Bio mol intra Flashcards
Entre quelles molécules se forment les liens glycosidiques?
Entre 2 molécules de glucides
Les acides gras sont des polymères de…
De lipides
Les polysaccharides sont des polymères de…
De glucides
De quoi sont formés les triglycérides?
-3 acides gras
-Un glycérol
De quoi sont formés les phospholipides?
-2 acides gras
-Un glycérol
-Un gr phosphate
De quoi est principalement formée la gaine de myéline?
De sphingomyéline
Quelle est la principale caractéristique de la sphingomyéline?
C’est le seul phospholipide sans glycérol
De quoi est formé le gr polaire de la sphingomyéline?
De sérine
De quoi sont formés les glycolipides?
-2 acides gras
-Un sucre
Quelle est la structure du cholestérol?
4 cycles (pas une chaine)
Description de la polarité du cholestérol
Cycles très hydrophobes et extrémité hydrophile grâce au gr phosphate
Les acides nucléiques sont des polymères de…
De nucléotides
De quoi sont formés les nucléotides?
-Un sucre à 5 carbones
-Une base azotée
-Un gr phosphate
Quelle est la différence entre le ribose et le désoxyribose?
Le ribose a un hydroxyle (OH) lié à un carbone alors que le désoxyribose a un hydrogène
De quoi est formée une base?
Base + sucre
De quoi est formée une adénosine mono phosphate (AMP)?
Base + sucre + phosphate
De quoi est formée un ADP?
Base + sucre + 2 phosphates
De quoi est formée un ATP?
Base + sucre + 3 phosphates
Description structure primaire des prot?
Séquence d’aa
Description structure secondaire des prot?
Ossature: feuillet beta ou hélice alpha
Description structure tertiaire des prot?
Structure 3D
Description structure quaternaire des prot?
Complexes protéiques
De quel côté sont orientées les bases ds la double hélice de l’ADN?
Vers l’intérieur
Comment sont orientés les 2 brins d’ADN?
Ils sont antiparallèles
Qu’est-ce qui rend la double hélice stable (ds des conditions physiologiques)?
La complémentarité des bases
Le milieu au centre de la double hélice est-il hydrophobe ou hydrophile?
Hydrophobe
Les surfaces formées par les bases sont-elles parallèles entre elles ou non
Oui et elles sont stabilisées par des interactions de van der Walls
Quelle est la conformation principale de l’ADN?
Forme B
Quelle conformation de l’ADN est hydratée?
Forme B, plus étirée et sillons plus espacés/moins profonds
Quel est l’impact d’une base tordue?
Change localement la largeur des sillons et varie un poquito la structure, donc la séquence
Caractéristiques de l’ADN Z
-Tourne vers la gauche
-Squelette sucre-phosphate en zig-zag
Pourquoi l’ARN est-il plus flexible que l’ADN?
Il est simple brin, permettant des appariements non usuels
Les bases de l’ADN sont-elles tjr bien appariées?
Non il peut se former des boucles, des pseudo-noeuds, avoir des bases en trop, former de mauvais appariements
Rôle de la RNaseP
Clive les bases non nécessaires de l’extrémité 5’ des ARNt
Par quels liens sont assemblés les nucléotides?
Liens phosphodiesters (forts)
Par quels liens sont assemblés les chaines antiparallèles?
Pont H (faibles)
Si on chauffe un molécule d’ADN, que se passe-t-il?
Dénaturation: les brins se séparent
Si on refroidit un molécule d’ADN, que se passe-t-il?
Hybridation: les brins se réassocient
Définition séquence exogène
Morceau d’ADN provenant de l’extérieur de la cell qui peut s’hybrider avec un autre morceau
De quoi dépend la température de dénaturation?
-De la longueur de la séquence du double brin
-Richesse en C/G (empilement des bases)
-Salinité
Fn ARNm
Copie de l’ADN traduite en prot
Fn ARNt
Reconnaissance des codons et transfert des aa
Fn ARNr
Forme les ribosomes
Fn snARN
Participe à l’épissage des ARNm
Fn ARN non codants
-Structure chromatine
-Régulation de la transcription
V/F Le lien peptide est rigide
Vrai
Quelles est la composition des aa?
-Carbone central
-Gr acide (COOH)
-Gr amine
-Gr variable
V/F Les feuillets beta sont seulement antiparallèles
Faux peuvent être parallèle ou antiparallèles
Ds l’hélice alpha, de quel côté sont orientées les chaines latérales?
Vers l’extérieur pour permettre la formation de ponts H
Définition opéron
Segment d’ADN qui correspond à une même fn et opère sous le même promoteur
De quoi est composé l’ARNm des bactéries?
De transcrits polycistroniques
Différences entre les gènes eucaryotes et procaryotes
-Eucaryotes: plus longs et ch morceau code pour une prot
-Procaryote: plus courts et codent pour pls prot
Quelle est la forme de l’ADN chloroplastique?
Normalement circulaire
Les procaryotes sont-ils généralement haploïdes ou diploïdes?
Haploïdes
Les eucaryotes sont-ils généralement haploïdes ou diploïdes?
Diploïdes
V/F La densité génique augmente avec la taille de l’organisme
Faux
Dans quoi est situé le génome bactérien?
Ds le nucléoïde
Les bactéries ont-elles des histones?
Nope
Autour de quelles prot est enroulée la chromatine?
Histones
De quoi est composé le nucléosome?
Un complexe de 8 histones (octamère)
Comment s’appelle l’ADN reliant les nucléosomes?
ADN intercalaire
Sur quel sillon les histones se lient-elles à l’ADN?
Surtout sur le petit sillon
Quel est le rôle de l’histone H1?
Interagit avec l’ADN intercalaire pour rapprocher les nucléosomes
Quel est le rôle des remodeleurs de chromatine?
Interagissent avec les nucléosomes pour les déplacer et rendre l’ADN accessible
Quel prot débute la réplication?
L’AD N pol
De quoi a besoin l’ADN pol pour commencer la réplication?
D’une amorce
Quelle prot ajoute l’amorce (ARN) sur le brin matrice?
La primase
Par quoi seront remplacés les ribonucléotides de l’amorce?
Par des désoxyribonucléotides
Quelle prot retire tous les nucléotides sauf le dernier?
RNase H
Quelle prot retire le dernier nucléotide?
Une exonucléase
Quelle prot attache les fragments d’ADN après la réplication?
L’ADN ligase en utilisant de l’ATP
Quelle prot sépare les 2 brins d’ADN?
La ligase
Comment l’ADN simple brin est-il stabilisé?
Des prot de liaison à l’ADN simple brin (SSB) se fixent au brin pour le maintenir et se lient entre elles pour se stabiliser
V/F Les xsomes linéaires ont pls origines de réplication
Vrai
Quelles prot reconnaissent les origines de réplication?
Les prot ORC
Quelles prot activent la réplication en phase S?
Les Cdk
Quelle prot ajoute des séquences répétées à la fin des télomères pour éviter le raccourcissement des xsomes?
La télomérase. qui peut se transloquer
Principales sources de mutations
-Erreurs de réplication
-Dommages chimiques/radiations
-Transposons
Types de mutations ponctuelles
-Transposition: T pour C ou A pour G
-Transversion: T pour A/G ou G pour T/C
Définition microsatellite
Motifs de 2 à 10 nucléotides hautement répétés, dont les répétitions sont variables, à cause des dérapages de la POL
Définition tautomère
Structures différant par la position d’un atome, en général d’hydrogène, et d’une ou de pls liaisons multiples
Quelle prot répare les mésappariements?
La POL remet le bon nucléotide par son action exonucléase
Que peut causer une mauvaise forme d’un nucléotide?
Une liaison avec le mauvais nucléotide ex: C-G
Définition activité exonucléase
Lorsqu’un nucléotide incorrect est ajouté, la polymérase peut cliver le nouveau lien et retirer ce nucléotide
Comment réparer les mésappariements?
-Identifier le site du mésappariement,
-Identifier lequel des deux brins contient l’erreur
Chez E.colil, quelle prot répare les mésappariements?
MutS
Comment agit MutS?
-Reconnait mésappariement
-S’associe à l’ADN
-Cause un repliement de l’ADN
-Recrute MutL
Que fait MutL?
Active MutH, qui clive le bout d’ADN avec le mésappariement, puis une exonucléase élimine les nucléotides till le mésappariement
Brin réparé par POLIII et ligase
V/F MutH existe chez les eucaryotes
Faux juste chez les procaryotes
Quelle exonucléase dégrade le brin fille 5’ vers 3’?
Exo VII
Quelle exonucléase dégrade le brin fille 3’ vers 5’?
Exo I
Que fait la désamination de la cytosine?
Transforme la cytosine en uracile
Que fait la désamination de l’adénine?
-Transforme l’adénine en hypoxanthine
-L’hypoxanthine peut s’apparier avec la
cytosine
Que fait la désamination de l’adénine?
-Transforme la guanine en xanthine
-La xanthine s’apparie avec la cytosine
mais affinité réduite
Que fait l’hydrolyse du lien entre le sucre et la base du nucléotide?
Amène la création d’une base apurique
Que fait la désamination d’une 5-méthylcytosine?
- Transforme la 5-méthylcytosine en
thymine - «Hot spot» pour les mutations spontanées
Que peut causer les substances mutagènes?
-Alkylation
-Oxydation (causée par radicaux libres, radiations ionisantes) et cause des transversions
Que font les rayons UV sur les bases?
-Cause la fusion photochimique de 2 pyrimidines adjacentes sur le même brin
-Ces dimères sont impossibles à
apparier et provoquent l’arrêt de la polymérase
Principal moyen de réparer les altérations des bases?
Des enzymes spécialisées sont capables de reconnaître directement les bases altérées et d’inverser l’altération
Photoréactivation
2 types de systèmes de réparation des bases altérées
-Réparation par excision des bases
-Réparation par excision de nucléotides
Que font les ADN glycosylases?
-Reconnaissent les bases altérées
-Clivent le lien glycosidique entre la base et le désoxyribose
