VL8-Ribo-Seq

Question 1

Welches Gen wir am wahrscheinlichsten über Translation reguliert?

a) Gen mit stabiler mRNA, stabilem Protein
b) Gen mit stabiler mRNA, instabilem Protein
c) Gen mit instabiler mRNA, stabilem Protein
c) Gen mit instabiler mRNA, instabilem Protein

Answer 1

d

Question 2

2. Mittels welchen Experiments können Sie Polysomen anreichern?

Answer 2

Polysom-Sequenzierung (Dichte Gradient)

Question 3

Welche Bedingungen muss erfüllt sein, damit Sie nach einem Ribo-Seq-Experiment eine Kodon-aufgelöste Translationsaktivität bestimmen können?

Answer 3

Es muss 28 Bb haben, damit es einem Frame zugeordnet werden kann.

Question 4

Sie wissen, dass die neg. RNA negativ über die Termination der Translation reguliert wird. Wie sähe die read-coverage für diese mRNA in einem Ribo-Seq Experiment aus?

Answer 4

Negativ kontrolle über UAG, am UAG sitzt Ribosom, alle anderen Ris kommen nicht weiter.

Question 5

Ein uORF wird während Stickstoffmangel in Hefe deutlich reduziert translatiert. Welche Auswirkungen hat dies wahrscheinlich auf die Translation des stromab gelegenen Haupt-ORFs?

Answer 5

Der Haupt ORF wird dann deutlich stärker translatiert.

Question 6

Welche Möglichkeiten nutzen eu Zellen, um die Initiation der Translation zu Regulieren?

Answer 6

IRES, Zirkulation der mRNA, eIF4, PABP?, micro RNAs (Repression)