Régulation de l'expression génique du phage II Flashcards
Que fait l’ADN du phage lambda dans la voie lysogénique?
Elle s’intègre dans le génome de l’hôte
Où s’intègre l’ADN viral durant la voie lysogénique?
À des sites spécifiques: soit attP du phage et attB de la bactérie
Le site Cos (cohesive end sites) permet la circularisation de l’ADN du phage, et ainsi sont intégration à l’ADN de la bactérie
Quels opérateurs sont reconnus par cro et cI?
oL et oR
Quelle est l’affinité de cro pour les sites oR1-3 et les sites oL1-3
oR: 3>2=1
oL: 3>2=1
Quelle est l’affinité de cI pour les sites oR1-3 et les sites oL1-3
oR: 1>2>3
oL: 1>2>3
Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a absence de répresseur
ARN pol. initie la transcription à un haut niveau à partir de pR et à un niveau basal à partir de pRM
Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a une première augmentation de répresseur
cI à une afinité pour oR de 1>2>3
Il y a alors une liaison à oR1 d’abord et l’arrêt de la transcription à partir de pR
Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a une deuxième augmentation de répresseur
La quantité de répresseur augmente encore plus et il y a des liaisons cooperatives aux sites oR1 et oR2
Ceci stimule la transcription à partir de pRM
Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a une très haute quantité de répresseur
Tous les sites oR sont occupés et la transcription à partir de pR et de pRM est arrêtée
Quel gène est transcrit à partir du promoteur pR?
Cro
Quel gène est transcrits à partir du promoteur pRM?
cI
Comment avons nous démontré les effets du répresseur cI sur les promoteurs pR et pRM?
Avec des expériences in vitro avec des gènes rapporteurs
Que démontre le graphique qui décrit les effets du répresseur cI sur les promoteurs pR et pRM?
L’activité initiale de pR est haute, et celle de pRM est basse
L’activité de pR diminue tranquilement, et devient basse lorsqu’il y a liaison coopérative du répresseur cI au sites opérateurs oR1 et oR2
Lorsque les sites opérateurs oR1 et oR2 sont occupés, l’activité de pRM augmente
L’activité de pRM diminue lorsque l’opérateur oR3 est lié à son répresseur
Quelle protéines (cI ou Cro) est un répresseur plus fort?
cI
Est ce que la liaison de Cro à oR1 et oR2 peut être dite coopérative?
Non
En quelle forme Cro se lie aux opérateurs?
Sous forme de dimère
La liaison de Cro à oR3:
aboli la transcription à partir de pRM
La liaison de Cro aux sites oR2 et/ou oR1:
met fin à la transcription à partir de pR
Que provoque la liaison de cI aux sites opérateurs oR et oL?
Il y a formation de structure repliée.
cI intéragit avec elle-même aux sites oR et oL pour former cette structure
Quel(s) facteurs décident si, lors d’un inféction par un phage lambda, on passe par la voie lytique ou lysogénique?
- Lors du début de l’infection, les protéines int et cI ne sont pas produites initialement
- Les cascades d’expression des gènes du phage débute et est commune aux 2 cycles
- Int et cI sont nécessaires au développement du cycle lysogénique et leur activation dépend de cII et cIII qui elles activent la synthèse de cI initialement
Décrit le changement des sites opérateurs lorsqu’il y a changement entre le mode lytique et le mode lysogénique
- Lysogénique: cI se lie è oR1 et oR2 et bloque l’accès à pR (cro), la transcription à partir de pRM est induite (cI)
- Clivage de cI et libération des sites oR1 et oR2 pour la liaison de l’ARN pol.
- Transcription des gènes immédiats (Cro à partir de pR)
- Cro se lie ensuite à oR3 et bloque la transcription de cI à partir de pRM
- La voie lytique est induite
