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microbiologie > Cours 7 - Les virus > Flashcards

Cours 7 - Les virus Flashcards

1
Q

Définition virus

A

-parasite obligatoire qui dépend d’une cellule hôte (aussi appelée ‘cellule cible’) pour se répliquer.
-agent infectieux constitué d’un seul acide nucléique = génome, entouré d’un coque protéique = capside, l’ensemble pouvant être (ou non) entouré d’une membrane lipidique = enveloppe.

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2
Q

Quel virus le plus fragile : avec ou sans enveloppe?

A

-virus qui ont une enveloppe sont plus fragiles
-l’enveloppe est lipidique et est facilement dissous, ensuite il va perdre ce qui est sur son enveloppe qui lui sert à aller se fixer sur une cellule, donc même s’il a encore sa membrane protéine, il ne peut quand même plus aller se fixer aux cellules donc pu se répliquer
-tandis que les virus qui n’ont pas d’enveloppe : protéines sont très résistantes au rayons UV mais pas résistants à la chaleur, donc il faut les traiter à la chaleur parce que pas sensibles aux liquides savonnés non plus

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3
Q

Définition d’un virion

A

particule virale complète et capable d’infecter une cellule susceptible.

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4
Q

nucléocapside composé de ?

A

Nucléocapside = acide nucléique + capside

Généralement, les virus qui causent des gastroentérites n’ont pas de nucléocapside

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5
Q

Différence entre bactéries et virus

A

Bactérie :
* sont des cellules avec organelles fonctionnelles
* génome = ADN
* possèdent leur propre appareillage pour synthétiser les macromolécules nécessaires à leur reproduction
* se répliquent par fission binaire
* sont sensibles aux antibiotiques

Virus :
* ne sont pas considérés “cellules” (ne possèdent pas d’organelles)
* matériel génétique = ADN ou ARN
* dépendent obligatoirement de la « cellule hôte »
pour se reproduire
* l’acide nucléique viral peut être infectieux
* ne sont pas affectés par les antibiotiques
* La plupart sont « filtrables », voulant dire qu’ils passent à travers les filtres bactériologiques

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6
Q

En générale les virus et bactéries sont visibles quel sortes de microscope?

voir diapo 8

A

Bactérie : microscope optique
Virus : microscope électronique, sauf UNE excpetion

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7
Q

Quel sorte de virus sont visibles au microscope optiques?

A

Les virus géants

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8
Q

Description des virus géants

A
  • On propose un nouvel ordre pour ces virus: « Mégavirales »
  • Mimivirus, Mamavirus, Pandoravirus, Pithovirus
  • Les plus grands des virus géants ont un diamètre >1 μm et un génome > 500 kpb
  • Génome composé d’ADN (pas d’ARN)
  • Se répliquent dans le cytoplasme des amibes
  • En2008,le virophage Sputnik fut découvert comme virus satellite du Mimivirus

S’approchent au diamètre des bactéries, ainsi ces virus ne sont pas filtrables.
Sputnik: nom du vaisseau satellite spatial russe.

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9
Q

voir diapo 10-11-12

A
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10
Q

Nommer les principales composantes des virus de forme icosaédrique

voir diapo 14

A
  1. Capside
  2. Acide nucléique
  3. Capsomère
  4. Nucléocapside
  5. Virion (antité virale)
    -seulement pour les virus enveloppés:
  6. Enveloppe
  7. Glycoprotéine (=spike)
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11
Q

Virus de forme icosaèdre ….?

A

Possèdent 20 faces triangulaires

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12
Q

2 formes que les virus peuvent avoir?

voir diapo 15

A

-Icosèdre et hélicoïdale

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13
Q

Description du génome des virus

A
  • ADN ou ARN
  • Bicaténaire (ds = double-stranded) ou
    monocaténaire (ss = single-stranded)
  • Segmenté ou non segmenté
  • Linéaire ou circulaire
  • Poids moléculaire très variable (1.5 x 106 à 160 x 106 daltons)
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14
Q

Nommer les types de génomes viraux. (système de classification de Baltimore)

A
  1. ADN bicaténaire
  2. ADN monocaténaire
  3. ARN monocaténaire
  4. ARN bicaténaire
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15
Q

Qu’est-ce que le cycle de réplication virale?

A
  • L’ensemble des étapes permettant au virus de se répliquer à l’intérieur d’une cellule hôte.
  • Requiert une cellule susceptible et permissive à l’infection:
    -la cellule susceptible est munie de récepteurs cellulaires spécifiques
    -la cellule permissive est dotée des conditions permettant la production de nouveaux virions
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16
Q

2 aspects du cycle viral?

A

-Les virus se répliquent uniquement dans les cellules vivantes. La cellule cible devient l’usine pour la replication du virus.
-La cellule fournit: l’énergie (ATP), la machinerie cellulaire (enzymes, ribosomes, ARN de transfert), et des petites molecules (acides amines, nucleotides, sels minéraux) qui servant à la replication virale

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17
Q

Nommer les étapes du cycle réplicatif viral.

voir diapo 20

A
  1. Attachement – à l’aide d’une protéine à la surface du virus qui reconnaît un récepteur spécifique sur la cellule cible
  2. Entrée (m chose que pénétration)
  3. Décapsidation (‘uncoating’)
  4. Transcription (précoce)
  5. Traduction (précoce)
  6. Synthèse des enzymes de réplication
  7. Réplication de l’acide nucléique
  8. Transcription (tardive)
  9. Traduction (tardive)
  10. Synthèse des protéines structurales
  11. Assemblage des nucléocapsides (ADN s’insère dans la capside du génome)
  12. Libération
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18
Q

Cycle viral - entrée par pinocytose?

voir diapo 21

A
  • Rien ne se fait dans le noyau
  • Étapes clées :
    -Attachement
    -Entrée
    -Décapsidation
    -Relâchement du génome de brin positif (génome + = brin +)
    -protéines non structurales qui sont formés qui permettent la réplication du génome
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19
Q

Cycle viral - Entrée par fusion?

Diapo 22

A
  • Se passe en majorité dans le noyau
  • 3 étapes au lieu de 2
  • Étapes principales :
    -Absorption : Entre dans la cellule par absorption à l’aide d’un ligant qui s’attache sur un récepteur spécifique sur la cellule
    -Décapsidation (cytoplasme)
    -Transcription des gènes précoces immédiats (noyau)
    -Traduction des protéines (cytoplasme parce que les riobosomes sont là)
    -Réplication (noyau)
    -Bourgeonnement de la membrane nucléaire
    -Sortie

voir schéma c’est plus claire xxx

20
Q

Règles de nomenclature : histoire?

A
  • 1961: Comité international de la taxonomie des virus s’est rencontré pour la première fois pour mettre au point un système de classification des virus basé sur des critères définis. - Ce Comité continue à se rencontrer périodiquement afin de pouvoir faire des ajouts à la liste.
  • En 2018, on comptabilisait 14 ordres, 143 familles, 64 sous-familles, 846 genres, et 4958 espèces.
21
Q

Règles de nomenclature : classification et sufixe?

A
  • Ordre (…virales)
  • Familles (…viridae)
    -DNA ou RNA
    -ds ou ss
    -forme de la capside
    -enveloppés ou non
  • Sous-familles (…virinae)
    -poids moléculaire de l’acide nucléique
    -diamètre des particules virales
    -nombre de capsomères (= unités de capside)
    -hôtes infectés, etc
  • Genres (…virus)
  • Espèces (lettre ou chiffre qualifiant le genre)
22
Q

Méthode de diagnostic viral?

A
  • Microscopie électronique (technique fastidieuse)
  • Culture cellulaire + immunofluorescence (IF) avec un anticorps spécifique
  • PCR
  • Sérologie (recherche des anticorps dans le sérum par IF ou ELISA)
23
Q

Adénovirus au microscope électronique?

A

Visualisation en microscopie électronique démontre une structure assez unique – fibre.

24
Q

Astrovirus au microscope électronique?

A

-Ont une forme d’étoile
-Causent des entérites

25
Q

Entérovirus 71?

A
  • Cause la maladie pied-main-bouche
  • peut être mortelle chez les enfants
  • Microscopie électronique et immunofluorescence sur culture cellulaire ( voir diapo 27)
26
Q

Virus de l’hépatite A : symptomalogie?

A

-Épuisement, perte d’appétit, douleurs musculaires, nausée/vomissement, fièvre.
-Aussi: urine foncée, ictère, jaunissement au niveau des yeux, selles pâles, douleurs abdominales, démangeaisons.

27
Q

Stade du virus de l’hépatite A?

A

J1-J2 : incubation
J2 à J7 : ictère
J7 à J12 : convalescence

Transaminase : J2 à J11
IgM anti HAV : J4 à J12
IgG anti HAV : J5 à …..

voir diapo 28

28
Q

voir diapo 29-30

A
29
Q

Expliquer la polymérisation en chaine (PCR)

A

-ADN (~25°) : Prendre l’extrait cellulaire ou génétique, on met les réactifs à chauffer à haute température
-Dénaturation (~90°C)
-Hybridation des amorces (~55°) : baisse de température pour permettre aux amorces de se fixer. Amorces sont spécifiques au virus qu’on veut rechercher.
-Extension (~72°C)
-Duplication (~72°C)
-Dénaturation

À la fin du test PCR, si la charge virale est assez élevée, détecté par la machine.

voir diapo 31 pour schéma

30
Q

voir diapo 32

A
31
Q

Qu’est-ce qu’une gastroentérite?

A

Inflammation du système digestif (avec nausées, maux de ventre, vomissement, diarrhée, perte d’appétit, maux de tête, etc)

32
Q

Les causes des gastroentérites virales ?

A
  • Virus de l’hépatite A (anciennement entérovirus 72)
  • Norovirus (famille Calciviridae)
  • Virus de l’hépatite E (famille Anelloviridae)
  • Rotavirus (famille Reoviridae)
  • Entérovirus (famille Picornaviridae)
  • Adénovirus (types 40 et 41)
  • Astrovirus, Sapovirus (famille Calciviridae), Adénovirus, Parvovirus, Coronavirus, Aichavirus

voir diapo 34 pour images

33
Q

Caractéristiques des virus causant la gastroentérite?

A
  • Non-enveloppés
  • Résistants au chlore, solvants organiques et pH acide (Ne sont pas détruits par l’acidité de l’estomac, et résistent à l’acidité des fruits)
  • Résistants à la congélation
  • Sensibles à l’ébullition
34
Q

Quels sont les modes de transmission des gastroentérites virals?

A
  • Voie fécale-orale.
  • Aliments contaminés par l’eau des égouts: mollusques, fruits et légumes.
  • Selles et vomissures de personnes infectées (>1 million particules virales / g de selles). Une charge virale de 10 virions est suffisante pour causer la gastro.
  • Transmission peut se faire par contact direct avec la personne infectée ou par contact indirect (si on touche des surfaces contaminées par le virus, ex: poignées de portes, aliments et boissons contaminés).
  • Transmission facile dans les milieux où les gens sont en contact étroit: écoles, garderies, établissements de soins de longue durée et de soins de santé, navires de croisière.
  • Résistants à des taux relativement élevés de chlore et à des températures diverses. Beaucoup de ces virus survivent jusqu’à 12 heures sur des surfaces dures et jusqu’à 12 jours sur de la moquette contaminée.
35
Q

Prévention des gastroentérites virales?

A
  • Se laver les mains fréquemment au savon et à l’eau tiède (pendant au moins 20 secondes), notamment après avoir utilisé les toilettes, après avoir changé des couches, et avant de manger et de préparer les aliments. Une telle pratique s’impose davantage si vous avez été malade récemment ou été en contact avec une personne malade.
  • Manger des aliments cuits à point (minimum 2 minutes à 70°C, idéalement 11⁄2 minutes à 85°C), et encore chauds.
  • Bien laver fruits et légumes avant de les manger.
  • Jeter selles et vomissures dans les toilettes et s’assurer que les surfaces environnantes soient propres.
  • Ne pas secouer le linge contaminé et porter des gants domestiques pour manipuler les objets contaminés.
36
Q

Après un épisode de maladie de gastroentérite, comment nettoyé la place?

A

-Nettoyer soigneusement l’endroit contaminé immédiatement après un épisode de maladie en utilisant de l’eau chaude et du savon.
-Utiliser des gants en vinyl.
-Désinfecter ensuite les surfaces en utilisant un désinfectant à base de chlore d’une concentration d’au moins 1500 ppm (0.15%).
-Retirer et laver immédiatement vêtements, literies et autres linges susceptibles d’être contaminés par des selles ou des vomissures. Utiliser la laveuse au cycle chaud (85°C).

37
Q

La vaccination contre les gastroentérites virales?

A
  • Vaccin Twinrix:
    -Protection contre l’hépatite A et l’hépatite B.
    -La protection dure >20 ans et prend effet 2-4 semaines post-vaccination.
  • Vaccin Rotarix:
    -Protection contre le Rotavirus.
    -Pour les nourrissons seulement.
    -Vaccin donné en 2 doses: 1e dose à 6 mois et 2e dose avant 24 mois.
    -Peut causer l’intussusception.
38
Q

Gestion des manipulateurs d’aliments en lien avec les gastroentérites?

A
  • Tout employé souffrant de vomissement et diarrhée doit être libéré immédiatement, et ne doit pas retourner au travail avant une période asymptomatique d’au moins 48 heures.
  • Pour le virus de l’hépatite A, la période d’exclusion recommandée est de 1 semaine suite à l’apparition de jaunisse.
  • L’honnêteté est essentielle: faut encourager les employés à déclarer leurs symptômes dès que possible.
39
Q

Caractéristiques des Picornaviridae?

A
  • virus non enveloppés, résistants dans l’environnement
  • transmission fécale-orale
  • Exemple: poliovirus – cause la poliomyélite
  • petits virus à RNA+
  • stables à pH acide (pH 3 à 5)
  • multiplication dans le tube digestif
  • très large prédominance des infections inapparentes
  • diversité clinique des infections apparentes

Poliomyélite : paralysie du système nerveux central qui touche le plus souvent les membres inférieurs.

40
Q

Étiologie du poliovirus ?

A
  • Le poliovirus fait partie de la famille des Picornaviridae («pico» = petit, RNA…viridae). Le genre Entérovirus est inclus dans cette famille virale. Ce genre est divisé en deux groupes d’espèces susceptibles d’infecter les humains :
    1. Entérovirus(~75sérotypes)
    2. Rhinovirus(~99sérotypes)
41
Q

Expliquer la physiopathologie du poliovirus.

A
  1. Le virus atteint les voies digestives par la bouche.
  2. Période d’incubation (amygdales, adénoides, tissu lymphoide du tube digestif), durée : 1-2 semaines
    -infections inapparentes dans > 80% des cas
  3. phase d’invasion = virémie
    -durée : 4 - 5 jours
    -(fièvre, douleurs musculaires, malaises digestives, parfois avec maux de tête, vomissements = atteinte méningée)
    -maladie bénigne dans 90% des cas
  4. Moins de 10% des cas :
    -paralysies = poliomyélite = infection des neurones moteurs de la corne antérieure de la moëlle épinière
  5. Excrétion dans selles
42
Q

voir diapo 45 pour prévention du poliovirus

A
43
Q

Caractéristiques du coronaviridae?

A
  • Virus enveloppés
  • Génome ARN+
  • Causent des infections respiratoires, dont certaines sont des zoonoses très pathologiques pour l’humain (SRAS-2003, COVID-19)
  • Transmission: contact, gouttelettes, aérosol, fécale-orale(?)
44
Q

voir diapo 47-48-49

A
45
Q

COVID-19 : prévention et traitement

A
  • Mesures de santé publique: lavage des mains, distanciation sociale, port de masque, visière et autres EPP
  • Vaccins: Pfizer/BioNtech, Moderna, J&J, AstraZeneca, etc
  • Antiviraux: Remdesivir (?)
  • Monoclonaux
  • Sérums immuns (?)
  • Corticostéroïdes: dexaméthasone

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