pas lié, car l’ADN polymérase III peut seulement aller de 5’ à 3’, ce qui laisse de l’espace entre les différentes amorces
Comment les télomères (bout de l’ADN) sont répliqués?
Enzyme télomérase ajoute séquence répétée (1500x) d’ADN à l’extrémité 3’-OH du brin matrice tardif
Quels sont les rôles des télomères dans le cancer et le vieillissement?
Seulement active dans gamètes et cellules souches
Donc perte d’activité dans cellules somatique ce qui raccourcie télomères
Quels sont les rôles des télomères dans le cancer et le vieillissement?
Seulement active dans gamètes et cellules souches
Donc perte d’activité dans cellules somatique ce qui raccourcie télomères
Quelle est la différence entre une mutation somatique et une mutation germinale?
Germinale: seront héritées (maladie hériditaire)
Somatique: non héréditaire - peuvent mener au cancer
Quelles sont les causes des mutations?
Erreur machinerie réplicative pas corrigée et transmise
Mismatch (ex: A avec G)
Dépurination (pu de base)
Déamination (C en U (ressemblance structure))
Dimères thymine (lien cavalent entre thymines)
Quelles sont les mécanismes de réparation de mutations?
Proofreading (verif. et autocorrection par ADN polymérase)
DNA mismatch repair system (reconnaissance, excision et réparation / après réplication)
Excision repair (Repolymérisation par ADN polymérase de réparation et ligation / dommage à l’ADN)
Comment les mutations sont reconnues dans la cellule?
Nucléotides erronés ou endommagés causent une torsion ou/et déformation de la double hélice
Protéines de reconnaissance forment un complexe qui recrute une exonucléase (Exo1 / Pour DNA MRS, sinon pour Excision repair, nucléase (pas préciser)) pour dégradée nucléotide
- Reconnaitre brin matrice: chez E. Coli, brin pas encore méthylé
- chez autres, présence de Nick sur le brin néosynthétisé ou méthylé
