Bio cell final Flashcards
Comment agit le taxol?
C’est une molécule qui empêche la dépolymérisation des MT, elle les fige
In vivo, à partir de quelle extrémités les MT doivent polymériser/dépolymériser?
À partir de l’extimité +, car l’extrémité - est ancrée dans le MTOC
Que fait la stathmine?
Elle lie et séquestre la tubuline libre. Cela réduit la qt de tubuline pouvant se polymériser, favorisant la dépolymérisation du MT
Comment se nomme l’arrangement des MT pour les cils et les flagelles eucaryotes?
Axonème
Comment sont disposées les MT dans l’axonème?
9 doublets de MT sont disposés autour d’une paire de MT centrale
Les bactéries ont de la tubuline V/F
Faux
Comment se nomme la protéine très semblable à la tubuline chez les bactéries?
FtsZ
Quel est le rôle des FtsZ lors de la division cellulaire des bactéries?
Elles forment des ceintures qui se serrent pour scinder les bactéries en deux (scissiparité)
À quelle protéine les FtsZ ressemblent-elles pour la structure?
La tubuline
À quelle protéine les FtsZ ressemblent-elles pour le rôle?
L’actine
Lors de la mitose, à quel phase sont divisées les 2 cellules filles?
Pendant la cytocinèse
Comment se fait la séparation des cellules filles lors de la cytocinèse?
Les filaments d’actine du cortex forment un anneau contractile qui étrangle la cellule en 2 à l’aide du moteur protéique appelé myosine
Que font les moteurs protéiques?
Ils marchent sur les éléments du cytosquelette qui sont polaires. Ils permettent le mvt des organites, vésicules ou même des autres filaments
Quels sont les éléments polaires du cytosquelette?
-Actine-F
-Microtubules
Caractéristiques moteurs protéiques (3)
-Conformation/liaison
-Spécificité
-Direction
Définition conformation/liaison
Coordination entre un changement de conformation, causé par l’hydrolyse d’ATP, et une liaison réversible au filament
Définition spécificité
La spécificité des moteurs : myosine sur actine ; dynéine et kinésine sur les MT
Définition direction
La direction du moteur : la myosine (en général) et la kinésine vont vers le (+) alors
que la dynéine va vers le (-)
Quelle est la structure de la myosine?
La myosine est une protéine ayant 1 ou 2 tête globulaire qui lie l’actine et l’ATP et une queue
Quelles sont les fonctions de la myosine?
-Transport vésiculaire
-Formation des fibres musculaires
Définition du domaine flexible de la myosine
Changement de conformation en fonction de sa liaison avec soit ATP, soit ADP + Pi, soit ADP seul ou rien
Comment se nomme la membrane plasmique de la fibre musculaire?
Sarcolemme
À quoi sert le réticulum sarcoplasmique de la fibre musculaire?
Réservoir à Ca2+, qui sort du RS lors de la dépolarisation causée par un influx nerveux
Qu’est -ce qui permet le contact entre l’actine et la myosine?
Le Ca2+
La myosine a besoin d’ATP pour bouger V/F
Vrai
Similarités entre myosine et kinésine
-Vont vers l’extrémité + de leur filament
-Leurs têtes changent de conformation grâce à l’hydrolyse de l’ATP
Différences entre myosine et kinésine
-Pls myosines forment des filaments
-Kinésine travaille seule: c’est un dimère à 2 têtes qui peut tirer une vésicule toute seule. Pendant qu’une tête bouge, l’autre reste liée au MT
Est-ce la myosine ou la kinésine qui fonctionne sans ATP?
Myosine: pas besoin d’ATP ou d’ADP pour fixer l’actine
Kinésine: besoin d’ATP pour fixer le MT
Définition dynéine
La dynéine cytoplasmique est une protéine qui voyage sur les microtubules et qui va dans le sens inverse de la kinésine (vers extrémité -)
Quelles sont les 3 parties du flagelle bactérien?
-Corps basal
-Crochet
-Filament
De quoi est composé le flagelle bactérien?
Flagelline
Qu’est-ce qui fait tourner le corps basal?
Un gradient de protons
Quelle est la fonction du noyau?
Il protège et séquestre l’ADN pour éviter les collisions avec les protéines moteurs ou des cargos et empêche des mutations
Où se passe la maturation de l’ARN?
Dans le noyau
Où se passe la traduction de l’ARN?
Dans le cytoplasme
Comment se nomme le procédé permettant la maturation de l’ARNm?
Épissage de la coiffe en 5’ et la polyadénylation en 3’
Comment le noyau empêche-t-il la traduction précoce de l’ARNm?
Il contrôle les sorties vers le cytoplasme
Quelles sont les stades pour la transcription?
Gène, ARN pré-messager, ARNm
Quelles sont les stades pour la traduction?
ARNm, protéine
Quel est le codon de départ pour la traduction?
Méthionine
Le cytoplasme des bactéries ne possède pas de
moteurs protéiques V/F
Vrai
Pourquoi les bactéries n’ont pas de noyau?
Leur cytoplasme ne contient pas de moteurs protéiques, donc leur ADN n’ pas besoin d’être protégé
Pourquoi la transcription et la traduction de l’ADN bactérien peut être fait en même temps?
L’ADN des bactéries n’a pas d’introns, donc pas de tri à faire
Quels colorants peuvent être utilisés pour distinguer les chromosomes?
-Giemsa: bandes sur les chromosomes
-Sondes fluorescentes: chaque paire de chromosomes a une couleur
Quelles séquences de l’ADN sont très conservées?
Les séquences codantes et les séquences régulatrices
Définition séquence codante
Séquence d’ADN qui va coder pour une protéine
Définition séquence exprimée
Produit de la transcription, il y a de l’ARN transcrit
Définition séquence exprimée non codante
ex: introns (transcrits en ARN sans jamais être traduits), ARN ribosomique/de transfert
Définition séquence régulatrice
Séquences qui régulent l’expression du gène (jamais exprimées et jamais codantes)
Quelle est la composition du génome humain?
-25% gènes et séquences codantes
-50% séquences répétitives
-25% restant inconnu
Définition transposons
Séquences d’ADN capables de se déplacer de
manière autonome (ou presque) dans le génome
3 classes de transposons
-Transposons d’ADN
-Rétrotransposons viraux
-Rétrotransposons non-viraux (LINEs et SINEs)
Quels types de transposons codent eux-mêmes les enzymes nécessaires à leur mvt?
-Rétro
-ADN
-LINE
Quels types de transposons utilisent les enzymes de d’autres transposons pour leur mvt?
SINE
La séquence des transposons n’est pas bien délimitée V/F
Faux: chaque extrémité est bien
reconnue par les enzymes de transposition
Comment bougent les transposons d’ADN?
Couper-coller
Comment bougent les rétrotransposons?
Copier-coller, avec une étape ARN
Les séquences codantes ne sont pas les mêmes selon les espèces et les transposons ont un pourcentage d’identité très élevé V/F
Faux les séquences codantes ont un pourcentage d’identité très élevé et les transposons sont différents
Pour quoi code un transposon d’ADN?
Une transposase
Que fait la transposase?
Elle coupe le transposon, puis l’insère ailleurs dans le génome
Les rétrotransposons sont traduits complètement en ARN V/F
Vrai
Pour quoi peuvent coder les rétrotransposons?
-Transcriptase inverse
-Endonucléase
-Intégrase
Par quelle étape doivent passer les rétrotransposons avant d’être insérés dans le génome?
Rétrotranscription en ADN
Où peuvent s’insérer les transposons?
Dans les séquences codantes ou régulatrices de gènes déjà existants
Quel est l’impact de l’ajout d’un transposon dans une séquence?
Provoque des mutations, en modifiant un promoteur ou en brassant les exons. Ils peuvent donc créer de nouveaux gènes, nouveaux patrons d’expression, inactiver des gènes
Quelle est la composition de l’ADN répétitif (excepté les transposons)?
-Duplications de segments chromosomiques venant de crossing over inégaux
-Petites séquences simples de 2-6 paires
de bases répétées
Les séquences répétées sont mobiles V/F
Faux
Définition région satellite
Région répétée hétérogène selon les individus, de longueur variable
En quoi le compactage de l’ADN peut représenter un problème?
Le compactage nuit à l’accessibilité des gènes pour les enzymes
Quelles sont les solutions au compactage de l’ADN?
Dynamisme du compactage: certains gènes sont tjr exprimés, d’autres sont exprimés, donc accessibles seulement à certains moments
Si les protéines qui compactent/décompactent ont un problème: maladies
Quelles sont les formes de l’ADN dans une cellule en interphase (2)?
-Fibres de 30 nm (2e niveau de compaction)
-Fil de perles
Que fait la DNase?
C’est une enzyme qui hydrolyse
l’ADN
Où coupe la DNase?
À des endroits random: dans le fil de perle, elle coupe entre les nucléosomes, entre les boules
Définition nucléosomes
Bobines autour desquelles s’enroulent des paires de bases
Combien de paires de bases sont enroulées autour d’un nucléosome?
146 pdb
De quoi est composé un nucléosome?
De 8 histones, formant la fibre de 11nm
Comment le forme la fibre de 30 nm
Une 5e histone (nommée H1) oriente l’ADN sortant des nucléosomes et permet leur empilement
Quelles sont les fibres accessibles pour les enzymes?
Fibre de 11nm et de 30 nm
Quelles sont les 2 régions des histones du nucléosome?
-Queue N-terminale variable
-Partie C-terminale conservée
Que permet la queue N-terminale variable des histones du nucléosome?
Permet la régulation de la liaison de l’histone avec l’ADN
Que permet la partie C-terminale conservée des histones du nucléosome?
L’assemblage du nucléosome
Les queues des histones sortent du nucléosome et peuvent être modifiées par des enzymes
Quelles modifications peuvent subir les queues N-terminales des histones?
-Méthylation
-Phosphorylation
-Acétylation
Les modifications sur les queues N-terminales des histones sont-elles réversibles ou irréversibles?
Réversibles
À quoi servent les modifications sur les queues N-terminales des histones?
Modifient les interactions de l’ADN avec les histones pour rendre la transcription plus facile (histone moins stable) ou plus difficile (histone plus stable)
Comment appelle-t-on les fibres de 11 et de 30 nm pouvant être transcrites en ARN?
Euchromatine (accessible aux enzymes)
Comment appelle-t-on les fibres de plus de 30 nm?
Hétérochromatine
Avec quoi se lient les histones dans l’hétérochromatine?
Les protéines Sir pour former une boucle dans la fibre de 30 nm
Description du nucléole
Fibrillaire au centre et granuleux en périphérie
Quel est le rôle de la zone fibrillaire du nucléole?
Est la zone de transcription des ARN ribosomaux
Quel est le rôle de la zone granuleuse du nucléole?
Est le site d’assemblage des sous-unités ribosomales
Est-ce que le nucléole est délimité par une membrane?
Nope
Sous quelle forme est la chromatine pendant la transcription de l’ARNr?
Sous forme d’euchromatine, car la transcription se fait en continu
Quelle est la structure du ribosome?
Petite et grosse sous-unités
À quel moment s’assemblent les sous-unités des ribosomes?
Seulement au moment de la traduction
De quoi sont composées les sous-unités des ribosomes?
Protéines et ARNr
Quelles sont les étapes de la création d’un ribosome?
1.ARNr et ARNm transcrits dans le noyau (ARNr ds le nucléole et ARNm à l’ext du nucléole)
2a. Traduction des prot ribosomales dans le cytoplasme
2b.Modifications des ARNr dans le nucléole
3.Entrée des prot ribosomales dans le noyau
4.Assemblage des sous-unités (pas attachées) en périphérie du nucléole
5.Assemblage du ribosome dans le cytoplasme (début de la traduction)
