Biokemi 20 Flashcards
Nukleotiders 3 komponenter
Nitrogenholdig base, en pentosesukker og en, to eller tre fosfatgrupper.
De to typer af nukleotider
Ribonukleotider, hvor pentosesukkermolekylet er en ribose
Deoxyribosenukelotider, hvor pentosesukkermolekylet er en deoxyribose.
Hvilke typer af nitrogenholdige baser kan bruges til nukleotider?
Purin (dobbeltring struktur) eller pyrimidin (enkeltring struktur).
Hvad kaldes en nukleotid uden en fosfatgruppe?
Nukleosid
Hvilke molekyler skal bruges til nukleotid syntese?
Tetrahydrofolat, glutamin, ribosefosfat fra pentosefosfatvejen, carbon og nitrogengrupper fra aminosyrer og andre molekyler.
Folat/tetrahydrofolat mangel
Neuralrørsdefekt og anæmi, samt dårligt fungerende tarmoverflade.
Purinnukleotid syntese
Ribosefosfat –> IMP –> amineres til AMP og GMP
Til IMP skal der bruges 1 ribose-5-fosfat, 4 aminosyrer, 1 bikarbonat, 2 formylgrupper og energi fra 6 ATP.
Efter aminering skal de fosforyleres til di og trifosfater.
IMP –> AMP
IMP + aminogruppe fra aspartat –> AMP.
Kræver GTP
IMP –> GMP
IMP + aminogruppe fra glutamin.
Kræver ATP
Energiforbrug af syntese til AMP og GMP
Ribose-5-fosfat til PRPP=2 ATP
PRPP –> IMP=4 ATP
IMP –> GMP/AMP=2 ATP/1 GTP
Så dannelse af AMP=6 ATP og 1 GTP (7 ATP)
Dannelse af GMP=8 ATP.
Regulering af purinnukleotid syntese
PRPP-syntetasen hæmmes af ADP og GDP
ATase hæmmes af IMP, AMP og GMP.
PRPP aktiverer ATase ved feedforward.
Adenylosuccinat syntetase.
Hæmmes af AMP
IMP-dehydrogenase hæmmes af GMP.
Syntese af pyrimidinnukleotider
Dannelse af orotat –> kobles på ribosefosfaten –> OMP –> UMP –> UTP –> CTP.
Pyrimidinsyntese energiforbrug
Carbamoylfosfat koster 2 ATP, syntese af PRPP koster 2 ATP. Det koster altså 4 ATP at danne UMP.
UMP —> UTP koster 2 ATP.
UTP –> CTP koster yderligere 1 ATP.
6 ATP for UTP
7 ATP for CTP
Regulering af pyrimidinsyntese
CPSII –> hæmmes af UTP, aktiveres af ATP og PRPP.
OMP-decarboxylase –> hæmmes af UMP.
CTP-syntetasen –> hæmmes af CTP
Nedbrydning af nukleotider
RNA/DNA –> Nukleotider –> nukleosider
Nukleosider kan gå to veje
- -> ribosefosfat –> glykolyse og PRPP
- -> base –> nedbrydes til urin eller genbruges.