Bio cell intra Flashcards
Quelles sont les molécules essentielles à la cellule?
-ADN
-ARN
-Protéines
-Source d’énergie (glucides)
-Lipides
Quelles sont les bases de l’ADN
-Guanine
-Thymine
-Cytosine
-Adénine
Quelles sont les bases de l’ARN?
-Guanine
-Uracile
-Cytosine
-Adénine
De quoi est composé le nucléoside?
Base azotée+sucre
De quoi est composé le nucléotide?
Base azotée+sucre+groupement phosphate
Qu’est-ce qui rend la molécule d’ADN stable?
Les ponts H entre les paires de bases azotées
Combien de liens se trouvent entre l’adénine et la thymine?
2
Combien de liens se trouvent entre la cytosine et la guanine?
3
Définition bicaténaire
Possède 2 brins: ADN
Définition monocaténaire
Possède un seul brin: ARN
Quel est le niveau de structure de l’ARN?
Structure secondaire pouvant prendre pls formes
Quelle est la composition d’un aa?
-Groupement amine
-Groupement carboxyle
-Carbone alpha portant une chaine latérale
Combien existe-t-il d’aa?
20
Laquelle de ces molécules, entre l’ADN, l’ARN et les protéines, a le plus grand pouvoir de catalyse ?
1-Protéines: très variées avec des caractéristiques différentes
2-ARN: instable
3-ADN
Quel était le matériel génétique de base des premières cellules?
L’ARN
Au cours de l’évolution, quel a été l’avantage de l’ADN?
Plus stable que l’ARN qui se dégrade facilement. Permet d’augmenter ses chances de survie et de transmission des gènes
Quel ARN permet la traduction des aa en protéines?
ARN messager
Les Archées ont-elles un noyau?
Nope
Qu’est-ce que les procaryotes ont inventés?
La phosphorylation oxydative (respiration cellulaire)
Quels sont les organites dans les eucaryotes?
-Noyau
-Système intramembranaire important
-Mitochondries (toutes)
-Chloroplastes (végétaux)
-Cytosquelette
-Moteurs protéiques
Comment se sont formés le réticulum endoplasmique et le noyau?
Invagination de la membrane plasmique pour protéger le matériel génétique et augmenter sa superficie d’échange avec le milieu
Quelle est l’origine de la mitochondrie?
Phagocytose d’une bactérie aérobique
Pourquoi mitochondrie, puis chloroplaste et non pas chloroplaste, puis mitochondrie ?
Toutes les cellules ont des mitochondries, alors que seules les cellules photosynthétiques ont des chloroplastes
Est-ce que les cyanobactéries ont des chloroplastes?
Non mais possèdent des thylakoïdes qui captent la lumière
Quelles sont les lois de la thermodynamique?
-Conservation de l’énergie
-Entropie: le désordre d’un système augmente ou reste constant
Plus le temps passe, plus il est probable qu’un système donné soit de plus en plus dans le désordre V/F
Vrai
Qu’est-ce qui permet à la cellule de maintenir l’ordre?
Un flux constant de réactions chimiques (métabolisme)
Comment les lois de la thermodynamique sont-elles respectées par le flux d’énergie dans la cellule?
-L’énergie dégagée par le catabolisme
(dégradation) est conservée, soit dans les molécules nouvellement synthétisées ou dans la chaleur créée par la cellule
-L’énergie dissipée par la cellule en chaleur augmente l’entropie totale du système
Est-ce qu’il faut de l’énergie pour briser un lien entre 2 atomes?
Oui
Est-ce qu’il faut de l’énergie pour créer un lien entre 2 atomes?
Non, cela libère de l’énergie
Comment s’appelle un changement d’énergie dans une réaction?
Énergie libre (delta G)
Caractéristiques d’une réaction spontanée
-Dans le sens des produits
-Libère de l’énergie libre
-Delta G -
Caractéristiques d’une réaction non spontanée
-Dans le sens des réactifs
-Dépense de l’énergie libre
-Delta G +
Définition enzyme
Protéine (catalyseur) qui accélère une réaction chimique en diminuant l’énergie d’activation de la réaction
De quoi dépend le niveau d’énergie d’une réaction?
-L’énergie intrinsèque des molécules (ΔG°)
-La concentration des produits et des
réactifs à un moment précis de la réaction
Liaisons chimiques de la plus forte à la plus faible
-Covalente
-Ionique
-Pont H
-Interaction hydrophobe
2 propriétés de l’eau
-Cohésion
-Solvant universel
Quelles liaisons permettent la formation des chaînes carbonées?
Des liaisons covalentes
non polaires
Définition macromolécule
Structure 3D dont la forme est déterminée par la séquence
Par quoi sont liés les monomères des macromolécules?
Des liaisons covalentes
Par quoi est stabilisée la structure 3D d’une macromolécule?
Des liaisons covalentes et non covalentes
Comment se nomment les protéines qui lient la double hélice d’ADN pour la compacter?
Histones
Quelles technique rend possible la visualisation des macromolécules et leurs interactions?
La cristallographie aux rayons X
Que faut-il faire à la molécule d’ADN pour la cristallographie aux rayons X?
Il faut enlever l’eau, ce qui rend la molécule inerte, donc plus stable
Polymère de sucres
Polysaccharides
Polymère d’acides gras
Lipides
Polymère d’acides aminés
Protéines
Polymère de nucléotides
Acides nucléiques/ADN
De quel côté se lit une séquence d’ADN?
5’ vers 3’
Comment isole-t-on les acides nucléiques?
1-lyse cellulaire
2-filtration des protéines
3-précipitation de l’ADN
4-réhydratation de l’ADN
Comment purifie-t-on les acides nucléiques?
1-liaison de l’ADN
2-wash
3-élution de l’ADN
Quel est le principe de l’électrophorèse sur
gel?
Séparer différents fragments d’ADN (ou protéines ou ARN )en fonction de leur taille. Les acides nucléiques sont polaires chargées négativement au pH de la cellule: peut faire migrer selon le pH
Toutes les molécules passent facilement dans les pores de l’agarose V/F
Faux, les petites molécules passent plus facilement et vont plus loin
Un gène a toujours la même séquence V/F
Vrai
Est-ce que les gènes pour une molécule spécifique se ressemblent d’une espèce à l’autre?
Oui
Par quoi sont unis les acides aminés?
Liaisons peptidiques
Par quoi commence et se termine une protéine?
Commence: gr amine
Se termine: gr carboxyle
Quelles sont les 2 structures secondaires possibles?
Hélice alpha
Feuillet bêta
Quelles liaisons lient les chaines d’aa dans les feuillets/hélices?
Se forment spontanément dans l’eau grâce aux ponts H
Où sont les chaines R pour les feuillets/hélices?
Feuillets: vers le haut et le bas
Hélices: vers l’extérieur
Définition reverse turn
Segment random qui relie les hélices et les feuillets
Qu’est-ce qui détermine la fonction des protéines?
Les domaines qui la composent. Un domaine peut être présent dans plusieurs protéines et ne pas avoir exactement la même fonction
Quelles structures de protéines sont fonctionnelles?
Tertiaires
Quaternaires (pas toutes les protéines ont besoin de se rendre là)
Quelle est la fonction du lysozyme?
Accélère la réaction d’hydrolyse des sucres (ajout d’eau pour briser des liens) en se liant aux glucides dans une conformation particulière
Fonction ADN
Conserve et réplique l’information génétique
Brins complémentaires et antiparallèles
Comment fonctionne la chromatographie sur colonne?
Faire traverser les protéines une colonne contenant une matrice solide poreuse. Les
protéines seront plus ou moins retardées selon leur interaction avec la matrice
Quels éléments peuvent être utilisés pour purifier dans la chromatographie sur colonne?
-Leurs charges (colonne d’échange d’ions)
-Leur degré d’hydrophobicité
-Leurs tailles
-Leur capacité à se fixer à d’autres molécules
Les 3 premiers ne permettent pas de purifier à 100% une protéine
Principe du génie génétique/chromatographie par affinité
-Clonage du gène codant pour la protéine X dans un plasmide bactérien avec un His-tag
-La cellule devient une usine à fabrication de votre protéine X His-taggée
-La solution avec les cellules His-tag est filtrée dans une matrice nickel ou cuivre (les protéines voulues vont se lier au Ni/Cu dans la matrice)
-Wash
-Protéine His-tag purifiée est dans le bas
Principe électrophorèse sur gel de polyacrylamide
Sert à séparer les protéines selon leur taille
-Bain de SDS: rend toutes les molécules négatives
-Bêta-mercaptoéthanol: agent réducteur qui défait les ponts S-S
-Les protéines, chargées négativement et dénaturées, migrent dans le gel selon leur taille
-Les protéines sont coupées en peptides, qui sont séparés
-Leur masse est comparée pour les identifier
Quel est le désavantage de l’électrophorèse sur gel de polyacrylamide?
Il n’y a pas de certitudes sur l’identification des aa, car seule la masse sert à les identifier
Principe microscope photonique
Il utilise la lumière visible ( 380-700 nm) et la diffraction afin de produire une image grossie de l’échantillon. Limites de résolution à cause de la λ de la lumière
Principe microscope électronique
Utilise un faisceau d’électrons, beaucoup plus petits que des photons et permet donc une résolution plus grande
Faut un échantillon mort
À transmission ou balayage
Définition MEC
Ensemble des molécules extracellulaires sécrétées par les cellules et elle fournit un apport structurel et biochimique aux cellules environnantes