Régulation de l'expression génique du phage I Flashcards
Quel est le phage que nous étudions?
Bactériophage lambda
Quels sont les deux stades possible du phage lorsqu’il insert son ADN dans une bactérie?
Phase lytique ou lysogénique
Décrit la phase lytique
- Expression des gènes du phage lambda
- Nouvelles particules de phage sont produites et lyse de la bactérie
Décrit la phase lysogénique
- ADN du phage demeure incorporé au génome bactérien
- ADN de lambda sera répliqué avec celui de la bactérie et les gènes du phage ne sont pas exprimés
- Prophage
Qu’est ce que l’induction lysogénique?
À partir de stade prophage, le phage passe au stade lytique
Quels sont les éléments du cycle de multiplication des phages?
- Lytique
- Lysogénique
- Induction lysogénique
Combien de kb contient le génome du phage lambda?
48.5kb
Décrit la séquence du génome du phage lambda
50 gènes et plsueirus sites de régulation
Comment les gènes sont ils regroupés dans le génome du phage lambda?
Selon leur fonction:
ex. gènes de la queue, gènes de la tête, etc.
Comment la trasncription de l’ADN du phage lambda est elle exécutée?
- Transcription par l’ADN pol. de l’hôte
- Contrôle effectué par des protéines régulatrices exprimées à partir du génome du phage: cIII, N, cI, cro, cII et Q
Que signifie une cascade d’expression génique?
L’expression des phases différée et tardive est régulée par des protéines synthétisées à la phase précédente (immédiate)
Décrit le early transcription de l’ADN du phage lambda durant le cycle lytique
- Transcrit L1: Commence au promoteur PLOL et contient le gène d’anti-terminaison N, finit au terminateur TL
- Transcrit R1/R2: Commence au promoteur ORPR, contient cro (1 et 2), cII, O et P (2) finit au terminateur TR1 (1) ou TR2 (2)
- Transcrit R4: commence au promoteur P’R et finit au terminateur t’R
Décrit le delayed-early transcription de l’ADN du phage lambda durant le cycle lytique
Anti-terminateur N agit sur les sites de terminaison tL1, tR1 et tR2
* Transcrit L2: commence au promoteur pLoL, et inclu les gènes N, cIII, xis et int
* Transcrit R3: commence au promoteur oRpR et contient les gènes cro (répresseur), cII, O, P et l’anti-terminateur Q, finit au terminateur tR3
* Transcrit R4: commence à p’R et finit à t’R
Décrit le late transcription de l’ADN du phage lambda durant le cycle lytique
- cro réprime les promoteurs pLoL et OrPr
- Anti-terminateur Q agit sur le terminateur t’R
- Transcrit R5: commence à p’R, contient les gènes S et R
Décrit le fonctionnement d’une protéine anti-terminaison chez le phage
Une protéines anti-terminateur se lie à l’ARN pol et permet de transcrire l’ADN du site de terminaison pour produire un ARN contenant les séquences des gènes après le terminateur
Quelles sont les trois phases de la voie lytique
- Immédiate
- Différée
- Tardive
Avant que l’ADN du phage soit incorporé dans les particules de phage:
Il doit y avoir une quantité suffisante d’ADN répliquée de phase pour être ensuite incorporé dans les particules de phage
La formation de particules de phage doit être complétée:
avant la lyse de la bactérie
Comment la lysogénie est-elle déclanchée?
La lysogénie est déclanchée par:
* Forte concentrations de la protéine cII qui stimulent la transcription vers la gauche à partir de pI (intégrase) et à partir de pRE (represor establishement) et pRM (repressor maintenance)
Comment se fait le maintient de la lysogénie?
- Répreseur cI se lie à l’opérateur oL et à oR (sites oL1 et oL2) et or (sites oR1 et oR2) et bloque la transcription à partir de pL et pR
- cI bloque l’expression des gènes de la phase immédiate incluant cro et cII
Décrit establishment of lysogeny de l’ADN du phage lambda durant le cycle lysogénique
- Transcrit de p1 contenant xis et int
- Transcrit de pRE contenant cI
Décrit maintenance of lysogeny de l’ADN du phage lambda durant le cycle lysogénique
- Sites opératers oL et oR réprimés par cI
- Transcription à partir de pRM contenant cI
Quel est l’élément principle de la décision de stade lytique ou lysogénique?
- Stabilité de la protéine cII (instable, courte demi-vie)
- Protéine cIII stabilise cII (hétérodimère)
Quelle cascade de réaction est nécessaire pour établir la lysogénie?
2 transcrits:
1. à partir de pI (ou pint) pour générer le transcrit de l’intégrase
2. à partir de pRE pour générer le transcrit de cI
Comment se fait le maintient de la lysogénie?
Établissement de la lysogénie prend fin et est remplacé pr le circuit du répresseur cI