Bakterieidentifikation Flashcards

1
Q

Nämn några vanliga provmaterial

A

Urin, faeces, blod, likvor, sårmaterial, svalgsekret, nasopharynx, sputum, BAL, vävnadsbitar, cervixprov, urethraprov, miljöprover

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vilka två generella kategorier av plattor finns det?

A

Selektiva och icke selektiva plattor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad påverkar antalet plattor man odlar på?

A

Förväntat bakteriefynd - ju fler bakterier desto fler plattor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

I vilken ordning ockuleras plattorna?

A

Den minst selektiva plattan först

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Inkubering - vilka olika syrenivåer används? Vilka temperaturer?

A

Vanlig luft, endast CO2, mikroaerofil miljö, anaerob miljö

30°C, 37°C, 42°C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilka 4 sätt kan växten undersökas/användas för att identifiera bakterien?

A

Vilken syrenivå den växte på: Aerobt/anaerobt/CO2

Växt på selektiva/oselektiva plattor

Morfologi: form, storlek, färg på kolonierna

Lukt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Humanpatogener - vilken syrenivå föredrar de generellt?

A

De är fakultativa anaerober så de kan existera både aerobt och anaerobt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vilka former finns för kolonimorfologin? (2D-form samt hur den står ut från plattan (3D))

A

2D: Rund, oregelbunden, taggig, lobformad, utflytande, filamentös

3D: Platt, upphöjd, konvex, bucklig

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hur kan koloniernas yta se ut? (kolonimorfologi)

A

Blank/glänsande, matt, torr, oregelbunden, frasig

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vilken storlek har G- vs G+ kolonier över lag?

A

G- är stora över lag

G+ är små över lag

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Ge exempel på bakterier och vad de kan lukta!

A
Pseudomonas: söt (hallongodis)
E. coli: syrligt/surt
Stafylokocker: unken gammal garderob
Haemofilus: snor
C. difficile: stall
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vilka egenskaper kan utnyttjas för vidare identifiering av bakterier? (6 st)

A
  1. Produktion av extracellulära toxiner och enzymer
  2. Antibiotikakänslighet
  3. Antigenspecificitet hos ytmakromolekyler (serologisk typning)
  4. Känslighet för tillsats av selekterande eller hämmande substanser i odlingsmedier
  5. Biokemiska egenskaper
  6. Genetiska egenskaper
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hur går ett katalastest till?

Vilken egenskap undersöks?

Vad används det för, dvs vilka bakterier/bakteriegrupper skiljer den åt?

A

En bakteriekoloni sätts på objektsglas och väteperoxid droppas över. Bildas bubblor tyder detta på att bakterien är en stafylokock (katalas +).

Det undersöker förekomst av enzymet katalas (omvandlar H2O2 till H2O + O2).

Används för att skilja på stafylokocker och streptokocker.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hur går ett koagulastest till?

Vilken egenskap undersöks?

Vad används det för, dvs vilka bakterier/bakteriegrupper skiljer den åt?

A

Bakterier tillsätts till ett provrör med fårplasma, inkuberas och sedan undersöks om plasman koagulerat.

Förekomst av enzymet koagulas (omvandlar fibrinogen till fibrin)

Används för att skilja S. Aureus från övriga stafylokocker (KNS)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur går ett oxidastest till?

Vilken egenskap undersöks?

Vad används det för, dvs vilka bakterier/bakteriegrupper skiljer den åt?

A

En droppe av oxidastestet (lösning innehållande NNNN-tetramethyl-p-
phenylendiamin (TMPD)) droppas på läskpapper, varefter lite bakterier tillsätts. Oxidaspositiva bakterier färgas violett.

Förekomsten av enzymet indolphenoloxidas.

Neisseriabakterier, Moraxella och P. Aeruginosa bildar detta enzym och dessa kan mha oxidastest skiljas från övriga bakterier.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hur går indol spot till?

Vilken egenskap undersöks?

Vad används det för, dvs vilka bakterier/bakteriegrupper identifierar den?

A

En droppe sätts på läskpapper, varefter lite bakterier tillsätts. Indolspot innehåller p-dimethylaminocinnamaldehyde
(PACA) som reagerar med indol
och bildar ett blått/blågrönt ämne.

Påvisande av indol indikerar tryptofan-nedbrytning.

Används för att påvisa E. coli

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad innehåller en DNAas-platta?

Vilken egenskap undersöks?

Vad används det för, dvs vilka bakterier/bakteriegrupper identifierar den?

A

Det är en vanlig agarplatta med tillsats av DNA.

Mörk färgning påvisar förekomst av DNAas

Används för differentiering av bakterier som producerar DNAas, tex S. Aureus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vad innehåller en Esculin-platta och hur funkar den?

Vad används det för, dvs vilka bakterier/bakteriegrupper identifierar den?

A

Vanlig agar med tillsats av esculin (en glukosid) och ett järnsalt (järncitrat). Vid nedbrytning bildas ett svartfärgat ämne (esculetin).

Används för identifiering av enterokocker

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Vad innehåller en Drigalski-platta?

Vilken egenskap undersöks?

Vad används det för, dvs vilka bakterier/bakteriegrupper identifierar den?

A

Det är en selekterande och differentieraned platta innehållande kristalviolett och laktos

För påvisning av laktosjäsning (ger gul färg).

Påvisar laktosjäsare som E. coli, klebsiella, icke-proteus och pseudomonas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Vad är bacitracin och vilka bakterier hämmas av det?

A

Ett antibiotikum

Hämmar växt av ß-streptokocker grupp A (ibland även C och G)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad är oleandomycin och vilka bakterier hämmas INTE av det?

A

Ett antibiotikum

Används för att hämma alla bakterier förutom Haemophilus. Även nesseria kan växa i hämningszonen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Vad är novobiocin och vad används det för?

A

Ett antibiotikum som används för att skilja S. saprofyticus från övriga KNS. Saprofyticus är ej känslig till skillnad från de andra.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Vad är tobramycin/gentamycin och vad används det för?

A

Ett antibiotikum som används som indikator för anaeroba bakterier

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Hur testar man för MRSA/VRE/ESBL?

A

Odling på MH-platta med antibiotikalappar. Efter inkubering mäts zonstorleken och jämförs med givna siffror för att se om den är resistent eller inte.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Vad används oxacillin för?

A

Resistensbestämning av pneumokocker. Påvisar betalaktamas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Vad används Nitrocifintest för?

A

Resistensbestämning. Detektion av betalaktamas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Vad används Cefoxitin (Fox-30) för?

A

Resistensbestämning. Detektion av MRSA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Vad används Cefadroxil för?

A

Resistensbestämning. Detektion av ESBL.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Vad är agglutinationstest? Vilken princip baseras de på?

Ge 2 exempel på tester

A

Kommersiellt tillgängliga kit för snabb bestämning av bakterietyp.

De baseras på agglutination av färgade latexpartiklar täckta med specifika antikroppar och bakterier, tex clumping factor och kolhydratstrukturer

Streptex: gruppbestämmer streptokocker
Stahaurex: urskiljer S. Aureus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Vad är XV-faktortest?

Vilka faktorer testas, dvs vad betyder X, V och XV?

Vilka bakterier identifieras?

A

Ett test som bygger på vilka faktorer olika Haemophilusbakterier behöver för att växa. 3 små lappar läggs på plattan och inkuberas, dagen efter undersöks runt vilka lappar det finns växt.

X=Hemin, V=NAD, XV=båda

H. influenzae behöver XV
H. ducreyi behöver X
H. parainfluenzae behöver V

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Vad är ett amningstest? Hur går det till? Vilka bakterier identifieras?

A

Ett test för att skilja mellan H. influenzae/parainfluenzae

På en blodagarplatta stryks misstänkt H. influenzae/parainfluenzae ut. S. aureus stryks i en rak linje genom det tidigare stryket. Efter inkubering undersöks plattan för att se om bakterien “ammar” på S. aureus, dvs om den bara växer precis runt linjen.

Amning = H. influenzae
Inte amning = H. parainfluenzae

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Vad betyder hemolys?

Vilka bakterier orsakar hemolys? Vilka sorters hemolys finns?

A

Hemolys: nedbrytning av blod

Streptokocker

Alfa, beta, gamma hemolys finns

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Vad är ett skyffeltest och vilken bakterie identifieras?

A

Ett test där man tar en plattinös och puttar på en bakteriekoloni för att se om man kan skjuta runt den som en “puck” eller om den smetas ut.

Puck = Moraxella catarrhalis

34
Q

Vad används motilitetsrör för? Vilka bakterier skiljer den åt?

A

Att påvisa rörlighet hos bakterier.

Om det är växt i hela röret = rörlig, om det är växt endast i hålet där man satte ner platinösen = icke rörlig.

Nyttjas för att skilja olika Enterobakterier, tex E. coli och Klebsiella.

35
Q

Vad är principen för biokemiska typningar?

A

De skiljer på fermentering och nedbrytning av olika kolhydrater och aminosyror

36
Q

Vad är ONPG-rör?

A

Rör med laktos + indikator för påvisande av laktosjäsare

37
Q

Vilka bakterier skiljer arabinosrör på?

A

E. faecalis och E. faecium

38
Q

Vad är OLA? Vilka bakterier identifierar de?

A

Trerörsjäsning för

  • Pseudomonas
  • Enterokockjäsning
  • Salmonellajäsning

Identifiering av olika enterobakterier

39
Q

Vad är API 20E?

A

Biokemiskt jäsningsstrip för identifikation av olika enterobakteriearter

40
Q

Vad är API Strep?

A

Biokemiskt jäsningsstrip för identifikation av olika streptokocker

41
Q

Vad är RAPID 32A?

A

Biokemiskt jäsningsstrip för identifikation av olika anaeroba bakterier, tex Bacteroides och Clostridium

42
Q

Vad kan PCR användas för?

A
  • Identifikation av bakterier som inte går att odla fram
  • Identifikation av långsamväxandebakterier
  • Ett sätt att kvantifiera hur mycket bakterier det finns
  • Epidemiologisk typning
  • Påvisande av klamydia och gonorré
  • Påvisande av resistensgener för att upptäcka MRSA och VRE
  • Smittspårning
43
Q

Vilka bakterier kan analyseras med gaskromatografi? Vad studeras?

A

Anaeroba bakterier. Studerar bla produktion av olika fettsyror

44
Q

Kan masspektrometri användas för bakterieidentifikation? Vilken typ? Vad undersöks?

A

Ja, MALDI-TOF. Undersöker mass-signaler från bland annat ribosomala proteiner

45
Q

Varför vill man diagnosticera grampositiva kocker?

A

Ett flertal är medicinskt betydelsefulla. Ett flertal är klassiska humanpatogener.

46
Q

Ge exempel på två stafylokocker samt vilka sjukdomar/tillstånd man kan hitta dem vid

A

S. aureus: sår, sepsis

S. saprofyticus: UVI

47
Q

Ge exempel på två streptokocker samt vilka sjukdomar/tillstånd man kan hitta dem vid

A

S. pneumonie: pneumoni

S. pyogenes: tonsillit

48
Q

Ge exempel på två enterokocker samt vilka sjukdomar/tillstånd man kan hitta dem vid

A

E. faecalis och E. faecium. Båda hittas vid UVI

49
Q

Vilka bakterier bildar katalas - streptokocker eller stafylokocker?

A

Endast stafylokocker

50
Q

Vilka bakterier bildar hemolysiner- streptokocker eller stafylokocker?

A

Streptokocker

51
Q

Vad sker vid betahemolys? Hur ser det ut på plattan?

A

Total omvandling av hemoglobin till porfyriner. Zonen kring kolonin blir helt klar/genomskinlig

52
Q

Vad sker vid alfahemolys? Hur ser det ut på plattan?

A

Hemoglobin omvandlas till gallfärgämnen. Kolonin + substrat blir grönfärgad

53
Q

Vad sker vid gamma-hemolys? Hur ser plattan ut?

A

Ingenting, gamma-streptokocker påverkar inte blod alls. Zonen runt kolonin påverkas ej

54
Q

Hur växer grupp A streptokocker (GAS)? Vad är de känsliga för? Nämn två sjukdomar de kan orsaka.

A

Betahemolys. De är känsliga för bacitracin.

De kan orsaka faryngit och scharlakansfeber

55
Q

Hur växer grupp B streptokocker? Hur kan man förstärka hemolysen? Nämn två sjukdomar de kan orsaka.

A

Svag Betahemolys. Kan förstärkas mha S. aureus på fårblodplatta (sk. CAMP-test).

De kan orsaka sepsis hos nyfödda och urinvägsinfektioner hos vuxna

56
Q

Hur växer grupp C och grupp G?

A

Betahemolys

57
Q

Hur växer grupp D? Vilken specialplatta kan man använda för att differentiera dem?
Var finns de normalt? Vilka sjukdomar är de ofta inblandade i?

Nämn två bakterier i denna grupp

A

Svag alfa-beta hemolys. Ger svarta kolonier på esculinagar.

Finns normalt i tarmen, men är patogena i urinvägarna och orsakar då UVI.

Enterococcus faecalis och E. faecium

58
Q

Hur växer grupp H? Var finns de normalt? Vilken sjukdom kan de orsaka?

A

Alfa-hemolys. Finns normalt i munhålan men kan orsaka subakut endokardit.

59
Q

Hur växer pneumokocker? Vad är de känsliga för? Vilka sjukdomar orsakar de?

A

Alfahemolys. Känsliga för optochin. Orsakar pneumoni och mellanöreinflammation.

60
Q

Hur grupperas/typindelas pneumokocker?

A

De kan ej grupperas i Lancefields grupper A-V men kan typindelas med antisera mot kapselsubstans.

61
Q

Vad består normalfloran i tarmen av? Ge några exempel

A

Gramnegativa stavar.

Vanligaste arten är E. coli. Andra exempel är tex klebsiella, enterobakter och proteus

62
Q

Vilka bakterier är coliforma? Nämn en egenskap de har gemensamt

A

E. coli, Enterobacter och Klebsiella ingår i gruppen “coliforma bakterier”.

De är alla laktosjäsare

63
Q
E. coli - 
vilket test används för snabbscreening?
Rörlig/orörlig?
Laktosjäsare?
Vilken färg får den på urin-chromagar?
Vilket test kan användas för att hitta EHEC och ETEC?
A
Indolspot
Rörlig
Laktosjäsare
Blir rosa på urinchromagar
EHEC och ETEC kan hittas med PCR
64
Q

Har klebsiella och enterobacter kapsel?

A

Ja

65
Q

Hur kan klebsiella och enterobacter identifieras? Vilka egenskaper har de?

A

De är laktosjäsare, kan identifieras genom biokemisk jäsning. Även MALDI-TOF kan användas.
Blir blå/blågröna på uriCHROM

66
Q

Vad har proteus för egenskaper?Hur identifieras den?

A

Icke laktosjäsare
Svärmar (väldigt rörlig)
Spjälkar urea
Bildar sulfid (luktar)

Identifieras via MALDI-TOF

67
Q

Vad har Pseudomonas för egenskaper? Hur identifieras den?

A
Hallonessens-liknande lukt
Blir blå-grön i färgen
Oxidas-positiv
Ej laktosjäsare
Rörlig

Identifieras via jäsningsrör alt MALDI-TOF

68
Q

Ge exempel på patogena tarmbakterier

A

Salmonella, shigella, campylobacter, yersinia, EHEC, ETEC

69
Q

Jämför Salmonella och Shigella med varandra! Vilka egenskaper har de gemensamt och var skiljer de sig åt?

A

Biokemiskt är de rätt lika. Spjälkar inte laktos eller sackaros.

Kan skilja dem åt mha mannit - shigella jäser utan gasbildning.

Shigella är alltid orörlig till skillnad från salmonella

70
Q

Vilka selekterande odlingsmedium finns för patogena tarmbakterier?

A

CAMP-plattor: selekterande för campylobacter
XLD: Salmonella
DC: Shigella
Yersiniaplatta alt blåplatta: yersinia

71
Q

Hur kan campylobacter identifieras?

A

Växt, gramfärgning, oxidaspositiv, CAMP-platta

72
Q

Hur kan Salmonella identifieras?

A

Jäsning, agglutination, phage-test (mha bakteriofag som är selektiv för salmonella), MUCAP, svärmning, XLD-platta mm

73
Q

Hur kan Shigella identifieras?

A

DC-platta, svärmning, phage-test, jäsning

74
Q

Hur delas Salmonella in serologiskt?

A

Först delas de in i grupper efter deras somatiska antigen (O-antigen) och inom grupperna efter flagellära antigen (H-antigen)

Sedan kan vissa serotyper undergrupperas ytterligare mha fagtypning

75
Q

Hur går H-antigenbestämningen till?

A

Utvecklingen av flageller stimuleras. Bakterierna låts sedan svärma på lösagar.

76
Q

Beskriv campylobacternas egenskaper! (Storlek, form, G+/-, syrenivå..)

A

Liten, böjd G- rörlig stav. Trivs i mikroaerofil miljö, odlas på selektivsubstrat i 42 grader. Oxidaspositiv

77
Q

Vilken sjukdom ger Yersinia enterocolitica?

A

Akut diarré

78
Q

På vilka plattor odlas ofta luftvägspatogener?

A

HI-plattor, blodplattor och streptokockplattor

79
Q

Hur diagnosticeras Haemophilus influenzae?

A

Odling på HI-platta, amningstest, lapptest med XV-faktor, oxidas, MALDI-TOF

80
Q

Hur diagnosticeras Moraxella?

A

Oxidastest (+), skyffeltest, MALDI-TOF