Vecka 4 - intro till cellsignalering (Lena) Flashcards
Varför behövs signaltransduktion?
I en multicellulär organism behöver celler kommunicera med varandra för att koordinera och styra dem vävnader/celler som finns i organismen.
Vad kan en signal göra i en multicellulär organism? Väldigt översiktligt.
- Upprätthålla homeostas
- Skapa en förändring
i organismen.
Vad är det för skillnad på signalproteiner och effektorproteiner? Vad kommer effektorproteinet att leda till i cellen?
Vad kan effektorproteiner vara för typer?
Signalproteiner är dem proteiner som ingår i signalkedjan. Effektorproteinet är det sista proteinet i signalkedjan som kommer leda till en förändring, et cellulärt svar.
Det kan t.ex. vara ett enzym, transkriptionsfaktor, eller cytoskelettet som är effektorproteinet.
Vilka olika kemiska interaktioner kan finnas mellan ett protein som binder till ett annat protein i en signaltransduktion?
Vad händer med den mottagande proteinet när en ligand binder?
Det är icke kovalenta bindningar som
- vätebindningar
- elektrostatiska interaktioner
- hydrofoba interaktioner
Interaktionen ändrar konformationen i det bindande proteinet!
Vilka 4 huvudtyper av cellulär signalöverföring finns?
- Parakrin signalering
- ligand som är ostabil, eller har låg affinitet till receptor
- krävs höga koncentrationer av ligand
- celler som ligger nära varandra - Autokrin signalering
- celler signalerar till sig själva. - Synaptisk siglanering
- nervceller släpper ut NT mellan varandra i synapsklyftan. - Endokrin signalering
- stabil ligand
- hög affinitet till receptor, pga utspädd koncentration
- långa avstånd mellan celler som kommunicerar
- ligand färdas med blod.
Vad gäller för receptorer och ligander angående signalering?
Nyckelord. specificitet, ligander subtyper
- ligand och receptor är specifika för varandra
- en cell måste uttrycka receptorn på sin yta eller i cellen för att kunna föra vidare en signal
- det finns strukturellt besläktade receptorer och ligander. Därmed kan olika ligander binda till samma receptor, men det. krävs fortfarande hög specificitet.
Vad leder alltid ligandbindning till i en receptor?
Konformationsändring!!!
Vilka svar är långsamma respektive snabba i en signaltransduktion?
Dem cellulära svar som kräver genstanskription tar längre tid. Min - timmar
Medan cellulära svar som aktiverar existerande proteiner tar kort tid, sek till min
Hur kan en ligand stimulera olika cellulära svar?
- Genom att binda olika sorters receptorer
- Till samma receptor i en annan cell, där andra signalproteiner nedströms finns som leder till ett annat svar.
T.ex. acetylkolin som kan binda kolinerga receptorer men i olika celltyper mediera olika svr som t.ex. kontraktion eller salivsekretion, eller ökad frekvens på aktionspotential
Vad skiljer adaptorer från scaffhold och dockingproteiner?
Vad är det för likheter?
Adaptorer binder till plasmamembranet ofta genom t.ex. en PIP, och till receptor.
En docking eller scaffhold är ett större proein som ofta finns tidigt i signalkedjan också, och binder till receptorn!
Båda proteinerna binder i sin tur andra proteiner nedströms.
- Docking och scaffhold har samma funktion som adaptorer. Skillnaden är att dokcingproteiner binder plasmamembranet, medan scaffhold binder receptorn.
- Proteinerna i sin tur binder andra proteiner nedströms.
Vad saknar adaptorproteiner för något som andra signalproteiner kan?
Dem har ingen enzymatisk aktivitet. Binder bara in andra proteiner. Består av en eller flera interaktionsdomäenr
Enzymer i signaltranduktion.
Vad gör
- kinaser
- fosfataser
- lipaser
- GTPas
- GEF
- fosforylerar
- tar bort fosfatgrupp från fosforylerade proteiner
- hydrolyserar lipider
- katalyserar hydrolys av GTP
- Katalyserar utbyte av nukleinsyror. Guanin exchange factor. Ta bort GDP så en GTP kan binda in.
Vad är Grb2? Vad har den för interaktionsdomäner.
En adaptor som bara har interaktionsdomäner för andra proteiner.
Den har en Sh2 och 2 SH3.
Vilka molekyler finns vid cellmembranet och har interaktionsdomäner för signalproteiner?
Hur kan dem “aktiveras”?
Nyckelord lipider.
Fosfoinositider är lipid som har en kopplad inositolring med olika fosfatgrupper på denna.
Dem har en inostiolring som kan fosforyleras. Specifik fosforylering av PIP kommer göra en interaktionsdomän, och den kan bildas t.ex. när en receptor aktiveras som fosforylerar den.
Interaktionsdomäner på proteiner binder till speciella motiv på andra proteiner.
Nämn dem fyra vi ska kunna.
Vad utmärker interaktionsdomänen i ett protein från resten av proteinet?
- SH2 domän är en domän i nedströms protein som känner igen fosforylerad tyrosin + C-terminala aa.
- PTB domän är en domän som känner igen fosforylerad tyrosin och N-terminala aa.
- SH3 känner igen prolinrika sekvenser
- PH- binder fosfolipider PIP.
Interaktionsdomänen veckas separat från övriga proteinet.
