CONTROL TRANSCRIPCIONAL 1.1 Flashcards
¿Qué pasa en el proceso de maduración?
se hace un corte y empalme (se quitan intrones y de primario se vuelve a ARN maduro)
¿Cómo se llama el espacio entre la CAP y el codón de inicio AUG?
5’UTR (untranslation region)
¿Cómo se llama el espacio entre la Poli A y el codón de paro UGA/UAG/UAA?
3’UTR (untranslation region)
ADN –> transcripción –> transcrito primario/pre-ARNm –> splicing –> ARNm maduro –> traducción –> proteína
:)
Esta región es importante para la regulación e iniciación de la traducción del ARNm
región 5’UTR
Esta región es la sección de un gen que sigue inmediatamente a la traducción codón de terminación. Puede influir poliadenilación, la eficiencia de traducción, localización, y la estabilidad del RNAm
Región 3’UTR
- mientras más adeninas más vive
- cantidad de A que pone el UTR da estabilidad
Se procesan para producir una molécula de mRNA madura a través del proceso de corte y empalme (splicing).
RNA precursores llamados: transcritos primarios o pre-mRNA
intrones se eliminan del transcrito dejando a los exones
Regiones que en unos tejidos se consideran exones y en otros, intrones
secuencias ambiguas
Proceso en el que los pre-RNAm llevan un proceso de corte y empalme (intrones eliminados y dejan exones)
sitios débiles = evitan maquinaria de empalme
splicing/empalme alternativo
Proteínas que activan los sitios de empalme
proteinas SR (identifican exones)
reconocen y cortan
Proteínas que inactivan los sitios de empalme
proteinas hnRNP (identifican intrones)
reconocen y cortan
¿Qué es el espliceosoma?
complejo/maquinaria de corte y empalme
¿Qué reconoce el espliceosoma mayor?
GU y AG extremos 5’ y 3’
Composición del epliceosoma
- 5 ribonucleuproteínas pequeñas
- 300 proteínas
¿Qué hace U1 en el espliceosoma?
espliceosoma mayor
identifica al extremo 5’
¿Qué hace U2 en el espliceosoma?
espliceosoma mayor
identifica a la A solita
¿Qué hace U2AF en el espliceosoma?
espliceosoma mayor
identifica al extremo 3’
¿Qué hace U1 snRNP en el espliceosoma?
corta en el extremo 5’
¿Qué hace U2 snRNP en el espliceosoma?
corta en el extremo 3’
¿Qué hace U4 en el espliceosoma?
espliceosoma mayor
inhibe a U6 (para que no corte siempe)
¿Qué hace U6 (ribozina) en el espliceosoma?
espliceosoma mayor
corta intrones
¿Qué hace U5 en el espliceosoma?
espliceosoma mayor
junta los exones
¿Qué puede pasar en la edición de ARN?
modificaciones en una o mas bases del RNA maduro (adenosin desaminasas)
* desaminación de adenina para producir inosina (A- I)
* desaminación de citocina para producir uracilo (C-U) (se puede producir codon de paro)
Proteína que exporta al ARNm del núcleo
nuclear RNA export factor 1
¿Qué tiene que tener para que el ARNm salga del núcleo?
(3 cosas)
- CAP (metilguanosina en extremo 5’)
- PoliA (3’)
- puros exones
primero sale el amino terminal*
¿Dónde se encuentra la señal que determina en dónde se va a localizar el ARNm?
en el 3’UTR
RNAm se va a sitios específicos de la célula antes de iniciar traducción
¿Qué es la búsqueda de escape?
“se escapa el primero y se busca el segundo AUG” son modificaciones de la secuencia señal de la proteína para modificar el lugar
Diferencia entre si el eIF2 se fosforila o no se fosforila
lo fosforila el RE a través del complejo UPR
si se fosforila: la traducción se bloquea
si no se fosforila: la traducción ocurre
Características de degradación e inestabilidad de la cola de Poli A
- una vez en el citoplasma, la cola se va acortando
- + corta + inestable
- + larga + estable
3’UTR: determina cuántas A le pone al ARNm
¿Qué hace la deadenilasa, enzima de descapsulación y exonucleasas?
(degradación cuando sale del núcleo)
deadenilasa: quita adeninas
descapsulación: quita CAP
exonucleasas (de 5’ a 3): quitan nucleótidos primero quitando CAP
exosoma (de 3’ a 5’): primero se degrada cola de PoliA hasta que quita caperusa
Las diferencias en la secuencia 3’UTR determinan la velocidad de acortamiento de la cola poli A:
- si son ricos en AU: vida media corta
- si son ricos en C: vida media larga