Virologie Flashcards
Nommez 5 familles de virus à ADN
- Parvoviridae (parvovirus B19)
- Papillomaviridae (VPH)
- Polyomaviridae (BK et JC)
- Adenoviridae (adénovirus)
- Hepadnaviridae (HBV)
- Herpesviridae (HSV-1, HSV-2, VZV, EBV, CMV, HHV-6, HHV-7, HHV-8)
- Poxviridae (variole, vaccine, Mpox, orf virus)
Nommez 5 familles de virus non enveloppés
- Parvoviridae
- Papillomaviridae (VPH)
- Polyomaviridae (BK et JC virus)
- Adenoviridae (Adenovirus)
- Picornaviridae (Enterovirus, Poliovirus, Rhinovirus, HAV)
- Reoviridae (Rotavirus)
- Caliciviridae (Norovirus)
- Hepeviridae (HEV)
Quelle est la durée d’incubation moyenne du norovirus?
24h (min 1.2h up to 48h)
Quelle est la durée d’incubation moyenne du Rhinovirus?
2-3 jours
Nommez 5 virus de la famille Paramyxoviridae
- Oreillons
- Rougeole
- Parainfluenza 1 à 4
- Nipah
- Hendra
Incubation Oreillons (Mumps) and period of communicability
- 14-25 jours, moyenne 16-18 jours
- 2 days before and up to 5 days after onset of parotid swelling (selon PHAC)
Quelle est la protéine virale d’attache du VIH? À quelle protéine humaine s’attache-t-elle?
2 corecepteurs
- GP120 (VIH-1)
- CCR5 puis CXCR4
S’attachent au récepteur CD4
Quelle est la protéine virale d’attache du SARS-COV-2? À quelle protéine humains s’attache-t-elle?
-Spike protein
-ACE2
Quelle est la protéine virale d’attache de l’influenza? À quelle protéine humains s’attache-t-elle?
-Hémagglutinine
-Récepteurs contenant de l’acide sialique
Nommer 4 causes expliquant un HBsAg positif isolé chez un patient n’ayant pas d’infection à HBV
- Période fenêtre / infection très aigue (mais serait une infection alors)
- Faux positif (surtout en grossesse)
- Vaccin Hép B récent (dans le 1er mois)
- Contamination du tube testé
Nommer 6 causes d’anti-HBc isolés
- Faux positif
- Période fenêtre (IgM anti-HBc détectacles)
- Hép B occulte
- Perte des anti-HBs
- S/P IVIG récentes
- Mutation de l’HBsAg le rendant indétectable)
- Transmission transplacentaire
- Hépatite fulminante
Nommer 5 indications cliniques de faire un PCR HHV-6 et sur quel spécimen le faire dans chaque cas
- Encéphalite post allo-GMO sur LCR
- Méningoencéphalite ou encéphalite chez l’enfant, sur le LCR
- Suspicion d’infection aigue chez l’enfant avec présentation atypique, sur le sérum ou le plasma
- Réactivation chez un allo-GMO sur le sérum ou plasma
- Retard de prise de greffon en GMO, sur le sang
Quels sont les trois conditions qui permettent d’arrêter le traitement d’un SOT avec une maladie à CMV?
- Résolution des symptômes
- TAAN CMV sanguin négatif
- Minimum 2 semaines de traitement sont complétées
Dans le CMV:
Lorsque la mutation UL97 est présente, à quel antiviral confère-t-elle une résistance?
Au Ganciclovir
UL54 est une mutation moins fréquente qui confère de la résistance au ganciclovir, mais peut également rendre résistant au cidofovir et au foscarnet.
Quelle est la période d’incubation et de contagiosité de la rougeole (Measles, Rubeola)?
-Incubation : 7-18 days to onset of fever, rarely as long as 21 days
- Contagiosité : 5 days before onset of rash (1 – 2 days before symptom onset) until 4 days after onset of rash
Délai pour débuter ART avec PJP?
Start ART within 2 weeks of starting treatment for PJP.
Délai pour débuter ART avec TB pulmonaire?
Dans les 2 semaines si pas d’atteinte SNC (Can TB standards)
What is ibalizumab and how does it work?
Anti HIV medication, long acting, given IV every 2 weeks.
Genitically engineered monoclonal antibody that prevents HIV fusion (CD4 post-attachment inhibitor)
What is fostemavir and how does it work?
Anti HIV medication
GP120 attachment inhibitor (attaches to region of gp120, blocking binding of gp120 to CD4)
What is lenacapavir and how does it work?
Anti HIV medication, injectable long acting
Capside inhibitor
What is the definition of an incomplete virological response (HIV)?
Two consecutive plasma HIV-RNA levels ≥200 copies/mL after 24 weeks on an ARV regimen in a patient who has not yet had documented virologic suppression on that regimen.
What is the definition of virological failure in a HIV patient?
The inability to achieve or maintain suppression of viral replication to HIV-RNA level <200 copies/mL.
2 entérovirus associés à la paralysie flasque chez l’enfant?
Entérovirus A71
Entérovirus D68
Quels sont les critères Dx d’un MIS-C de l’OMS?
- Âge 0-19 ans
- Fièvre > 3 jours
- Signe d’atteintes multisystémiques (au moins 2), soit :
- Rash, conjonctivite bilatérale non purulente, inflammation muco-cutanée
- HypoTA ou choc
- Dysfonction cardiaque, péricardite, atteinte valvulaire ou coronarienne
- Coagulopathie (PT ou PTT augmentés ou D-dimères élevés)
- Sx GI aigus
- Marqueurs inflammatoires élevés
- Pas d’autre cause infectieuse évidente
- Infection à SaRs-COV2 prouvée, soit :
- PCR positif
- Sérologie positive
- Test antigénique positif
- Contact avec patient positif à la covid
Quels sont les 7 rôles de la surveillance de l’influenza par l’ASPC?
L’étendue géographique de la présence de l’influenza
Les résultats d’influenza positifs obtenus dans les labos
Surveillance syndromique
Surveillance des évènements adverses sévères
Caractérisation des souches d’influenza en circulation et leurs résistances
Surveillance de la vaccination
Quelle classe d’ARV est particulièrement associée à une prise de poids?
Les INI (inhibiteurs de l’intégrase) soit:
- Raltégravir
- Dolutégravir
- Bictegravir
Le TAF est aussi associé ++ à prie de poids, surtout quand combiné avec II.
Quel est le mécanisme d’action du Fostemsavir?
Inhibiteur d’entrée via l’inhibition de la liaison au GP120 (inhibition de l’attachement)
Quel est le mécanisme d’action du ganciclovir?
Inhibition de la synthèse de l’ADN via inhibition de l’ADN polymérase virale. Nécessite phosphorylation par UL97 pour être actif.
Qui sont les groupes de patients les plus à risque d’infection transfusionnelle à CMV?
- Foetus necessitant une transfusion inutero
- Femme enceinte CMV -
- Allo-GMO CMV -
Quelle est la seule indication de donner une transfusion de culot CMV négatif testé par sérologie?
Transfusion inutero
Nommer 2 médicaments indiqués pour le traitement de l’influenza au Canada, mais qui sont donnés par une autre voie qu’orale.
Zanamivir inhalé
Peramivir IV
Ce sont tous des deux inhibiteurs de la neuraminidase.
Oseltamvir n’est disponible que via voie orale.
Baloxavir n’est pas disponible au Canada et n’est disponible que par la voie orale. C’est un inhibiteur de l’endonucléase.
Quelles sont les deux mutations qui expliquent la résistance du HSV à l’acyclovir?
- Mutation de la thymidine kinase (UL23)
- Mutation de l’ADN polymérase (UL30)
Quelles sont les personnes à risque de varicelle grave (en nommer 4)?
- Nnés d’une mère qui a fait varicelle dans les 5 jours pré-accouchement ad 48h PP.
- Prématurés de moins de 28 sem en USIP (néonat)
- Femme enceinte susceptible
- Immunosupprimé susceptible
- HSCT (GMO), peu importe leur statut post-greffe
Nommer 4 virus différents qui font partie de la famille Paramyxoviridae.
- Virus parainfluenza humain 1 à 4
- Virus des Oreillons
- Virus de la Rougeole
- Virus Nipah
- Virus Hendrah
Quel est le mécanisme d’action du foscarnet contre le VIH et contre les Herpesviridae?
Pyrophosphate analogue :
VIH : Inhibiteur de la transcriptase inverse
Herpesviridae: Inhibiteur de l’ADN polymérase
À part le VIH, quels autres virus (5) sont couverts par le Foscarnet?
- HSV
- VZV
- CMV
- HHV-6
- EBV
Nommez 9 Flaviviridae communs
- Hepatite C
- VNO/WNV
- Dengue
- Zika
- Fièvre jaune
- Encéphalite japonaise
- Encéphalite St-Louis
- Tick born encephalitis
- Powassan
Nommez 2 Filoviridae
- Ebola
- Marburg
Nommez 5 Togaviridae
- Chikungunya
- EEE
- EEO
- Venezuelan equine encephalitis
- Sindbis
Nommez 2 Arenaviridae, et leur réservoir naturel.
- Lassa
- Lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV)
- Both have rodents as reservoir.
Quelle est la famille de l’Influenza?
Orthomyxoviridae
Nommez 3 Picornaviridae
- Entérovirus
- Rhinovirus
- Hépatite A
- Parechovirus
Nommez 4 Retroviridae
- HIV-1
- HIV-2
- HTLV-1
- HTLV-2
Quelle est la famille du Rotavirus?
Reoviridae
Quelle est la famille de l’hépatite E?
Hepeviridae
Quelle est la famille du Norovirus?
Caliciviridae
Nommez 4 Bunyavirales
- California serogroup (Lacrosse, Showshoe hare, etc)
- Hantavirus
- Hémorragique Crimée-Congo
- Phlébovirus (Rift valley fever)
- Lassa
Les Oreillons et la Rougeole sont des Paramyxoviridae, mais la Rubéole est un _________.
- Matonaviridae
Nommez 2 Pneumoviridae.
- RSV
- Metapneumovirus
Dans quelle famille est le Lyssavirus?
- Rhabdoviridae
Quels sont les 2 types d’Influenza A les plus prévalants au Canada en 2023?
H1N1
H3N2
Inhibiteur de neuramidase IV pour traitement de l’influenza.
Peramivir
Zanamivir peut aussi être donné IV (mais majoritairement inhalé, expérimental, pas dispo canada)
Mode d’action du baloxavir
Inhibiteur de l’endonucléase cap-dépendant - actif contre les souches résistantes aux inhibiteurs de neuramidase!
Que cause le parapoxvirus?
Maladie de Orf (lésions anulaires cutanées chez fermiers)
Durée d’incubation, période de contagiosité et type d’isolement pour les Oreillons (Mumps).
- Incubation moyenne 16-18 jours, peut aller de 2 à 4 semaines (iso 10 jours post premier contact ad 26 jours post dernier contact)
- Contagiosité 2 jours avant et 5 jours après parotidite
- Isolement gouttelettes
What would be in your differential of parotiditis (mumps/oreillons)?
Parainflu3, coxsackie, influA, primary HIV, eosinophilic parotitis, Sjogren, Sarcoid
Complications de la rougeole (measles) (4)
Pneumonie (virale ou surinfection bactérienne)
Encéphalite aigue (durant la phase de convalescence)
Enzymite hépatique
Pan-encéphalite sclérosante subaigue (SSPE)
Diarrhée
Otite
Traitement de la rougeole
- Vitamine A
- Ribavirine pour cas sévères
Quelles sont les manifestations cliniques spécifiques du HHV6 chez les GMO?
- Encéphalite limbique (surtout chez GMO de sang cordon)
- Hépatite à cellule géante, colite, duodénite
- Possible suppression de la moelle osseuse et délai de prise du greffon
What are the usual subtypes of adenovirus causing GI symptoms? And causing keratoconjunctivitis?
40 and 41
8 and 19
Nommez 5 virus dans la famille paramyxoviridae
- Parainfluenza 1-4
- Rougeole
- Oreillons
- Nipah
- Hendra
Durée d’incubation, période de contagiosité et type d’isolement pour la rubéole (rubella).
- Incubation 14-21 jours (iso 7 jours post premier contact ad 21 jours post dernier contact)
- 7 jours avant et 7 jours après l’apparition du rash
- Gouttelettes
Durée et type de précautions pour rubéole congénitale.
- Jusqu’à l’âge de 1 an, unless nasopharyngeal and urine cultures done after 3 months of age are negative.
- Gouttelettes ET contact
2 tx de 1ere ligne pour HBV.
- TAF/TDF
- Entecavir (guanosine analogue)
5 présentations cliniques de la Poliomyélite.
- Abortive
- Non paralytique
- Paralytique spinale
- Bulbaire
- Polioencéphalite
Est-ce que l’atteinte de la Poliomyélite est plus:
- proximale ou distale
- ascendante ou descendante
- symétrique ou asymétrique?
Proximale (MI > MS)
Ascendante
Asymétrique