VL 10 Translation Flashcards
Was ist Translation und was wird benötigt?
-Übersetzung der gespeicherten genetischen Information(DNA) in Proteinsequenz
- benötigt wird:
- Zugang zur DNA in lesbarer Form(mRNA)
- konstanter Übersetzungsmodus(Genetischer Code)
- Adapter zur Umsetzung(tRNA)
- eine Maschine die die Übersetzung durchführt(RIbosom)
Wobble-Regel?
- Degeneration des Codes ermöglicht die Verwendung einer tRNA für mehrere Codons im Rahmen der ``Wobble´´-Regel
- Wobble Position am 5´-Ende des Anticodonloops paart mit der Base am 3´-Ende der mRNA
- Ursache -> Wobble Position hat keine Stapelinteraktion
Was sind mögliche Wobble-Paarungen?
- G mit C oder U
- U mit A oder G
- I kann mit U,C oder A
Aufbau Prokaryotisches Ribosom
-70s
Große Unterinheit(50S):
-23s+5s rRNA+ 31 Proteinen(mit L bezeichnet)
Kleine Untereinheit:
16s rRNA + 21 Proteine(mit S bezeichnet)
Positionierung der rRNA(Prokaryoten)
- RNA der 30s Untereinheit sorgt für die Positionierung des Ribosoms in der Nähe des Startcodons
- > Shine Dalgarno Sequenz
- 3´-Ende der 16s-rRNA interagiert mit SD-Sequenz
- Qualität und Zugänglichkeit der SD-Sequenz bestimmt Translationsrate
Was wirkt sich auf die Effektivität der Translation bei Prokaryoten aus?
- Positionierung und Konservierung der S/D-Sequenz
- Negativ: Sekundärstrukturen in der 5,UTR, Gehalt an seltenen Codons
Was vesteht man unter Polysomen?
-prokaryotische mRNA kann von mehreren Ribosomen gleichzeitig translatiert werden
Was geschieht bei der Peptidyltransferasereaktion?
- Aminogruppe der Aminoacyl-tRNA an der A-Stelle ersetzt die tRNA der Peptidyl-tRNA durch nucleophilen Angriff
- dadurch wird die wachsende Polypeptidkette auf die tRNA in der A-Stelle übertragen
- die tRNA an der P-Stelle ist nun unbeladen
Wie wird die Genauigkeit der Translation gewährleistet?
- kein proof reading->Ribosom erkennt keine fehlbeladenen tRNAs
- Verifizierung der Codon-Anticodon-Interaktion mittlels 16s rRNA
- Außerdem Verifizierung der Codon-Anticodon-Interaktion mittels EF-Tu
Termination Translation?
- für die Termination der Translation sind Terminationsfaktoren notwendig, die die Stopcodons erkennen: RF1-RF3(relaease factor)
- molekulare Mimikry-> Releasefaktoren ähneln tRNA
Ribosomen Aufbau Eukaryoten
-80S
- große Untereinheit(60S):
- 28S, 5S und 5,8s rRNA
- 50 Proteine(L)
kleine Untereinheit(40s)
- 18S rRNA
- 33 Proteine(S)
Grundlegende Unterschiede Translation Prokaryoten und Eukaryoten?
- Prokaryoten
- Polycistronisch-> mehrere ORFs
- interner Eintritt der Ribosomen
- > Shine Dalgarno-Sequenz
Eukaryoten:
- monocistronisch
- Scannen der Ribosomen von der Cap
- > Kozak-Sequenz
- kein formyliertes Methionin, aber trotzdem zwei tRNAs für Methionin: eins zur Initiation und eins für interne Methionine
Wie ist die eukaryotsiche mRNA geformt?Ursache und Funktion
- sie ist zirkulär
- Wechselwirkung eIF4G und Poly-A-Bindeprotein
- erhöht Translationsrate
Welche Vorteile hat der Ringschluss von Polysomen?
Erhöht die Translationsrate
- Nur mRNAs, die vollständig sind, also eine Kappe und einen PolyA-Schwanz haben, werden effektiv
translatiert.
Warum ist das Ribosom ein Ribozym
-Peptidyltransferase wird durch 23s rRNA durchgeführt