Génétique 9 Flashcards
1
Q
Définition de la génétique des populations?
A
- Étude de la structure génétique de populations
- Sous l’influence des lois de Mendel, de mutations, de migrations, de sélections et du hasard.
2
Q
Explique l’équilibre de Hardy-Weinberg.
A
Pour un locus autosomique donné où l’on retrouve 2 allèles A et a:
* f(A) = p et f(a) = q
* → p + q = 1
* → f(AA) = p2, f(Aa) = 2pq et f(aa) = q2
3
Q
Nomme les conditions nécessaires à l’équilibre de Hardy-Weinberg.
A
- Population infiniment nombreuse
- Pas de nouvelles mutations
- Pas de migration
- Pas de sélection naturelle
- Unions aléatoires
1-2-5 = conditions pas respectés dans l’effet fondateur
4
Q
Qu’est-ce que l’effet fondateur?
A
Création d’une nouvelle population à partir d’un nombre relativement restreint d’individus issus d’une population mère nombreuse
5
Q
Qu’entraîne l’effet fondateur?
A
Entraîne une perte de variation génétique, peut affecter la fréquence de génotypes
6
Q
Décrit l’effet fondateur du Québec.
A
- Pop C-F issue de 8500 colons français
- Mouvements migratoires successifs entraînent des effets fondateurs locaux dans certaines régions (ex: SLSJ)
7
Q
Décrit le mouvement migratoire Beaupré → Charlevoix (1675)
A
- 599 fondateurs
- 60% des colons étaient apparentés
- 25% descendaient d’ancêtres percherons
8
Q
Décrit le mouvement migratoire Charlevoix → Saguenay (1830)
A
- 2000 fondateurs
- 80% des colons au SLSJ venaient de Charlevoix
9
Q
Qu’est-ce qu’une dérive génétique?
A
Modification des fréquences géniques dans une population, attribuable au hasard de la transmission.
10
Q
Qu’est-ce que l’endogamie?
A
Se dit des unions au sein desquelles les deux partenaires proviennent de la même population
11
Q
Qu’est-ce qui explique l’endogamie au sein de la population C-F?
A
Isolement à cause de la langue, religion, situation socio-politique, et certaines contraintes géographiques
12
Q
__% immigrants avaient de la famille en Nouvelle-France
A
13
13
Q
Est-ce que la cosanguinité étroite est fréquente en N-F?
A
Non
14
Q
Est-ce que la cosanguinité éloignée est fréquente en N-F? Pourquoi?
A
Oui et elle augmente avec les générations à cause du nombre limité de fondateurs et de la mobilité réduite
15
Q
Vrai ou faux? Il n’y a pas plus de consanguinité en Nouvelle-France qu’ailleurs.
A
Vrai
16
Q
Qui sont les premiers arrivants au Québec?
A
Premières nations
17
Q
Décrit l’évolution de la population de première nation au Québec.
A
- 16e siècle: 25 000
- 17e siècle: 16 000
- Maintenant: 87 000 (1% de la pop)
18
Q
________ colons arrivent en Nouvelle-France entre 1608 et 1759
A
25 000
19
Q
Est-ce que beaucoup de colons se sont établis?
A
Non (8500)
20
Q
Combien de femmes se sont établis à l’origine, en N-F?
A
1 600
21
Q
La majorité des immigrants en Nouvelle-France venaient de _______.
A
France
22
Q
Qu’est-ce qui se passe au niveau de la composition de la population québécoise après 1680?
A
croissance naturelle > immigration
23
Q
Les 2 600 colons arrivés avant 1680 représentent environ ___ du pool génétique de la population actuelle
A
2/3
24
Q
Au moment de la conquête anglaise, localisation et nombre des C-F?
A
76 000
St-Laurent
25
Vrai ou faux? Il y a eu plusieurs mélanges des C-F avec les anglais.
Faux
26
Qu'est-ce qui se passe au niveau de la pop C-F après 1760?
Migration vers régions restées inoccupées
27
Décrit la population actuelle du Québec.
Plus de **9 millions** d’habitants dans la province de Québec, dont **80% descendent des immigrants français.**
28
Nomme des C-F hors Québec.
* Acadiens
* Explorateurs
* Coureurs des bois
* Voyageurs
29
Émigration massive vers la ____________ au tournant du 20e siècle
Nouvelle-Angleterre
30
Nomme les autres communautés ethniques au Québec.
* Premières Nations
* Anglophones, Italiens, Juifs, Allemands, Haïtiens, Chinois, Grecs, etc.
31
Décrit le cas des Irlandais au Québec.
* Immigration massive 1846-1851 (Great Potato Famine)
* En 1871, 10-15% de la population est d’origine irlandaise
* **Unions avec Canadiens français favorisées par religion commune**
32
Décrit la population actuelle du SLSJ.
* Environ 285,000 habitants
* Encore relativement isolé géographiquement
* Fardeau actuel de conditions génétiques est la conséquence d’effets fondateurs séquentiels
33
Projet pilote au SLSJ?
Projet pilote de programme de dépistage de porteurs de maladies récessives
34
Nomme un organisme local pour les maladies héréditaires.
CORAMH
35
Mission de CORAMH?
Prévenir les maladies héréditaires en misant sur la sensibilisation, l'information et l'éducation
36
Nomme les 5 conditions autosomiques récessives fréquentes au SLSJ.
* Tyrosinémie type I
* Ataxie spastique autosomique récessive de Charlevoix-Saguenay
* Neuropathie périphérique avec ou sans agénesie du corps calleux
* Syndrome de Leigh type canadien français
* Fibrose kystique
37
Qu'est-ce que le syndrome de Leigh?
Acidose lactique par déficit en cytochrome oxydase
38
Dépistage pour le SLSJ?
* NSMH+/-ACC (neuropathie périphérique avec/sans agénésie du corps calleux)
* ARSACS (ataxie spastique autosomique récessive de charlevoix-saguenay)
* Tyrosinémie type I
* Acidose lactique congénitale (syndrome de Leigh, type CF)
39
À qui est destiné le dépistage du SLSJ?
Destiné aux adultes qui planifient une grossesse qui:
- vivent au SLSJ
- ont au moins un grand-parent venant du SLSJ ou de Charlevoix
40
Gène de la tyrosinémie de type 1?
FAH
41
Gène de ARSACS?
SACS
42
Gène de NSMH+/-ACC?
KCC3
43
Gène de l'acidose lactique?
LRPPRC
44
Description et traitement de la tyrosinémie de type 1?
* Insuffisance hépatique
* Rachitisme hypophosphatémique
* Crises neurologiques avec douleur aigüe
* Traitement (**NTBC**) prévient la maladie si débuté avant symptômes (aussi inclus dans dépistage néonatal)
45
Description de ARSACS?
Ataxie et spasticité des membres inférieurs
46
Description de NSMH+/-ACC?
* Hypotonie et hyporéflexie dans en bas âge
* Retard de développement
* 2/3 ont agénésie partielle ou complète du corps calleux
47
Description de l'acidose lactique?
* Retard de développement, hypotonie, lactate élevé dans le sang/LCR
* Crises acidotiques ou épisodes neurologiques
48
Enjeux soulevés du dépistage prénatal du SLSJ?
* Besoin de résultats disponibles rapidement (laboratoire)
* Décision de ne pas dépister la fibrose kystique
49
Nomme les 3 types de maladies chez les C-F.
* «Uniques» aux C-F
* Plus fréquentes chez C-F (mais pas unique aux C-F)
* Caractéristiques particulières chez C-F
50
Nomme les 2 types de maladies/conditions au Québec.
* Maladies chez Canadiens français
* Maladies chez les Premières Nations au Québec
51
Vrai ou faux? Liste inclut maladies transmises par tous les modes de transmission, sauf mitochondrial.
FAUX, inclut tout les modes
52
Sur quel type de transmission a un effet l'effet fondateur?
Sut TOUS les types de transmissions
53
Distribution géographique des maladies du Québec?
Hétérogène dans toute la province
54
Via quoi trouvons-nous des gènes reliés à une maladie sévère?
Via apparentés ou cas décédés
55
Vrai ou faux? Hétérogénéité génétique peut être présente même dans une population issue d’un effet fondateur
Vrai
56
Mutation peut témoigner du lien vers _________________________________________________________.
une population d’origine ou une population descendante
57
Sur quel taux l'effet fondateur peut-il avoir un impact?
Sur le taux de porteurs de maladies récessives
58
Exemple de gènes identifiés via apparentés ou cas décédés?
Atrésies intestinales multiples héréditaires
59
Décrit l'atrésies intestinales multiples héréditaires.
* Obstruction intestinale néonatale avec calcifications intra-abdominales
* Décès avant 4 mois
60
Transmission de l'atrésie intestinale?
autosomique récessive
61
Transmission autosomique récessive de l'atrésie intestinale suggérée par:
* Récidives familiales
* Présence d’ancêtres communs
* Consanguinité de certains parents
62
Gène de l'atrésie intestinale?
TTC7A
63
Exemple d’hétérogénéité génétique malgré population issue d’un effet fondateur?
Syndrome de Joubert
64
Décrit le Syndrome de Joubert.
* Malformation SNC typique, apraxie oculomotrice, apnée centrale, retard de développement
* Condition hétérogène (17 gènes)
* Fréquence plus élevé dans Bas St-Laurent
65
Décrit les 11 familles testés pour le Syndrome de Joubert.
* 7 familles avec mutation du gène 1 (3 mutations)
* 2 familles avec mutation du gène 2 (2 mutations)
66
Nomme 3 gènes associés au syndrome de Joubert
C5ORF42
CC2D2A
TMEM231
67
Exemple de mutation témoignant du lien vers populations d’origine et/ou descendantes?
Neuropathie optique héréditaire de Leber (LHON)
68
Décrit la neuropathie optique héréditaire de Leber (LHON).
* Perte de vision centrale aigüe ou subaigüe, suivie d’une atrophie optique
* Cas d’origine C-F plus susceptibles de récupérer une acuité visuelle partielle/complète
69
Nomme les 2 cas de mutation de l'ADNmt de la neuropathie optique héréditaire de Leber.
**T14484C** dans majorité de cas CF (36/42) contrairement à ailleurs dans le monde où **G11778A** est la mutation principale (78-92% cas)
70
Que suggère l'analyse d'haplotypes de la neuropathie optique héréditaire de Leber?
Fondatrice unique (même mutation que les hollandais)
71
Exemple de l’impact de l’effet fondateur sur taux de porteurs de maladies récessives?
Neuropathie héréditaire sensitivo-autonome de type II
72
Décrit la neuropathie héréditaire sensitivo-autonome de type II.
Perte de sensibilité profonde des extrémités et dysfonction du système nerveux autonome menant à auto-mutilation accidentelle
73
Mutations et gène de la neuropathie héréditaire sensitivo-autonome de type II?
**Deux mutations** par perte de fonction dans gène **HSN2** identifiées chez des cas de Lanaudière
74
Symptômes des porteurs de la neuropathie héréditaire sensitivo-autonome de type II?
Porteurs semblent moins sensibles aux stimuli thermiques
75
% de la mutation c943C->T?
75%
76
% de la mutation c.918-919insA?
25%
77
Porteur de c.918-919insA Lanaudière? Village d'origine?
1/260
1/28
78
Porteur de c943C->T Lanaudière? Village d'origine?
1/116
1/18
79
Nomme 4 maladies retrouvés chez les premières nations.
1. Encéphalopathie crie
1. Encéphalite crie
1. Cirrhose amérindienne
1. Ostéogénèse imparfaite type VII
80
Pourquoi le clinicien doit connaître les maladies monogéniques fréquemment rencontrées dans la population qu’il traite.
Cela permet de prioriser les investigations selon la probabilité de chaque diagnostic.
81
Une connaissance de la structure génétique d’une population est utile à la pratique clinique. Pourquoi?
Elle permet:
- de cibler les investigations
- l’élaboration de tests appropriés
- une interprétation juste des résultats du test
82
Qu'est-ce que la santé publique?
La santé publique est un vaste ensemble d'efforts qui visent à garder les gens en santé et à l'extérieur des hôpitaux.
83
Sur quoi repose la santé publique?
La santé publique repose sur des interventions à l’échelle de populations (pas à l'échelle individuelle)
84
Nomme 3 indicateurs de la santé des populations.
1. Espérance de vie
1. Taux de mortalité infantile
1. Prévalence de maladies dans la population
85
Facteurs qui influencent les politiques de santé?
* Données scientifiques
* Hasard
* Intérêts et priorités
86
Nomme les 10 critères de dépistages.
1. La **maladie ciblée** doit être un problème de **santé important**.
1. Un **traitement** pour cette maladie doit être disponible.
1. Les **moyens** pour **diagnostiquer** et **traiter** cette maladie doivent être disponibles.
1. La maladie doit avoir un **stade latent ou asymptomatique** pendant laquelle la maladie est décelable.
1. Un **test de dépistage** doit être disponible pour la maladie.
1. Le test de dépistage doit être **acceptable** pour la population.
1. L’**histoire naturelle** de la maladie doit être bien connue et comprise.
1. Une **politique** doit être établie pour déterminer **quels cas doivent être traités**.
1. Le **coût** total de l’identification d’un cas devrait être n’est pas disproportionné par rapport aux coûts globaux des soins de santé.
1. La recherche de cas doit être un **processuss continu**, pas une opération “une fois pour toutes”
87
Nomme les 10 critères émergents.
1. Le programme de dépistage doit répondre à un **besoin reconnu**.
1. Les **objectifs** du dépistage doivent être définis dès le départ.
1. Il doit y avoir une **population cible** définie.
1. Des **données probantes** sur l’efficacité du programme de dépistage doivent être disponibles.
1. Le programme doit inclure l’**éducation**, le **test**, les **services cliniques**, et la **gestion du programme**.
1. De l’**assurance qualité** doit être mise en place, avec des mécanismes pour minimiser les risques potentiels du dépistage.
1. Le programme doit s’assurer du **choix éclairé**, de la confidentialité, et du respect de l’autonomie des participants.
1. Le programme doit promouvoir **l’équité et l’accès** au dépistage pour toute la population cible.
1. L’**évaluation du programme** doit être planifiée dès le départ.
1. Les **bénéfices** du dépistage doivent dépasser les **risques**
88
Nomme les 5 étapes de la progression d'une maladie.
1. Naissance
2. Début biologique
3. Début clinique
4. Maladie irréversible
5. Décès
89
Quand le dépistage a-t-il lieu?
Début biologique de la maladie (ou début clinique pour le dépistage/diagnostic)
90
Nomme l'état des faux -.
Symptômes légers et tardif
91
Nomme l'état des faux +.
Asymptomatiques et métabolites anormaux
92
Nomme les 3 grands éléments/acteurs nécessaires à un programme de dépistage.
1. Gestion du programme
1. Services cliniques
1. Laboratoires
93
Nomme les 4 composantes de la gestion du programme de dépistage.
1. Normes
1. Utilisation des ressources
1. Organisation des services
1. Mesure des résultats et contrôle de qualité
94
Nomme les éléments des services cliniques.
* Décider du type de dépistage, de la condition à dépister et de la population cible.
* Définir l’intervention proposée
95
Nomme les éléments du laboratoire.
Établir paramètres du test de dépistage
96
Comment choisir quelles conditions seront dépistées?
* Données probantes
* Pressions par groupes/associations (ex: professionnels, parents, etc.)
* Avancées technologiques
97
Comment choisir une population cible?
* Population à haut risque (incidence)
* Sous-groupe de la population à risque qui est facile d’accès (couverture)
* Population la plus susceptible de bénéficier d’un diagnostic précoce et/ou d’une intervention (effectiveness)
98
Avantages du dépistage d'une population cible?
* Dépiste population à risque (plus grand taux de détection pour moins de ressources)
* Identification en vue de prévention/traitement précoce
99
Désavantages du dépistage d'une population cible?
* Ne permet pas de détecter tous les cas (cas dans des populations à risque plus faible)
* Mesures préventives pourraient être bénéfiques pour toute la population, même ceux qui ne sont pas à haut risque
100
Si l’on considère un programme de dépistage, que sont les 3 questions que l'on doit se poser?
1. Devrait-on le faire?
1. Peut-on le faire?
1. A-t-on les moyens de le faire?
101
Qu’est-ce que le dépistage néonatal?
* Sang pris sur le talon du nouveau-né à 48h de vie
* Sang recueilli directement sur le papier buvard (5 cercles bien remplis)
102
Décrit le processus du dépistage néonatal (DN).
* Tous les échantillons sont envoyés dans un laboratoire centralisé où les échantillons sont analysés
* Objectif est d’identifier et rapporter les résultats positifs dans les plus brefs délais (< âge de 2 semaines)
103
Que fait-on avec un résultat de test positif?
* Résultat transmis à un centre de référence
* Rendez-vous donné avec les parents dans les plus brefs délais pour évaluer l’enfant
* Évaluation diagnostique de l’enfant
* Si diagnostic confirmé, début des traitements
104
Vrai ou faux? Québec est un pionner dans le dépistage néonatal.
Vrai
105
Décrit les 1er efforts en DN (1960).
* Développement de tests de dépistage pour la **phénylcétonurie (PCU) et l’hypothyroïdie congénitale**
* Impact majeur sur le devenir des enfants atteints
106
Jusqu’au début des années 2000, tous les programmes de DN dépistent pour la ___ et l’___________.
PCU
hypothyroïdie congénitale
107
Décrit les avancés technologiques en DN à travers les années/décennies.
* Dépistages de l’hypothyroïdie congénitale, de la PCU et de la tyrosinémie étaient effectués par des **techniques séparées à l’origine**
* Venue de la **spectrométrie de masse en tandem** à la fin des années 1990 a ouvert la porte au dépistage de plusieurs maladies à l’aide d’un seul test
108
Nomme les 4 recommandations de l'ACMG (american college of medical genetics)
1. Rendre obligatoire le dépistage de toutes les affections du "panel principal" définies dans ce rapport.
2. Rendre obligatoire la notification de toutes les affections secondaires ciblées définies ici, ainsi que le signalement de tout résultat anormal pouvant être associé à des affections cliniquement significatives, y compris l’identification définitive du statut de porteur.
3. Maximiser l’utilisation des technologies multiplex.
4. Prendre en compte que les bénéfices du dépistage néonatal incluent des traitements qui vont au-delà de la mortalité et de la morbidité du nourrisson.
109
Nombre de conditions dépistées Québec?
17 (+12 par urine)
110
Problématiques liées à l'équité à l'accès au dépistage?
* Variabilité des conditions dépistées selon la province/l’état
* Questions de coûts? De disponibilité des services?
* Besoin d’une politique à l’échelle nationale pour uniformiser les pratiques?
* Qui décide? Selon quels critères?
* Si dépistage, nécessité d’un suivi approprié pour les résultats positifs
111
Décrit le prélèvement sanguin.
* À la naissance
* Sur le talon
* À l'hôpital/maison de naissance
* Par une infirmière ou sage-femme
112
Décrit le prélèvement d'urine.
* J21 de vie
* Urine de la couche
* À la maison
* Par le parent
113
Après avoir décidé d’ajouter une maladie, il faut faire quoi?
* Mettre le test au point
* Préparer les centres de référence
* Informer les professionnels et futurs parents
114
Qu'est-ce qui est compris dans "mettre le test au point"?
* Choix du test et de l’algorithme
* Équipement
* Contrôle de qualité
115
Que comprends préparer les centres de références?
* accès aux tests diagnostiques
* accès à une évaluation rapide et au traitement
116
À la base, est-ce qu'on demandait le consentement explicite pour les tests de dépistages?
Non
117
Maintenant, qu'est-ce qui se passe avec le consentement et le dépistage?
À Montréal et à Laval, besoin d'un consentement verbal explicite des parents et le documenter sur le formulaire de dépistage
118
Quels sont les impacts d'un faux +?
* Investigations diagnostiques chez enfant en santé
* Suivi/médicalisation d’enfants asymptomatiques
* Anxiété chez famille (temporaire?)
* Danger de stigmatisation
119
Bénéfices d'étendre le DN à des conditions sans traitement?
* Éviter l’ “odyssée diagnostique” (anxiogène et coûteuse)
* Informer les décisions reproductives des parents
* Offrir un(e) prise en charge/intervention/soutien précoce
* Informer la prise en charge
120
Vrai ou faux? Dépistage néonatal n’a pas une sensibilité de 100%.
Vrai
121
Si vous posez un diagnostic de maladie dépistée chez un enfant qui a été manqué au dépistage, il faut faire quoi?
Le rapporter au programme de dépistage comme faux négatif.
122
Décrit l'expansion du DN.
* Avancées technologiques en DN ont le potentiel d’améliorer le devenir d’enfants avec des maladies rares
* Ajout de nouvelles maladies dépend de plusieurs critères, pas juste la disponibilité du test
123
Que comprends le programme de dépistage?
* Test
* Prise en charge
124
Avant d’ajouter une nouvelle maladie au programme de dépistage, il faut considérer:
* Caractéristiques du test
* Disponibilité et efficacité du traitement
* Ressources nécessaires pour suivi et prise en charge
* Priorité par rapport à d’autres maladies/programmes
125
Est-ce que l'effet du hasard a une plus grande importance dans les petites populations?
Oui
126
Effet de l'endogamie sur une petite population?
Amplification de facteurs plus rares
127
Est-ce que les conditions ''uniques au C-F'' sont vraiment uniques?
Non, mais moins grande proportion ailleurs
128
Est-ce que la fibrose kystique est spécifique au SLSJ?
Non, juste plus fréquente
129
Combien de mutations fréquentes pour les maladies dépistés?
1-2
130
Est-ce qu'on pourrait manquer un malade, car il a une mutation super rare? Pourquoi?
Oui, car on ne teste de 1-2 mutations fréquentes
131
Décrit le processus pour la création d'un test de dépistage.
* Gens impliqués
* Évaluation
* Décision
* Programme pilote
* Modification
* Test mis à disposition
132
Qu'inclus le stade préclinique?
* Naissance
* Début biologique
* Début clinique
133
Que se passe-t-il si on a un test super sensible?
Plusieurs faux +
134
Que se passe-t-il si on a un test pas très sensible?
Plusieurs faux -
135
Pourquoi les avancées technologiques représentent une pression?
Si on a le matériel pour détecter une maladie, on devrait le faire
136
Où s'arrête le seuil des maladies dépistés au États Unis?
Fibrose kystique
137
Vrai ou faux? Il y a des délais entre la décision de tester une maladie et le début de son dépistage.
Vrai
