ADN - Concepts à retenir

Question 1

Quelles sont les bases qui composent l’ADN et les bases qui composent l’ARN?

Answer 1

ADN: AT - CG
ARN: AU - CG

Question 2

Quels sont les appariements de bases dans l’ADN et dans l’ARN?

Answer 2

ADN: AT - CG
ARN: AU - CG

Question 3

Quels sont les sucres dans l’ADN et dans l’ARN?

Answer 3

ADN: Désoxyribose
ARN: Ribose

Question 4

Qu’est-ce qu’un lien phosphodiester?

Answer 4

Lien entre les carbones 5’ et 3’ des sucres

Question 5

Qu’est-ce que la polarité de l’ADN?

Answer 5

La direction des brins
Phosphates confèrent une charge négative à l’ADN

Question 6

Pourquoi l’ADN est double brin?

Answer 6

Sucres et phosphates à l’extérieur de l’hélice / Base ayant une complémentarité se retrouvent à l’intérieur / Plus facile de retrouver les erreurs de complémentarité

Question 7

Comment les brins sont orientés dans la double hélice?

Answer 7

Antiparallèles et complémentaires

Question 8

Combien de paires de bases par tour d’hélice?

Answer 8

10 paires de nucléotides par tour d’hélice

Question 9

Quelles sont les protéines se lient à l’ADN?

Answer 9

Protéines basiques (positives)

Question 10

Quelle liaison entres les bases est la plus forte?

Answer 10

Liaison CG plus forte que la liaison AT (car plus de ponts-H)

Question 11

Dans quel direction la réplication est effectuée?

Answer 11

Sens 5’ vers 3’

Question 12

Quelle sont les caractéristiques d’une origine de réplication?

Answer 12

Riche en AT

Question 13

Quelle est la chaine d’actions pour démarrer une origine de réplication?

Answer 13

Protéines d’initiation, hélices, primase, complexe primasse-hélicase

Question 14

Qu’est-ce que le brin avancé et le brin tardif?

Answer 14

Brin conducteur: synthèse ADN à partir d’une seule amorce
Brin retardé : synthèse discontinue sous formes de courts fragments (d’Okasaki)

Question 15

Quelles sont les enzymes impliquées dans la réplication?

Answer 15

Primase (crée amorce ARN)
ADN polymérase III (utilise amorce pour faire ADN)
ADN polymérase I (enlève amorce ARN pour ADN)
ADN ligase ((Lie bouts d’ADN en créant lien phosphodiester avec ATP)
(Enlève Nick))
Sliding clamp (Maintient ADN poly. avec ADN
SSB (empêche ADN simple brin de se fixer à sa complémentaire)

Question 16

Quelles sont les caractéristiques des ADN polymérases?

Answer 16

5’ vers 3’
Requiert amorce
Requiert matrice

Question 17

Quelles sont les caractéristiques des ARN polymérases?

Answer 17

Ne requiert pas d’amorce pour faire ribonucléotides
Synthétise des amorces d’ARN à partir d’une matrice d’ADN

Question 18

Qu’est-ce qu’un fragment d’Okazaki et comment est-il généré?

Answer 18

Fragment d’ADN fait par la polymérase, mais qui ne sont pas lié, car l’ADN polymérase III peut seulement aller de 5’ à 3’, ce qui laisse de l’espace entre les différentes amorces

Question 19

Comment les télomères (bout de l’ADN) sont répliqués?

Answer 19

Enzyme télomérase ajoute séquence répétée (1500x) d’ADN à l’extrémité 3’-OH du brin matrice tardif

Question 20

Quels sont les rôles des télomères dans le cancer et le vieillissement?

Answer 20

Seulement active dans gamètes et cellules souches
Donc perte d’activité dans cellules somatique ce qui raccourcie télomères

Question 21

Quels sont les rôles des télomères dans le cancer et le vieillissement?

Answer 21

Seulement active dans gamètes et cellules souches
Donc perte d’activité dans cellules somatique ce qui raccourcie télomères

Question 22

Quelle est la différence entre une mutation somatique et une mutation germinale?

Answer 22

Germinale: seront héritées (maladie hériditaire)
Somatique: non héréditaire - peuvent mener au cancer

Question 23

Quelles sont les causes des mutations?

Answer 23

Erreur machinerie réplicative pas corrigée et transmise
Mismatch (ex: A avec G)
Dépurination (pu de base)
Déamination (C en U (ressemblance structure))
Dimères thymine (lien cavalent entre thymines)

Question 24

Quelles sont les mécanismes de réparation de mutations?

Answer 24

Proofreading (verif. et autocorrection par ADN polymérase)
DNA mismatch repair system (reconnaissance, excision et réparation / après réplication)
Excision repair (Repolymérisation par ADN polymérase de réparation et ligation / dommage à l’ADN)

Question 25

Comment les mutations sont reconnues dans la cellule?

Answer 25

Nucléotides erronés ou endommagés causent une torsion ou/et déformation de la double hélice
Protéines de reconnaissance forment un complexe qui recrute une exonucléase (Exo1 / Pour DNA MRS, sinon pour Excision repair, nucléase (pas préciser)) pour dégradée nucléotide
- Reconnaitre brin matrice: chez E. Coli, brin pas encore méthylé
- chez autres, présence de Nick sur le brin néosynthétisé ou méthylé