Cours 10 Flashcards
- Qu’est ce qu’un polymorphisme?
variation phénotypique ou génétique
considérée comme normale chez une espèce
Dépend de la fréquence de cette variation dans la population étudiée
Qu’est-ce qu’un polymorphisme moléculaire?
variation détectable par des techniques moléculaires comme l’hybridation, le clivage par enzymes de restriction, l’amplification par PCR ou le séquençage de nucléotides
b. Quel est un avantage d’analyser les marqueurs plutôt que le phénotype (d’un trait dominant par exemple)?
Les marqueurs sont utiles pour la cartographie des gènes, pour suivre les allèles dans les individus et pour l’identification de gènes responsables de phénotypes particuliers. Permettent de détecter des différences moléculaires, non perceptible sur le phénotype. Permet aussi l’observation avant le développement complet de l’organisme
Qu’est-ce qu’un marqueur moléculaire?
locus démontrant un polymorphisme moléculaire. Il est localisé à un endroit précis du génome, facilement détectable et varie dans la population étudiée.
a. Comment utilise-t-on un marqueur moléculaire en relation avec un gène d’intérêt?
En utilisant un test de liaison entre le marqueur et le gène d’intérêt.
- Peut-on calculer la distance génétique entre un marqueur et un gène particulier?
Si parentaux = recombinés; le marqueur n’est pas sur le même chromosomeque le gène déterminant la longueur des ailes
Si parentaux > recombinés; le marqueur est sur le même chromosome que le gène déterminant la longueur des ailes; le % de recombinaison donne la distance entre ce gène et le marqueur
a. Que signifie l’acronyme RFLP?
Restriction fragment length polymorphism
b. Que signifie les acronymes VNTR et STR?
Variable number of tandem repeats
Short tandem repeats
c. Que signifie l’acronyme SNP?
Single nucleotide polymorphism
d. Que signifie l’acronyme Indels?
Courtes insertions oudélétions
- RFLP : Qu’est-ce qu’un site de restriction?
une séquence spécifique de nucléotides reconnue par une enzyme de restriction. L’enzyme de restiction coupe le site de restriction en 2
a. Qu’arrive-t-il si une variation génétique survient dans un site de restriction?
L’enzyme ne peut plus couper le site (site non reconnu par l’enzyme)
b. Que fait-on avec l’échantillon d’ADN après avoir digéré avec une enzyme de restriction?
On peut faire une électrophorèse, mais elle indique pas de fragments spécifiques. On peut aussi révéler les fragments spécifiques à l’aide d’une sonde (buvardage Southern)
c. Dans un Southern blot, pourquoi doit-on utiliser une sonde (probe)?
Visualisation: La sonde est généralement marquée avec un élément radioactif ou fluorescent. Ce marquage permet de localiser avec précision les fragments d’ADN auxquels la sonde s’est hybridée. En utilisant des techniques d’autoradiographie ou de fluorescence, on peut créer une image où les bandes correspondant aux fragments d’intérêt apparaissent clairement.
d. Dans une approche par PCR, pourquoi n’a-t-on plus besoin d’une sonde?
Étant donné que l’ADN spécifique à été amplifié, on peut observer directement les fragments sans hybridation. (électrophorèse du fragment spécifique uniquement)
