Synthèse protéique et le code génétique II Flashcards
Un ribosome bactérien est aussi appelé:
70S
Contient deux sous-unités: grande (50S) et petite (30S)
Un ribosome eucaryote est aussi appelé:
80S
2 sous-unités: grande (60S) et petite (40S)
Les ribosomes sont formés de quels types de molécules?
- ARN
- Protéines
Décrit la conservation de la grande et petite sous-unité des ribosomes
Hautement conservée
Quels sont les trois sites des ribosomes qui intéragissent avec l’ARNt?
E(ject), P(eptidyl), A(ccepter)
Quels sont le trois étapes de la traduction?
- Initiation
- Élongation
- Terminaison
Quel est le premier acide aminé incorporé durant la traduction?
Met
Comment la cellule différencie entre une Met start et un résidu Met dans une protéine?
La cellule possède 2 ARNt distinct pour Met
* ARNtimet
* ARNtmet
Quelle est la différence entre la méthionine start bactérienne et la méthionine eucaryote
La méthionine bactérienne est formylée, tandis que la méthionine eucaryote ne l’est pas
Décrit la structure de l’ARNt procaryote pour la Met start
- A.a formylé
- En 5’ de l’ARNt, la position 1 est sous forme simple brin mais sans pairage (5’-C, 3’-A)
- 3 paires de G-C situées dans la tige de l’anti-codon
- Séquence conservée dans la tige-boucle D
Quelle est la séquence de reconaissance de début de traduction chez le procaryote?
Séquence Shine-Dalgarno
Quelle partie de ribosome reconnaît la séquence Shine-Dalgarno chez le procaryote?
ARN ribosomale 16S de la sous unité ribosomale 30S
Comment se fait la reconaissance du site d’initiation de traduction chez l’eucaryote?
- Liaison de l’ARN 40S à l,extrémité 5’ de l’ARNm
- Balayage de l’ARNm par le ribosome pour repérer la séquence Kozak
Qu’est ce que la séquence Kozak?
Un A ou G à la position -3 p/r au A du codon start
ex.
A/G C C A U G
-3 -2 -1 +1
Quels sont les éléments inclus dans l’initiation de la traduction chez les procaryotes?
- IF: facteurs d’initiation
- ARNr: 50s + 30s = 70s
- 50S: 23S + 5S + 34 protéines
- 30S: 16S + 21 protéines
Quelles sont les trois IF de l’initation de la traduction chez les procaryotes et quelles sont leurs fonctions?
IF 1: bloque le site A du ribosome
IF 2: se lie au GTP
IF 3: prévient l’association de la grande sous-unité ribosomale
Quels sont les éléments impliqués dans l’initiation de la traduction chez les eucaryotes?
- eFI: facteur d’initiation eucaryote
- ARNr: 60S + 40S = 80S
- 60S: 28S + 5S + 5.3S + 49 protéines
- 40S: 18S + 3 protéines
- Autres facteurs (au moins 8)
Où se lie la petite sous-unité ribosomale lors de l’initation de la traduction chez l’eucaryote?
Elle se lie au CAP 5’ en recherche de l’AUG d’initiation
Comment se fait la liaison de l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome durant l’élongation (traduction) chez le procaryote?
- Site A est vacant
- site P est occupé avec le peptide en élongation
- EF-Tu-amoniacyl-ARNt se lie au site A
- Correspondance juste: 1/10
- Hydrolyse du GTP
- Dissociation du EF-Tu-GDP
- Association du EF-Ts au complexe EF-Tu-GDP
- EF-Tu-GDP recylcé
Quels sont les équivalents de EF-Tu et EF-Ts chez l’eucaryote?
EF1A
EF1B
Comment se fait la translocation durant l’élongation de la réaction de traduction?
- Après la dissociation de EF-Tu du complexe aminoacyl-ARNt-ribosome
- Catalyse par la sous-unité 50S ribosomale qui possède une activité peptidyle transférase
- Attaque Nu
- Transfert du peptidyl-ARNt du site P au groupe aminoacyl-ARNt occupant le site A. Élongtion de la chaîne peptidique de un a.a
- Le groupe amino prend la place du groupe ester sur le ribose en 3’
Quel est la fonctione de EF-G?
Catalyse la translocation du ribosome vers le codon suivant
Hydrolyse du GTP cause sa dissociation
Structure ressemble à celle de l’aminoacyl-ARNt-EF-Tu-GTP (mimiquerie moléculaire)
Quelles sont les trois étapes de l’élongation durant la traduction?
- Aminoacyl-ARNt se lie au site A vacant
- Formation d’un lien peptidique au site P et le ribosome se déplace 3nts sur l’ARNm
- Ejection de l’ARNt non chargé d’un a.a du site E
Nomme certains antibiotiques qui inhibent la synthèse protéique
- Tétracycline: empêche la liaison de l’aminoacyl-ARNt au ribosome
- Erythromycine: empêche la formation du lien peptidique
Quelle est une particularité de la synthèse protéique chez l’eucaryote&
L’ARNm est circulaire: la petite sous-unité n’a alors pas besoin de se dissocier de l’ARNm, et elle peut reprendre la synthèse
