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Génétique > Cours 13 > Flashcards

Cours 13 Flashcards

1
Q
  1. Quel type de trait est étudié en génétique quantitative?
A

La génétique quantitative étudie les caractères
phénotypiques à variation continue

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Q

a. Pourquoi un caratère à variation continue en nature est-il généralement plus difficile à étudier que les traits « Mendéliens »?

A

Les caractères étudiés en génétique quantitative résultent de l’action conjointe de nombreux facteurs (« caractères multifactoriels » ou
« caractères complexes » )
Les caractères étudiés en génétique « classique » étaient essentiellement définis par l’information génétique

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3
Q
  1. Qu’est-ce que la norme de réaction?
A
  • Définit les relations environnement-phénotype
    pour un génotype déterminé
  • Décrit l’ensemble des phénotypes produits par
    un génotype particulier sous différentes
    conditions environnementales
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4
Q

/a. Pour une espèce dispersée dans un environnement varié (et qui a évolué ainsi), peut-il exister un génotype qui possède un meilleur fitness dans tous les environnements?

A

Aucun génotype n’est « le meilleur » dans tous les environnements

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5
Q
  1. Quel type de graphique permet de bien observer si un trait possède une distribution normale?
A

L’histogramme de fréquences est un mode de représentation souvent adopté pour un caractère complexe

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6
Q
  1. Quelle valeur utilise-t-on pour mesurer la dispersion des données pour un trait?
A

La variance et l’écart type sont des mesures
de la dispersion autour de la moyenne

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7
Q

a. Pourquoi la variance présente-t-elle des unités élevées au carré?

A

moyenne de l’écart au CARRÉ de valeurs par rapport à la moyenne

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8
Q

i. Ces unités ont-elles une signification biologique?

A

Les unités de mesure ne sont pas les mêmes que celles des observations originales et n’ont pas une signification biologique

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9
Q
  1. Quels facteurs affectent l’expression des traits (le phénotype) en général?
A

Inné (contrôle génétique) ou aquis (contrôle environnemental)

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10
Q
  1. De quelle manière décompose-t-on la variance observée pour un trait donné?
A

La variance phénotypique totale peut être décomposée en variance génétique et en variance environnementale.

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11
Q

a. Quelle formule résume cette décomposition?

A

Vx= Vg+ Ve

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12
Q

b. Peut-il exister un lien entre les composantes (génétique et environnement) pour que cette formule soit valide?

A

La Vg et Ve doivent être indépendants. Il ne
doit pas exister de corrélation entre les deux

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13
Q
  1. Que signifie l’héritabilité au sens large?
A

contribution de la variance génétique à la variance phénotypique totale. 0 < H2 < 1

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14
Q

a. Comment la calcule-t-on?

A

Hérétiablité = Vg/Vx = Vg/ (Vg + Ve)

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15
Q

b. Quel type d’expériences ou d’études nous permettent d’évaluer les variances génétiques et environnementales?

A

Plusieurs méthodes sont basées sur l’étude d’individus identiques génétiquement, qui sont soumis à divers environnements.

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16
Q

i. Comment fait-on pour « annuler » les effets génétiques sur la variance?

A

Chez les plantes : Individus obtenus par reproduction végétative (des «clones»)
Chez les animaux et les plantes : Individus obtenus par croisement de lignées pures-Individus issus de plusieurs générations de croisement consanguins
Chez les humains : Études sur les jumeaux

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17
Q

ii. Comment fait-on pour « annuler » l’effet environnemental sur la variance?

A

Étude dans un environnement constant

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18
Q
  1. Qu’arrive-t-il à la variance phénotypique dans les environnements extrêmes?
    a. Qu’arrive-t-il à l’héritabilité au sens large (H2) dans les environnements extrêmes?
A

L’héritabilité au sens large est plus basse dans les environnements extrêmes: les différences phénotypiques s’expliquent ici surtout par des différences environnementales

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19
Q
  1. Quel type d’étude permet d’estimer l’héritabilité des traits chez les humains?
A

Études sur les jumeaux (et autres personnes apparentées)

20
Q

a. Que peut-on dire sur la différence observée dans les traits entre jumeaux monozygotiques?

A

Le Vg est de 0. Donc toute la variance est environnementale

21
Q

b. Est-ce que la variance des traits risque d’être plus élevée ou plus faible pour des jumeaux élevés séparément par rapport à des jumeaux élevés ensemble?

A

Elle risque d’être plus élevée car la vraiance environnementale est plus grande.

22
Q

c. Est-ce que la variance des traits risque d’être plus élevée ou plus faible pour des jumeaux monozygotiques par rapport à des jumeaux dizygotiques?

A

La variance des traits risque d’être plus grande chez des jumeaux dizygotiques, car la variance génétique est plus haute

23
Q
  1. Quelles conclusions peut-on tirer de la valeur d’héritabilité au sens large (H2) pour un trait?
A

Permet d’estimer quelle proportion de la variance phénotypique dans une population est due à des différences génétiques entre individus.

24
Q

a. Peut-on extrapoler les valeurs d’héritabilité au sens large d’une population et assumer qu’elle est la même pour une autre?

A

Les estimations de l’héritabilité ne peuvent pas être extrapolées d’une population à l’autre.

25
Q

b. Si on observe une héritabilité élevée pour un trait dans une population et qu’elle est faible pour l’autre population, est-ce que cela veut dire que la première population possède de meilleurs allèles pour ce trait?

A

le H2 n’informe pas sur l’expression du
phénotype, seulement sa variance. Un Q.I.
élevé pourrait être l’effet de l’environnement

26
Q

c. Si H2 est faible, est-ce que ça signifie qu’un faible nombre de gènes contribuent à l’expression du trait?

A

Non, un H2 faible signifie que la variance observée s’explique surtout par des facteurs environnementaux, elle n’indique pas le nombre de gènes impliqués

27
Q
  1. Comment distingue-t-on un effet additif d’un allèle versus un effet de dominance?
A

Effet additif: effet provoqué par la substitution
de B1 par B2.
A= X(B2/B2)–X(B1/B1) / 2
Effet de dominance: déviation de l’hétérozygote
de la moyenne entre les deux homozygotes
D= X(B1/B2)–[( X(B2/B2)+ X(B1/B1) )/2

28
Q

a. Une effet « purement additif » d’un allèle correspond à quel type d’interaction allélique? (Quel type de dominance?)

A

Un effet de dosage

29
Q
  1. Quel est le désavantage des gènes à effets de dominance par rapport aux gènes à effets additifs lorsqu’on applique une sélection artificielle?
A

Les effets de dominance camoufle la présence d’alléle indésirés (les hétérozygotes ont le même phénotype que le caractère souhaité)

30
Q
  1. Comment calcule-t-on l’héritabilité au sens strict (h2) si on connait la variance génétique additive?
A

h2= Va/ Vx

31
Q
  1. Comment calcule-t-on l’héritabilité au sens strict (h2) lorsqu’on pratique une sélection sur un trait quantitatif?
A
32
Q

a. Qu’est-ce que l’écart de sélection?

A

La zone des caractères qui sera sélectionné (du caractère le plus extrême au plus minime qui sera sélectionné)

33
Q

b. Qu’est-ce que la réponse à la sélection?

A

Le déplacement de la moyenne entre les générations subissant la sélection artificielle

34
Q
  1. En quoi la valeur de l’héritabilité au sens strict (h2) est-elle utile pour les éleveurs et les agriculteurs?
A

Elle permet de savoir quels critères peuvent être sélectionnés et quels critères demandent trop de ressources pour avoir un effet de la sélection minime

35
Q

Qu’est-ce qu’un trait polygénique?

A

gènes ayant des effets similaires et cumulatifs sur un phénotype.

36
Q

a. Quelle est la distribution de la plupart des traits polygéniques?

A

Normale

37
Q
  1. Quel est l’effet de l’environnement sur l’expression de certains traits?
A

Permet une expression continue de certains traits

38
Q

a. Est-il possible d’observer une distribution continue pour un trait monogénique?

A

Un caractère contrôlé par un seul gène avec deux allèles peut démontrer une variation continue si le phénotype est soumis à des facteurs environnementaux.

39
Q
  1. Quelle approche permet d’estimer le nombre de gènes responsable d’un caractère continu?
A

Analyser des hybrides entre la variété cultivée
et une espèce sauvage apparentée.

40
Q

a. Quels individus faut-il croiser pour générer la F1?

A

La variété cultivée avec la variété sauvage

41
Q

b. La proportion de quels type descendants faut-il compter dans la génération F2?

A

La fréquence des deux phénotypes extrêmes

42
Q
  1. Que signiifie l’abbréviation QTL?
A

Quantitative trait locus

43
Q
  1. Quelle méthode permet d’identifier l’emplacement des QTLs dans une population hétérogène?
A

Les études par association à l’échelle génomique (GWAS) mènent à la découverte de QTLs

44
Q
  1. Quelle variation expérimentale permet de faire ce type d’analyse dans des espèces hautement consanguines?
A

Analyser des hybrides entre la variété cultivée
et une espèce sauvage apparentée.

45
Q
  1. Qu’est-ce qu’une lignée congénique?
A

Lignées presque identiques génétiquement mais qui ont subi des recombinaisons dans la région d’un marqueur M

46
Q

a. À quoi servent ces lignées?

A

à analyser les polymorphismes SNPs chez ces lignées pour déterminer les points de recombinaison
À mesurer le phénotype de chaque lignée pure

47
Q

b. Comment identifie-t-on les allèles appartenant à l’un ou l’autre des parents?

A

Selon le phénotype que la pousse possède.

Génétique (13 decks)

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