Génétique final Flashcards
Quels sont les 3 types de génomes des eucaryotes?
-Génome nucléaire
-Génome mitochondrial
-Génome plastidial ou plastidique (dans le nucléoïde des
chloroplastes)
Quels sont les 3 types de génomes des procaryotes?
-Généralement sur un seul chromosome circulaire
-Génome extrachromosomique : présence de plasmides ou d’épisomes (ADN circulaire qui peut se répliquer de manière autonome)
La transmission cytoplasmique suit un patron d’hérédité mendélien V/F
Faux
Comment est la ségrégation dans la transmission cytoplasmique?
Aléatoire
Comment sont distribués les mitochondries et les chloroplastes dans la transmission cytoplasmique?
Distribués au hasard
Quels sont les 2 types de transmission cytoplasmique?
-Horizontale
-Verticale
Transmission horizontale
-Transfert d’ADN d’une cellule à une autre
-Une fois dans la cellule receveuse, l’ADN peut se répliquer
Transmission verticale
Le contenu du cytoplasme est divisé de manière aléatoire entre les deux cellules filles grâce à pls mitoses
Définition plasmide
Élément génétique bactérien distinct de l’ADN chromosomique
Définition épisome
Épisome : Élément génétique bactérien (plasmide) susceptible de s’intégrer dans le chromosome
Caractéristiques des plasmides
-Capables de réplication autonome
-Non essentiels à la cellule
Quel type de transfert est la conjugaison?
Horizontal
Comment fonctionne la conjugaison?
-La présence du plasmide F permet la formation de pili sexuels (contiennent le gène tra qui induit la formation des pili)
-Ces ponts de conjugaison servent au transfert du matériel génétique. Une fois le transfert effectué, la bactérie qui était F- devient F+
-Le plasmide F est un épisome et sera éventuellement introduit dans le chromosome de la bactérie (HFr)
Quels sont les avantages des plasmides de résistance?
-Source importante de l’augmentation de la résistance aux antibiotiques
-Réplication indépendante du cycle cellulaire
-Peuvent être transmis de manière horizontale à d’autres bactéries
Définition transformation
Bactéries mourantes libérant leur ADN
Définition transduction
Transmission d’éléments transposables via des bactériophages
Définition conjugaison
Transfert de plasmides via
les ponts de conjugaison
Quels sont les 2 organites eucaryotes qui ont leur propre génome?
-Mitochondries
-Chloroplastes
Quels sont les points communs entre les mitochondries et les chloroplastes?
-Existent en plusieurs copies par organite,
-Réplication indépendante du reste de la cellule
-Transmission non mendélienne
-Génomes circulaires
-Séquences ressemblant aux génomes bactériens.
Comment se fait la transmission des mitochondries/chloroplastes?
Transmission verticale
Quelles sont les évidences microscopiques de l’endosymbiose?
-Mitochondries: double membrane
-Chloroplastes: triple membrane
-Ont leur propre ADN, semblable à celui des procaryotes
-Transcription et traduction semi-autonome
-Se divisent par fission
-Ont des chaînes de transport d’électrons membranaires
Quelles sont les évidences génétiques de l’endosymbiose?
Phylogénie moléculaire grâce aux caractères morphologiques et moléculaires
Définition phylogénie
La comparaison des séquences des gènes homologues permet de retracer l’histoire des mutations et de l’évolution des espèces
D’où viennent les phénotypes affectant les chloroplastes?
Peuvent venir du noyau ou du chloroplaste
Caractéristiques mitochondries (7)
-Organites cytoplasmiques à double membrane
-Uniquement chez les eucaryotes.
-Dans tous les types cellulaires sauf les globules rouges.
-Chaque cellule contient 1000-3000 mitochondries selon les types cellulaires
-Possèdent leurs propres génomes
-Sont transmises de façon strictement maternelle
-Se déplacent grâce aux interactions avec le cytosquelette
Fonctions mitochondries (7)
-Respiration cellulaire (ATP)
-Fonctions de synthèse (ex. certains aa et phospholipides, hormones)
-Régulation calcique
-Thermogénèse
-Apoptose
-Immunité
-Impliquées dans plusieurs maladies et dans le vieillissement
Définition hétéroplasmie
Coexistence de plusieurs génomes différents dans la même cellule à cause des mutations
Définition évolution réductive de l’ADN mitochondriale
Transfert d’une majeure partie des gènes vers le noyau
Réduction du nb de gènes dans les mitochondries et les chloroplastes
Hypothèse des radicaux libres
Les fonctions énergétiques des mito et des plastes produiraient des radicaux libres mutagènes et les gènes, lorsque relocalisés dans le noyau, auraient moins de chance de muter
Hypothèse du cliquet de Muller
La transmission maternelle et l’absence de recombinaison dans les mitochondries font que la probabilité de fixation de mutations délétères y est plus forte que dans le noyau
Pourquoi les mutations ont plus de chances de rester dans les mito?
Elles ont moins de mécanismes de réparation que le noyau
Où sont codées les protéines mitochondriales?
La majorité des protéines
mitochondriales sont codées dans
le noyau
Définition signalisation rétrograde
-Communication de la mitochondrie vers le noyau
Mito dit au noyau quoi lui envoyer
Qu’est-ce qui maintient la fonction optimale des mito?
Co-évolution et co-adaptation des éléments codés par le génome nucléaire et mitochondrial
Quels mécanismes ont évolué afin d’assurer une transmission maternelle des mito?
-Mécanismes post-fécondation
-Mécanismes pré-fécondation
+Élimination au moment de
la fécondation
Définition mécanisme post-fécondation
Destruction des mitochondries paternelles (et de leur ADNmt) suite à la fécondation
Définition mécanisme pré-fécondation
Destruction des mitochondries paternelles (et de leur ADNmt) avant même la fécondation
Définition état haploïde
Il y a une seule copie de chacun des chromosomes
La phase diploïde est-elle réduite ou prépondérante?
Réduite
La phase haploïde est-elle réduite ou prépondérante?
Prépondérante
Il n’y a pas de relation de dominance dans l’état haploïde V/F
Vrai
Définition périthèces
Petits sacs en forme de gourde ou d’amphore, remplis de nombreux autres petits sacs allongés, les asques, contenant 8 spores en file linéaire
Que donne la germination d’une spore?
Un hyphe mycélien avec des noyaux haploïdes issus par mitose du noyau unique qui était présent dans la spore d’origine
Pour les organismes à asques, est-ce que l’autofécondation est possible?
Nope
Comment se forment les spores?
-2 cellules haploïdes se combinent pour devenir diploïdes
-Font une méiose pour redevenir haploïdes
-Chaque chromatide donne une spore, organisées en tétrade
Comment sont organisés les asques préréduits?
-11112222
-Séparations dès la première division de la méiose
-Sont présents en nombre égaux
Comment sont organisés les asques postréduits?
-11221122
-Sont présents en nombre égaux
Caractéristiques pré-réduction
-Pas eu de crossing-over
-Ségrégation à la première division méiotique
- Asques préréduits : asques de types I et II
-Fréquences des deux types d’asques sont équivalentes (équiprobables)
Caractéristiques post-réduction
-Séparation des caractères à la seconde division méiotique. On obtient des asques post réduits (recombinés)
-Crossing over entre chromatides non sœurs
-Fréquences équivalentes
Définition ditype parental (TIIP)
Combinaisons alléliques parentales
Définition ditype recombinant (TIIR)
Spores recombinées avec de nouvelles combinaison
Définition tetratype (TIV)
La moitié des spores recombinées et moitié parentales
Caractéristiques transmission de deux allèles sur un même chromosome
Tetratypes
-La moitié des spores recombinées et moitié parentales
-Deux des quatre chromatides qui participent au crossing-over.
Ditype recombinant
-Que des spores recombinées
-Les 4 chromatides ont participé à des crossing-over
Caractéristiques transmission de deux allèles sur deux allèles sur deux chromosomes
-Fréquences sensiblement égales pour le TIIP et TIIR car l’orientation des chromosomes homologues à la métaphase I de la méiose se fait au hasard
Définition mutation
Changements de séquence de l’ADN pouvant être néfastes, bénéfiques ou nulles
Que peuvent affecter les mutations?
-La structure des protéines
-La régulation de la transcription
Quels sont les 2 types de mutations?
-Mutations ponctuelles: affectent quelques nucléotides
-Modifications profondes: affectent de grandes régions
2 types de mutations ponctuelles
-Substitution de nucléotides
-Indels
Caractéristiques de la substitution de nucléotides
-Se produit pendant la réplication
-Modification de la structure chimique d’un nucléotide déjà présent
Définition indels
Insertion ou délétion d’une paire de
nucléotides
4 types de modifications profondes
-Large insertion/délétion
-Réarrangement chromosomique
-Amplification génétique
-Anomalies chromosomiques
Définition réarrangement chromosomique
Modification de l’organisation de large région d’un chromosome (change l’ordre des gènes)
Définition amplification génétique
Répétitions anormales de régions de l’ADN suite à la réplication
Augmente la taille du génome
Définition substitution
Remplacement d’un nucléotide. La réplication suivante assure ensuite d’intégrer la modification de manière permanente sur les deux brins
Quelles sont les causes d’une substitution?
-Erreur non réparée pendant la réplication
OU
-Modification de la structure chimique d’un nucléotide déjà présent induit une erreur de lecture de la polymérase qui associe la mauvaise base azotée
2 classes de substitution
-Transition
-Transversion
Définition transition
D’une pyrimidine à une autre (C à T) ou d’une
purine pour une autre (A à G)
Définition transversion
D’une pyrimidine à une purine (T pour A
ou G) ou le contraire
Comment les indels causent-ils des mutations?
Ils induisent un changement du cadre de lecture: soit la polymérase lit un nucléotide 2 fois ou elle en skip un
Que peut engendrer un indel?
Conduit à de nouveaux aa à partir de ce site mutationnel et parfois à une terminaison prématurée de la chaîne polypeptidique
Par quoi sont causés les indels?
Souvent causé par un glissement de la polymérase lors de la réplication
Si un indel n’est pas réparé, la mutation sera intégrée de manière réversible dans le génome V/F
Faux
Dans quel cas un indel cause une mutation fixe?
Si la modification a lieu au niveau des cellules germinales ou cellules germinales primordiales (CGP), elle sera transmise aux prochaines générations
Pas grave pour les cellules somatiques car seule cette lignée sera affectée
Quels sont les effets selon la position des mutations?
-Changement dans la séquence codant une protéine (traduction)
-Changement dans la région régulatrice de l’expression génique (transcription)
-Changement dans la structure de l’ADN qui empêche la réplication et la transcription
Impact d’un changement dans la séquence codant une protéine
La protéine change de forme, d’activité ou sa capacité à faire des liens avec d’autres protéines change
Impact d’un changement dans la structure de l’ADN qui empêche la réplication et la transcription
La réplication/transcription ne se font plus