2B1 week 1 HC 3 & 6 Inleiding virologie Flashcards
Wat is de definitie van een virus?
Obligaat intracellulaire moleculaire parasieten
Hoe heet een virus tijdens de extracellulaire fase?
Virion
Wat zijn kenmerken van een virus?
- Bevatten DNA óf RNA
- Verspreiding door virus partikels
- Passieve agentia
Op basis waarvan kunnen virussen worden geclassifiseerd?
- Ziekte
- Morfologie (vorm en genetisch materiaal)
- mRNA synthese (Baltimore)
Hoe kun je virussen bekijken?
Met elektronenen microscoop
Waar wordt naar gekeken bij virus taxonomie?
- Vorm van capside (icosaeder, helicaal of pleomorf)
- Wel of geen envelop
- DNA of RNA / ss of ds / linear of circulair
Wat is tropisme?
Wel of niet aanwezigheid van juiste receptor
- Wel: susceptibel
- Niet: resistent
Wat is de Berlin patient?
Patiënt met HIV en AML, die transplantatie van CCR-5 deficiënte donor kreeg
Op welke manier kan een virus binnendringen?
Penetratie, endocytose of membraanfusie
Waaruit bestaat de Baltimore classificatie?
Manier waarop mRNA wordt bereikt
- DNA of RNA
- Enkelstrengs of dubbelstrengs
- Positief of negatief
Wat is assemblage?
Samenkomst van virale eiwitten en DNA of RNA
Uit welke stappen bestaat virus replicatie?
Attachement, entry, synthesis, assembly en release
Wat is permissiviteit?
Ondersteunen van virus replicatie
Hoe kun je een virus aantonen?
- Pathologie / immunohistochemie
- PCR (detectie virale genoom)
- ELISA (detectie viraal antigeen)
- Elektronenmicroscopie / immunofluorescentie
- Virus isolatie
Wat bepaalt de specificiteit van een virus?
De capside of envelop
Wat zijn de groepen van de Baltimore classificatie?
- Groep 1: dsDNA (+/-)
- Groep 2: ssDNA (+ of -)
- Groep 3: dsRNA (+/-)
- Groep 4: ssRNA (+)
- Groep 5: ssRNA (-)
- Groep 6: ss RNA (+) (via DNA)
- Groep 7: dsDNA (+/-)
Hoe wordt HIV vastgesteld?
Positieve ELISA bevestigen met western blot
Waaruit bestaat de virus envelop?
Lipide bi laag
Wat zijn kenmerken van RNA virussen?
Hebben eigen RNA polymerase nodig
Welk virus is het moeilijkst te inactiveren?
DNA naked virus
Hoe verloopt synthese van het HIV virus?
ss + RNA -> ss - DNA -> ds DNA -> mRNA
Wat zijn nucleoside analogen?
Nucleosiden waarbij de OH groep van de suikerring wordt vervangen
- Replicatie wordt geremd
- Worden intracellulair gefosforyleerd
Waardoor zijn selectieve nucleoside analogen niet toxisch?
De nucleosiden worden alleen gebruikt door virale polymerases
Waardoor treedt er snel resistentie op tegen nucleoside analogen?
Hoge replicatie snelheid met veel mutaties
- M184V mutatie heeft voordeel
Wat zijn compensatie mutaties?
Mutatie die verlies van fitness compenseren door betere replicatie
Hoe kun je resistentie voorkomen?
- Combinatie therapie: 3 middelen (cART)
- Hoge genetische barrière: meerdere mutaties nodig
Wat is acyclovir?
Nucleoside analoog dat door viraal thymidine kinase wordt gefosforyleerd (200x beter dan cellulair kinase)
- Verminderd mortaliteit encephalitis bij herpes
Waar repliceren de verschillende soorten virussen?
- DNA: in celkern met DNA polymerase van cel (behalve pokkenvirus)
- RNA: in cytoplasma met eigen RNA polymerase
Hoe kan er van een viraal mRNA meerdere eiwitten gevormd worden?
- Proteases
- Ribosomale frameshifting
- Interne transcriptie
- Gesegmenteerd genoom
Welke vier groepen RNA virussen zijn er?
- Plus strengs: via negatief RNA naar mRNA
- Min strengs: via positief RNA naar mRNA
- Dubbelstrengs
- Positief met DNA als intermediair
Hoe verloopt de replicatie van hepatitis B?
ds DNA -> RNA intermediair -> ds DNA
Hoe heet de verzwakking van virussen?
Attenuatie
Op welke manieren kunnen RNA virussen hun genetisch materiaal veranderen?
- Standaardmutaties (antigene drift)
- Recombinatie virale genomen
- Reassortering virale genomen
Wat zijn mogelijke functies van virale eiwitten?
- Component voor replicatie van het genoom
- Proteolytische klieving van gesynthetiseerde eiwitten (virale proteases)
- Structuurelement
Welk deel van het virus wordt herkent?
Glycoproteïnen
Welke typen vaccinaties zijn er?
- Klassiek: verzwakt virus
- Recombinant vector: onschuldig virus met recombinant materiaal
Hoe werkt het retrovirus?
- RNA wordt DNA (reverse transcriptase)
- Intergratie in humane genoom (intergrase)
- Assemblage (proteases)
Wat is seropositief?
In het serum zijn antistoffen tegen het virus aantoonbaar
Wat is het gevolg van HIV?
- Directe afbraak T helpercellen
- Afbraak door cytotoxische T cellen doordat T helpercellen HIV op MHC-I presenteren