7 COURS_Interaction ligands-R Flashcards
donner 2 définitions d’un R
- protéine qui active un des facteurs en présence d’un agoniste
- protéine qui médie l’action de substances endogènes et/ou exogènes
décrire un R (3)
- peut être incorporé dans une membrane, associé à une membrane, associé à d’autres structures ou soluble
- ont une poche où le ligand vient se fixer avec des interactions très spécifiques qui favorisent un signal dans la cellule
- peut être inhibé par des agents pharmacologiques ou des protéines de transport ou structurales
donner 3 R incorporés dans la membrane
- R associé à une protéine G
- GPCR
- R à tyrosine kinase
définir un ligand
substance biologiquement active qui exerce son action en agissant via un R
décrire un ligand (2)
- classé selon son affinité ou son action
- se lie au niveau de la poche d’interaction dans les boucles du R (pas nécessairement attaché à tous les domaines)
donner 4 modes d’actions des ligands
- agoniste : réponse normale
- antagoniste : pas de réponse
- agoniste partiel : réponse moins forte
- agoniste inverse : baisse la réponse
comment fonctionne le mode d’action des ligands ?
certaine affinité du ligand au R qui engendre généralement une réponse (= efficacité)
comment étudier la liaison d’un ligand spécifique à un R ?
utilise des R purifiés, fragments de membrane de cellules qui expriment le R ou regarde des cellules isolées
comment mesurer l’activité d’un R ?
utilise des fragments membranaires, des cellules, des organes ou l’organisme
comment séparer les ligands chauds des ligands froids lors des études de l’activité et de l’affinité (4) ? lequel est le plus facile ?
- centrifugation
- dialyse
- chromatographie
- filtration (le plus facile)
donner les 4 critères pour qu’une liaison ligand-R soit considérée comme spécifique
- réversibilité
- affinité
- saturabilité
- stéréospécificité
définir la stéréospécificité
ligands ont différentes formes qui assurent une liaison spécifique plus ou moins bonne au R
quels types de forces permettent à la liaison ligand-R d’être réversible ?
- van der waals
- non-covalente
- hydrogène
- ionique
==> liaisons faibles
pourquoi est-ce important que la liaison ligand-R soit réversible ?
sinon le R serait toujours actif
qu’implique le fait que la liaison ligand-R soit réversible ?
on peut la changer (ratio ligands libres vs associés change si augmente la quantité de ligands, ratio change aussi si change le volume dans lequel se fait la réaction)
pourquoi voit-on la dissociation du ligand du R ? que se passe-t-il si la réaction est diluée ?
atteinte d’un état d’équilibre où le nombre de ligands associés et libres reste stable
atteint un état d’équilibre plus bas si dilue la réaction
définir l’affinité
probabilité qu’un ligand occupe un R à un moment donné
comment varie la probabilité de liaison si l’affinité est forte ?
plus l’affinité est forte pour un R plus la probabilité qu’il produise un effet via son interaction est grande : besoin d’une faible quantité pour avoir une efficacité
comment obtenir une courbe d’affinité ?
met des R avec des ligands chauds dans une solution (liaison 100% avec les ligands chauds) puis ajoute de plus en plus de ligands froids donc compétition entre les 2 donc déplacement du ligand chaud : regarde combien de ligands froids il faut pour déplacer les ligands chauds pour calculer la constante d’affinité
décrire la constante d’affinité (4)
- Kd
- concentration de ligands froids qu’il faut pour déplacer 50% des ligands chauds
- moins ça prend de ligands froids pour déplacer les ligands chauds plus l’affinité est grande
- affinité relative au ligand chaud utilisé
comment augmenter le nombre de liaisons entre un ligand chaud et son R ?
augmenter le nombre de R
décrire une courbe d’affinité lorsque le R a 2 sous-types différents dans la solution
courbe avec 2 plateaux et 2 descentes : 1ère portion est l’affinité pour un sous-type de R pour lequel le ligand a plus d’affinité et 2e portion est l’affinité pour l’autre sous-type
comment varie la saturabilité d’un ligand selon le type de liaison ? pourquoi ?
nombre fini de liaisons quand elle est spécifique car nombre limité de sites de liaison donc saturable
nombre virtuellement infini de liaisons quand elle est non-spécifique car se lie à n’importe quoi autre que le R
comment obtenir la courbe de liaisons spécifiques ?
soustrait la courbe de liaisons totales à la courbe de liaisons non spécifiques
définir Bmax et Kd
Bmax : quantité maximale de R / sites de liaison de R
Kd : concentration de radioligands requise pour occuper 50% des R, plus Kd est petite meilleure est l’affinité du ligand pour le site de liaison
donner les 2 formules à connaître
quand [L] = Kd alors on a Bmax/2
taux d’occupation Y = L/Bmax donc [LR]/Bmax = [L]/(Kd +[L*]) = Y
donner différents antagonistes (6)
- vrai antagoniste / antagoniste neutre
- antagoniste compétitif : même site de liaison que l’agoniste
- antagoniste non-compétitif
- antagoniste fonctionnel
- antagoniste surmontable
- antagoniste insurmontable
donner différents agonistes (3)
- agoniste inverse
- agoniste protéan : réponse change selon la conformation actuelle du R
- agoniste biaisé : utilise préférentiellement certaines voies
quel facteur peut changer la conformation du R ? qu’est-ce que ça implique ?
environnement peut changer la conformation du R donc la réponse
définir les R de réserves
comment varie cette réserve ?
fraction des R non utilisés et non nécessaires pour avoir la réponse maximale
varie selon la sensibilité du tissu, efficacité de l’agoniste…
