Régulation de l'expression génique du phage II

Question 1

Que fait l’ADN du phage lambda dans la voie lysogénique?

Answer 1

Elle s’intègre dans le génome de l’hôte

Question 2

Où s’intègre l’ADN viral durant la voie lysogénique?

Answer 2

À des sites spécifiques: soit attP du phage et attB de la bactérie

Le site Cos (cohesive end sites) permet la circularisation de l’ADN du phage, et ainsi sont intégration à l’ADN de la bactérie

Question 3

Quels opérateurs sont reconnus par cro et cI?

Answer 3

oL et oR

Question 4

Quelle est l’affinité de cro pour les sites oR1-3 et les sites oL1-3

Answer 4

oR: 3>2=1

oL: 3>2=1

Question 5

Quelle est l’affinité de cI pour les sites oR1-3 et les sites oL1-3

Answer 5

oR: 1>2>3

oL: 1>2>3

Question 6

Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a absence de répresseur

Answer 6

ARN pol. initie la transcription à un haut niveau à partir de pR et à un niveau basal à partir de pRM

Question 7

Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a une première augmentation de répresseur

Answer 7

cI à une afinité pour oR de 1>2>3

Il y a alors une liaison à oR1 d’abord et l’arrêt de la transcription à partir de pR

Question 8

Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a une deuxième augmentation de répresseur

Answer 8

La quantité de répresseur augmente encore plus et il y a des liaisons cooperatives aux sites oR1 et oR2

Ceci stimule la transcription à partir de pRM

Question 9

Décrit l’initation de la transcription de l’ADN du phage lorsqu’il y a une très haute quantité de répresseur

Answer 9

Tous les sites oR sont occupés et la transcription à partir de pR et de pRM est arrêtée

Question 10

Quel gène est transcrit à partir du promoteur pR?

Answer 10

Cro

Question 11

Quel gène est transcrits à partir du promoteur pRM?

Answer 11

cI

Question 12

Comment avons nous démontré les effets du répresseur cI sur les promoteurs pR et pRM?

Answer 12

Avec des expériences in vitro avec des gènes rapporteurs

Question 13

Que démontre le graphique qui décrit les effets du répresseur cI sur les promoteurs pR et pRM?

Answer 13

L’activité initiale de pR est haute, et celle de pRM est basse

L’activité de pR diminue tranquilement, et devient basse lorsqu’il y a liaison coopérative du répresseur cI au sites opérateurs oR1 et oR2

Lorsque les sites opérateurs oR1 et oR2 sont occupés, l’activité de pRM augmente

L’activité de pRM diminue lorsque l’opérateur oR3 est lié à son répresseur

Question 14

Quelle protéines (cI ou Cro) est un répresseur plus fort?

Answer 14

cI

Question 15

Est ce que la liaison de Cro à oR1 et oR2 peut être dite coopérative?

Answer 15

Non

Question 16

En quelle forme Cro se lie aux opérateurs?

Answer 16

Sous forme de dimère

Question 17

La liaison de Cro à oR3:

Answer 17

aboli la transcription à partir de pRM

Question 18

La liaison de Cro aux sites oR2 et/ou oR1:

Answer 18

met fin à la transcription à partir de pR

Question 19

Que provoque la liaison de cI aux sites opérateurs oR et oL?

Answer 19

Il y a formation de structure repliée.

cI intéragit avec elle-même aux sites oR et oL pour former cette structure

Question 20

Quel(s) facteurs décident si, lors d’un inféction par un phage lambda, on passe par la voie lytique ou lysogénique?

Answer 20

• Lors du début de l’infection, les protéines int et cI ne sont pas produites initialement
• Les cascades d’expression des gènes du phage débute et est commune aux 2 cycles
• Int et cI sont nécessaires au développement du cycle lysogénique et leur activation dépend de cII et cIII qui elles activent la synthèse de cI initialement

Question 21

Décrit le changement des sites opérateurs lorsqu’il y a changement entre le mode lytique et le mode lysogénique

Answer 21

• Lysogénique: cI se lie è oR1 et oR2 et bloque l’accès à pR (cro), la transcription à partir de pRM est induite (cI)
• Clivage de cI et libération des sites oR1 et oR2 pour la liaison de l’ARN pol.
• Transcription des gènes immédiats (Cro à partir de pR)
• Cro se lie ensuite à oR3 et bloque la transcription de cI à partir de pRM
• La voie lytique est induite