ADN y PCR 1.2 Flashcards

1
Q

¿Qué es la electroforesis?

A
  • separa biomoléculas dependiendo de su peso molecular
  • biomoléculas están en un campo eléctrico
  • dura 30 min
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2
Q

Elementos necesarios para una electroforesis

A
  • cámara de electroforesis
  • gel de agarosa
    → + concentada = poros + pequeños
    → - concentrada = poros + grandes
  • marcador de peso molecular
  • transiluminador violeta
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3
Q

Características de la cámara de electroforesis

A
  • genera campo eléctrico alrededor del gel
  • tiene 2 polos conectados a 1 fuente de energía
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4
Q

Características del gel de agarosa

A
  • polisacárido extraído de algas marinas
  • separa fragmentos de DNA que van de 100 pb a 25 kb
  • concentración de agarosa = tamaño del ácido nucleico analizado
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5
Q

¿Para qué sirve el peso molecular?

A

saber cuántos pares de bases tiene la banda en la electroforesis (por ej. 150)
pares de bases pintados en la cámara tienen que coincidir con el gen que buscamos

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6
Q

¿Qué es el marcador de peso molecular?

A
  • mezcla de moléculas de ADN o proteínas
  • permiten comparar el tamaño de moléculas (ac. nucleicos/proteínas) en las muestras de electroforesis
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7
Q

Tipo de PCR (estándar/punto final)

A
  • si/no (cualitativa de un segmento de ADN)
  • mediantes geles de agarosa
  • amplificación de ADN con 2 partidores
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8
Q

Tipo de PCR (múltiplex)

A
  • busca diferentes (2 o más) genes (ADN) en 1 muestra (cualitativa)
  • se utilizan varios partidores
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9
Q

Tipo de PCR (SSO)

secuence specific oligo

A
  • busca compatibilidad en transplantes
  • usa secuencias específicas de polinucleótidos
  • es la + común
  • busca polimorfismos en HLAI y HLAII
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10
Q

Tipo de PCR (SSP)

A
  • busca secuencias específicas
  • detecta polimorfismos
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11
Q

Tipo de PCR (RFLP)

restriction fragment length polymorphisms

A
  • primero se crean fragmentos con enzimas de restriccion (cortar ADN) y después se hace PCR (cualitativa)
  • se detectan polimorfismos genéticos en ADN
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12
Q

Tipo de PCR (TR)

transcriptasa reversa

A
  • con transcrpitasa reversa para buscar ARN’s (virus)
  • síntesis de cADN a partir de ARN
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13
Q

Tipo de PCR (RT)

real time

A
  • (carga) cuántos virus o bacterias hay de un solo tipo y su detección cualitativa
  • se usan tinciones o sondas con fluoróforos
  • de tipo multiplex
  • es la única que es cuantitativa

es el método + sensible (se usaba en COVID)

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14
Q

¿Qué son los microarreglos?

A

expresión de muchos genes a la vez en muy poco tiempo

px con una enfermedad ver a qué pocitos se adhieren sus genes y su tx

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15
Q

¿PCR o Southern blot?

A
  • PCR + sencilla/espacios específicos/cuando hay poco ADN
  • Para el southern tiene que haber mucho ADN
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16
Q

Tipos de colorantes en el análisis de ácidos nucleicos

A
  • específicos
  • no específicos (syber green)
17
Q

Tipo de colorante no específico (syber green)

A
  • cuando hay doble cadena de ADN
  • generan señal fluorescente
  • tienen afinidad por sdADN
  • no nos muestra lo que queremos
18
Q

De dónde a dónde van los primers reverse y forward

A

forward: 5’ 3’
reverse: 3’ 5’

19
Q

Tipo de colorante específico

A
  • son sondas fluorescentes
  • cuando la ADN polimerasa pone nucleótidos se libera fluoróforo y empieza a brillar
  • es el más caro y trabajoso
20
Q

¿Qué es una sonda?

A

secuencia de nucleotidos del gen de interés

21
Q

¿Qué tienen las sondas en sus extremos?

A
  • inhibidor
  • fluoróforo