Transcripción Flashcards
¿la secuencia de nucleótidos importa?
si
La información génica tiene un proceso de expresión
Transcripción–>se forma RNA
Traducción–>se forma una proteína
¿qué determina el orden de los aminoácidos?
determina la diferencia de una proteína y otra (secuencia de aminoácidos)
Los aminoácidos que se forman dependen de
la secuencia específica del RNAm
A su vez, el RNA proviene de
la secuencia de DNA
Si hay un cambio de secuencia en el DNA, entonces puede cambiar
el sentido de la RNA y de la proteína eventualmente
DNA
2 hebras enrrolladas como doble hélice
En la profundidad de la molécula se encuentran las bases nitrogenadas
Los hidrógenos se encuentran en el exterior del DNA
Para que se pueda transcribir el DNA
la hebra tiene que separarse
El DNA se organiza como
nucleosoma junto con las proteínas histonas
Las histonas son
proteínas muy básicas (muchos aminoácidos positivos)–>octámero proteico
Las histonas se están enrrollando con
el DNA
Se ven colas que sobresalen del nucleosoma
(colas de las histonas), son importantes para determinar si el DNA puede transcribirse o no
Cromatina
Modificaciones químicas de las histonas y compactación de la cromatina
La unión más separada es lo primero que determina
si la maquinaria de transcripción se podrá instalar
Si están muy juntas las histonas
entonces la maquinaria no se podrá unir (cromatina trascripcionalmente más inactivas)
La separación está determinada por
las colas de la histona y los distintos grupos que puede incorporar a las colas dependiendo de las modificaciones determinará si las colas son más afines (se juntan) o se repelan (más separadas)
Las modificaciones químicas son transitorias
hay un cambio de estado a otro dependiendo de las distintas enzimas, por lo que puede transitar de colas más juntas o separadas de forma dinámica
RNA
- Tiene uracilo y no timina
- Tiene una ribosa
- Tiene una hebra
Carbono 3’
carbono que se une a fosfato
Carbono 5’
carbono con grupo fosfato
Hay carbonos 5’ y 3’ extremos que corresponden a
carbonos libres
El RNA tiene polaridad
que es importante para la síntesis
El RNA puede adoptar desde estructuras
secundarias hasta terciarias (la RNA se pliega y hay unión por puentes de hidrógeno)
mRNA
RNA mensajero (codificante)
tRNA
RNA de transferencia (no codificante)–>parte de la maquinaria de traducción
rRNA
RNA ribosomal (no codificante)–>parte de la maquinaria de traducción
otros ncRNAs: muy importantes en la regulación de la expresión génica
- Para que haya transcripción, para que ocurra o no la traducción, regulan la vida media del RNAm, etc
RNA polimerasa
Procariontes: 1
Eucariontes: 3
Pol I
rRNA (28s, 18s y 5.8s)
Pol II
mRNA
Pol III
tRNA, 5srRNA y otros RNA pequeños
La separación del DNA es bastante corta
ocurre solo cuando está en contacto con la enzima
El RNA va saliendo por otra parte de la molécula
así el RNA se separe de la hebra complementaria
Las enzimas no solo catalizan la polimerización del RNA, sino que
también determinan el proceso de transcripción (separación del DNA)
Transcripción
Las bases nucleótidos del RNA son complementarias a las bases del DNA en esta región
Esto ocurre en el espacio de la polimerasa
La polimerasa cataliza la ruptura de los fosfatos
provocando así la formación de enlace fosfodiéster
El RNA se va a sintetizar desde 5’—3’
este es el enlace que puede catalizar la enzima (agrega enlaces por 3’)
A partir de la formación de este DNA se va a eliminar
fosfatos inorgánicos
- Cadena crece
antiparalela y complementaria al ADN templado
Cada vez que hay un transcrito, esto va a suceder por
una enzima
Los transcritos de las distintas polimerasas son
iguales
La polimerasa va junto a distintas enzimas que
modifican la disposición del octámero temporalmente para poder realizar la transcripción
Transcripción rRNA y nucleolo-genes repetidos en tándem
Los genes para rRNA están repetidos
(son genes ribosomales), cada repetición de esto genes tienen la misma secuencia
en los genes ribosomales
Cistrón robosomal, gen ribosomal
Espaciador, espacio sin síntesis en el DNA
Nucleolo con misma secuencia de DNA
que se repite muchas veces, sintetizando así rRNA
Se va leyendo de izquierda a derecha (5’—3’)
En el espaciador hay una señal
de inicio y termino de la trascripción que genera los saltos entre transcripciones
Cada vez que se incorpora U, ingresa un
nucleótido marcado
En la periferia del núcleo se ve
cromatina electrodensa
El nucleolo se define como el lugar donde
ocurre mucha transcripción
La polimerasa no sabe dónde comenzar a transcribir
Tiene que buscar señales moleculares
secuencia de nucleótidos
Hay una región con una secuencia determinada que
comienza la trascripción
Lectores de señales
proteínas=factores de transcripción
Entre determinados átomos de proteínas y nucleótidos se establecen
interacciones intermoleculares
La morfología de la proteína le permite de forma muy específica
acercarse a la base que contiene la señal de transcripción
RNAm. Señales de inicio de transcripción
Promotor basal (core promoter) TATA-box
Secuencias promotoras de la transcripción
Están principalmente en la codificación del RNAm
RNA mensajero. Promotor basal-caja TAT-proteína TBP (TATA box binding portein). TFIIs
La proteína se une a la secuencia TATA como
respuesta a la señal molecular
TFIID
por la polimerasa II que sintetiza al RNAm
Inicio de transcripción: Pol I, Pol II, Pol III
Cada polimerasa se une a
distintas secuencias
El conjunto de proteína forma el factor de trascripción
que permite la unión de la polimerasa
La polimerasa llega con otros factores de trascripción que se unen al
complejo proteico (tiene afinidad a estas proteínas que se unen a la caja TATA)
Transcripción
actividad del promotor basal
TFIIH fosforila la cola de la Pol II
generando que comience la lectura del DNA
Esa fosforilación genera que se desprende el complejo proteico de iniciación
pero la polimerasa continúa unida al DNA, con las hebras ya separadas. Una vez la Pol II se separa del complejo de proteínas, entonces avanza por el DNA
TFIIH es una quinasa
está abre inicialmente la hebra de DNA (helicasa)
Una vez las hebras están separadas
la Pol II pone “un dedo” y esta continúa abriendo el DNA mientras avanza
Hay una trascripción aumentada que es dada por
otras secuencias
