Visualisation de la fonction du système nerveux - Cours 10 Flashcards
Quelles sont les deux principales approches pour étudier la dynamique via des marqueurs statiques?
- Observer indirectement la présence d’activité en mesurant des produits qui s’accumulent durant ou après le processus.
- Incorporer un marqueur dans les cellules. Ce dernier indique la présence d’activité dans des futurs examens histologiques.
Comment pouvons-nous évaluer l’activité neuronale dans les tissus fixés?
- L’activité neuronale induit rapidement la transcription transitoire d’un groupe de gènes connus comme les gènes précoces immédiats (immediate early genes: IEGs). Ces gènes sont activés rapidement, souvent en quelques minutes, en réponse à une activité neuronale. Cette transcription transitoire est un indicateur précoce et indirect de l’activité dans une région donnée du cerveau.
- Ces IEGs codent pour une diversité de protéines jouant des rôles clés dans la plasticité neuronale.
- Les IEGs ne donnent qu’un premier indice sur la fonction d’une région du cerveau. Ils indiquent qu’une activité a eu lieu, mais pas nécessairement pourquoi ou comment cette activité s’intègre dans le réseau neuronal. Pour aller au-delà, il faut combiner ces approches avec d’autres méthodes dynamiques ou fonctionnelles.
Donnez des exemples de protéines jouant des rôles clés dans la plasticité neuronale codées par les IEGs
- Des facteurs de transcription, comme c-fos, c-myc et c-jun, qui régulent l’expression de nombreux autres gènes.
- Des protéines interactives avec le cytosquelette, comme Arc, qui participent à la réorganisation structurelle des synapses.
- Des facteurs de croissance, comme le BDNF (brain-derived neurotrophic factor), qui favorisent la survie et l’adaptabilité des neurones.
Quelles sont les limitation de l’évaluation de l’activité neuronale dans les tissus fixés?
- Le tissu est fixé, donc ça ne reflète pas la véritable dynamique de l’activité neuronale en temps réel (arrêt sur image ou snapshot)
- L’analyse à un moment précis ne capture pas la continuité ou l’évolution des changements neuronaux. Ce que nous voyons à un instant peut ne pas refléter l’ensemble du processus ou la nature transitoire des signaux neuronaux (et ce, même si on utilise plusieurs timepoints de tissus fixés)
- Les données obtenues à partir de tissus fixés doivent être interprétées avec prudence. Il est souvent nécessaire de compléter ces résultats par d’autres types d’études, notamment des méthodes dynamiques ou fonctionnelles, pour s’assurer que les changements observés sont pertinents et bien reliés à la fonction neuronale.
Nommez des méthodes histologique pour détecter les IEGs
L’hybridation in situ
L’immunihistochimie
Comment fait-on l’hybridation in situ pour détecter les IEGs?
- Il faut connaître la séquence génétique de l’ARNm !
- Utilisation d’une sonde d’acide nucléique simple brin complémentaire à la séquence de de l’ARNm d’intérêt (antisens)
- La sonde doit être marquée pour pouvoir la voir (nucléotides radioactifs, etc).
- Incuber la sonde avec le tissu: la sonde ira s’hybrider avec notre ARNm d’intérêt
Utilisation du Allen Brain Atlas
Comment fait-on l’immunohistochimie pour détecter les IEGs?
L’immunohistochimie (IHC) est une technique essentielle pour détecter les gènes précoces immédiats (IEGs) dans les tissus fixés. Cette méthode repose sur l’utilisation d’anticorps pour localiser et visualiser des protéines spécifiques associées à l’activité neuronale.
Détection :
* IHC directe: l’anticorps primaire est conjugué avec un fluorophore/enzyme chromogénique
* IHC indirecte: utilisation d’un anticorps secondaire conjugué avec un fluorophore/enzyme chromogénique
Amplification de signal: c’est quand plus d’un anticorps secondaire peut reconnaitre l’anticorps primaire
- Molécules rapportrices: fluorophores, phosphatase alcaline, peroxydase, etc.
Quel est un marquer de l’activité dans le cortex visuel?
L’immunoréactivité de c-Fos
Comment peut-on évaluer la prolifération cellulaire ?
Incorporation d’un marqueur dans les cellules
Utilisation des analogues de la thymidine
Expliquez comment se fait l’évaluation de la prolifération cellulaire avec des analogues de la thymidine
- Le Bromodésoxyuridine (BrdU), ou 5-bromo-2’-désoxyuridine, est un nucléoside analogue synthétique de la thymidine. C’est un outil largement utilisé pour détecter la prolifération cellulaire dans les tissus vivants.
- Lorsque les cellules se divisent, elles répliquent leur ADN. Pendant ce processus, le BrdU peut être intégré dans l’ADN à la place de la thymidine. Cela signifie que les cellules qui incorporent le BrdU sont en phase de synthèse (phase S) du cycle cellulaire, ce qui indique une prolifération active.
- Cette technique est particulièrement précieuse en neurosciences pour étudier des phénomènes comme la neurogenèse, où de nouvelles cellules sont produites dans des régions spécifiques du cerveau. Après l’incorporation du BrdU, on peut utiliser des méthodes comme l’immunohistochimie pour détecter sa présence et localiser précisément les cellules en division.
- En comparant la structure chimique de la thymidine naturelle et du BrdU, on remarque que la seule différence est le remplacement d’un groupe méthyle par un atome de brome, ce qui rend le BrdU détectable sans perturber significativement la réplication de l’ADN.
Quelles sont les étapes principales pour détecter la prolifération cellulaire en utilisant le BrdU?
- Incorporation du BrdU : Le BrdU est incorporé dans l’ADN en cours de réplication à la place de la thymidine naturelle.
- Fixation et dénaturation : Après l’incorporation, les cellules ou tissus sont fixés pour préserver leur structure. L’ADN est ensuite dénaturé (par exemple, avec de la chaleur ou des agents chimiques) pour exposer le BrdU incorporé.
- Liaison des anticorps : Un anticorps spécifique dirigé contre le BrdU est appliqué. Si on utilise un anticorps primaire non conjugué, un anticorps secondaire marqué (par un fluorophore ou une enzyme) est ensuite ajouté.
- Détection colorimétrique ou fluorescence : Le signal est visualisé soit par fluorescence (comme montré ici en vert avec l’anti-BrdU) soit par une réaction enzymatique produisant un changement coloré détectable (IHC, Elisa)
Comment le BrdU peut-il est administré?
Le BrdU peut être administré de plusieurs façons: par injection (IP, IV, dans les ventricules du cerveau, etc.), administration orale (eau, nourriture).
Avec quoi compare-t-on les cellules BrdU positives ?
Les cellules BrdU positives peuvent être comparées avec celles marquées avec un anticorps contre Ki67, un indicateur de prolifération cellulaire.
Pourquoi le marquage BrdU est différent?
- Le marquage BrdU identifie les cellules qui étaient en division active à un moment spécifique (Phase S), correspondant à la période d’exposition au BrdU.
- Ki67 est une protéine nucléaire exprimée dans toutes les phases actives du cycle cellulaire (G1, S, G2 et M) mais absente en phase G0 (repos). Le marquage reflète donc toutes les cellules en prolifération active, pas uniquement celles en phase S.
Donnez une alternative à l’utilisation de BrdU
Le 3H-thymidine (radioactive tritiated thymidine) peut être utilisé pour marquer le nouvel ADN.
Donnez des exemples expliquant que la taille du cerveau des oiseaux varie en fonction des saisons
- Au mois de mars, après un long hiver pendant lequel les oiseaux sont peu actifs et chantent moins, leurs cerveaux étaient plus petits, et il y avait une moindre survie neuronale.
- À la fin de l’été, lorsque les oiseaux sont beaucoup plus actifs et chantent intensément, la taille de leur cerveau augmentait considérablement.
En quoi le centre vocal élevé (HVC) est essentielle pour les oiseaux chanteurs?
- L’apprentissage des chansons.
- La modulation de leur structure.
- La plasticité neuronale nécessaire pour produire ces chansons complexes.
Quelle a été l’hypothèse de Dr. Nottebohm?
Le changement de taille observé pourrait être dû à une prolifération neuronale chez les oiseaux adultes.
Quels ont été les résultats de l’expérience de Dr. Nottenohm dans le HVC?
- Le nombre de neurones marqués par BrdU était significativement plus élevé dans le groupe chanteur par rapport au groupe non chanteur (p < 0,005).
- Cela montre que le chant favorise la prolifération neuronale dans cette région liée à la production et à l’apprentissage des chansons.
Quels ont été les résultats de l’expérience de Dr. Nottenohm dans le l’hippocampe (contrôle)?
- Aucune différence significative dans le marquage BrdU n’a été observée entre les deux groupes.
- Cela indique que la prolifération neuronale observée est spécifique au HVC et liée à l’activité de chant.
Sur quoi repose la visualisation de l’activité neuronale ?
Sur la mesure des signaux électriques ou chimiques associés à cette activité
Quels sont les deux aspects clés souvent explorés lors de la visualisation de l’activité neuronale?
Les changement de voltage et les changements de calcium, qui reflètent des processus critiques dans les neurones
Qu’utilisons-nous pour visualiser les changements de voltage?
Marqueurs sensibles au voltage
Qu’utilisons-nous pour visualiser les changements de calcium?
Marqueurs ratiométriques
Marqueurs non-ratiométriques
Senseurs de calcium génétiquement encodés
Expliquez comment on peut visualiser l’activité neuronale avec l’électrophysiologie et ses limitations
Le patch-clamp est la technique de référence pour la mesure des signaux neuronaux.
Avec cette technique, on peut enregistrer à partir d’un neurone ou d’un petit circuit comprenant peut-être deux ou trois neurones.
Il est presque impossible d’étendre cette méthode à un réseau neuronal plus vaste pour capturer l’activité d’un grand nombre de cellules en temps réel.
En pratique, si nous plaçons une pipette pour enregistrer l’activité d’un neurone, il devient rapidement difficile d’ajouter davantage de pipettes pour couvrir un circuit entier.
Quel est le principe des marqueurs sensibles au voltage?
- Utilisation de fluorophores qui changent leur capacité d’absorption ou d’émission de fluorescence en réponse aux variations du potentiel membranaire d’un neurone.
- Ces changements sont associés à l’ouverture et la fermeture des canaux ioniques.
- Cette technique offre une résolution temporelle fine, permettant d’observer les fluctuations rapides du potentiel membranaire, comme les potentiels d’action ou les courants sub-seuil.
Quelles sont les application des marqueurs sensibles au voltage?
- Les MSV permettent de cartographier l’activité neuronale à un niveau précis et de comprendre comment les changements de voltage sont associés à des processus comme l’ouverture et la fermeture des canaux ioniques.
- Ces outils sont particulièrement utiles pour étudier la dynamique de réseaux neuronaux complexes.
Quelle est la variété de marqueurs possibles sensibles au voltage?
Il existe de nombreux marqueurs sensibles au voltage, chacun ayant des propriétés spécifiques, comme:
* La durée du signal: certains sont adaptés à des changements rapides, d’autres à des processus plus lents.
* Le bruit de fond: un signal clair est essentiel pour éviter des interprétations erronées.
* La toxicité : les marqueurs les plus efficaces sont ceux qui ont un impact minimal sur la viabilité des cellules.
Quels sont les avantages des MSV?
- Ils offrent une approche non invasive et plus globale que les pipettes électrophysiologiques.
- Bien que similaires aux techniques électrophysiologiques classiques dans leur précision, ils permettent une analyse simultanée de plusieurs neurones, ce qui est crucial pour comprendre les interactions dans des réseaux neuronaux
Nommez un marqueur très sensible et fiable pour détecter les fluctuations de voltage.
La mérocyanine