Domaine 8 : Analyse d'article scientifique Flashcards
Comment /qu’elles sont les étapes pour faire une lecture critique ?
Étape 1 : lecture Titre et abstract
Étape 2 : Rechercher dans l’article rédigé :
◦ Question de recherche / Design
◦ Méthode
◦ Résultats
La pratique est fondé sur 3 choses :
- Evidence scientifique
- Expérience clinique
- Individualité patient
Qu’elles sont les structures d’un article ?
- Résumé (abstract)
- Introduction
- Méthode
- Résultats
- Discussion
- Conclusion
- Références
Donner les critères picots, ils aident a quoi ?
P : Population
I : Intervention
C : Comparateur
O : Outcome, critère de jugement
T : Temps
OU
P : Population ou problème
I : Interet
Co : Contexte
Aide à élaborer une question de recherche
Pour plus d’info : photo tel
En recherche, il y a deux grands types d’études, donner les
Etude quantitative :
- descriptive
- analytique
- expérimentale
- comparative
Etude qualitative :
- ethnographique
- historique
- philosophique
- sociologique
Dans les études quantitatives on retrouve :
Dans épidémiologie :
- étude cas/série de cas
- étude transversale
- étude cas témoin
- étude de cohorte
Dans interventionnelle :
- Essai contrôlé randomisé
L’étude de cas (case serie) ou série de cas (case study), est utilisé pour quelle problématique ?
Description de cas exceptionnel
- rencontré en pratique clinique
- non généralisable
- découverte préliminaire dans monde de la recherche = peu de valeur en niveau de preuves
L’étude transversale (cross sectional study), est utilisé pour quelle problématique ? Couteux ? Quels peuvent être les biais de ce type d’étude ?
Photo de la population à un instant donné T : - Prévalence : description de la répartition de la maladie dans la population générale à un instant T
- Étude observationnelle
- Peu coûteuse (questionnaires)
Biais de mesure
Biais de sélection
PS : Elle peut être
- descriptive : prévalence
- étiologique : facteur de risque
L’étude de cohorte (cohort study), est utilisé pour quelle problématique ? Couteux ? Quels peuvent être les biais de ce type d’étude ?
Nombre de nouveaux cas qui apparaissent sur un temps donné
- = Incidence de la maladie
- Étude observationnelle
- Coûteuse
- Permet éval pronostic et étiologie
- Srobe (grille lecture) –SIGN (checklist qualité)
Biais de mesure
Biais de selection
(PS : Une fois que l’étude transversale est réalisée, on va pouvoir faire une étude
de cohorte)
L’étude cas témoin (case control study), est utilisé pour quelle problématique ? Couteux ? Quels peuvent être les biais de ce type d’étude ?
But : association ou relation entre un facteur et une maladie rare ou d’apparition lente
- 1 groupe témoins (sans maladie)
- 1 groupe maladie rare ou d’apparition lente. - Demande si exposition à 1 facteur passé
- On ne calcule pas l’incidence
- Il n’ y a pas de suivi dans le temps !
Biais de rappel ++ –> biais de mémorisation
L’étude essai contrôlé randomisé (RCT), est utilisé pour quelle problématique ? Couteux ? Quels peuvent être les biais de ce type d’étude ?
But : efficacité d’un ttt en comparaison à un groupe contrôle recevant placebo ou ttt existant “de référence”.
- population où ils sont tous malades.
- répartition aléatoire en 2 groupes
- meilleur en double aveugle
- On les suit et on compte à la fin ceux qui ont guéris, le groupe où il y a le plus de personnes guéries = traitement le plus efficace
Donner les différents types de revus qui existent et leur but.
- narrative :
Choix arbitraires des articles / risques biais de sélection des auteurs - systématique :
Tous les articles sur le sujet / méthode de recherche et de sélection des articles expliquées. - critique systématique :
Tous les articles sur le sujet mais avec critique. On peut éval validité interne, sélectionner article que de bonne qualité. Répond à la question recherche et extrapole les résultats. Grille ASMTAR, Rédaction PRISMA (si transversale STROBE) - méta-analyse
Analyse statistique des études existantes. Les études incluses dans une revue critique permettent ou non de faire une méta-analyse.
Si bien menée: revue meilleur niveau preuve !
Donner les principaux biais possible (sans rentrer dans les sous biais –> voir photo tel)
Biais de sélection
Biais d’information ou de classement*
Biais de confusion
Quelles sont les différences entre une variable quantitative et qualitative ?
Quantitative
- S’expriment par un nombre
- Peuvent être exploitées mathématiquement
Qualitativement
- S’expriment pas en valeur numérique
- S’expriment par une qualité
- Peut répartir en classes ou catégories
Donner les types de variables quantitative et qualitative
Quantitative
- Continues (n’importe quelle valeur numériq)
- Discrètes (que valeur numériq entière)
- Temporelles (date, heure, …)
Qualitativement
- Nominale (ne peut pas être hiérarchisé)
- Ordinale (peut être classé entre elle)
- Binaire (ne peut pas être hiérarchisé et 2 modalités possible)
Donner selon les types de variables quantitative et qualitative, les types de graphiques adéquats :
Quantitative
- Continues : polygone de fréquence
- Discrètes : histogramme
- Temporelles : /
Qualitativement
- Nominale : D barre (horizontale), camembert
- Ordinale : diagramme en barre
- Binaire : camembert
Qu’est ce qu’une variable indépendante et dépendante ?
La variable dépendante :
- un paramètre qui varie sous l’influence d’autres variables appelées variables indépendantes.
- elle subit l’effet de la variable indépendante.
Variable indépendante :
- qu’on peut pas changer
- age, sexe par exemple
Concernant les mesures en statistique, il existe deux types de paramètre.
Paramètre de position
Paramètre de dispersion
Donner les différentes donnés des paramètres de position et comment on les calcule.
Moyenne : somme valeur/ nb valeur
Médiane : dans échantillon, valeur qui sépare échantillon en 2
Quartile 1 /Q1 : plus petite donnée de la liste telle qu’au moins 1⁄4 des données sont inférieures ou égales à Q1 et Q3 au moins 3⁄4 des données sont inférieures ou égales à Q3
Mode : valeur de la série pour laquelle
l’effectif associé est le plus grand
Fréquence : quotient de l’effectif de cette
donnée par l’effectif totale, elle peut
s’exprimer en pourcentages
Donner les différentes donnés des paramètres de dispersion et comment on les calcule.
Extrêmes
= valeurs min et max
Étendue
= différence entre la plus grande et la plus petite valeur de la distribution
Intervalle interquartile
= étendue de la distribution sur laquelle se trouvent concentrée la moitié des valeurs de X qui sont les moins différentes de la médiane. On exclut de cette distribution 25% des valeurs les plus faibles et 25% des valeurs les plus fortes
Variance ( s x) 2
= la moyenne du carré des écarts à la moyenne
Écart type ( s x ) :
la racine carré de la variance →indique la dispersion entre les valeurs
IC 95% :
intervalle de confiance qui a 95% de chances de contenir une valeur réelle que l’on cherche à estimer. Elle permet de définir une marge d’erreur. → Si l’IC comprend la valeur 1 = les
résultats ne sont pas significatifs = P >0,05 !!!
A voir si on doit connaitre les tests de comparaison et de liaison et les interpréter (voir photo tel)
Donner les interprétations en fonction des tests dx avec les HO, H1 ,…
- Établir H0 = pas de différence entre les 2
- Établir H1 = différence entre les 2
- Calcul tests
- Résultats test de comparaison :
- α = proba de rejeter H0, si H0 est vraie
- β = proba de pas rejeter H0 (accepter H0),
si H1 est vraie - 1-β = puissance d’un test
- Interprétation finale
Qu’est ce que RR ? –> cohorte
Comment on l’interprète ?
Comment on le calcul ?
La calcul du Risque Relatif
- Mesure le risque de survenue d’un événement dans un groupe par rapport à un autre
Interprétation : si IC 95%
◦ RR < 1 → Facteur protecteur
◦ RR = 1 → Absence de risque
◦ RR > 1 → Facteur de risque
La calcule de RR : Voir photo tel
Incidence exposé / incidence non exposé
Ie : malade exposé/ (exposé malade et non malade)
Ine : malade non exposé/ (malade ne + non malade non exposé)
Qu’est ce que OR ? → Cas-témoin
Calcul de rapport de coté = Odds Ratio
- Ou rapport de chances, rapport des cotes ou RR rapproché
- Mesure statistique, svt utilisée en épidémiologie, exprimant le degré de dépendance entre des variables aléatoires qualitatives.
Interprétation : si IC 95%, idem que RR
◦ RR < 1 → Facteur protecteur
◦ RR = 1 → Absence de risque
◦ RR > 1 → Facteur de risque
Calcul OR :
(cas exposé X témoin non exposé) /
(témoin exposé X cas non exposé)
Qu’est ce que la fiabilité ?
Comment est ce mesuré, quel coef ?
Fiabilité = Reproductibilité
→ Capacité du test à être reproduit dans les mêmes conditions par d’autres personnes
Mesurée par le coefficient de kappa et le coefficient intraclasse
Qu’est ce que la validité ?
Comment est ce mesuré, quel coef ?
→ Propriété d’un test à mesurer ce qu’il est censé mesurer (maladie).
En général, comparaison avec un test de référence ou « gold standard ».
Mesurée par le Likelhood ration (LR) ou rapports de vraisemblance
Qu’est ce que le critère de jugement et le facteur étudié ?
Facteur étudié = ce que l’on teste
Critère de jugement = ce qui nous permet de mesurer (le changement d’état)
Donner et expliquer les 3 types de préventions.
Prévention primaire :
→ Prévenir le dvpt initial d’une maladie
Prévention secondaire :
→ Détecter tôt des maladies déjà existantes pour réduire la sévérité et les complications
Prévention tertiaire :
–> Réduire les impacts des maladies, éviter les rechutes, complications ou séquelles
Qu’est ce que la validité interne ? ça depend de quoi ?
A quel point les résultats d’une étude sont corrects pour la population étudiée ?
- dépend méthodo étude utilisée
- menacée par les biais
Qu’est ce que la validité externe ?
Elle permet de juger de l’applicabilité des résultats et de généraliser les résultats à la population qui nous intéresse.
PS : Pour pouvoir généraliser les résultats, il faut que pop départ soit identique à pop qui nous intéresse
Voir si on doit apprendre standard de présentation et grille de lecture en fonction étude : voir photo tel
Quels sont les différents niveau de preuve qui existent ?
Niveau 1 : A preuve scientifique établie
Niveau 2: B présomption scientifique
Niveau 3 : C faible niveau de preuve scientifiq
Qu’est ce que le CNRS ? et l’INSERM ?
CNRS : centre national de la recherche scientifique
INSERM : institut national de la santé et de la recherche médicale
Donner les différentes recherche qui existent.
(A voir si on doit les apprendre)
Recherche fondamentale :
- acquérir nouvelles connaissances sur fondements des phénomènes et faits observables, sans envisager une application ou une utilisation particulière à court terme.
Recherche appliquée :
- acquérir connaissances nouvelles, dans un objectif pratique déterminé, pour apporter une solution à un problème plus concret
Recherche translationnelle :
- Trouver des applications pratiques aux découvertes fondamentales les plus récentes.
Recherche clinique :
- Dans la majorité des cas, elle s’intéresse aux nvx médocs et nouvelles techniques de PEC
Recherche en santé publique
- Pluridisciplinaire et transversale
- Épidémiologique
- Biostatistique
- Sciences humaines et sociale
- Biologique, génétique, toxicologie
Donner les étapes d’un projet de recherche
1) Contexte du sujet ou problématique
2) Elaboration des objectifs et hypothèses
3) Construction méthodologie
4) Définir le calendrier
5) Estimation ressource nécessaire
6) Dimensions éthiques
7) Collecte des donnés
8) Traitement des donnés
9) Rédaction et diffusion des résultats
Quelle est la structure IMReD :
I : Introduction
M : Méthode
R : Résultats
e : (and)
D : Discussion
Donner les opérateurs booléens et leurs rôles.
A quoi serve les parenthèses et la troncature * ?
- AND : pour préciser recherche
- OR : pour élargir recherche
- NOT : restreindre rechercher
- Parenthèse : structurer l’équation
- Troncature * : remplace les lettres manquantes à la fin d’un mot, au milieu.
–> permet de sélectionner plusieurs termes ayant une racine commune, rechercher singulier et pluriel
Quel est le nom du logiciel de gestion de références gratuit, libre et open source
Zotero
Donner quels sont les buts en santé publique de la relation soignant-soigné.
- Améliorer le travail médical
- Optimiser l’adhésion thérapeutique
- Améliorer la prise en charge
- Tendre vers une meilleure efficience
- Réduire le coût des soins
- Ramener les personnes à l’activité
- Assurer le bon fonctionnement de la société
Qu’est ce que l’ISS ?
Inégalité Sociale de Santé
Qu’est ce que l’acronyme FINER, pour quoi ?
F : Faisable
I : Intéressante
N : novatrice
E : Ethique
R : relevant = pertinent
Quelle est la première chose à regarder dans un article ?
Question de recherche
Où trouver la question de recherche dans un article ?
À la fin de l’introduction
Qu’est‐ce qui est lié à la question de recherche ?
Le design
Quel peut être un objectif d’une étude ?
- Pronostic‐ évolution–
- Test diagnostique
- Impact d’une intervention/ thérapeutique
- Étiologie – causalité
Où trouve t‐on le design ?
- Méthode
- Résumé
- Titre
Qu’est ce qu’un vrai positif, un faux positif, un vrai négatif et un faux négatif ?
- Vrai positif (VP) : sujet malade, test +
- Vrai négatif (VN) : sujet non malade, test -
- Faux négatif (FN) : sujet malade, test -
- Faux positif (FP) : sujet non malade, test +
Quels sont les points clés du résumé d’une étude ?
- rédigé une fois l’article écrit, pas avant
- simplicité, clarté, précision
- phrases simples avec un style direct
- présenter que données les plus pertinentes
- passé simple sauf si possible conclusion
Qu’est ce qu’une :
- “whole target population”
- Convenience simple
- Random selection
- Consecutive sample
- ensemble de pop au sein d’1 échantillon
- échantillon dans pop cible
- sélection aléatoire
- échantillon consécutif
