Coronavirus - 9 Flashcards
Quels sont les 2 types de virus qui causent des infections des voies respiratoires inférieures et supérieures?
Les virus à ARN et ADN
Nomme les 4 classifications des coronavirus (et le nom des virus humains dans ces classes distinctes)
- Alphacoronavirus : 229E, NL63
- Betacoronavirus: OC43, HKU1, Sars-Cov-1, MERS-Cov, Sars-Cov-2
- Deltacoronavirus
- Gammacoronavirus
229E-CoV, NL63-CoV, OC43-CoV, and HKU1-CoV sont responsable de _ des infections respiratoires chaque année?
15-30%
Vrai ou Faux? Les coronavirus saisonniers infectent majoritairement les personnes âgées ayant plus de 65 ans?
Faux. Ils infectent plus particulièrement les enfants jeune et les adolescents.
Qu’est-ce qui est plus caractéristique des infections causées par NL63?
Une croup (toux aboyante) et des complications qui entrainent des pneumonies (aussi chez OC43)
Caractéristiques communes des infections causées par les coronavirus saisonnier? (symptôme, durée..)
- Symptôme: fièvre, mal de tête, mal de gorge, toux, frisson, diarrhée (5%), malaise, asthme, écoulement nasal
- Dure autour de 7 jours (souvent entre 3 et 18 jours)
- Réinfection commune
- Affecte plus souvent jeune enfant/ado
Comment peut on être infecté par les coronavirus?
En inoculant des sécrétions contaminées/des fomites contaminés et/ou inhalé des gouttelettes
Caractéristique de SARS-Cov-1 (zoonotique)
1. Origine
2. Invasion démographique
3. Réservoir
4. Symptôme
5. Prise en charge (hôpital)
- Origine en 2002 en Chine (Guangdong)
- 29 pays = environ 8000 cas = environ 800 décès
- Réservoir dans les chauves-souris, hôte intermédiaire les civets
- Symptôme : fièvre (fréquent), diarrhée (25%), toux (2-4 jours), souffle court, pneumonie,peut affecter plusieurs organes, 20-30% asymptomatique
- Prise en charge : incubation pour 2 à 10 jours, 20-30% besoin d’être intubé ou ventilé, 3-12% en meurt
Caractéristique MERS-Cov (zoonotique)
1. Origine
2. Invasion démographique
3. Réservoir
4. Symptôme
5. Prise en charge
- Origine en 2012 en Arabie saoudite
- 27 pays = environ 2500 cas = 850 morts, pic en avril/juin
- Réservoir dans les chauves-souris, hôte intermédiaire chameau (souvent symptôme inexistant)
- Symptôme : fièvre, frisson, toux, essoufflement, touche plusieurs organes, asymptomatique fréquente, excrétion du virus jusqu’à 6 semaines
écoulement nasal, maux de gorge, maux de tête, douleurs abdominales (jeune enfant/adulte)
gastro-intestinaux (gravement malade)
- Incubation pour 5 jours (entre 2 et 14 jours), infection dure environ 7 jours, pic d’hospitalisation à 4 jours, 33% en meurt
Origine du virus SARS-CoV-2?
En décembre 2019, dans le marché Huanan dans la région Wuhan en Chine vendant des animaux sauvages
Vrai ou faux. Sars-Cov-2 affecte un plus grand nombre sont les jeunes enfant (plus petit que 5 ans)
Faux. Tout âge est à risque, mais les personnes ayant 60 ans et plus/ou avec des problèmes de santé ont un plus grand risque de développer une infection sévère
Chez quels animaux pourraient provenir le SARS-Cov-2?
Un réservoir de chauve-souris ou de pangolins
Quelles groupes ethnies sont plus susceptible de contracter la COVID-19?
Les noirs, hispaniques et asiatiques
Quel genre est plus susceptible de développer une infection plus sévère à la COVID-19?
Les mâles
Les personnes ayant déjà des problèmes de santé était combien de fois plus à risque de mourir ou d’être hospitalisé de la COVID-19?
Mourir : 12x
Hospitalisé : 6x
Qu’est-ce qui caractérise la phase précoce et tardive de la COVID-19?
Phase précoce : la réplication virale
Phase tardive : la réponse immunitaire avec le recrutement des monocytes, lymphocytes T et les neutrophiles qui libère plusieurs cytokines telles que TNF-alpha, GM-CSF, IL1, IL6 et IFN-y
Dans les cas grave d’infection COVID-19, il y a sur-activation du système immunitaire. Qu’est-ce que cela entraîne?
Une tempête de cytokines (IL6 et TNF-alpha surtout) qui provoque l’inflammation
Quels sont les symptômes de la COVID-19?
Fièvre, toux, fatigue, essoufflement, mal de gorge, mal de tête, douleurs musculaires, nausée/diarrhée/vomissement, rash et une perte de l’odorat et/ou du goût
Quel symptôme différencie le SARS-Cov-2 des autres coronavirus?
La perte de l’odorat et du goût
Habituellement les symptômes de la COVID-19 peuvent durer jusqu’à…?
2 semaines (premier symptôme souvent 2 à 6 jours après exposition au virus). Dans certains cas, les symptômes peuvent durer des semaines voir des mois.
Explication du cycle réplicatif de SARS-Cov-2
- Les domaines de liaison au récepteur (RBD) des protéines de pointe du SARS-CoV-2 se lie au récepteur ACE2 (hôte poumon/gorge). La sous-unité S2 favorise la fusion du virus avec la membrane de la cellule hôte
- D’autres protéines présentes à la surface de la cellule hôte initient un processus qui conduit à la fusion
- TMPRSS2 (enzyme) clive la protéine de pointe, exposant ainsi des parties qui permettent la fusion de la membrane virale avec celle de l’hôte.
- Le virus injecte ensuite son génome directement dans la cellule. L’ARN viral (vRNA) est traduit en protéines non structurales (NSP) qui suppriment la traduction des ARNm de l’hôte
- Remodelage de la cellule hôte et formation de vésicule à double membrane pour la réplication et la traduction
- Départ du Golgi et sortie des nouveaux virus (furine coupe un site sur la protéine Spike)
Nomme les 3 parties qui organisent le génome
- ORF-1a et b : NSP1– NSP16
- Gènes structuraux : protéines structurales, spike, enveloppe, membrane et nucléocapside
- Protéines accessoires
Vrai ou Faux. Le virus portant la mutation D614G (variant) est plus infectieux que l’isolat Wuhan-Hu-1?
Vrai
Quels sont les 4 différents niveau de risque des variants émergents de la COVID-19?
- Variants surveillés
- Variants d’intérêt
- Variants préoccupant
- Variants de hautes conséquences
Nomme des exemples de variants d’intérêt et préoccupant (of concern)
Intérêt : Lambda
Préoccupant : Delta et Omicron
Vrai ou Faux. Un variants qui a des changements génétiques qui sont susceptibles de modifier les caractéristiques du virus et de causer des transmissions communautaires significatives est un variant préoccupant (of concern)
Faux. Définition d’un variant d’intérêt
Variant préoccupant: Un variant du SARS-CoV-2 qui répond à la définition d’un variant d’intérêt (VOI) ET, a démontré être associé à un ou plusieurs des changements suivants, dans un degré de signification pour la santé publique mondiale. Lesquels?
- Augmentation de la transmissibilité ou changement défavorable dans l’épidémiologie
- Augmentation de la virulence ou changement dans la présentation clinique de la maladie
- Diminution de l’efficacité des mesures de santé publique et sociales ou des diagnostics, vaccins et traitements disponibles
Vrai ou Faux. Un seul variant de SARS-Cov-2 fait partie des variants causant de hautes conséquences?
Faux. Aucun
Présentement en janvier 2024 au Canada, quelle est le variant dominant?
C’est le XEC (47% des cas)
Nomme les 5 plateformes du vaccin de la COVID-19
- ARNm
- Vecteur viral
- Protéine recombinante
- Inactivé
- ADN plasmidique
Explication vaccin à ARNm
L’information génétique de l’antigène est livrée via des nanoparticules lipidiques et traduit pour produire la protéine Spike
Explication des vaccins vecteur viraux
Basé sur un autre virus (adénovirus), qui a été conçu pour exprimer la protéine spike dans son génome (culture cellulaire/non réplicable). Entre dans le cellule pour exprimer protéine Spike.
Positif : pas besoin de manipuler le virus vivant + montre une réponse humorale et cellulaire
Explication des vaccins protéines recombinantes
Le gène d’intérêt est transféré dans un plasmide et transfecté dans des cellules d’insecte, par exemple, pour exprimer la protéine (qui sera dans la formulation du vaccin)
A quoi sert l’ajout de l’adjuvant Matrix-M, à base de saponin, dans les vaccins à protéines recombinantes ?
À faciliter l’activation des cellules du système immunitaire inné, ce qui renforce la réponse T et B contre la protéine Spike
Les vaccins inactivés (COVID-19) contiennent habituellement quel adjuvant?
Alum
Vrai ou Faux. Les vaccins inactivés doivent être conçu dans un laboratoire de niveau 2?
Faux. Dans un laboratoire de niveau 3.
Nomme tout les types possible d’antiviraux COVID-19
- Inhibant les enzymes (polymérase et protéase)
- Inhibant l’entré du virus (Mabs)
- Interferons (IFNs)
- Inhibant les processus de l’hôte nécessaires à la réplication
Nomme un exemple d’enzymes inhibées lors d’un traitement antiviral et quels rôles ont ces enzymes?
Les enzymes RdRp (polymérase) (CoVs) catalysent la copie du génome et la transcription de plusieurs ARN sous-génomiques.
Que contient le complexe réplication-transcription associé à la RdRp Covs?
Le complexe de réplication-transcription associé à la RdRp contient deux protéines accessoires (nsp7 et nsp8) ainsi qu’une exonucléase
