Fabrication et utilisation des organismes transgéniques - Cours 12 Flashcards
Pourquoi dit-on que les humains sont des sujets expérimentaux terribles?
- Ils sont génétiquement hétérogènes.
- Il y a des différences environnementales.
- La reproduction est lente avec peu de progéniture.
- Ils vivent trop longtemps (pour la recherche!).
- Ils sont réticents à donner des tissus ou à être injectés avec des toxines.
Quelles sont les caractéristiques communes des organismes modèles?
- Croissance et développement rapides
- Petite taille chez l’adulte et/ou facilité de manipulation
- Anatomie relativement simple
- Facilité de production (aménagements, coûts des opérations, etc.)
- Manipulable génétiquement (génétique directe et réverse simples)
- Outils de génétique moléculaire disponibles (e.g. transgénèse)
- Génome séquencé et annoté
- Multiples ressources (banques de données, collection de mutants, etc.)
Quels sont les organismes modèles invertébrés importants en neurobiologies?
Caenorhabditis elegans (nématode)
Drosophila melanogaster (mouche à fruit)
Quels sont les organismes modèles vertébrés importants en neurobiologies?
Xenopus laevis (xénope)
Rattus norvegicus (rat)
Danio rerio (poisson zèbre)
Mus musculus (souris domestique)
Macaca mulatta (macaques rhésus)
Quels sont les avantages du C. elegans?
- Invariance anatomique et petit nombre de cellules: Permet l’identification de toutes les cellules de l’animal.
- Transparence, simplicité, vitesse et invariance du développement: Permet la description du lignage cellulaire complet.
- Système nerveux entièrement reconstruit par sections de microscopie électronique.
- Génétique: petite taille, développement rapide, reproduction par autofertilisation et croisement facultatif pour faciliter les analyses génétiques.
- Analyse moléculaire: génome séquencé et bien aligné en cartes génétiques, permet un progrès rapide des analyses moléculaires génétiques
Qu’est-ce qu’un lignage cellulaire?
Séries reproductibles des divisions cellulaires par lesquelles un œuf fertilisé produit un adulte, marqueur à haute résolution du sort cellulaire.
Qu’est-ce qu’un promoteur?
Formé de séquences d’ADN spécifiques reconnues par des facteurs de transcription, qui sont recrutés, avec l’ARN polymérase, sur le site pour initier la transcription.
* Situé juste en amont du gène (proche du site de démarrage de la transcription).
* Adjacent au site de liaison de l’ARN polymérase.
* Il est responsable de l’initiation basale de la transcription.
* Détermine où, quand et dans quelles conditions un transgène sera exprimé.
Qu’est-ce qu’un amplificateur?
Ce sont des séquences d’ADN régulatrices qui, lorsqu’elles sont liées par des protéines spécifiques, appelées activateurs, améliorent la transcription du gène associé
* Peut être situé à distance du gène (en amont, en aval ou même dans un intron).
* Peut fonctionner à des milliers de paires de bases du promoteur.
* Augmente la transcription en recrutant des facteurs de transcription activateurs et des co-activateurs.
* Augmente l’expression du transgène sous le contrôle du promoteur.
Qu’est-ce qu’un inactivateur?
C’est une séquence d’ADN qui peut se lier à des facteurs de régulation de la transcription, appelés répresseurs.
- Similaire aux amplificateurs, il peut être positionné à distance du gène (en amont, en aval ou dans un intron).
- Peut également être intégré près du promoteur pour bloquer directement la transcription.
- Diminue ou inhibe l’expression génique en recrutant des facteurs de transcription répresseurs ou en bloquant l’accès de l’ARN polymérase.
Pourquoi ajouter un amplificateur?
1- Pour booster l’expression dans des tissus spécifiques sans modifier le promoteur.
2- Pour surmonter les limitations dues à une faible activité intrinsèque du promoteur choisi.
Pourquoi ajouter un inactivateur?
1- Pour éviter une expression hors cible du transgène dans des tissus indésirables.
2- Pour limiter l’activité des amplificateurs ou promouvoir un contrôle spatio-temporel précis.
Comment faire un modèle transgénique?
- Tout gène exprimé dans un animal qui ne porte pas normalement ce gène est appelé un transgène, et tout animal qui porte cet ADN étranger est appelé un organisme transgénique.
- Il existe aujourd’hui des dizaines de transgènes couramment utilisés qui peuvent être utilisés pour répondre à diverses questions expérimentales.
- Les scientifiques peuvent injecter ces transgènes dans des embryons pour créer des lignées transgéniques d’animaux qui passeront le transgène à leur descendance (lignée stable).
- Sinon, ces transgènes peuvent aussi être introduits directement dans des cellules ou des régions du cerveau.
Expliquez le processus de fabrication d’une mouche transgénique
- Le processus de fabrication d’une mouche transgénique utilise le système de transposons.
- Un transposon, ou élément transposable, est une séquence d’ADN capable de se déplacer d’un endroit à un autre dans le génome. Ces séquences sont comme des “copier-coller” ou des “couper-coller” d’ADN, offrant une flexibilité génétique.
- Ils ont une sélectivité modérée, ce qui signifie qu’ils peuvent s’insérer dans différents sites du génome, souvent de façon aléatoire. Cette propriété est utile pour explorer différentes régions du génome.
- Les transposons les plus couramment utilisés chez la Drosophile sont appelés éléments P.
Qu’est-ce qu’est l’élément P?
- L’élément P est un transposon, une séquence d’ADN capable de se déplacer d’un endroit à un autre dans le génome grâce à une enzyme spécifique appelée transposase.
- Ce transposon a été modifié pour être utilisé en génie génétique afin d’introduire des transgènes dans le génome des mouches.
- L’élément P est utilisé pour insérer des gènes d’intérêt (par exemple, un gène rapporteur comme GFP).
Quelles sont les étapes importantes du processus d’introduction des transgènes dans le génome des mouches avec l’élément P?
- Reconnaissance par la transposase
- Découpage de l’élément P
- Insertion dans un nouvel emplacement
- Réassemblage de l’ADN
Qu’est-ce qui sera présent dans l’injection pour faire des mouches transgéniques?
- La construction transgénique (Il s’agit d’un élément P modifié contenant le transgène).
- Le plasmide codant la transposase
Pourquoi injecte-t-on également la transposase?
Parce que L’élément P modifié ne peut pas produire sa propre transposase, ce qui le rend incapable de bouger sans aide externe.
Où est réaliser l’injection pour faire des mouches transgéniques?
Dans la région postérieure de l’embryon, car c’est là que se situent les cellules germinales en développement, qui donneront naissance aux gamètes.
Comment faire des vers transgéniques?
- Les techniques pour créer des vers transgéniques sont similaires conceptuellement à celles utilisées pour les mouches :
1- Une construction transgénique est introduite dans l’organisme, et cette construction est intégrée ou exprimée de manière stable.
2- Cependant, au lieu d’injecter des embryons, on injecte directement les gonades du ver, où se trouvent les cellules germinales. - Une différence importante avec la mouche est que les vers sont hermaphrodites et capables de produire leurs propres œufs fécondés.
- Chez C. elegans, le transgène peut rester sous forme de copie libre extrachromosomale au lieu d’être inséré dans le génome. Ces copies libres sont stables dans certaines lignées mais peuvent être perdues avec le temps.
Quand est où est injecter le transgène chez le C. elegans?
Un transgène est injecté dans la gonade d’un hermaphrodite jeune adulte au moment où les embryons se divisent.
Comment savoir où un gène est exprimé ?
Le classique: avec de la fluorescence
- dpy-5 est un gène du procollagène de la cuticule.
- Les vers porteurs de mutations dans dpy-5 présentent une morphologie “Dumpy” (corps court et trapu) en raison de défauts dans la cuticule.
- Cela en fait un excellent modèle pour tester si un transgène peut restaurer la fonction perdue.
Expérience de sauvetage du phénotype.
Les deux constructions transgéniques sont co-injectées.
L’utilisation de la GFP permet de s’assurer que l’injection est un succès (marqueur de co-injection).
Le ver transgénique est de type sauvage avec dpy-5 (+/+) et le GFP.
Comment contrôler quand et où un gène est exprimé ?
Les gènes du choc thermique (comme les protéines HSP, ou Heat Shock Proteins) sont activés en réponse à un stress environnemental, tel que :
* Stress thermique (augmentation de la température).
* Stress oxydatif.
* Stress chimique.
Cette activation est régulée par un facteur de transcription appelé HSF1:
* En conditions normales, HSF1 est inactif.
* Lors d’un stress, HSF1 est activé, se lie à l’ADN au niveau du promoteur des gènes de choc thermique, et déclenche leur expression.
Permet une expression:
* Temporelle : L’expression du transgène ne se produit qu’en réponse à une augmentation de la température.
* Réversible : Une fois le stress thermique éliminé, l’expression du gène diminue.
Qu’est-ce que la Channelrhodopsine-2 (ChR2)?
- Une opsine qui permet l’entrée de cations (Na+, Ca2+) dans le neurone lorsqu’elle est exposée à une lumière bleue (∼470 nm).
- Résultat : dépolarisation de la membrane neuronale, entraînant l’activation du neurone (potentiel d’action).
Qu’est-ce que l’Halorhodopsine (NpHR) ?
- Une opsine activée par une lumière jaune (∼590 nm) qui permet l’entrée d’ions chlorure (Cl⁻) dans le neurone.
- Résultat : hyperpolarisation de la membrane, inhibant l’activité neuronale.
Quel est le rapporteur de l’activation inductible de l’activité neuronale?
Channelrhodopsin-2: activation des neurones mécanosensoriels
* mec-4 code pour un canal Na+, qui est exprimé dans les neurones mécanosensoriels.
* Ainsi, le promoteur mec-4 peut être utilisé pour exprimer des gènes spécifiquement dans les neurones mécanosensoriels.
Activer les neurones mécanosensoriels avec la lumière provoque des changements de direction des animaux