Bactériologie Flashcards
Nommez 4 types d’infections impliquant du biofilm excluant les KT/corps étranger
- Sinusite chronique
- Infections chroniques à Staph coag neg
- Pneumonies à S. maltophilia ou B. cepacia complexe
- Infection urinaire à Proteus sp (calculs de struvite)
- Infection pulmonaire à M. pneumoniae
- Infection périodontiques
Quels sont les mécanismes d’action du biofilm qui affectent les antibiotiques?
- Altère l’efficacité des cellules immunitaires à combattre l’infection (notamment les phagocytes)
- Métabolisme plus bas dans les bactéries dans le biofilm donc les ATB ciblant la réplication sont moins efficaces
- Diminue l’efficacité antibiotique et sa pénétration au sein du biofilm en :
1. pH plus bas au sein du biofilm
2. Expression aussi des facteurs de résistance au sein du biofilm
What are the 2 toxins released by S.aureus causing scalded skin syndrome?
- Exfoliative toxin A
- Exfoliative toxin B
Nommer 3 espèces du B. cepacia complex pouvant entraîner des surinfections/exacerbations de FKP et nommer 2 milieux sélectifs permettant de les isoler.
Espèces:
- Cenocepacia
- Multivorans
- Vietnamiensis
- Gélose PC (Pseudomonas cepacia)
- Gélose BCSA (Burkholderia cepacia selective agar)
5 indication de faire une prophylaxie à morsure de tique
Tique ixodes
Dans une région où Lyme hyper-endémique
Tique attachée plus de 36h
Patient se présentant <72h
Pas de CI à la doxy
Quel est l’agent étiologique et le vecteur du typhus des brousailles/scrub typhus?
Orientia tsutsugamushi, mite borne
Quel est l’agent étiologique et le vecteur du typhus endémique/murine typhus?
Rickettsia typhi, flea borne
Nommer les causes les plus fréquentes d’adénite granulomateuse (chronique) chez l’enfant.
NTM, surtout MAC
Bartonella henselae
Toxoplasma?
Actino?
Quelles sont les manifestations cliniques extrapulmonaires du M. pneumoniae?
Hémolyse
Atteinte SNC:
- Encéphalite
- Méningite
- ADEM
- Neuropathie périphérique
Mucosite à mycoplasme (SJS-like)
Atteinte cardiaque :
- Myocardite
- Péricardite
Hépatite
Nommer 4 voies de pathogenèse d’abcès hépatique.
- Biliaire (obstruction biliaire)
- Contiguité (pneumonie base D/abcès pulm)
- Trauma pénétrant
- Portal
- Systémique (via artère splénique)
Quel sinus est le plus susceptible d’être infecté et d’être la cause de la cellulite orbitaire?
Sinus ethmoïde
Quels 5 signes à l’examen physique sont indicatifs d’une cellulite orbitaire plutôt que d’une cellulite pré-septale?
- Proptose
- Douleur aux MEO
- Ophtalmoplégie (ou limitation aux MEO)
- Déficit pupillaire afférent
- Diminution de l’acuité visuelle
- Diplopie
Nommer 5 Staphylococcus à l’espèce qui peuvent causer des maladies chez l’humain mais qui proviennent d’animaux (et nommer les animaux d’où ils proviennent)
- S. schleiferi: chien
- S. intermedius: chien
- S. sciuri: boeuf
- S. pseudintermedius: chien
- S. hyicus: cochon
Nommer les avantages de la sérologies à 2 volets modifiée (EIA suivi d’un autre EIA) plutôt que la sérologie à deux volets standards (EIA puis immuno-empreinte IgM et IgG) pour la maladie de Lyme (en place depuis 2014).
- Meilleure sensibilité surtout pour infections à stade précoce
- Moins coûteux
- Moins laborieux
- Moins subjectif
- Réduction des délais d’exécution (fait localement plutôt que dans des labo spécialisés)
Nommer les inconvénients de la sérologies à 2 volets modifiée (EIA suivi d’un autre EIA) plutôt que la sérologie à deux volets standards (EIA puis immuno-empreinte IgM et IgG) pour la maladie de Lyme (en place depuis 2014).
- Si maladie précoce (EM), on devra quand même traiter les patients empiriquement puisque la sensibilité de cet algorithme est tout de même < 90%
- Impossible de différencier une infection ancienne d’une réinfection (comme pour l’ancien algorithme)
- Spécificité incertaine dans les régions où la prévalence est moindre
- Perte potentielle de spécificité associée à certains EIA polyvalents chez certains patients (entre autre ceux ayant une arthrite)
Une bouteille d’hémoculture sonne, mais on ne voit rien au Gram (la coloration fonctionne bien sur d’autres spécimens). Donner 5 explications et 1 coloration supplémentaire à faire.
- Faux positif
- Bactéries sans parois
- Bactéries intracellulaires
- Charge bactérienne trop faible
- Bactérie prenant mal la safranine
Coloration supplémentaire: Acridine orange
M47: quels facteurs influencent la détection de pathogènes dans des hémocultures?
- Volume de sang (facteur le plus important)
- Ratio sang:bouillon (idéal 1:5 à 1:10)
- Type de milieu
- Additifs (EDTA, SPS, antico)
- Conditions d’incubation
- Agitation (dans le premier 24h, améliore le recouvrement dans la bouteille aérobie car meilleure oxygénation)
- Fréquence du monitoring
What is the treatment of mild Leptospira infection?
Doxycycline 5-7 days
Amoxicillin 7 days
Azithromycin 3 days
What is the treatment of severe Leptospira infection?
IV PNC 7 days
Ceftriaxone 7 days
Quelles bactéries peuvent causer la diphtérie?
C. diphteriae
C. ulcerans
C. pseudotuberculosis
What is the preferred treatment approach for infections caused by Enterobacterales isolates without carbapenemase production that remain susceptible to meropenem and imipenem but are not susceptible to ertapenem?
For infections caused by Enterobacterales isolates that exhibit susceptibility to meropenem and imipenem (i.e., MICs ≤1 µg/mL), but are not susceptible to ertapenem (i.e., MICs ≥1 µg/mL), the use of extended-infusion meropenem (or imipenem-cilastatin) is suggested
Tigecycline or eravacycline are alternative options for the treatment of CRE infections not involving the __________ or ____________
Bloodstream or urinary tract
What are the preferred antibiotics for the treatment of infections outside of the urinary tract caused by CRE if KPC production is present?
Meropenem-vaborbactam > ceftazidime-avibactam > imipenem-cilastatin-relebactam are preferred treatment options for KPC-producing infections. Cefiderocol is an alternative option.
What are the preferred antibiotics for the treatment of infections outside of the urinary tract caused by CRE, when carbapenemase testing results are either not available or negative
Ceftazidime-avibactam, meropenem-vaborbactam, and imipenem-cilastatin-relebactam are the preferred treatment options for infections outside of the urinary tract caused by CRE, when carbapenemase testing results are either not available or negative. For patients with CRE infections who within the previous 12 months have received medical care in countries with a relatively high prevalence of metallo-β-lactamase-producing organisms or who have previously had a clinical or surveillance culture where a metallo-β-lactamase-producing isolate was identified, preferred treatment options include the combination of ceftazidime-avibactam plus aztreonam, or cefiderocol as monotherapy, while awaiting AST results to the novel β-lactam agents and carbapenemase testing results.
What are the preferred antibiotics for the treatment of infections outside of the urinary tract caused by CRE if NDM production is present?
Ceftazidime-avibactam in combination with aztreonam, or cefiderocol as monotherapy, are preferred treatment options for NDM and other metallo-β-lactamase-producing infections.
What are the preferred antibiotics for the treatment of infections outside of the urinary tract caused by CRE if OXA-48-like production is present?
Ceftazidime-avibactam is the preferred treatment option for OXA-48-like-producing infections. Cefiderocol is an alternative treatment option.
What is the role of polymyxins for the treatment of infections caused by CRE?
Polymyxin B and colistin are not suggested for the treatment of infections caused by CRE. Colistin can be considered as an alternative agent for uncomplicated CRE cystitis.
What is the role of combination antibiotic therapy for the treatment of infections caused by CRE?
Combination antibiotic therapy (i.e., the use of a β-lactam agent in combination with an aminoglycoside, fluoroquinolone, tetracycline, or polymyxin) is not suggested for the treatment of infections caused by CRE.
What are preferred antibiotics for the treatment of infections caused by MDR P. aeruginosa? (3 elements)
- When P. aeruginosa isolates test susceptible to both traditional non-carbapenem β-lactam agents (i.e., piperacillin-tazobactam, ceftazidime, cefepime, aztreonam) and carbapenems, the former are preferred over carbapenem therapy.
- For infections caused by P. aeruginosa isolates not susceptible to any carbapenem agent but susceptible to traditional β-lactams, the administration of a traditional agent as high-dose extended-infusion therapy is suggested, and repeat AST is encouraged.
- For critically ill patients or those with poor source control with P. aeruginosa isolates resistant to carbapenems but susceptible to traditional β-lactams, use of a novel β-lactam agent that tests susceptible (e.g., ceftolozane-tazobactam, ceftazidime-avibactam, imipenem-cilastatin-relebactam) is also a reasonable treatment approach.
What are preferred antibiotics for the treatment of uncomplicated cystitis caused by DTR-P. aeruginosa?
Ceftolozane-tazobactam, ceftazidime-avibactam, imipenem-cilastatin-relebactam, and cefiderocol are the preferred treatment options for uncomplicated cystitis caused by DTR-P. aeruginosa. A single-dose of tobramycin or amikacin is an alternative treatment for uncomplicated cystitis caused by DTR-P. aeruginosa.
What are preferred antibiotics for the treatment of DTR-P. aeruginosa that produce metallo-β-lactamase enzymes?
For patients infected with DTR-P. aeruginosa isolates that are metallo-β-lactamase producing, the preferred treatment is cefiderocol.
What is the general approach for the treatment of infections caused by CRAB?
The use of high-dose ampicillin-sulbactam (total daily dose of 6-9 grams of the sulbactam component) in combination with at least one other agent is suggested for the treatment of CRAB infections.
- Additional agents that can be considered as components of combination regimens for the treatment of CRAB infections include polymyxin B, minocycline, tigecycline, or cefiderocol
What is the role of extended-infusion meropenem or imipenem-cilastatin for the treatment of infections caused by CRAB?
High-dose, extended-infusion meropenem or imipenem-cilastatin are not suggested for the treatment of CRAB infections.
What is a general approach for the treatment of infections caused by S. maltophilia?
(1) the use of two of the following agents: TMP-SMX, minocycline/tigecycline, cefiderocol, or levofloxacin (can step down to 1 agent once clinical improvement is observed)
or
(2) the combination of ceftazidime-avibactam and aztreonam, when significant clinical instability is evident or intolerance to or inactivity of other agents is identified.
What is the role of ceftazidime for the treatment of infections caused by S. maltophilia?
Ceftazidime is not a suggested treatment option for S. maltophilia infections due to the presence of β-lactamase genes intrinsic to S. maltophilia that are expected to render ceftazidime inactive.
***Tier 4 au CLSI
Name 3 branching GPB causing actinomycetoma.
- Actinomadura
- Nocardia
- Streptomyces