VL 10 Translation Flashcards

1
Q

Was ist Translation und was wird benötigt?

A

-Übersetzung der gespeicherten genetischen Information(DNA) in Proteinsequenz

  • benötigt wird:
  • Zugang zur DNA in lesbarer Form(mRNA)
  • konstanter Übersetzungsmodus(Genetischer Code)
  • Adapter zur Umsetzung(tRNA)
  • eine Maschine die die Übersetzung durchführt(RIbosom)
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2
Q

Wobble-Regel?

A
  • Degeneration des Codes ermöglicht die Verwendung einer tRNA für mehrere Codons im Rahmen der ``Wobble´´-Regel
  • Wobble Position am 5´-Ende des Anticodonloops paart mit der Base am 3´-Ende der mRNA
  • Ursache -> Wobble Position hat keine Stapelinteraktion
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3
Q

Was sind mögliche Wobble-Paarungen?

A
  • G mit C oder U
  • U mit A oder G
  • I kann mit U,C oder A
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4
Q

Aufbau Prokaryotisches Ribosom

A

-70s

Große Unterinheit(50S):
-23s+5s rRNA+ 31 Proteinen(mit L bezeichnet)
Kleine Untereinheit:

16s rRNA + 21 Proteine(mit S bezeichnet)

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5
Q

Positionierung der rRNA(Prokaryoten)

A
  • RNA der 30s Untereinheit sorgt für die Positionierung des Ribosoms in der Nähe des Startcodons
  • > Shine Dalgarno Sequenz
  • 3´-Ende der 16s-rRNA interagiert mit SD-Sequenz
  • Qualität und Zugänglichkeit der SD-Sequenz bestimmt Translationsrate
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6
Q

Was wirkt sich auf die Effektivität der Translation bei Prokaryoten aus?

A
  • Positionierung und Konservierung der S/D-Sequenz

- Negativ: Sekundärstrukturen in der 5,UTR, Gehalt an seltenen Codons

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7
Q

Was vesteht man unter Polysomen?

A

-prokaryotische mRNA kann von mehreren Ribosomen gleichzeitig translatiert werden

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8
Q

Was geschieht bei der Peptidyltransferasereaktion?

A
  • Aminogruppe der Aminoacyl-tRNA an der A-Stelle ersetzt die tRNA der Peptidyl-tRNA durch nucleophilen Angriff
  • dadurch wird die wachsende Polypeptidkette auf die tRNA in der A-Stelle übertragen
  • die tRNA an der P-Stelle ist nun unbeladen
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9
Q

Wie wird die Genauigkeit der Translation gewährleistet?

A
  • kein proof reading->Ribosom erkennt keine fehlbeladenen tRNAs
  • Verifizierung der Codon-Anticodon-Interaktion mittlels 16s rRNA
  • Außerdem Verifizierung der Codon-Anticodon-Interaktion mittels EF-Tu
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10
Q

Termination Translation?

A
  • für die Termination der Translation sind Terminationsfaktoren notwendig, die die Stopcodons erkennen: RF1-RF3(relaease factor)
  • molekulare Mimikry-> Releasefaktoren ähneln tRNA
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11
Q

Ribosomen Aufbau Eukaryoten

A

-80S

  • große Untereinheit(60S):
  • 28S, 5S und 5,8s rRNA
  • 50 Proteine(L)

kleine Untereinheit(40s)

  • 18S rRNA
  • 33 Proteine(S)
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12
Q

Grundlegende Unterschiede Translation Prokaryoten und Eukaryoten?

A
  • Prokaryoten
  • Polycistronisch-> mehrere ORFs
  • interner Eintritt der Ribosomen
  • > Shine Dalgarno-Sequenz

Eukaryoten:

  • monocistronisch
  • Scannen der Ribosomen von der Cap
  • > Kozak-Sequenz
  • kein formyliertes Methionin, aber trotzdem zwei tRNAs für Methionin: eins zur Initiation und eins für interne Methionine
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13
Q

Wie ist die eukaryotsiche mRNA geformt?Ursache und Funktion

A
  • sie ist zirkulär
  • Wechselwirkung eIF4G und Poly-A-Bindeprotein
  • erhöht Translationsrate
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14
Q

Welche Vorteile hat der Ringschluss von Polysomen?

A

Erhöht die Translationsrate
- Nur mRNAs, die vollständig sind, also eine Kappe und einen PolyA-Schwanz haben, werden effektiv
translatiert.

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15
Q

Warum ist das Ribosom ein Ribozym

A

-Peptidyltransferase wird durch 23s rRNA durchgeführt

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16
Q

Einzelschritte der Elongation?

A
  1. beladene tRNA besetzt A-Stelle
  2. 23s rRNA führt Peptidyltransferaseaktivität aus: überträgt vorhandene Aminosäurekette auf die neu hinzugekommene Aminosäure
  3. Ribosom rutscht drei Nucleotide weiter und die Peptidyl-tRNA in die p-Stelle
  4. unbeladene tRNA verlässt die E-Stelle und das Ribosom
17
Q

Schritte der Termination?

A
  1. A-Stelle gelangt an Stopp-codon->RF1 und RF2 besetzen A-Stelle, da es keine tRNA mit entsprechendem Anticodon gibt
  2. synthetisiertes Protein löst sich von Ribosom
  3. RF3 vermittelt Ablösung von RF1 und RF3 aus Ribosom->GTP-Verbrauch
  4. Aufspaltung des Ribosoms in die Untereinheiten