Genregulation auf Translationsebene Flashcards

1
Q

Was ist ein uORF?

A

=upstream open reading frame

  • eukaryotische Translationsregulation, die die Initiation beeinflusst
  • 35% Prozent aller Gene haben uORFs
  • reduzieren in meisten Fällen die Translation des Haupt- ORFs
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2
Q

Was sind wichtige Faktoren für den reprimierenden Einfluss von uORFs auf den ORF?

A
  • Entfernung zur Cap
  • Nähe zur MCS(main protein coding sequence)
  • Länge des uORFs
  • Anzahl der uORFs
  • Konservierung des uORFs
  • Kozak-Kontext
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3
Q

Was ist NMD?

A
  • Nonsense mediated decay of RNA
  • Abbau von RNA, die Nonsense-Mutation tragen-> vorzeitiger Translationsstopp
  • verhindert so, dass schädliche Proteine gebildet werden
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4
Q

Wie wird NMD signalisiert?

A
  • Ribosomen bleiben stromauf von einem EJC stecken
  • > EJC wird nicht entfernt-> von Terminationsfaktoren erkannt-> decapping und Abbau Exonukleasen
  • und fehlender 3´-UTR der korrekte Translationstermination ermöglicht
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5
Q

Wo sind die Komponenten von NMD lokalisiert?

A
  • in P-Bodies
  • Aggregate von nicht-translatierten RNAs
  • Komponenten der RNA-Abbau-maschinerie(Decapping,Deadenylierung,Exoribunuklease,NMD)
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6
Q

Wie wird RNA i.d.R. abgebaut?

A

1.Deadenylase entfernt Poly-A-Schwanz
2.Entweder 3´->5´-Abbau durch Exosom(Exonuklease)
oder decapping durch decapping complex und 5´->3´ Abbau durch Exonukleasen

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7
Q

Wie können Proteine abgebaut werden?

A

Ubiquitinierung

  • Ubiquitin-ligasen erkken abzubauende Proteine
  • Anhängen von Ubiquitin an Lysin
  • Proteasom schneidet ubiquitinierte Peptide
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