Cours 1- Le monde microbien Flashcards
Quels sont les différents domaines d’études en microbiologie?
Bactériologie
Protozoologie (protozoaire)
Phycologie (algues)
Mycologie
Virologie
Quels sont les impacts des microorganismes sur les activités humaines?
Agriculture:
* Fixation de l’azote en nitrate par les bactéries
* Production animale (leur flore microbienne leur permette de digérer la cellulose)
Environnement:
* Biodégradation
* Décomposition
* Bioremédiation
Alimentation:
* Conservation
* Aliments fermentés (fromage)
* Additifs alimentaires (faits à partir de MOO)
Maladies:
- Découvertes de maladies comme COVID
- Vaccin
Biotechnologie:
- Organisme génétiquement modifié
- Médicaments (ex: insuline)
- Thérapie génique (ex:vaccin ARN)
thérapie génique: introduction de matériel génétique dans cellules
Quels sont les impacts positifs des MOO chez les humains et la nature?
Humains:
* Aliments
* Biotechnologie
* Produits pharmaceutiques (antibio)
* Flore microbienne
Nature:
* Balance écologique
* Décomposition (moo décomposent les matières mortes/débris)
* Biodégradation (dégradation en substances + simples)
* Bioremédiation (atténuation d’un polluant ex:pétrole -> CO2)
Quels sont les impacts négatifs des MOO chez les humains et la nature?
- Détérioration des aliments
- Odeur
- Infection
- Corrosion (ex du titanic)
Quels sont les différents types de MOO?
- Bactéries
- Mycètes (levures + moisissures)
- Protozoaires
- Algues
- Virus
- Prion
Quelle est la différence entre les bactéries et les virus au niveau de la taille?
Bactéries = um
Virus = nm (bcp plus petit)
Quelles sont les propriétés des cellules?
Métabolisme
Différenciation (ex: cell ostéogéniques → ostéoblastes)
Reproduction (cell mère → cell fille)
Mouvement (flagelles)
Evolution (nvl propriétés au fil des années)
Communication
Quelle était la première classification des organismes vivants et elle se basait sur quoi?
Carl Von Linné
1. Plantes = photosynthétiques + immobiles
1. Animaux = non-photosynthétiques + mobiles
Bactéries = plante pcq paroi cellulaire / Algues = plante
Quelles étaient les problèmes de la 1ère classification?
Champignons = non-photosynthétique + immobile (classé comme plante malgré que non-photo)
Euglène = photosynthétique + mobile (classé comme animal par zoologiste/ plante par botanistes)
Quelle était la deuxième classification des organismes vivants et elle se basait sur quoi?
Haeckel
1. Plantes
2. Animaux
3. Protistes ( algues, protozoaires, champignons, bactéries)
Basé sur l’organisation biologique: unicellulaire, pluricellulaire, différenciation,etc
Quelle était la troisième classification des organismes vivants et elle se basait sur quoi?
Whittaker
- Monères (bactéries)
- Protistes (algues, protozoaires)
- Mycètes (champignons, levures)
- Plantes
- Animaux
Basé sur:
1- Type de cellule: procaryote ou eucaryote
2- Organisation biologique (unicellulaire/pluricellulaire, solitaire/colonie)
3- Nutrition :
-Autotrophe (CO2)
-Hétérotrophe (matière organique)
Quel est le type cellulaire des 5 règnes de Whittaker?
Monères: Procaryote
Protistes, Mycètes, Plantes, Animaux: Eucaryote
monères = bactéries
Quelle est l’organisation cellulaire des 5 règnes de Whittaker?
Monères: unicellulaire
Protistes: unicellulaire ou pluricellulaire
Mycètes: pluricellulaire
Plantes: pluricellulaire
Animaux: pluricellulaire
Quelle est la nutrition des 5 règnes de Whittaker?
Monères: autotrophe (maj) ou hétérotrophe
Protistes: autotrophe ou hétérotrophe
Mycètes: hétérotrophe
Plantes: autotrophe
Animaux: hétérotrophe
Quelle est la dernière classification des organismes vivants ?
Woese
Se base sur la phylogénétique
Progénote (= ancêtre commun des 3 ci-dessous)
1- Eubactérie
2- Archéobactérie
3- Eucaryote
1-2 = procaryote et 3=eucaryote
D’où proviennent les mitochondries et les chloroplastes?
mitochondries: endosymbiose de cellules aérobiques
chloroplastes: endosymbiose de cellules photosynthétiques
endosymbiose= une cellule a ingéré une autre cellule aérobique/photosynthétique dans notre cas
V ou F
les archéobactéries sont plus proches des eucaryotes
Vrai mm si archéobactéries et eubactéries= procaryotes
V ou F
Les cellules procaryotes ont une paroi cellulaire contrairement aux cellules euaryotes
FAUX
cellules procaryotes ont une paroi cellulaire, mais certaines cellules eucaryotes en ont aussi. La composition de cette paroi est différente dans les cellules procaryotes et eucaryotes.
Les cellules humaines n’ont pas de paroi cellulaire, mais cell eucaryote= protiste, mycètes, plantes aussi
Quelles sont les différences entre les procaryotes et les eucaryotes?
Procaryote
* Dimension:
1-10 um (jste savoir que c + petit)
* Paroi cellulaire:
peptidoglycane
* Organelles:
peu, absence de noyau, ribosomes libres dans cytoplasme, pili, flagelles, inclusions
* ADN:
bicaténaire, circulaire, 1 chromosome, pas d’introns, plasmide
Eucaryote
* Dimension:
10-100 um
* Paroi cellulaire:
polysaccharides (plantes), chitine (mycète)
* Organelles:
plusieurs organites, noyau, ribosomes dans RER et cytoplasme
* ADN:
bicaténaire, linéaire, plusieurs chromosomes, introns
chitine -> champignon -> mycète /// polysaccharide -> plante
IMPORTANT DE CONNAITRE L’ORDRE DES DÉCOUVERTES
En ordre nomme moi les découvertes dans le domaines de la microbiologie au fil des années
- Fracastoro: maladies causés par êtres vivants invisibles
- Hooke: décrit moisissures et mot cellule
-
Van leeuwenhoek: décrit bactéries (les apl animacules)
GAP DE 200 ANS - Spallanzani: génération spontanée
- Koch: Postulat de Koch
- Gram: coloration
- Lister: Antisepsie
- Fleming: pénicilline
- Jenner: vaccin contre variole
- Pasteur: génération spontannée, vaccin contre charbon et rage
- Von Behring: Sérum antitoxine
V ou F, les progrès et les découvertes en microbiologie se sont produits très rapidement, on a appelé ça l’âge d’or de la microbiologie
Après la découverte des cellules et bactéries au 17e siècle il n’y a pas eu de progrès.
Au 19e siècle, c’était l’âge d’or et il y a eu plusieurs découvertes
V ou F
Louis pasteur fut le premier a attaqué la théorie de la génération spontanée, suivi de Lazzaro Spallanzani
F
1er = Spallanzani
100 ans plus tard = Pasteur
Explique comment Pasteur et Spallanzani ont réfuté la théorie de la génération spontanée et souligne la différence entre les deux
Spallanzani:
1- Bouillon chauffé
2- Laisse bouchon fermé = pas de croissance microbienne
3- Ouverture du bouchon = croissance microbienne
a déterminé que ça provient de l’air et donc tout être vivant provient d’un être vivant (pas de génération spontannée)
Pasteur:
1- Stérilisation du bouillon dans la fiole à col de cygne
2- Fiole droit = pas de croissance microbienne
3- Fiole inclinée = croissance microbienne
a déterminé que bouillon est entré en contact avec moo coincé dans le col de cygne et que tout être vivant provient d’un être vivant
Explique en détail le postulat de Koch
Décrit le lien entre pathologie et moo et utilise la méthode de culture pure
Souris malade et souris saine
2. Prélèvement d’organisme suspecté d’être pathologique chez la souris malade (cet organisme doit être absent chez la souris saine)
3. Organisme suspecté est cultivé en culture pure
3. Inoculation de l’organisme suspecté pouvant être pathologique à la souris saine
4. Souris saine développe les mêmes symptômes que la souris malade
5. Si organisme suspecté est isolé à nouveau et recultivé en culture pure = cause de la maladie
culture pure = inoculation pétri “pur”
Qu’est que Hans Christian Gram a découvert?
Coloration de Gram
Qu’est que Joseph Lister a découvert?
Méthodes antiseptiques:
1. lavage de main
2. stérilisation d’instruments
lister marque de désinfectant
Qu’est que Alexander Fleming a découvert?
Découverte de la pénicilinne par accident
(autour de la pénicilline, pas de croissance de staphilocoques)
Qu’est que Edward Jenner a découvert?
Premier vaccin contre la variole à l’aide des vésicules de pus produite par la maladie vacca
vacca et variole sont des maladies de la mm famille
Qu’est-ce que Louis Pasteur a découvert?
C’est lui qui explique le principe du vaccin
-Vaccine moutons contre le charbon
-Vaccine humain contre la rage
Qu’est que Emil Von Behring a découvert?
premier sérum anti-toxine
V ou F
Les bactéries ɑ-hémolitiques lysent complètement les globules rouges
Faux
c’est les β-hémolitiques qui lysent complètement
Comment pouvons-nous distinguer les bactéries β-hémolitique, ɑ-hémolitique et ɣ-hémolitique sur une gélose?
Inoculation des bactéries sur géloses sang
β-hémolitique: lyse complète (gélose transparente)
ɑ-hémolitique: lyse incomplète (gélose rouge-transparente)
ɣ-hémolitique: pas de lyse (gélose rouge)
V ou F
La morphologie bactérienne (bâtonnet, cocci,etc) est due à la membrane cytoplasmique
F
due à la paroi cellulaire
V ou F
la lyse des bactéries est empêchée par la présence de la membrane cytoplasmique
F
empêchée par la présence de la paroi cellulaire
(gram - : protection de plus avec la membrane externe)
Quels sont les fonctions de la membrane cytoplasmique?
- Métabolisme
- Barrière perméable
- Nutriments in, déchets out (transport)
- Délimite le cytoplasme
- Détection des signaux (chimiotactisme)
- Ancrage des protéines
V ou F
Les bactéries n’ont pas de cholestérol, ainsi c’est les hopanoïdes qui stabilisent la membrane cytoplasmique
Vrai
Quelles sont les composantes de la membrane cytoplasmique?
- Bicouche lipidique
- Hopanoïde (remplace le cholestérol, assure stabilité)
- Oligosaccharides / glycolipides
- Protéines membranaires
Quelles sont les propriétés de la bicouche phospholipidique?
Extrémité polaire/hydrophile fait face au cytoplame et milieu extracellulaire
Extrémité non-polaire/hyrophobe
Quelles sont les différents types de protéines membranaires et leur rôles?
Périphériques:
- moins bien ancrées dans la membrane
Intrinsèque:
- s’occupe du transport (uniport, antiport, symport), transfert d’électron, etc.
- oligosaccharides/glycolipides peuvent s’y lier
V ou F
il y a plus de protéines membranaires chez les procaryotes que chez les eucaryotes
Vrai
C’est quoi un mésosome et quel est son rôle?
Invagination de la membrane cytoplasmique, fonction inconnu
Que retrouve-t-on dans le cytoplasme des bactéries?
- Ribosomes libres (synthèse protéique)
- Nucléoide (ADN: 1 chromosome et plasmide, ARN)
- Inclusions (réserves des bactéries lorsque nutriments en excès)
Quels sont les différents types d’inclusion + leurs rôles?
- Glycogène: source de C + énergie
- PHB: source de C + énergie
- Vacuole de gaz: permet de flotter
- Phosphate: ATP
- Souffre: Source d’électrons (H2S) pour bactéries photosynthétiques pourpres
- Fer: permet aux bactéries de s’orienter à l’aide du magnétisme
V ou F
les inclusions sont toujours de nature organique
FAUX
organiques et inorganique
V ou F le chimiotactisme est dû à la détection de signaux chimiques par la paroi cellulaire
Faux
détection des signaux par la membrane cytoplasmique
Comment ça se fait que ADN de 1400 um entre dans une bactérie de 1-10 um?
Compaction d’environ 500x
Quelles sont les fonctions de la paroi cellulaire des bactéries?
- Confère la forme (cocci, batonnet)
- Protection contre la lyse (essentielle pour survie)
De quoi est composée la paroi cellulaire des bactéries?
Peptidoglycane
V ou F
le peptidoglycane consiste des polypeptides reliés entre eux par des polymères de glucides
F
Polymères de glucides NAM- NAG
reliés entre eux par des peptides
De quoi est composée la peptidoglycane?
Polymères de glucides NAM- NAG
reliés entre eux par des peptides
NAM-NAG——-peptide——NAM-NAG
V ou F les lysosymes sont des organelles pouvant lyser les liens glycosidique de la paroi cellulaire
F
ce ne sont pas des organelles, ils proviennent des larmes et de la salive
Pourquoi les lysosymes et la pénicilline sont mortels pour les bactéries?
- La paroi cellulaire empêche la bactérie de gonfler/ratatiner (=mort) en mileu hyper/hypotonique !!!!!
- Lysosyme: lyse les liens glycosidiques entre NAM et NAG
- Pénicilline: empêche la formation des liens peptidiques reliant les polymères de glucides
Pénicilline -> Peptide
Quel type de bactérie est résistant aux lysosyme et pénicilline (et pq) ?
La bactérie Gram - en raison
Explique c’est quoi un pontage du peptidoglycane et quelle est la différence entre ceux des bactéries Gram+ et Gram-
Pontage= pont entre les PEPTIDES qui relient les polymères de glucide
* Gram - : Pontage direct
* Gram +: Pont de pentaglycine
Quelles sont les charactéristiques des bactéries Gram +?
- ↑ Peptidoglycane
- ↓ Espace périplasmique
- Présence acides téichoïques et lipotéichoïques
Quelles sont les charactéristiques des bactéries Gram - ?
- Présence de membrane externe (composé de lipopolysaccharide LPS)
- ↓ Peptidoglycane
- ↑ Espace périplasmique
- Protéines extrinsèques: porine et lipoprotéine
- Absence d’acides téichoïques et lipotéichoïque
Qu’est-ce qui est communément appelé endotoxine et pourquoi?
LPS (lipopolysaccharide) qui compose la membrane externe des bactéries Gram-
* Parceque le lipide A du LPS est toxique et peut causer des fièvres
Explique la composition du LPS de haut en bas
1-Chaine O
2- Polysaccharide central
3- Lipide A
se rapl que lipide A est enfoui dans le feuillet externe de la membrane externe, cet ancrage= toxique et cause des fièvres
Après une coloration de gram, quelles bactéries sont rose et lesquelles sont violet?
Gram +: violet
Gram-: rose
positive = purple
C’est quoi le glycocalyx et son rôle?
Couche de polysaccharides autour de la paroi
* Protection contre les bactériophages et le système immunitaire
* Adhérance
Augmente la chance des bactéries à être pathogène
Quels sont les types de glycocalyx?
- Capsule:
- Couche mucoïde:
Est-ce que la couche S s’agit d’un glycocalyx?
Non,
il s’agit d’une couche de protéines et glycoprotéines
Rôles: Protection, adhérence
Quelle est la différence entre un pili, un fimbriae et un flagelle?
Pili sexuel = conjugaison et récepteur pour bactériophages (LONG)
Fimbriae = adhérence, motilité aussi pr certains (COURT , structure similaire au pili, composé de protéines en hélice)
Flagelle= motilité (protéines en hélices aussi)
Quels sont les différents types de flagelles?
- Monotriche: 1 flagelle à une extrémité
- Amphitriche: 1 flagelle à chaque extrémité
- Lophotriche: plusieurs flagelles à une extrémité
- Péritriche: plusieurs flagelles sur toutes la surface
Quelle est la structure du flagelle?
1.Filamtent: formé de flagelline (protéines) en hélice
2.Crochet
3.Corps basal
V ou F
en présence d’un signal chimiotactique/ substance chioattractive les bactéries s’y dirigent de façon désorganisé/culbutes
Faux ils s’y dirigent de façon ordonnée vers la substance chimioattractive
Quelles sont les structures de l’endospore ?
Exosporium
Tunique
Cortex
Protoplaste
Quelle est la différence entre une endospore, une sporange et une spore?
Dans quels circonstance l’endospore se forme et elle est résistante à quoi?
Sporulation vs germination?
