Rekombination Flashcards
Welche Rekombinationstypen gibt es?
- homologe Rekombination: 2 homolge Chromosomen tauschen Teile der DNA aus->Allele werden neu kombiniert
- illegitime Rekombination(Austusch nicht homologer Chromosomen loci->unequal crossover)
- sequenzspezifische Rekombination: gezielte Integration von DNA in ein Genom durch ein Enzym
(z. B. Phage λ mit Integrase) - Transposition: Transposon springt an neuen Locus
Was besagt die 3. mendelsche Regel?
- Neukombinationsgestz
- in der F2 kommt es beim dihybriden Erbgang zu neuen Kobinationen von Phänotypen, die es in der Parentalgeneration nicht gab
Wozu führt eine Testkreuzung wenn Gene auf untersch. und auf dem selben Chromosom liegen?
Dihybrider Erbgang:
zwei Gene auf untersch. Chromomosomen:
-nach Testkreuzung: hälfte der Nachkommen sieht aus als hätte sie einen der parentalen Chromosomensätze bekommen
-andere Hälfte als ob sie einen Mix der Chromosomensätze erhalten hat
(partielle) Kopplung der Allele von Genen, die auf dem gleichen Chromosom liegen:
- Parentale Phänotypen > 1/4 ->über 50%
- Rekombinanten Phänotypen < 1/4 ->unter 50%
Was bedingt die Häufigkeit des Austauschs von zwei Genen auf einem Chromosom?
- die Entfernung der Gene zueinander auf einem Chromosom
- Häufigkeit wird benutzt für Genkartierung
Was wird bei der Genkartierung gemacht?
- bestimmt die Abfolge von Genen und die relative Distanz der Gene in map units
- 1 map unit = cM(centiMorgan)=1% rekombination
- Genkartierung beruht auf Rekombinationsfrequenzen zwischen Allelen
- Rekombinationsfrequenzen zwischen Allelen sind proportional zu ihrer Distanz
RF= Zahl Rekombinater Individuen/Gesamtzahl x100
Wie lassen sich gekoppelte Gene bestimmen?
-alle Gene mit einer Rekombinationsfrequenz von unter 50% sind gekoppelt/linked
Was ist eine Kopplungsgruppe/linkage group?
-alle Gene auf einem Chromosom
Was wird bei einer Dreipunktkreuzung untersucht?
- 3 Mutante Gene auf einem Chromosom
- alle 3 mutanten Allele rezssiv
- durchgeführte Kreuzung Testkreuzung-> F1 mit Testelter gekreuzt, der für alle Loci homozygot mutant ist
Was kann bei einer Dreipunktkreuzung herausgefunden werden?
- Position der Genloci
- Entfernung der Genloci relativ zueinander
Wie geht man bei einer Dreipunktkreuzung vor?
nicht notwendig
- parentale Genotypen bestimmen(höchste Frequenz aller Phänotypenklassen
- Doppelrekombinaten bestimmen(niedrigste Frequenz)
- welcher der drei Loci hat seine Position relativ zu den anderen beiden in den Doppelrekombinanten getauscht(dieser liegt in der Mitte)
- für jede der beiden Regionen Klassen bestimmen in denen Einzelrekombination stattgefunden hat
- > Individuen summieren + Doppelrekombinanten und RF bestimmen
Was sind genetische Polymorphismen?
Beispiele
-das Vorkommen mehrerer Varianten eines Locus/Gens/Chromosoms nennt man Polymorphismus
-Restriktions Fragment Längen Polymorphismen(RFLP):
schneiden untersch. in verschiedenen Personen
- single nucleotide Polymorphismus (SNP)
- simple sequence repeats=microsatellite (SSR)
Wo geschieht das Crossing over?
- in der Phropahse 1 der Meiose
- wenn sich homologe Chromosomen zusmammenpaaren (beginnt im Zygotän)
Was ist der Synaptonemale Komplex? Wann wird er ausgebildet?
- im Zygotän und Pachytän
- filamentöse Proteine die homologen Chromosomen zusammen halten
- garantiert dass richtige Chromosomen zusammenbleiben
Initiation des Crossing overs?
- initiale DNA-Spaltung durch Spo11
- es entsteht ein DSB(double strand break)
- Spo11 wird entfernt und es kommt zur 5´-3´-Resektion durch MRX-> bis zu 1000 Nucleotide lange überhängende 3´-Enden
- DMC1 und Rad51 binden an überhängende Enden und sorgen für die Stranginvasion und Ausbildung der Holliday-junction Struktur
Auf welche Weisen kann Holliday-junction Struktur aufgelöst werden?
- abhängig von Schnittstelle(horizontal oder vertikal)
- entweder wird nur kleiner Bereich ausgetauscht( der durch die holliday-junction entstandene Hetero-duplex Bereich)
- oder ganze Chromosomenarme werden ausgetauscht
