COURS 11 - DX DES INFECTIONS Flashcards
cheminement Dx en infectiologie - nommer les étapes (3)
- phase pré-analytique
- phase analytique (avec survol des cultures)
- phase post-analytique
cheminement Dx en infectiologie - décrire les étapes de la phase pré-analytique (5)
- le patient consulte avec des Sx/signes d’une maladie infectieuse
- le MD fait un Dx clinique tentatif
- il prescrit des prelevements de culture
- les prélèvements sont identifiés au nom du patient puis acheminés au lab avec demandes d’analyse
- réception des prévèlements au lab
cheminement Dx en infectiologie - décrire les étapes de la phase analytique (8)
- examen direct sur le prélèvement
- rapport partiel émis au MD : interpretation
- mise en culture du prélèvement
- incubation des milieux ensemencées
- lectures des milieux (le lendemain)
- identification bactérienne
- rapport partiel : interpretation
- finalisation de l’identification
cheminement Dx en infectiologie - décrire les étapes de la phase post-analytique (2)
- émission du rapport final
- Interpretation finale du MD
examen direct en microbiologie - nommer les raisons pour effectuer un examen direct (4)
- quantifier les globules blancs présents dans le prélèvement
- exprimer en valeur relative la quant de polynucléaires présents dans le prélèvement
- observation de MO pour poser un Dx présomptif
- évaluation de la qualité du prélèvement pour décider si le résultat final sera fiable
examen direct en microbiologie - a quoi est-ce que la quantification des globules blancs présents dans le prélèvement sert?
nous informe sur la réponse inflammatoire et la “purulence” de l’échantillon
examen direct en microbiologie - nommer les types d’examens directs sans coloration (4)
- sérum physio
- hydroxyde de K (KOH)
- iode
- fond noir
examen direct en microbiologie - décrire l’examen direct du sérum physiologique (2)
- permet d’observer la mobilité de certains MO
- permet d’évaluer rapidement les MO avec des formes particulières
examen direct en microbiologie - utilité du KOH (2)
- KOH 10% digère la kératine
- utile pour Dx des éléments mycéliens a partir de prélèvements d’ongles, de peau, de cheveux
examen direct en microbiologie - utilité test à l’iode (2)
- colore les noyaux et les organelles cytoplasmique
- utile pour colorer rapidement les selles d’un patient et Dx la présence de protozoaire
examen direct en microbiologie - utilité du test au fond noir
- utile pour mettre en évidence des MO mal visualisées en microscopie optique standard et qui se colore difficilement
examen direct en microbiologie - nommer les examens directs avec coloration (2)
- coloration de gram
- coloration de Ziehl-Neelsen
examen direct en microbiologie - coloration de Gram : expliquer son principe (3)
- la teneur en lipide de la paroi cellulaire des bact est variable
- les parois pauvres en lipides retiennent + le colorant cristal violet (Gram +)
- quand la paroi est riche en lipides, le cristal violet ne s’imprègne pas de façon permanente (gram -)
examen direct en microbiologie - coloration de Gram : nommer les étapes de la technique (10)
- étaler sur une lame une couche mince du prélèvement a colorer
- fixer à la chaleur
- ajouter le cristal violet pour 1 min
- laver
- mettre de l’iode 1 min pour fixer le cristal violer
- décolorer quelques sec a l’acétone alcool
- laver
- ajouter la safranine 1 min
- laver, sécher
- lire au microscope
examen direct en microbiologie - coloration de Gram : expliquer l’interprétation des couleurs
- couleur bleue : le cristal violet n’a pas été décoloré par l’acétone et la contre-coloration a la saffranine a été inefficace → paroi pauvre en lipide → gram +
- couleur rouge : le cristal violet est décoloré, permettant à la saffranine de paraitre → la paroi est riche en lipides → gram -
examen direct en microbiologie - coloration de Gram : utilités (4)
- permet de reconnaitre rapidement le ou les bact possiblement pathogènes présentes dans le prélevement et den informer rapidement le clinicien
- permet d’évaluer la présence ou l’absence de flore normale quand le prélèvement provient d’un site non stérile
- permet d’évaluer la rep inflamm car les globules blancs sont colorés dans le processus
- permet de quantifier de façon relative les polynucléaires vs les mononuclées
examen direct en microbiologie - coloration de Gram : pourquoi est-ce que la quantification relative polynucléaires vs mononuclées est utile?
aide a distinguer les infections bact des infections virales
examen direct en microbiologie - coloration de Ziehl-Neelsen : expliquer le principe (2)
- la paroi de certains MO est épaisse et cireuse et ne se colore pas facilement, mais une fois qu’elles sont colorées elles résistent à la décoloration par un solvant comme l’acide-alcool
- cest bactéries sont appelées les bacilles acido-alcoolo résistants (BAAR)
examen direct en microbiologie - coloration de Ziehl-Neelsen : nommer les étapes de la technique (8)
- prépare une lame avec le prélèvement
- mettre du carbol fuschin
- laver
- mettre de l’acide alcool
- laver
- mettre du bleu de méthylène
- laver, sécher
- lire au microscope
examen direct en microbiologie - coloration de Ziehl-Neelsen : expliquer l’interprétation (2)
- bactérie rose : la paroi épaisse et cireuse a capté le premier colorant et à résister a la décoloration → contre coloration inefficace → BAAR
- bactérie bleue : la paroi plus mince de la bactérie n’a pas résister au décolorant → la contre-coloration a été possible → pas BAAR
examen direct en microbiologie - coloration de Ziehl-Neelsen : utilités (1)
- permet l’identification présomptive des mycobact sans pouvoir les identifier à l’espèce
culture : nommer les caractéristiques macroscopiques des cultures (4)
- forme de la colonie
- couleur de la colonie
- grosseur de la colonie
- présence ou non d’hémolyse autour de la colonie
culture : donner les caract des colonies de staphylocoques (4)
- grosse colonie
- covnexe
- jaune
- hémolyse beta
culture : donner les caract des colonies de streptocoque (4)
- petite colonie
- convexe
- translucide
- hémolyse beta large
culture : donner les caract des colonies de pneumocoque (4)
- colonie plate
- ombliquée
- translucide
- hémolyse alpha
culture : donner les caract des colonies des entérobactéries (3)
- colonie surélevée
- semi-opaque
- grise
culture : donner les caract des colonies de pseudomonas (4)
- colonie plate
- opaque
- verdatre
- odeur fruitée
culture : comment se fait l’identification finale des bactéries (5)
- performance de tests biochimiques a partir des colonies
- rapport partiel
- identification finale de la bactérie
- performance de l’antibiogramme
- émission du rapport final
interpretation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site normalement stérile - nommer les sites normalement stériles (3)
- liquide céphalo-rachidien
- liquide synovial
- liquide pleural
interpretation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site normalement stérile - expliquer le concept de pathogène classique
quand un pathogène classiquement associé a une infection d’un liquide normalement stérile est mis en évidence, le MD considère que l’infection suspectée ou non est confirmée
interpretation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site normalement stérile - nommer le pathogène classique du liquide céphalo-rachidien
méningocoque
interpretation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site normalement stérile - nommer le pathogène classique du liquide synovial
staph aureus
interpretation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site normalement stérile - nommer le pathogène classique du liquide pleural
pneumocoque
interpretation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site normalement stérile - que se passe-t-il lorsque des germes non classiquement associées aux maladies sont retrouvés
on parle généralement de contamination lors du prélèvement, et le germe identifié n’est pas considéré comme pathogène
interpretation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site non stérile - définir site non stérile
site ou il est connu qu’une flore normale s’y trouve
interprétation des résultats d’un prélèvement à partir d’un site non stérile - que faut-il pour interpréter correctement les cultures obtenues a partie des sites non stériles (2)
- connaitre la flore normale de ces sites
- porter attention seulement aux bact qui ne font pas partie de cette flore ou qui sont reconnues pour causer des infections
Dx rapide - nommer les méthodes de Dx rapide (2)
- détection rapide d’Ag
- méthode moléculaire
Dx rapide - décrire la détection rapide d’Ag
- diverses méthodes existent pour détecter la présence d’Ag, qui sont souvent des prots de surface
- par exemple, des texts rapides sont dispo pour identifier la présence d’influenza de type A a partir d’un échantillon resp
Dx rapide - décrire la méthode moléculaire (2)
- amplification d’une partie du génome du germe a identifier dans un premier temps
- application d’une méthode de détection de la portion du génome maintenant amplifiée pour confirmer la présence d’un patho suspecté dans un 2e temps
Dx rapide - quand est-ce que la méthode moléculaire est utile (2)
- quand le germe a détecter se cultive difficilement
- quand il se trouve en faible quantité dans un prélèvement, ce qui rend sa détection difficile
sérologie - décrire le principe (3)
- mettre en évidence des preuves indirectes de la présence d’un agent infectieux
- au lieu de détecter le germe directement, il s’agit de détecter la présence d’Ac spécifiques produit par le patient colonisé ou infecté par un germe
- ces Ac sont présents dans le sérum de la personne atteinte
sérologie - nommer son utilité
- utile pour faire le Dx des infections virales, puisque les virus sont plus longs et difficiles à mettre en évidence par culture
- ex : VIH, hépatites, rougeole, rubéole, varicelle
sérologie - nommer les 2 types d’Ac recherchés
- IgM
- IgG
sérologie - décrire les IgM (2)
- ces Ac apparaissent en phase aigue de la maladie et leur présence indique une infection actuelle ou très récente
- quand la phase aigue de la maladie est passée, ce type d’Ac disparait et un 2e type d’Ac apparait alors
sérologie - décrire les IgG
- en phase de convalescence d’une infection, c’est ce type d’Ac qui est produit et qui confère une immunité long terme l’argent infectieux en question
sérologie - décrire le principe de la séroconversion (2)
- cest le passage des IgG négatif à positif
- ce concept s’appliquer à la vaccination : la recherche d’Ac est effectuée sur un échantillon de sérum pré-vaccin et sur un 2e quelques semaines post-vaccin