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Biochimie Cyprien > Le Glycogène Phosphorylase > Flashcards

Le Glycogène Phosphorylase Flashcards

1
Q

Les enzymes, accélèrent t’il une reaction?

A
  • OUI
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Q

Les enzymes influent t’il l’équilibre de la réaction?

A
  • NON
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3
Q

Quelles sont les étapes qui fait transforme le substrat en produit?

A
  • La phase initiale
  • La phase stationnaire
  • L’équilibre
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4
Q

Quelles sont les caractéristiques de la phase initiale?

A
  • La phase initiale est une phase de latence ou l’enzyme et le substrat ne sont pas encore liés
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Q

Quelles sont les caractéristiques de la phase stationnaire?

A
  • La phase stationnaire est l’enzyme fonctionne de façon régulière, a vitesse constante
      • La vitesse en phase stationnaire (V0) est donnée par la pente de la tangente en 0
      • On considère que l’enzyme libre se lie directement a une molecule de substrat, car il est en large excès par rapport a l’enzyme
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6
Q

Quelles sont les caractéristiques de la phase de l’équilibre?

A
  • La phase de l’équilibre est la réaction se ralentit, car il y a moins de substrat et plus de produit, donc la liaison enzyme-substrat se fait plus difficilement
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7
Q

Qu’est qu’on appelle vitesse en cinétique enzymatique?

A
  • On appelle « vitesse » la variation de la quantité de produit ou de substrat dans le milieu
  • Cela se traduit mathématiquement par la relation :
      • V = - (d[S] / dt) = d[P] / dt
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8
Q

Quelle est l’équation de Michaelis-Menten?

A
  • L’équation de Michaelis-Menten :
      • V0 = Vmax ([S] / (Km + [S]))
      • V0 :
        • La vitesse initiale de la réaction (pendant la phase stationnaire)
      • Vmax :
        • La vitesse maximale qu’une réaction puisse atteindre pour : une enzyme spécifique, et une certaine quantité de cette enzyme
      • [S] :
        • La concentration en substrat
      • KM :
        • La concentration en substrat pour laquelle V0 = Vmax/2, autrement appelée constante de Michaelis
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9
Q

La glycogène phosphorylase est une enzyme comment?

A
  • La glycogène phosphorylase est une enzyme allostérique car la coopération entre ses différentes sous-unités permet une régulation de son activité
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10
Q

La glycogène phosphorylase est une enzyme allostérique car elle comporte quoi?

A
  • La glycogène phosphorylase est une enzyme allostérique car elle comporte :
      • Plusieurs sous unites (2 pour la glycogène P)
      • Plusieurs sites de liaisons pour un/des ligands (2 sites catalytiques pour le Pi+ 2 sites pour le glycogène) telle que la liaison sur un site modifie la liaison des autres ligands
        • Cela veut dire que la fixation d’un ligand favorise la fixation d’un autre ligand : c’est la notion de coopérativité
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11
Q

Que fait la forme R dans la glycogène phosphorylase?

A
  • La forme R a une grande affinité car dans cet état le phosphate de pyridoxal est dans un environnement favorisant la fixation de Pi ,en effet vu que le Pi est chargé négativement et que la Lysine et l’Arginine sont globalement chargées positivement il y a une interaction qui favorise la fixation de Pi
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12
Q

Que fait la forme T dans la glycogène phosphorylase?

A
  • La forme T a une faible affinité car dans cet état le phosphate de pyridoxal est dans un environnement défavorisant la fixation de phosphate inorganique (Pi) , en effet vu que le Pi est chargé négativement et que l’Arginine a été remplacée par un acide aspartique qui est chargé négativement , il y a une interaction défavorable à la fixation de Pi
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13
Q

Les effecteurs allostériques sont des ligands de quoi et ils se fixent sur quoi?

A
  • Les effecteurs allostériques sont des ligands de la glycogène phosphorylase
      • Ils se fixent sur la protéine sur les sites de régulation (et non sur les sites actifs, attention)
      • On a donc deux types d’effecteurs : les activateurs et les inhibiteurs
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14
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’effecteur, les activateurs?

A
  • ACTIVATEUR : AMP
      • Dans le cytoplasme quand la cellule est en manque d’énergie (après hydrolyse de l’ATP)
        • La cellule est donc en besoin d’énergie, et va donc favoriser la libération du G1P (qui, métabolisé, permet de générer de l’ATP)
      • Favorise l’état R
      • Meilleure affinité (besoin de moins de Pi pour une même vitesse) , déplacement de la courbe vers la gauche
      • Petite K ½
        • Effet hétérotrope positif
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15
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’effecteur, les inhibiteurs?

A
  • INHIBITEURS : ATP et G6P
      • Dans le cytoplasme quand la cellule a beaucoup d’énergie
        • Elle n’a donc pas besoin d’ATP, et ne va pas activer la voie de production du G1P
    – Favorise l’état T
      • Mauvaise affinité
        • On a besoin de + de Pi pour activer l’enzyme, déplacement de la courbe vers la droite
      • Grande K ½
      • Effet hétérotrope négatif
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16
Q

La glycogène phosphorylase est aussi present sous quelles formes?

A
  • La GP est aussi présente sous deux formes distinctes : a et b (a ne pas confondre avec R et T)
      • La phosphorylation de la GP se fait par la phosphorylase kinase en présence d’ATP dans le milieu et sur la sérine 14 des 2 sous-unités
      • Il y a donc modification covalente des deux sous-unités
      • L’enzyme peut prendre deux formes, selon sa liaison ou non avec un phosphate sans P la forme b ou la forme a
17
Q

Quelles sont les caractéristiques de la forme a de la glycogène phosphorylase?

A
  • La forme a :
      • Avec phosphate (phosphorylée)
      • Favorise l’état R
        • Donc forte activité
18
Q

Quelles sont les caractéristiques de la forme b de la glycogène phosphorylase?

A
  • La forme b :
      • Sans phosphate (déphosphorylée)
      • Favorise l’état T
        • Donc faible activité
19
Q

Est ce que a/b est la meme chose que T/R?

A
  • a/b n’est pas la même chose que T/R ! La forme a favorise la forme R, et la forme b favorise la forme T, mais ce sont deux choses distinctes
  • Les forme R et T sont dépendantes des régulateurs allostériques, alors que les formes a et b dépendent de la régulation covalente
20
Q

La phosphorylation de la glycogène phosphorylase est le résultat de quoi?

A
  • La phosphorylation de la glycogène phosphorylase est le résultat d’une cascade enzymatique
21
Q

La cascade enzymatique de la glycogène phosphorylase est activé par quoi?

A
  • La cascade enzymatique de la glycogène phosphorylase est activé par :
      • Les catécholamines (adrénaline, noradrénaline), pour faire simple des hormones de réponse au stress
        • Ces hormones se fixent sur les cellules du muscle et du foie
      • Le glucagon, sécrété par le pancréas quand la concentration de glucose dans le sang est trop faible
        • Le glucagon ne se fixe que sur les cellules du foie, mais n’a pas d’action directe sur le muscle
22
Q

Dans le glycogène phosphorylase, les catecholamines et le glucagon envoient quoi?

A
  • Les catecholamines et le glucagon envoient un signal qui arrive ensuite au niveau d’un récepteur transmembranaire qui provoque l’activation de l’adénylate cyclase
23
Q

L’adénylate transforme l’ATP en quoi?

A
  • L’adénylate transforme l’ATP en AMPc
24
Q

L’AMPc active quoi?

A
  • L’AMPc active la protéine kinase A :

- - L’AMPc se lie à cette protéine inactive et provoque la dissociation dessous-unités catalytiques

25
Q

L’activation de la protéine kinase A entraîne quoi?

A
  • L’activation de la protéine kinase A entraîne l’activation de la phosphorylase kinase
      • La phosphorylase kinase est également activée par le calcium Ca2+
26
Q

La phosphorylase kinase va phosphoryler quoi?

A
  • La phosphorylase kinase va phosphoryler la glycogène phosphorylase et ainsi l’activer
27
Q

Au niveau du foie, que ce passe t’il au glycogène phosphorylase sans signal de glucagon (forme, état et production)?

A
  • Au niveau du foie :
      • Sans signal glucagon
        • Sous forme déphosphorylée b
        • État T prédominant
        • Pas de production
28
Q

Au niveau du foie, que ce passe t’il au glycogène phosphorylase avec signal de glucagon (forme, état et production)?

A
  • Au niveau du foie :
      • Avec signal glucagon
        • Sous forme phosphorylée a
        • État T prédominant
        • Production de glucose-1-phosphate
29
Q

Au repos, quelle est l’état/forme du muscle “non stressé”?

A
  • Au niveau du muscle “non stressé” :
      • Au repos :
        • Forme déphosphorylée b
30
Q

Au fur et à mesure d’exercice, quelle est l’état/forme du muscle “non stressé”?

A
  • Au niveau du muscle “non stressé” :
      • Au fur et à mesure d’exercice :
        • Activation allostérique sous forme R
31
Q

Si il y a de nouveaux de l’ATP et du glucose 6 phosphate, quelle est l’état/forme du muscle “non stressé”?

A
  • Au niveau du muscle “non stressé” :
      • Si de nouveaux ATP et glucose 6 phosphate :
        • Retour forme T
32
Q

Que ce passe t’il au muscle stressé?

A
  • Au niveau du muscle stressé
      • Activation des catécholamines
      • Activation de la phosphorylase kinase
      • Glycogène phosphorylase sous forme a
      • Principalement sous l’état R

Biochimie Cyprien (14 decks)

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