1. Historique, Processus infectieux et Microbiote Flashcards
Qui suis-je?
Science/étude des organismes de petites tailles
Microbiologie
(science assez récente)
Qui est le premier à observer un m-o au microscope? (1665)
Robert Hooke
Qui est le premier à observer le “monde microscopique”? (1674)
Antoni van Leeuwenhoek
Qui fait les premiers travaux sur la “vaccine”/1er vaccin? 1796
Edward Jenner
Qui identifient les
agents responsables de la tuberculose, anthrax, choléra.
-> théorie des germes et postulat de Koch (1860-80)
Robert Koch (droite) et Louis Pasteur (gauche)
Qui “invente” la stérilisation des instruments 1860-70
Joseph Lister
Qui découvre les premiers agent antibac/début chimio (1909)
Paul Ehrlich
Qui a découvert la Pénicilline
Alexander Fleming
Placer le monde microbien en ordre croissant
(eucaryote, levure/parasite, bact, mycélium/parasite, virus)
mycélium=pls mycètes
Quelle a été la première utilité des m-o
alimentation (bière, vin, pain)
Quelque utilisation des biotechnologies
biotech=produire molécule d’intérêt
Produire; antibio, hormones, prot recombinantes, autres (botox)
Pourquoi la microbio est importante à étudier?
Menace santé humaine
Qui suis-je?
maladie constamment présente dans une région ou une population donnée
Maladie endémique
Différence entre Épidémie et Pandémie
- Épi: dév et propagation rapide maladie contagieuse dans population
- Pan: idem mais plusieurs pays/continent (monde)
Différence entre prévalence et incidence
- Préval: nbr de cas
- Incidence: nbr de nouveaux cas
Placer 5 épidémie en ordre temporelle
- Peste d’Athènes
- Peste de Justinien (fin antique/début moy-age)
- Peste noire (tue 1/3 europe)
- Variole (Amérique du sud)
- Pandémie de grippe espagnole (1/3 pop modiale infecté, mais pas tous mort)
Comment appelle t-on une maladie qui tue chaque année, qui n’a pas de vaccin efficace et qui a peu de couverture médiatique
Pandémie/épidémie “silencieuses”
V ou F
En 2019, 14% de mortalité mondiale était dû aux maladie infectieuses
V
7,7 millions morts
Est-ce qu’une maladie infectieuses peut amener des conséquences à moy/long terme
Oui
ex: covid longue et mono qui aug risque de sclérose en plaque
Faire une flash sur le paludisme ig
lien entre le génome et la région d’épidémie
En évoluant on a améliorer notre résistance aux infections, par contre on est rendu plus à risque de quoi?
Aug risque de maladies auto-immunes
L’évolution change notre système immunitaire. Comment la peste a modifié notre système (ex du gène ERAP2)
- Bénéfique: plus de protection contre infections bactériennes
- Néfaste: ERAP2 associé aux maladie auto-immunes
Dans le proc infectieux, c’est quoi la différence entre Réservoir, Source et Vecteur
- Réservoir: humain/animal… où le m-o peut survivre (donc porteurs sains)
- Source: matière biologique qui contient l’agent infectieux ex: gouttelettes
- Vecteur: organisme vivant qui acquiert l’agent dans un réservoir et transmet à l’hôte ex: moustique
nommez les étapes d’un processus infectieux (7)
- être en contact avec un pathogène
- envahir l’hôte
- adhérer aux cellules de l’hôte
- compétition avec la flore
- résister à la réponse immunitaire de l’hôte
- envahir les tissus
- induire des dysfonctions physiologiques
L’étape initiale/0 du proc infectieux est d’être en contact avec un pathogène, quelles sont les transmissions/infections les plus populaires
Qui suis-je?
Maladie ou infection naturellement transmissible des animaux vertébrés à l’homme
Zoonose
(virus, bac, parasite, champi)
V ou F
Très peu de maladies humaines ont une origines zoonotique
F
Souvent les maladies humaines ont une origine zoonotique
avant de devenir spécifique à l’humain (exemple VIH)
Quel endroit est le plus à risque de “commencer” une zoonose
Contact avec animaux sauvages ou domestiques qui transmettent leur maladie
Quel “étape” de l’histoire a amené une multiplication des maladies infectieuses
Révolution néolitique/Sédentarisation
(avec les animaux d’élevages et le bassin de pop humaine)
Que signifie la Pathogénicité
Pouvoir pathogène (quaLitatif)
degré de pathogénicité=virulence
Quoi la différence entre un pathogène primaire et opportuniste
- Primaires: sur sujet sain
- Opportunistes: sur personnes immunodéf/supprimées
Différence entre taux de morbidité et mortalité
- Morbidité: incidence de population dans temps
- Mortalité: Décès p/r aux infectés
Que signifie la Dose Léthale 50
dose qui entraîne la mort de 50% des individus
Que signifie Dose infectieuse
qt de m-o nécessaire pour causer une infection
V ou F
La virulence d’un m-o est la même pour tous les individus
F
Virulence est variable selon différents facteurs de l’hôte
Quels sont les facteurs de risques importants de l’hôte à développer une infection
Génétique, Âge, Mode de vie (alimentation), Maladie chronique (diabète)
médicament et environnement
Par quelles voies entrent les microbes dans l’hôte
- Muqueuse
- Peau
- Voie parentérale
Quelle structure du microbe aide à voyager/adhérer aux cellules de l’hôte? (correspond à quelle antigène)
Flagelles (antigène H)
Pour que le microbe adhère aux cellules il y a une intéraction complémentaire et spécifique entre a) et b)
a) adhésine (pilus ou fimbriae sur la surface bactérienne)
b) récepteur (surface cellule hôte)
Comment les pili améliorent la mobilité des m-o
V ou F
Il y a plus de cellules humaines que de microbes dans le corps humain
F
10 microbes pour 1 cellule humaine
V ou F
Tous les cellules bactéries de notre corps ne sont pas pathogènes
F
Les bactéries symbiotiques sont potentiellement patho si elles se retrouvent dans un autre organe
Quoi la différence entre microbiote et microbiome
- MicrobioTe: m-o sur et dans individu (Flore Normale)
- MicrobioMe: microbiote + environnement
Quoi le Core microbiome
espèces microbiennes communes entre individus dans endroits spécifiques du corps
en gros; commun à tous
C’est quoi la diversité Alpha et Beta
- alpha: diversité (nbr d’espèces) dans un seul échantillon
- beta: diversité entre deux (microbiotes) échantillons
Qui suis-je?
M-o qui a une action bénéfique sur l’hôte
Probiotique
Qui suis-je?
Déséquilibre/perturbation du microbiote
Dysbiose
Quels sont les 5 fonctions du microbiote
- Protection contre patho
- Rôle sur système immunitaire
- Fct métabo
- Fct tissulaires
- Fct neuro
V ou F
Les bact de la peau sont sensiblement les mêmes partout sur le corps
F
Type bactérie varie selon caractéristiques de la peau
Nommez 4 types de microbiote sur le corps:
- La peau
- Buccal
- Urogénital
- Tractus digestif
Où se situe le microbiote de la peau? à quoi sert-il?
- Épiderme, glandes sudoripares ou follicules pileux
- Maintient les défenses immunitaires
Staphylococcus epidermis et Proprionibacterium acnes sont des bactéries de la microbiote …. ?
De la peau
- epidermis = flore normale
- acnes = acné
Causes (3) d’une dysbiose (déséquilibre) du microbiote de la peau
1. Infections chroniques des plaies
2. Acné
3. Dermatite atopique
V/F: Le microbiote de la peau est le 2ème microbiote le plus diversifié et plus important en nb de bactéries
F
c’est la microbiote buccal (1er=digestif)
Rôle de la microbiote buccal
Fonctions protectrices (effet de barrière)
Streptococcus, Fusobacterium et Actinomyce sont des bactéries de quel microbiote?
Buccal
(bact à retenir)
Lors de dysbiose du microbiote buccal; quels sont les bact à retenir pour a) Caries b) Maladies Parodontales c) Candidose orale
a) Streptococcus mutans
b) Porphyromonas gingivalis
c) Candida albicans
Quelles sont les bactéries présentes dans les reins et la vessie?
NORMALEMENT stérile
Quelles sont les bactéries présentes dans l’urètre?
- Staphylocoques
- Streptocoques
- Entérocoques
- Bacilles anaérobies
Quelle est l’importance de la flore complexe évolutive du vagin?
Elle a un effet sur le pH:
- av puberté et après ménopause = Alcalin (7 et plus)
- adulte: Acide (3.8-4.5)
V/F: La flore normale peut contenir des levures comme Candida albicans qui prolifèrent lors d’une dysbiose et peuvent causer des infections urinaires
Vrai
Une des bactéries les plus importantes du microbiote urogénital pour réguler le pH
Lactobacillus
Que pourrait altérer la composition du microbiote du sys uro-génital? (Et diminuer la qut des lactobacilles)
1. Augmentation du pH
2. Perte des défenses immunitaires (peptides antimicrobiens)
3. Environnement inflammatoire
Causes de dysbiose du microbiote du sys uro-génital
1. Âge
2. Stress
3. Manque d’hygiène
4. Antibiotiques
Quel est le microbiote le plus étudié, le plus diversifié et le plus peuplé?
Microbiote du tractus digestif
- effets locaux et systémiques par les liens avec de nombreux organes
- différents pH, concentrations d’O2
Composition du microbiote du tractus digestif:
Bactéries, virus et levures
Bactéries à retenir du tractus digestif
1. Bacteroides
2. Prevotella
3. Streptococcus
4. Candida
5. Saccharomyces
V/F: Le microbiote du tractus digestif est le même à la naissance qu’à l’âge adulte.
FAUX: il évolue avec l’âge, très lié à l’immunité (voir image diapo 84 pp1)
Nommez 9 mécanismes du tractus digestifs:
- Production d’acides gras à courte chaine (SCFA: butyrate, propionate)
- Libération de molécules bactérienne
- Métabolisme des acides biliaires
- Métabolisme du tryptophane
- Production de médiateurs immunomodulateurs
**6. Maintien de la tolérance immunitaire - Production de peptides antimicrobiens
- Maintien de l’intégrité barrière intestinale
- Activation des lymphocytes B et production d’IgA**
Avec quoi le tractus digestif maintien la tolérance immunitaire (2)
- Cellules dentritiques tolérogéniqus
- Lymphocytes T régulateurs
Comment le tractus digestif maintien l’intégrité de la barrière intestinale? (2)
- Renforcement des jonctions cellulaires
- Activation des lymphocytes innés 3 (IL3) = produisent des IL22
Liens entre le microbiote du tractus digestif et les autres organes (j’ai copié collé le pp)
Cerveau: stress, anxiété, dépression, autisme, etc.
Système endocrinien: désordres hormonaux
Cœur: maladies cardiovasculaires, hypertension, athérosclérose
Poumon: MPOC, fibrose pulmonaire
Foie: Carcinomes, inflammation hépatique, NASH
Pancréas: diabète, inflammation pancréatique
Muscle: sarcopénie, faiblesse musculaire
Peau: acné, psoriasis, rides, etc
Rein: pathologies rénales aigues et chroniques, néphropathie
Vessie: infections urinaires
Système reproductif: infertilité, cancer, ostéoporose
Bref, savoir qu’il y a lien entre microbiote digestif et les autres organes
Quels sont les effets des antibiotiques sur l’infection par Clostridium difficile sur le tractus digestif?
- Cause des diarrhées
- Les infections sont difficiles à traiter
Quels sont les traitements possibles pour réduire les effets des antibiotiques sur l’infection par Clostridium difficile sur le tractus digestif?
Traitement de 1ère ligne: antibiothérapie, probiotiques
Traitement de 2ème ligne: transplantation de matériel fécal
Pour résister à la réponse immunitaire, certains microbes peuvent:
1. Se protéger de la _________
2. Survivre à l’intérieur des ______________
3. Sécréter des ___________ qui détruisent les leucocytes
4. Interférer avec les ___________ et le ___________
- Phagocytose
- Leucocytes
- Enzymes
- Anticorps/complément
Caractéristiques d’une capsule
- Définit l’antigène K
- Peut être présent chez les Gram- et Gram+
- Composé de polysaccharides ou protéines
- Essentielle pour la survie dans l’hôte (pas nécessaire pour la croissance bactérienne)
Rôle de la capsule (3)
- Barrière physique contre les molécules hydrophobiques (détergents)
- favorise l’adhérence aux surfaces/tissus
- Empêche la phagocytose
Définition d’un biofilm
Communauté microbactérienne adhérant à une surface (généralement plusieurs organismes)
Production de matrice protectrice glycocalyx
4 étapes de la formation d’un biofilm
- Attachement réversible
- Attachement irréversible, Formation de la matrice polysaccharidique
- Maturation, formation de microcolonies, colonisation par d’autres espèces bactériennes
- Dispersion
Les microbes sécrètent des enzymes extracellulaires, décrire leurs fonctions:
Cytolysine
Hémolysine
Cogulases et fibrinolysines
Leucocidines
- Cytolysines: détruisent les composantes cellulaires des cellules de l’hôte (ex. phospholipases, collagénases)
- Hémolysines: lysent les érythrocytes (globules rouges)
- Coagulases et fibrinolysines: agissent sur la coagulation du sang (favorisent ou empêchent)
- Leucocidines: forment des pores dans les membranes des leucocytes et induisent leur lyse
Exemple: Virus de la grippe aviaire (H5N1)
Rôles des différentes protéines du virus qui vont agir sur la réponse immunitaire
NS1
PB1-F2
M2
NS1
1- Supprime l’immunité antivirale (action sur les interférons de type I)
2- Induit l’apoptose des cellules infectées
PB1-F2
1- Supprime l’immunité antivirale (action sur les interférons de type I)
2- Induit l’apoptose des cellules infectées
M2
Inhibe l’autophagie en bloquant la fusion entre le phagosome et le lysozome
Décrire le mécanisme Zipper
- Interactions entre les adhésines de la bactérie et celles des récepteurs de l’hôte
- Modulation du cytosquelette
- La bactérie est entourée par la membrane qui forme un endosome pour permettre l’invasion
Décrire les étapes du mécanisme Trigger
1- Bactérie injecte (par une seringue SST3) des protéines effectrices directement dans le cytoplasme de la cellule hôte
2- Modulation du cytosquelette d’actine par les effecteurs bactériens
3- La bactérie est entourée par la membrane qui forme un endosome pour permettre l’invasion
Exemple d’un mécanisme Trigger
Salmonella, Shigella
Effecteurs: SipA, SipC, SopB, SopE, SopE2
Déf: toxine
Protéine d’un microorganisme qui lui permet de provoquer une maladie
Déf: Exotoxine
Toxine présente dans le cytoplasme es microorganisme qui est ensuite sécrétées dans le milieu extracellulaire ou directement dans la cellule hôte
Déf: Endotoxine
**Portion lipidique (lipide A) du lipopolysaccharide (seulement chez les bactéries à Gram - ) qui est libérée lors de la lyse ou de la croissance
Déf: Anatoxine
Toxine qui a perdu son pouvoir toxique mais reste immunogène et peut être utilisée comme vaccin
Rôle du liquide A dans les endotoxines
Ancre les LPS dans la membrane externe, responsable du pouvoir immunogénique
Que peut causer comme symptôme les endotoxines chez l’humain
Réponse inflammatoire +++ (Cytokines, Cellules)
Atteinte systémique (Fièvre, Choc septique)
Caractéristiques des exotoxines (3):
- Poisons violents
- Efficaces à faible dose
- Effets neurotoxiques, cytotoxiques, entérotoxiques
Décrire les exotoxines de classe 1
Classe 1:
Agissent à la surface de la cellule
- récepteur de l’hôte
- formation de pore
Décrire les exotoxines de classe 2:
Classe 2:
Agissent sur des cibles intracellulaires
- endocytées
- à sous-unités A/B
Agissent sur les voies de signalisation de l’hôte, cytosquelette, synthèse protéique
Décrire les exotoxines de classe 3:
Classe 3:
Agissent sur des cibles intracellulaires INJECTÉES
Agissent sur les voies de signalisation de l’hôte, cytosquelette, synthèse protéique
On utilise la toxine botulique pour l’humain, cmt agit-elle?
Neurotoxine très puissante qui agit à faible dose (atténuer les rides)
