Épidémiologie des maladies infectieuses Flashcards
Qu’est-ce que le spectre d’infection?
- exposition sans infection
- infection asymptomatique
- maladie bénigne
- maladie sévère
- décès
Qu’est-ce que la colonisation?
- Multiplication de microorganismes sans évidence d’infection et souvent sans réponse immunitaire
- Parfois à l’origine d’infection ou d’éclosion (ex SARM)
Qu’est-ce que la vigie?
Détection de menace et mise en place de mesures
Qu’est-ce qu’une éclosion?
Épidémie localisée, circonscrite (ex Salmonellose buffet)
Qu’est-ce qu’une épidémie?
- Épidémie plus étendue Communauté, Région
- Développement d’une maladie qui atteint simultanément de nombreux individus
Qu’est-ce que la flore normale (microbiote)?
- 30 à 40 000 milliards de bactéries (1-10x cellules humaines)
- 0,2 kg ou 0,3% masse corporelle
- 200-500 espèces
- Sites TGI, Bouche, Nez, Vagin, Peau
- Rôles : métaboliques et immunologiques
Causalité agents infectieux et maladie Modèle du Triangle épidémiologique - agent microbien (virus, bactérie, parasites)
- Pathogénicité
- Virulence
- Transmissibilité
- Tropisme
- Susceptibilité aux antimicrobiens
- Géographie
- Habitat naturel
Causalité agents infectieux et maladie Modèle du Triangle épidémiologique - hôte
- Âge
- Sexe
- Immunosuppression
- Intégrité peau/muqueuses
- Microbiote
- Immunité
- Vaccination
- Génétique
Causalité agents infectieux et maladie Modèle du Triangle épidémiologique - environnement
- Géographie
- Résidence (CHSLD, Sans abri, bidonville, etc..)
- Salubrité
- Alimentation
- Animaux (fermes, abattoir, trappeur, etc…)
- Occupation
- Loisirs
- Contacts infectieux
Quel est le questionnaire clé en épidémiologie?
V : voyage et vaccin
O : occupation
L : loisirs
C : contacts infectieux
A : animaux
N : nourriture
Quel est l’apport de Jonh Snow en épidémiologie
«père de l’épidémiologie moderne»
1854 :
- épidémie de choléra à Londres
- Mapping cas de choléra
- pompe Broad Street
- Fermeture de la pompe
- fin éclosion
Qu’est-ce que l’épidémiologie?
- Étude de la distribution et des facteurs qui interviennent dans l’apparition et l’évolution des maladies
- initialement, application en gestion épidémies et maladies infectieuses
- maintenant pratiquement dans tous les secteurs (accidents, cancer, violence, obésité)
Comment gère-t-on une éclosion?
- Valider éclosion
- Valider diagnostic
- Mettre en place équipe de travail
- Définition de cas
- Recueil cas, données
- Étude épidémiologique descriptive (courbe épidémique, mode de
transmission, morbidité, mortalité) - Développer des hypothèses et les réévaluer
- Mesures de contrôle et de prévention, parfois avec intensification
- Poursuivre la surveillance active
- Produire rapport
Quels sont les éléments qui mènent à une pandémie infectieuse?
- L’émergence d’un nouvel agent pathogène transmissible.
- L’émergence d’une nouvelle maladie (manifestations cliniques) causée par ce nouvel agent.
- Nouvel agent cause une épidémie
- Nouvel agent cause une pandémie
Quelles sont les 7 phases de pandémie selon l’OMS?
- infection animale. Pas d’infection humaine
- Infection animale. Rares cas humains
- Infection animale. Cas sporadiques ou petites éclosions humaines. Transmission inter-humaine limitée
- Transmission inter-humaine efficace. Limitée à un pays ou zones limitrophes
- Transmission inter-humaine importante. Plus de 2 pays ou zones non limitrophes. Alerte Pré-Pandémique
- Pandémie
- Post-pandémie
Qu’est-ce que le taux de reproduction effectif ou facteur de propagation?
- Il est défini comme le nombre moyen d’infections secondaires produites par un cas infecté dans une population où certains individus ne sont plus susceptibles à l’infection.
- Exemple : un Rt de 2 implique qu’une personne infectée transmettra la COVID à deux personnes en moyenne pendant la période où elle est infectieuse.
- Rt = 1 indique que la transmission est stable
- Rt < 1 indique que l’épidémie est contrôlée.
Quels sont les principaux effets d’une pandémie?
- Excès de mortalité
- Propagation hors contrôle (Taux d’attaque élevé)
- Surcharge de capacité des infrastructures de santé
- Impacts socioéconomiques négatifs
Quelles sont les principales mesures de contrôle d’une pandémie?
- En premier lieu, éviter d’importer des cas pathologiques nouveaux, ce qui implique de fermer et filtrer les transferts de cas potentiellement contaminent, en maîtrisant les frontières.
- Sur le plan médical, détecter et soigner au mieux les victimes de l’infection.
- Imposer en tant que de besoin des dispositions de distanciation à l’ensemble de la population, y compris d’isolement ou de quarantaine, aux cas suspects
Quelle est l’importance d’écraser le courbe?
- Identification du pathogène
- Développement de vaccins et traitements
- Déploiement des mesures
- Cibler les interventions (Infrastructures, PCI)
- Réduction de mortalité
- Préservation du réseau de santé
Qu’est-ce que la courbe épidémique?
- C’est une représentation graphique (histogramme) du nombre de cas en fonction du temps
- De nombreuses représentations sont possibles (groupes d’âge, résultats des tests, etc,)
Qu’est-ce que l’incidence?
Nombre de nouveaux cas d’une maladie par période
Qu’est-ce que le taux d’incidence?
Incidence par quantité de population
Qu’est-ce que la prévalence?
- Nombre de cas avec telle maladie actuellement dans la population
- dépend de la durée de la maladie
Qu’est-ce que le taux de prévalence?
Prévalence par quantité de population
Qu’est-ce que le taux d’attaque?
nombre de nouveaux cas pendant une période/nombre de personnes à risque pendant la même période
Quelles sont les types d’études épidémiologiques?
- Observationnelles
- Expérimentales
Que sont les études épidémiologiques observationnelles?
Descriptive
- décrire les cas
Cohorte
- groupe défini avec exposition commune, SANS maladie (patients avec cathéter central, personnel soins critiques sur les unités COVID)
- aussi cohortes exposées/non exposées, SANS maladie
- observer les facteurs de risque de survenue d’une maladie
Cas-témoins
- sélection des cas MALADES et NON MALADES
- plusieurs facteurs d’exposition et une seule pathologie est étudie (cas avec C. difficile et cas sans C. difficile)
Que sont les études épidémiologiques expérimentales?
- Prospective
- Modèle de choix pour Vaccins ou Traitements
- Souvent randomisée (répartition au hasard)
- Souvent double insu (patient et investigateur ignorent le traitement)
- Souvent avec groupe Placebo
- Très complexe et dispendieuse
Quels sont les outils analytiques?
Fréquences
Analyses autres
* Risque relatif
* Table 2x2
* Sensibilité
* Spécificité
* Valeur prédictive positive
* Valeur prédictive négative
Que sont que les fréquences?
- distribution d’une donnée dans des variables avec Excel ou autre tableur (exclusives ou non exclusives)
- il existe plusieurs modèles : modèle données exclusives total 100%, modèle données non exclusives (cas peut avoir un ou plusieurs occurrences)
Qu’est-ce que la table 2x2?
Évaluation de la relation entre l’exposition et la survenue d’un événement (outcome)
Table 2x2 - qu’est-ce que la valeur P?
Mesure de la valeur p
- calcul de Chi-carré le plus souvent
- test de Fischer si une cellule à une valeur inférieure à 5
Estimation de la valeur des résultats obtenus (ex relation entre exposition et maladie)
- Hasard, Biais ou Erreur 2x2
Valeur p entre 0-1
Par convention p<.05 assume les probabilités <5% que les relations observées soient dues au hasard
p<.05 est considéré habituellement comme une différence significative
Il est important de prendre en considération la taille de l’échantillon.
Qu’est-ce que la sensibilité?
capacité de détecter correctement les patients malades
Qu’est-ce que la spécificité?
capacité de détecter correctement les patients non malades
Qu’est-ce que le VPP?
capacité d’un test à confirmer, lorsque positif, la présence d’une pathologie donnée
Qu’est-ce que le VPN?
capacité d’un test à confirmer, lorsque négatif, l’absence d’une pathologie donnée
Qu’est-ce que les MADO (maladies à déclaration obligatoire)?
- Loi de la santé publique
- obligation de signaler au Directeur de la santé publique toute menace à la santé de la population
- obligation du médecin et/ou du laboratoire
- chimique ou infectieuse
- chlamydia et gono sont les plus fréquentes
