4. La structure primaire des protéines

Question 1

Les peptides contiennent entre ? résidus d’acides aminés.

Answer 1

2 à 50

Question 2

Les protéines sont des biomolécules constituées de longues chaînes de plus de ?

Answer 2

50 résidus

Question 3

Nom du polymère pour 13 à 20 résidus

Answer 3

Oligopeptide

Question 4

Nom du polymère pour plus de 20

Answer 4

Polypeptide (souvent utilisé lorsque discussion s’applique à la fois aux peptides et protéines)

Question 5

Nom du polymère pour plus de 50

Answer 5

Protéine (vaste majorité contient entre 100 et 1000 résidus)

Question 6

Minimum de ? résidus pour obtenir une structure tridimensionnelle stable

Answer 6

40

Question 7

Une protéine monomérique est constituée …

Answer 7

d’une seule chaîne polypeptidique.

Question 8

Protéines multimériques ou oligomériques

Answer 8

Constituées de plusieurs chaînes polypeptidiques associées les unes avec les autres

Question 9

Chaque chaîne d’une protéine multimérique est appelée ?

Answer 9

Sous-unité

Question 10

Lorsque la protéine est formée de la répétition d’une seule et même sous-unité, on parle ?

Answer 10

d’un homomultimère

Question 11

Les hétéromultimères sont formés …

Answer 11

d’au moins 2 sous-unités différentes.

Question 12

La séquence linéaire des résidus d’acides aminés d’une chaîne peptidique est appelée ?

Answer 12

structure primaire

Question 13

L’union des acides aminés entre eux s’effectue entre la fonction ? du premier acide aminé et la fonction ? d’un deuxième acide aminé pour former ? aussi appelé liaison peptidique ou lien peptidique.

Answer 13

a-carboxyle
a-amine
un lien amide

Question 14

Les peptides et les protéines ? en milieu aqueux

Answer 14

s’ionisent
(charges portées par groupements COOH situé à extrémité C-terminale et NH2 situé à extrémité N-terminale libres aux extrémités ET chaîne latérales)

Question 15

Les valeurs de pKa des acides aminés diffèrent donc légèrement lorsque ceux-ci se retrouvent à l’intérieur ?

Answer 15

d’un polypeptide (microenvironnement)

Question 16

Pour décrire la séquence d’un peptide, on commence par le résidu ? et on énumère successivement les résidus jusqu’à ?

Answer 16

extrémité N-terminale
extrémité C-terminale
Bien savoir codes à une lettre
Résidus - alanyl par exemple

Question 17

Composition d’une protéine

Answer 17

Réfère à la nature des acides aminés (% de chaque)

Question 18

Séquence d’une protéine

Answer 18

Ordre dans lequel les résidus sont attachés les uns aux autres **COMMENCE TOUJOURS PAR EXTRÉMITÉ N-TERMINALE

Question 19

8 étapes principales des techniques de séquençage des protéines

Answer 19

1- Bris des ponts disulfures
2- Bris des interactions non covalentes
3- Composition en acides aminés
4- Caractérisation des extrémités N- et C- terminales
5- Fragmentation des chaînes polypeptidiques
6- Séquençage des fragments
Répéter étapes 5-6 avec seconde méthode fragmentation
7- Reconstruction de la séquence
8- Localisation des ponts disulfures

Question 20

À l’aide de la bio-informatique et de logiciels spécialisés dans la transformation de séquence nucléotidique en séquence protéique, il est possible d’obtenir… 3

Answer 20

Sa structure primaire
Sa masse moléculaire
Son point isoélectrique

Question 21

Les analyses ? des séquences protéiques obtenues à partir de l’analyse de l’ADN ne permettent pas de prédire ? (présence d’acides aminés modifiés ou de ponts disulfures). De plus, il n’est pas possible de déterminer si la protéine est composée d’une ou de plusieurs ?.

Answer 21

in silico (par ordinateur)
les modifications post-traductionnelles
sous-unités

Question 22

On dit que 2 protéines sont ? lorsqu’elles possèdent un degré significatif de similarité de séquence. Elles sont dérivées d’un ancêtre commun; elles peuvent être orthologues ou paralogues.

Answer 22

Homologues

Question 23

Deux protéines homologues ayant la même fonction, mais provenant d’organismes différents sont dites ?. Les protéines ? sont retrouvées dans un même organisme. Ce sont des protéines homologues (similarité de séquence) qui ont des rôles différents. Ces protéines proviennent de la duplication d’un gène et de sa spécialisation subséquente.

Answer 23

Orthologues

Paralogues

Question 24

On parle de ? lorsqu’un résidu est remplacé par un autre ayant des caractéristiques semblables.

Answer 24

substitution conservatrice

Question 25

Les alignements de séquence permettent également de construire ? à partir des pourcentages de similarité entre protéines orthologues de plusieurs espèces.

Answer 25

Arbres phylogénétiques

Question 26

Le type de peptide est déterminé par le ?. Si le nombre de résidus est égal à n, le nombre de liens peptidiques est égal à ?.

Answer 26

nombre de résidus

n-1