Vecka 3 - Det oveckade proteinsvaret (Kreuger)

Question 1

Vad är BIP och IRE1?

Answer 1

BIP är en chaperon i ER-lumen

IRE1 är en sensor för oveckade proteiner.

Dessa två sitter i ett komplex om det inte finns oveckade proteiner i ER-lumen.

Question 2

Vad händer med BIP/IRE1-komplexet när oveckade proteiner finns i ER lumen?

Vad händer när BIP gjort sin grej med IRE1?

Nyckelord XBP1, pre mRNA

Answer 2

IRE1 är ett transmembranprotein i ER. Denna binder BIP som är ett protein i lumen på ER.

1. BIP släpper från IRE1 och binder proteiner
2. IRE1 dimersierar i ER-membranet –> autofosforylering
3. Detta gör att ribonukleasdomänen i IRE1 aktiveras. Denna kommer att splica pre mRNA i cytosolen för XBP1.
4. XBP1 protein finns sedan efter translation. Detta är en transkriptionsfaktor.
5. BIP och andra chaperoners gener uppregleras genom XBP1 –> hjälpen är på väg.

Question 3

Vad är XBP1 och vad händer när det inte längre finns felveckade proteiner i ER-lumen? mRNA kontroll i annat flashcard.

Nyckelord- chaperoner

Answer 3

XBP1 är en transkriptionsfaktor som kommer bli aktiv när det finns oveckade proteiner i ER-lumen –> chaperoner uppregleras

När det inte finns mer oveckade proteiner som Chaperonen BIP kan binda, kommer denna istället binda till IRE1 receptorer som är dimeriserade

Då kommer dessa upphöra att dimerisera med varandra, och de kommer inaktiveras med fosfatas. Då upphör transkrption av chaperoner.