Écosystème digestif Flashcards
Qui suis-je? Ensemble dynamique de m/o organisés en communautés complexes et qui interagissent avec l’environnement dans lequel ils vivent, notamment dans le corps humain
Microbiote / Écosystème microbien
PS : voici les différentes classes de micro-organismes on les connait bien. (Ce sont des organismes vivant microscopique)
VF? La composition et la fonction du microbiote est constante à travers l’organisme
Faux: il y a une variabilité à travers l’organisme!!!
Qu’est-ce qu’un m/o?
Donne des exemples de m/o
Organisme vivant microscopique
Bactéries, champignons, archées, protozoaires, virus, bactériophages
Nomme différents microbiotes dans l’organismes humain
- Respiratoire
- Oral
- Cutané (peau)
- Vaginal
- Intestinal : Bien important
Quel est le microbiote le plus peuplé de l’organisme?
Microbiote intestinal (10^7-10^14 m/o par gramme de contenu) surtout au niveau de l’intestin et du côlon
Il existe un gradient _ des bactéries résidentes dans le TGI en fonction des _ du milieu
oro-anal
paramètres physicochimiques (ex: O2, glu, pH, transit)
PS : il y a de plus en plus de bactéries au fur et à mesure qu’on s’approche du rectum.
Quels m/o sont surtout retrouvés dans l’intestin grêle?
Bactéries à croissance rapide anaérobies facultatives (supportent O2 ou absence d’O2)
Pourquoi les m/o pénètrent facilement la paroi de l’intestin grêle?
Couche de mucus FINE
Ce mucus qui se renouvelle rapidement empeche l’accumulation de biofilms et donc se sera plutot des biofilms transitoires. De plus, les biofilms on vont se trouver à la surface des couche de mucus, (même si pénétrable)
Quels m/o sont surtout retrouvés dans le côlon?
Bactéries à croissance lente et exigeantes: elles vont consommer des résidus des nutriments non-digérables = fermentation microbienne (Résidence de la fermentation microbienne/ absence d’O2)
Quelles sont les 2 couches de mucus dans le côlon?
Couche externe: facilement pénétrable par m/o
Couche interne: presque impénétrable par m/o
Les biofilms se trouveront implenter dans la couche externe de mucus ou ils pourront s’implanter, mais ne rentreront pas dans la couche interne qui sert de protection.
VF? Il y a interaction unidirectionnelle entre les m/o du microbiote intestinal et les médicaments
Faux: bidirectionnel
Ex: IPP diminue acidité = effet sur populations de m/o et M/o influe sur le métabolisme des Rx
Quelle discipline étudie les variations inter-individuelles dans le microbiote et leurs effets sur l’efficacité des réponses aux médicaments?
Pharmacomicrobiomique
- À quoi ressemble le micriobiote à la naissance?
- Comment évolue-t-il?
- À quel moment pouvons nous le considérer comme stable?
- À la naissance, le tube digestif est rapidement colonisé par des micro-organismes provenant en partie de la mère. (Type d’Allaitement et mode d’accouchement sont des sources de colonisation.)
- Période d’acquisition du microbiote ou on se fou tout dans la gueule (1000 premiers jours de la vie)
- Vers les 3 ans la fraction dominante du microbiote devient stable.
Quels 3 domaines regroupe la pharmacomicrobiomique?
- Génomique microbienne
- Pharmacologie
- Microbiologie
Qu’est-ce qu’un modèle de digestion in vitro?
Une reproduction technologique de la physiologie du TGI sur plusieurs contenant avec différents pH et autres facteurs physicochimiques.
VF? Les modèles in vitro de digestion peuvent substituer l’expérimentation animale/études cliniques humaines
Faux: utilisation en complémentarité
Donne 2 exemples de modèles de digestion in vitro disponibles à l’Uni
Le TIM-1 (digestion) : reproduit les principaux paramètres physicochimiques de seulement l’ estomac et l’intestin grêle)
Le SHIME (fermentation) : Les trois parties du colon sont ajoutés (d’ou la fermentation). L’objectif étant de reproduire les différentes variables de l’écosystème colique.
PS: On arrive aussi à distinguer les différentes niches: les bactéries qui colonisent spécifiquement la couche de mucus, à celles qui restent dans le lumen. (Fermentation SHIME)
Quels sont les avantages des technologies de digestion in vitro par rapport aux études cliniques humaines? (4)
- Moins de considérations éthiques (animaux)
- Prélèvements illimités (N’importe l’endroit dans le tractus)
- Étude de substances néfastes sur le sujet
- Test de nouvelles molécules pharmaco/diététiques
Quels facteurs affectent le microbiote à la naissance/petite enfance (8)
- Mode d’accouchement
- Naissance à terme ou prématurée
- Mode d’allaitement
- Colonisation utérine de la mère
- Style de vie de la mère
- Alimentation de la mère
- Prise antibio mère
- Génétique
VF? Le microbiote est relativement stable à l’âge adulte selon la variable “âge”
Vrai
Stable jusqu’à la vieillesse. Tout au long de notre vie, le microbiote détient une certaine capacité de résistance aux perturbations écologiques.
Qu’est-ce qui caractérise le microbiote à l’âge avancé? (2)
- Diminution de la diversité des m/o
- Augmentation d’espèces délétères (nuisibles)
Nomme des facteurs d’influence du microbiote intestinal à l’âge adulte (4)
- Alimentation
- Style de vie
- Médicaments (antibios, anti-acides, anti-diabétiques)
- Activité physique
Pas trop perdre de temps c’est juste logique.
Nomme des facteurs d’influence du microbiote intestinal à l’âge avancé (4)
- Déclin des fonctions physiologiques
- Alimentation
- Style de vie
- Médicaments (antibios, anti-acides, anti-diabétiques)
Quelles sont les conséquences possibles des perturbations gastro-intestinales du microbiote?
- infx alimentaire
- Diarrhées du voyageur
- Diarrhées lors d’antibiothérapie
- Maladies inflammatoires chroniques de l’intestin
Quelles sont les conséquences possibles des perturbations extra-intestinales du microbiote? (4)
- Syndrome métabolique/obésité
- Allergies
- Infx vaginales, urinaires
- Affections neuropsychiatriques: stress, anxiété, autisme, neurodégénérescence (Grâce à l’axe intestin-cerveau)
Quelles sont les 4 fonctions du microbiote?
1) Fonctions métaboliques: synthèse, dégradation, transformations
2) Fonctions de barrière/défense: exclusion pathogènes, modulation défenses innées, sécrétion mucus, immunomodulation…
3) Effets trophiques (De croissances): sur cellules immunitaires, cellules épithéliales
4) Neuromodulation: sensibilité viscérale, transit intestinal, affections neuropsychiatriques
1) La fermentation intestinale est une réaction _ anaérobie.
2) Sustrats?
3) Produits?
4) Fonctions des produits?
1) d’oxydoréduction
2) Nutriments non-absorbés
3) métabolites secondaires (acides gras à chaine courte) au potentiel bioactif.
4) Provision énergie à l’organisme, réduction de la charge osmotique colique, nourrit colonocytes (énergie de la fermentation)
Nomme des médicaments modulateurs du microbiote (5)
- Antibiotiques: Rx qui tuent bactéries
- Probiotiques: m/o vivants
- Prébiotiques: substrats utilisés par m/o
- Psychobiotiques: pro/prébiotiques qui procurent bienfaits psycho
*Aussi: fécothérapie: transplantation microbiote fécal (surtout pour traitement d’infection à C. difficile)
