Synthèse protéique et le code génétique I Flashcards

1
Q

Quel est l’équation du taux à l’équilibre de protéines?

A

Taux à l’eq. = taux de synthèse - taux de dégradation

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2
Q

La dégradation de protéines permet de:

A
  • Réguler les concentrations de protéines
  • Pévenir l’accumulation de protéines anormales
  • Contrôler la croissance et le développement
  • S’adapter à son environement (cellule)
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3
Q

Décrit la favorabilité et la spécificité de la réaction de formation de lien peptidique

A
  • Non-favorable énergétiquement: doit être catalysé (ATP requis)
  • Non-spécifique: a lieu entre n’importe quel a.a (mais les protéines ont des séquences en a.a spécifiques)
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4
Q

Quel mécanisme fait la synthèse des protéines?

A

La traduction

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Q

Décrit les trois étapes de la réaction de traduction

A
  1. Codon recognition
  2. Peptide bond formation
  3. Translocation
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6
Q

Qu’est ce que Watson et Crick on suggérer dans leurs papier à propos de la traduction?

A
  • Les a.a sont incorporés dans un ordre prédéterminée par l’ARNm
  • Puisque les a.a ne peuvent pas reconnaître directement les nucléotides de l’ARNm
  • Il doit y exister une molécule adapteur entre les a.a et l’ARNm

Adaptateur = ARNt

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7
Q

Quels sont les fonctions de l’ARNt durant la transcription?

A
  • Molécules adapteur entre l’ARNm et les acides aminés; 2 molécules avec des chimies différentes
  • Spécificité: les a.a sont incorporés dans un ordre prédeterminé par la séquence de l’ARNm qui est lue par les ARNt
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8
Q

Décrit les éléments de structure général de l’ARNt

A
  1. Structure tige boucle: complémentarité des bases pour former la tige et une région simple brin au bout 3’
  2. Bras accepteur = bout de l’ARNt auquel se lie lie groupe OH libre en 3’ de l’ARNt à l’a.a libre
  3. Structure tertiaireL forme d’un L inversé
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9
Q

Quel sont les éléments chimique importants de la structure tige-boucle de l’ARNt?

A
  • Séquence CCA 3’
  • Nucléotides modifiés dans les séctions loupes (régions simple brin)
  • Inositol à la position 5’ du codon
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10
Q

Quels sont les noms des 4 loupes de l’ARNt?

A
  1. D loop
  2. Anti-codon loop
  3. Variable loup
  4. TpsiCG loup
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11
Q

Pourquoi la présence d’un inosine à la position 5’ de l’anti-codon est elle bénifique aux ARNt?

A

Les ponts H formés entre les bases modifiées sont différentes de ceux formés dans la double hélice de Watson-Crick (structure tertiaire de l’ARNt)

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12
Q

Quelles sont les étapes générales du chargement de l’a.a sur l’ARNt?

A
  1. Activation de l’acide aminé. Formation du complexe aminoacyl-AMP
  2. Le complexe aminoacyl-AMP réagit avec l’ARNt pour former un complexe aminoacyl-ARNt
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13
Q

Quelle enzyme catalyse la fomration d’un lien ester entre l’ARNt et l’acide aminé?

A

Aminoacyl-ARNt synthase

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14
Q

L’aminoacyl-ARNt synthase confert quoi à sa réaction?

A

La spécificité

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15
Q

Comment se fait le chargement de l’a.a sur l’ARNt par l’aminoacyl ARNt synthéthase?

A
  1. La cellule contient 1 aminoacyl-ARNt synthase pour chacun des 20 a.a. Cependant plusieurs basctéries comptent moins de 20
  2. Chaque synthase doit reconnaître l’a.a qui correspond à l’anti-codon de l’ARNt et dicté par le code génétique
  3. Chaque a.a est représenté par plus d’un ARNt
  4. L’aminoacyl-ARNt synthétase a 3 sites de liaison
  5. In vitro, la substitution d’un a.a déjà chargé sur un ARNt par un a.a différent et qui ne correpond paas à ‘anti-codon sera incorporé dans la chaine peptidique bien qu’inexacte
  6. Deux classes de synthases: une liant l’a.a directement au groupe OH 3’ du ribosome et l’autre liant le groupe OH 2’ du sucre. Un changement de postion vers 3’ aura lieu en suite
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16
Q

Selon son codon, comment l’aminoacyl-ARNt synthase reconnaît le bon a.a?

A

Chaîne latérale, charge, hydrophobicité et structure

17
Q

Quelles sont les caractéristiques du code génétique?

A
  1. Univoque: chaque codon correspond à un seul a.a
  2. Dégénégé: pour un même a.a, il peut y avoir plus d’un codon
  3. Les 2 premiers nts sont utilisés pour spécifier l’a.a
  4. Les codons ayant des séquences simialires spécifient des a.a chimiquement similaires
18
Q

Un ARNt peut reconnaître plus d’un codon puisque:

A

Les 2 premier nts de tous les codons reconnus par le même ARNt sont identiques alors que le troisième peut varier

19
Q

Est ce qu’il y a un pairage Watson-Crick entre les bases du codon et de l’anti-codon?

A

Pour les 2 premières bases, oui c’est un pairage Watson-Crick

Des pairages non standard peuvent avoir lieu entre la dernière base du codon et la première de l’anti-codon

20
Q

Le pairage wobble est dû à quoi?

A

Plusieurs possibilités de pairage pour l’inosine

21
Q

Est ce que les séquences de nts pour un a.a est constant à travers toutes les espèces?

A

Non, le code génétique n’est pas universel

p. ex. le code génétique mitochondrial est différent du code génétique du reste de l’humain