Vecka 7 - Proteoglykaner Flashcards
Nämn två vanliga proteoglykaner som har heparansulfat och som binder till en cellyta.
Nämn en som också finns i BM.
Varför är domäner av heparansulfat viktigt på proteoglykaner?
- Syndecan
- Glypican
I BM
- Perlecan.
Domänerna som bildar ett ett specifikt mönster binder in proteiner.
Beskruv hur en proteoglykan ser ut.
En proteoglykan har en kärna av aminosyror (core protein)
En glykosaminoglykan binder till serin i coreproteinet.
Glykosaminoglukan är en molekyl med repeterande disackarid-enheter.
- Dessa är ogrenade.
- De kan vara sulfaterade.
Vilken proteoglykan är inte sulfaterad?
Hyaluronan.
Vad är skillnaden på ett glykorpotein och en proteoglykan?
En proteoglykan är en variant av ett glykoprotein.
En proteoglykan har ett core protein som sockerenheter binder till.
Det som skiljer denna från proteoglykaner är att proteoglykaner
- inte är förgrenade
- de är repeterande disackaridenheter.
Således innehåller inte glykoproteiner just glykosaminglykaner, utan andra former av kovalent bundna sockerenheter.
Vilka domäner kan en glykosaminglukan ha?
Till vilken aa fäster glykosamingolykan till?
- NA domän = icke sulfaterade
- NS domän - sulfaterade disackarider
- NS/NA - blandning av icke sulfaterade och sulfaterade disackarider
- En GAG fäster till serin i core protein.
Förutom sulfatgrupper på disackariderna, vilken annan funktionell grupp gör sockemolekylen laddad?
COO-
Vilka celler tillverkar heparansulfat?
Hur särskiljer dem från varandra?
Alla celler har samma proteoglykaner, det som skiljer är sulfateringsmönstret på GAG.
- Celler tillverkar cellspecifikt heparansulfat med olika sulfateringsmönster.
Vilken cell tillverkar heparin? Vad är heparin?
Heparin är en högsulfaterad variant av heparansulfat som tillverkas av mastceller.
Varför är heparansulfat viktigt för embryoutvecklingen?
Detta är med och bestämmer differentiering av celler under utvecklingen. Implantation funkar dock.
Nämn 3 olika områden då heparansulfater är viktiga.
- Som co-receptor för ligander
- För koagulationshämning
- Virus och parasiter använder heparansulfat för att docka in till initialt.
Beskriv hur heparansulfat är viktigt för koagulation.
- Antitrombin hämmar koagulation genom att binda trombin. Dessa två molekyler attraheras inte av varandra så bra.
- Celler som utsöndrar Heparin - som binder till antitrombin gör att en konformationsändring sker i antitrombin.
- Då kan antitrombin binda trombin och hämma koagulation.
På vilket sätt kan HSPG (heparansulfatproteoglykaner) medverka till embryonalutvecklingen?
De fungerar som co-receptorer som binder in morfogener, t.ex. FGF.
FGF binder till heparansulftatet som sitter på core protein. Core protein sticker upp på cellen.
- FGF kommer då binda sin receptor och föra signalering vidare.
Beroende på tiden som FGF sitter på receptor fås olika cellulära svar. Detta påverkar HSPG!
En HSPG kan även binda till sig andra morfogener också, men kanske inte med lika hög affinitet. Därmed förkortas längden som denna morfogen sitter och kan påverka sin receptor.
På vilket sätt kan morfogenes av kärl ske med HSPG?
Olika HSPG har olika affinitet för olika PDGF.
Dessa PDGF finns i olika isoformer och binder olika bra till olika HSPG. Genom att celler på en plats utsöndrar HSPG på sin cellyta som binder en specifik PDGF bra, kan en gradient skapas i området.
Vi får en hög koncentration av en viss PDGF i ett område som kommer leda växande blodkärl till den platsen, pga cellen som bildar en specifik HSPG med specifikt sulfateringsmönster.
Vilka enzymer är viktiga för syntes av heparansulfater?
- EXT1/2. Polymeriserar disackarider. Använder UDP-glukos.
- Isoformer av sulfatotransferaser sulfaterar sedan olika platser på disackariderna.
Hur ser linkage region ut i en heparansulfat? Den som binder serin.
Serin –> Xylos, Galaktos, Galaktos, Glukuronsyra, Acetylglucosamin.
