Transcription chez les eucaryotes I Flashcards
La transcription est effectué par quel molécule?
ARN polymérase
La traduction est effectué par quelle molécule?
Ribosomes
Nomme la différence entre la réplication et la transcription en terme du produit
Réplication: ADN –> ADN
Transcription: ADN–> ARN
Nomme la différence entre la réplication et la transcription en terme des brins
Réplication: 2 brins d’ADN répliqués
Transcription: Un seul brin d’ADN transcrit
Nomme la similarité entre la réplication et la transcription en terme de la synthèse
Les deux s’effectuent sur la matrice
Nomme la différence entre la réplication et la transcription en terme d’amorce
Réplication: ADN pol à besoin d’une amorce pour débuter la réaction
Transcription: ARN pol n’a pas besoin d’une amorce pour débuter la réaction
Nomme la différence entre la réplication et la transcription en terme de l’emplacemet de l’initiation
Transcription: initiée à l’endroit de séquences promoteurs
Nomme la différence entre la réplication et la transcription en terme de quantité de produits
Réplication: génome entier répliqué une seule fois durant un cycle
Transcription: copie certaines régions du génome et en nombre diférents
Nomme la différence entre la réplication et la transcription en terme du taux d’erreur
Réplication: très précis, 1 erreur par 10^9-10^11nts
Transcription: 1 erreur par 10^4-10^6nts
Quel est l’impact de la compartimentation de l’expression génique chez l’eucaryote?
- Le génome est sous forme de chromatine dans le noyau
- La transcription et traduction ont lieu dans des compartimnets différents
- Ceci mène a des modifications de l’ARN tel que la coiffe, l’épissage et l’addition de queue poly-A aux ARNm
En regardant le contenu en ARN d’une cellule eucaryote on peut déterminer que:
l’ARNr et l’ARNt est plus stable que l’ARNm
Combien de types d’ARN polymérases ont les eucaryotes?
3
Quel type d’ARN polymérase synthétise l’ARNm?
ARN polymérase II
Comment les trois types d’ARN polymérases ont-ils été découverts?
Les trois ARN polymérases ont une sensibilité différente à l’alpha-amanitin
Les trois ARN polymérases synthétisent des différents ARN
Donc les ARN polymérases affectés ne seront pas ou moins capable de produire leur ARN tandis que ceux moins affecté pourrons produire
Comment se comparent les structures des diférentes ARN polymérases?
Très smilaires
Combien de sous-unités contient l’ARN pol. II?
12
Est ce que le mécanisme des ARN polymérases sont les mêmes?
Oui, c’est la même réaction biochimique catalysée pour les 3 enzymes: mécanisme = catalyse par ion métallique divalent pour l’addition des nts
Est ce que les sous-unités de toutes les ARN pol sont différentes?
Non, certaines sont différentes et d’autre communes
Quel sont les nom des sous-unités de l’ARN pol. II?
RPB1-12
Décrit brièvement RPB1
- Plus grosse sous-unité
- Contient le domaine C-terminal (CDT)
Quelle est la structure générale (en mots) de l’ARN pol. II?
- Clampe
- Mur
- Gouvernail
- Couvercle
- Fermeture éclair
Quel est le mécanisme de formation des liens phosphodiester pour la transcription eucaryote?
Même mécanisme que la transcritpion procaryote
Quelles sont les trois étapes de la transcription eucaryote?
- Initiation
- Élongation
- Terminaison
Est ce que l’ARN pol eucaryote se lie seul à la matrice?
Non, elle requiert plusieurs co-facteurs pour se lier à la matrice
Décrit brièvement les facteurs de transcription généraux chez les eucaryotes
- Requis pour la plupart des promoteurs liés par l’ARN pol. II
- TFII = transcription factors for RNA polymerase II
- Nécessaire lors de l’initiation de la transcription par l’ARN pol II
- Assemblage séquentiel
Décrit l’étape d’initiation de la transcription chez l’eucaryote avec l’ARN pol. II
Formation du complexe de préinitiation:
* Complexe TBP et TFIID, TBP lie la boîte TATA
* TFIIA et TFIIB se lient au complexe sur l’ADN, TFIIB cré une asymétrie et dicte le brin et la direction de transcription
* TFIIE, TFIIH et TFIIF lié à l’ARN pol II se lient au complexe
Assemblage séquentiel des facteurs de transcription généraux, de l’ARN pol II et de TFIID
À quel temps l’ARN pol. II effectuent les processes de maturation de l’ARNm?
Couple les processus et la maturation
Quel sont les quatres composantes du promoteur de base?
- BRE = B recognition element (TFIIB)
- INR = Initiator element
- DPE = downstream promoter element
- TATA = Boîte TATA
Quelle est la séquence de BRE? Elle est reconnue par quel facteur de transcription général?
G/CG/CG/ACGCC
TFIIB
Quelle est la séquence de TATA? Elle est reconnue par quel facteur de transcription général?
TATAA/TAA/T
TBP
Quelle est la séquence de INR? Elle est reconnue par quel facteur de transcription général?
C/TC/TANTA/AC/TC/T
TFIID
Quelle est la séquence de DPE? Elle est reconnue par quel facteur de transcription général?
A/GGA/TCGTG
TFIID
Décrit brièvement TFIID
- Contient TBP (TATA binding protein)
- 11 protéines accesoires appelées TAF (TBP-associated factors)
Décrit la TBP
- Provoque une courbure de l’ADN correspondant à la surface concave de la TBP
- Décroulement du motif TATA mais aussi des séquences adjacentes: exposition de surfaces de contact pour d’autres FTGs dont TFIIB
- Empêche la formation de nucléosomes à l’endroit du promoteur
Comment TFIID permet la liaison de l’ARN pol II?
- Séquence de promoteur en contact direct avec TFIID et TBP
- Boîte TATA se lie à TBP
- TBP permet la liaison de TFIIB à la séquence BRE et se lie à l’ARN pol II
- Assemblage du reste du complexe d’initiation de la transcription: TAFs (TBP-associated factors = 12 protéines, reconaissance des séquences INR et DPE), TFIIA (stabilise l’intéraction TBP-ADN
- ADN pol II est recrutée avec TFIIF
- TFIIE et TFIIH se lient pour compléter le complexe de pré-initiation
- TFIIH: activité hélicase et phosphorylase (Domaine CTD de l’ARN pol II)
Quelle est la structure et la fonction de TBP?
- Structure en forme de selle formant des ponts H avec les 8 PB du sillon mineur du motif TATA (spécifique)
- Provoque une courbure de l’ADN correspondante à la surface concave de la TBP
- Décroulement du motif TATA mais aussi des séquences adjacentes
- Exposition de surfaces de contact pour d’autres FTGs dont TFIIB
- Empêche la formation de nucléosomes au niveau du promoteur
- Homodimère
- Extrémité N-terminale riche en glutamines et qui module l’activité de liaison de l’extrémité C terminale à l’ADN: affecte le taux d’initiation de la transcription et formation du complexe de pré-initiation
Explique l’initation de la transcription au niveau de TBP et TAF
TBP:
* La surface supérieur de TBP est faite d’hélices amphipathiques qui sont impliquées dans le recrutement des TAFs
TAFs:
* Reconnaissanes des sites INR et DPE des gènes ne possédant pas de séquence TATA
* TFIID permet la formation d’un complexe d’initiation de transcriptions ur les promoteurs avec ou sans éléments TATA par l’entreprise des TAFs
Explique l’initation de la transcription au niveau de TFIIB
- Polypeptide unique contenant un domaine C-terminal de liaison à l’ADN de type hélice-tour-hélice (reconnaissance de l’élément BRE en amont de la boîte TATA)
- Élément clé de l’arrimage du complexe holoenzymatique ARN pol II au promoteur
- Liaison asymétrique du complexe TFIID et du facteur TFIIB au promoteur permettrait l’alignement de l’ARN pol. II sur le promoteur
- Permet le positionnement de l’appareil transcriptionnel du site d’initiation de la transcription (+1) dans le centre catalytique de l’ARN pol. II
Qu’arrive t’il lorsque TFIID et TFIIB se sont assemblé au niveau du promoteur?
- Recrutement de l’ARN pol II liée à TFIIF et à d’autres facteurs
- Liaison des facteurs TFIIE et TFIIH
Décrit TFIIE
- Tétramère alpha 2, béta 2
- Recrutement et régulation de l’activité TFIIH
- Site d’ancrage pour TFIIH
Décrit TFIIH
- La plus massive des FGT: 8 à 9 sous unités, poids moléculaire se rapprochant de celui du complexe holoenzymatique d’ADN pol II
- Possède des activité enzymatqiues bien définies: ADN hélicase ATP-dépendante (ouverte transitoire de la double hélice pour exposer le brin matrice), activité de protéine kinase (addition de groupements phosphate sur une protéine, phosphorylation du domaine C-terminale de l’ARN pol. II)
