7 COURS_Interaction ligands-R

Question 1

donner 2 définitions d’un R

Answer 1

• protéine qui active un des facteurs en présence d’un agoniste
• protéine qui médie l’action de substances endogènes et/ou exogènes

Question 2

décrire un R (3)

Answer 2

• peut être incorporé dans une membrane, associé à une membrane, associé à d’autres structures ou soluble
• ont une poche où le ligand vient se fixer avec des interactions très spécifiques qui favorisent un signal dans la cellule
• peut être inhibé par des agents pharmacologiques ou des protéines de transport ou structurales

Question 3

donner 3 R incorporés dans la membrane

Answer 3

• R associé à une protéine G
• GPCR
• R à tyrosine kinase

Question 4

définir un ligand

Answer 4

substance biologiquement active qui exerce son action en agissant via un R

Question 5

décrire un ligand (2)

Answer 5

• classé selon son affinité ou son action
• se lie au niveau de la poche d’interaction dans les boucles du R (pas nécessairement attaché à tous les domaines)

Question 6

donner 4 modes d’actions des ligands

Answer 6

• agoniste : réponse normale
• antagoniste : pas de réponse
• agoniste partiel : réponse moins forte
• agoniste inverse : baisse la réponse

Question 7

comment fonctionne le mode d’action des ligands ?

Answer 7

certaine affinité du ligand au R qui engendre généralement une réponse (= efficacité)

Question 8

comment étudier la liaison d’un ligand spécifique à un R ?

Answer 8

utilise des R purifiés, fragments de membrane de cellules qui expriment le R ou regarde des cellules isolées

Question 9

comment mesurer l’activité d’un R ?

Answer 9

utilise des fragments membranaires, des cellules, des organes ou l’organisme

Question 10

comment séparer les ligands chauds des ligands froids lors des études de l’activité et de l’affinité (4) ? lequel est le plus facile ?

Answer 10

• centrifugation
• dialyse
• chromatographie
• filtration (le plus facile)

Question 11

donner les 4 critères pour qu’une liaison ligand-R soit considérée comme spécifique

Answer 11

• réversibilité
• affinité
• saturabilité
• stéréospécificité

Question 12

définir la stéréospécificité

Answer 12

ligands ont différentes formes qui assurent une liaison spécifique plus ou moins bonne au R

Question 13

quels types de forces permettent à la liaison ligand-R d’être réversible ?

Answer 13

• van der waals
• non-covalente
• hydrogène
• ionique
  ==> liaisons faibles

Question 14

pourquoi est-ce important que la liaison ligand-R soit réversible ?

Answer 14

sinon le R serait toujours actif

Question 15

qu’implique le fait que la liaison ligand-R soit réversible ?

Answer 15

on peut la changer (ratio ligands libres vs associés change si augmente la quantité de ligands, ratio change aussi si change le volume dans lequel se fait la réaction)

Question 16

pourquoi voit-on la dissociation du ligand du R ? que se passe-t-il si la réaction est diluée ?

Answer 16

atteinte d’un état d’équilibre où le nombre de ligands associés et libres reste stable
atteint un état d’équilibre plus bas si dilue la réaction

Question 17

définir l’affinité

Answer 17

probabilité qu’un ligand occupe un R à un moment donné

Question 18

comment varie la probabilité de liaison si l’affinité est forte ?

Answer 18

plus l’affinité est forte pour un R plus la probabilité qu’il produise un effet via son interaction est grande : besoin d’une faible quantité pour avoir une efficacité

Question 19

comment obtenir une courbe d’affinité ?

Answer 19

met des R avec des ligands chauds dans une solution (liaison 100% avec les ligands chauds) puis ajoute de plus en plus de ligands froids donc compétition entre les 2 donc déplacement du ligand chaud : regarde combien de ligands froids il faut pour déplacer les ligands chauds pour calculer la constante d’affinité

Question 20

décrire la constante d’affinité (4)

Answer 20

• Kd
• concentration de ligands froids qu’il faut pour déplacer 50% des ligands chauds
• moins ça prend de ligands froids pour déplacer les ligands chauds plus l’affinité est grande
• affinité relative au ligand chaud utilisé

Question 21

comment augmenter le nombre de liaisons entre un ligand chaud et son R ?

Answer 21

augmenter le nombre de R

Question 22

décrire une courbe d’affinité lorsque le R a 2 sous-types différents dans la solution

Answer 22

courbe avec 2 plateaux et 2 descentes : 1ère portion est l’affinité pour un sous-type de R pour lequel le ligand a plus d’affinité et 2e portion est l’affinité pour l’autre sous-type

Question 23

comment varie la saturabilité d’un ligand selon le type de liaison ? pourquoi ?

Answer 23

nombre fini de liaisons quand elle est spécifique car nombre limité de sites de liaison donc saturable
nombre virtuellement infini de liaisons quand elle est non-spécifique car se lie à n’importe quoi autre que le R

Question 24

comment obtenir la courbe de liaisons spécifiques ?

Answer 24

soustrait la courbe de liaisons totales à la courbe de liaisons non spécifiques

Question 25

définir Bmax et Kd

Answer 25

Bmax : quantité maximale de R / sites de liaison de R Kd : concentration de radioligands requise pour occuper 50% des R, plus Kd est petite meilleure est l'affinité du ligand pour le site de liaison

Question 26

donner les 2 formules à connaître

Answer 26

quand [L*] = Kd alors on a Bmax/2 taux d'occupation Y = L*/Bmax donc [L*R]/Bmax = [L*]/(Kd + [L*]) = Y

Question 27

donner différents antagonistes (6)

Answer 27

- vrai antagoniste / antagoniste neutre - antagoniste compétitif : même site de liaison que l'agoniste - antagoniste non-compétitif - antagoniste fonctionnel - antagoniste surmontable - antagoniste insurmontable

Question 28

donner différents agonistes (3)

Answer 28

- agoniste inverse - agoniste protéan : réponse change selon la conformation actuelle du R - agoniste biaisé : utilise préférentiellement certaines voies

Question 29

quel facteur peut changer la conformation du R ? qu'est-ce que ça implique ?

Answer 29

environnement peut changer la conformation du R donc la réponse

Question 30

définir les R de réserves comment varie cette réserve ?

Answer 30

fraction des R non utilisés et non nécessaires pour avoir la réponse maximale varie selon la sensibilité du tissu, efficacité de l'agoniste...