DNA3

Question 1

tijdens welke fase bevindt replicatie van het DNA plaats?

Answer 1

Tijdens het S-fase van de celcyclus.

Question 2

waar bevinden zich vrije nucleotiden en welke onderdelen hebben ze? (belangrijk)

Answer 2

in het kernplasma (dATP, dTTP, dCTP, dGTP), elke bestaat uit:
1 desoxyribose (d), 1 stikstofbase(A T C G), 3 fosfaatgroepen (TP). hierbij bevindt chemische energie in de binding tussen de fosfaat groepen, die komt vrij door twee fosfaatgroepen te splitsen.

Question 3

omschrijf het replicatie van DNA: (belangrijk)

Answer 3

1- beginnen bij replicatiestartpunt.

2-ontstaan van REPLICATIEBEL:
waterbruggen tussen de basenparen wordt verbroken door het enzym HELICASE, waardoor het helixstructuur verdwijnt en de twee ketens gaan uit elkaar.

3-SINGEL STRAND BINDING PROTEINEN binden aan de strengen en voorkomen dat de vrijgekomen stikstofbasen in een streng van een replicatiebel opnieuw waterstofbruggen gaan vormen met de vrijgekomen basen in de andere streng.

4- DNA-POLYMERASE schuift langs de enkelvoudige ketens in tegengestelde richting en bindt de vrije nucleotiden van het kernplasma aan de vrijgekomen stikstofbasen van de replicatiebel, hiervoor wordt de energie verbruikt die vrijkomt door het afsplitsen van 2 fosfaatgroepen.

5- ontstaat twee dubbele strengs DNA moleculen die iedere uit oude en nieuwe ketens bestaan.

Question 4

reden dat replicatie proces is zo snel bij eukaryoten: (belangrijk)

Answer 4

Omdat bij eukaryoten organismen bevat een DNA molecuul veel Replicatiestartpunten.

Question 5

chromosom vorm na DNA replicatie

Answer 5

twee Chromatiden, op plaats van het centromeer worden beide Chromatiden bij elkaar gehouden door waterstofbruggen. X

Question 6

wat is PCR (polymerase chain reactie)?

Answer 6

door PCR kunnen een of meerdere specifieke gedeelten uit DNA worden gekopieerd.

Question 7

wat hebben we voor PCR nodig?

Answer 7

twee verschillende Primers voor elke streng een, Stukjes DNA, DNA polymerase, DNA nucleotiden

Question 8

wat zijn Primers? en waarom hebben we primers nodig voor het PCR?

Answer 8

Primers zijn korte stukjes DNA van 20 tot 30 nucleotiden die worden gemaakt in een laboratorium.
ze zijn complementair aan een een deel van het DNA dat men wilt Vermenigvuldigen. omdat polymerase kan niet een enkele streng DNA kopiëren, hij kan allen nieuwe nucleotiden vastplakken aan het 3’ uiteinde van een al bestaande streng.

Question 9

hoe kunnen we DNA sequentie aflezen?

Answer 9

Door sequensen (speciale PCR reactie die wordt gevolgd door gelelektroforese)

Question 10

wat hebben we nodig bij het sequensen?

Answer 10

DNA,DNA polymerase, DNA nucleotiden, primers, Didesoxynucleotiden (ddA,ddT,ddC,ddG)

Question 11

wat is Didesoxynucleotiden?

Answer 11

moleculen die op normale nucleotiden lijken maar zonder OH-groep in het 3’ uiteinde. en hebben bovendien een stof gebonden die in een bepaalde kleur fluoresceert (label)

Question 12

wanneer stopt het DNA replicatie bij sequensen?

Answer 12

nadat er is een Didesoxynucleotiden is ingebouwd, omdat ze hebben geen OH-groep in hun 3’uiteinde

Question 13

PCR methode:

Answer 13

1-in de PCR machine wordt een eppendorfcupje met mengsel van DNA stukjes, Geschikte primers, DNA polymerase, DNA nucleotiden.
2-DNA tot 95C verhitten: twee strengen uit elkaar.
3-DNA tot 65C verlagen: primers hechten aan de twee strengen en passen aan het begin dus 3’.
4-DNA tot 72C verhitten: DNA polymerase vanaf de primers de keten verlengen, ontstaat 2 dubbele strengen.

Question 14

Sequensen door Gelelektroforese methode:

Answer 14

1-DNA door PCR kopiëren.
2-DNA dubbele streng gescheiden, alleen leidende streng wordt gebruikt.
3-reageerbuis van: Leidende strengen, DNA polymerase, primers, veel DNA nucleotiden, klein hoeveelheid Didesoxynucleotiden A of ddT of ddG of ddC met fluorescerend label kleur.(iedere Basen apart reageerbuis)
4-PCR-reactie op gang, DNA kopieën worden gesloten aan Didesoxynucleotiden, ene keer nadat er korte DNA gevormd, andere keer nadat er lange keten werd gevormd.
5- reageer buis bevat alle verschillende mogelijkheden lengtes van DNA met Gelabelde Didesoxynuleotide aan het eind.
6-DNA gescheiden met lengtes (kleiner sneller) door gelelektroforese.
7-NA kleuring kan DNA worden afgelezen, en te zien met UV-licht als bandjes in de gel.
8-Omdat de gelabelde een nucleotiden in lengte verschillen wordt de nucleioteden van onder naar boven worden gelezen.

Question 15

wat is repetitief DNA?

Answer 15

een DNA met herhalende korte sequenties, bijv(AGTAAGTAAGTAAGTA..), en het aantal herhalingen verschilt van persoon tot persoon.

Question 16

hoe komt dat soms verschilt het aantal repeats in allelen van een chromosoom? en waarom iedere persoon heeft een unieke patroon van repetitief DNA?

Answer 16

chromosomen komen in paren voor daarom hebben mensen per locus twee allelen, het kan dat elke allel heeft verschillende aantal repeats, en dat komt doordat mens een chromosomen van zijn moeder erft en andere van zijn vader, daarom is het bij iedere persoon unieke patroon van repeats.

Question 17

waarvoor wordt DNA-Fingerprint of DNA-profiel gebruikt?

Answer 17

een persoon te identificeren

Question 18

hoe wordt DNA-Fingerprint of DNA-profiel bepaald?

Answer 18

door beide allelen van minimaal tien onafhankelijk overervende loci met repetitieve DNA te onderzoeken:
1-DNA Vermenigvuldigen door PCR om te kunnen analyseren.
2- loci knippen die met repeats met behulp van het restrictie-enzymen, ze herkennen een specifieke nucleotidensequentie van 4-8 nucleotiden en knippen het DNA op die plaats door.
3-DNA fragmenten afhankelijk van het aantal repeats hebben verschillende lengtes, worden gescheiden door gelelektroforese dat levert een unieke bandenpatroon.
4-met behulp van dezelfde specifieke restrectie-enzymen van dezelfde loci DNA-profielen te maken van het DNA van andere personen kan men het DNA profielen vergelijken

Question 19

wat zijn Restrectie-enzymen? functie?

Answer 19

Afkomstig uit bacteriën, en beschermen hun tegen het DNA van virussen, ze herkennen een specifieke nucleotidensequentie van 4-8 nucleotiden en knippen het DNA op die plaats door, er is verschillende soorten restrectie-enzymen die iedere specifieke sequentie herkent, bij de meeste restrectie enzymen zijn herkenning plaatsen in beide ketens van DNA molecuul elkaars spiegelbeeld.

Question 20

Hoevell verschillende soorten primers hebben we nodig bij PCR, en hoeveel bij Sequensen?

Answer 20

PCR twee voor elke streng een, Sequensen een omdat bij sequensen wordt gebruikt van leidende strengen alleen.