Traducción II Flashcards
qué encontramos en 3’ y 5’
la cola de poli A en 3’ y el capuchón en 5’
Entre ambos extremos hay una proteína que actúa como puente entre
la cola de poli A y el capuchón
subunidad menor del ribosoma con un metionil tRNA
este es uno particular, ya que se llama metionil tRNA de inicio. Este metionil se puede unir al hemisitio P
factores de inicio de la traducción
que permiten que a la zona 5’ se una la subunidad ribosomal menor con el metionil tRNA de inicio y el factor de traducción de inicio
Luego de la unión al extremo 5’ de la subunidad ribosomal menor, hay una serie de
cambios conformacionales y comienza el escaneo, donde la subunidad ribosomal menor se desplaza sobre el mensajero de 5’—3’
Entre la subunidad ribosomal y los factores de inicio de traducción
no se esta traduciendo ninguna proteína
Se muestra que la subunidad ribosomal menor se detuvo en la zona en la que en el piso del hemisitio P aparece el triplete
AUG (codón de inicio)
en el momento en el que se encuentra AUG
queda establecido, la subunidad ribosomal menor se detiene porque el metionil tRNA tiene una secuencia en su anticodón que es complementario con la secuencia AUG en el hemisitio P
Cuando la subunidad menor queda detenida en el AUG, se produce un cambio conformacional en la subunidad menor
se liberan varios factores que estaban unidos a ellas, y estaban bloqueando la unión de la subunidad mayor, por lo que al detenerse en el AUG se liberan los factores de traducción y luego se puede unir la subunidad ribosomal mayo. Ahora se conforma el ribosoma completo
El ribosoma está completo con ambas subunidades unidas solo
cuando se encuentra en proceso de traducción
Los ribosomas que no están traduciendo
no los encontraremos unidos
Con la subunidad ribosomal mayor vemos el codón siguiente y los 2 nucleótidos que continúan en el mensajero
encuentran en el suelo del sitio A se une un aminoacil tRNA, se forma el enlace peptídico, y se desplaza el ribosoma sobre el mRNA, de tal manera que el peptidil tRNA queda en el sitio P
En el sitio E queda el tRNA que ya no tiene aminoácido unido
hay un nuevo codón, el triplete siguiente, que se expone en el piso del sito A
Esta secuencia de traducción se mantiene hasta que aparece 1 de 3 codones para los cuales no existe un
tRNA que tenga un anticodón complementario. Estos se denominan codones de término
Cuando cualquiera de estos 3 codones aparece en el sitio A
aparecen factores proteicos denominados factores de liberación.
Cuando estos factores se unen ahí, entonces la misma peptidil transferasa corta el último aminoácido que está unido al tRNA
con lo cual se libera el péptido y se desensambla todo el complejo
Este término no ocurre en el último nucleótido del tRNA
tampoco ocurre en la cola de poli A, sino que ocurre en un sitio más interno dentro del mRNA, es decir, quedan nucleótidos sin traducir en el mRNA
Código genético
Es universal, todos los seres vivos lo compartimos, también el cómo se leen las secuencias de codones
Para algunos aminoácidos, hay múltiples codones que codifican para ellos
(ejemplo, leucina tiene 6 codones que la traducen)código redundante
Universal:
conservado evolutivamente. Origen común de todos los seres vivos
Redundante
diferentes codones para un mismo aminoácido. Esto NO significa que no sea específico!–>sabemos por la secuencia de nucleótidos qué aminoácido obtendremos, pero del aminoácido no podemos saber con certeza de qué secuencia proviene (por lo que es específico)
Una de las estructuras del mRNA está en el extremo 5’ (capuchón), luego continua una región que denominamos 5’UTR (untranslated, no traducida)
luego de identificar el codón de inicio se continua con la secuencia codificante, luego se identifica el codón de término continuándose con una región 3’UTR, y luego se identifica la cola de poli A
La función de las regiones no traducidas (5’ y 3’ UTR) contienen señales relacionadas con la vida media del mRNA
también tiene que ver con si se traduce o no se traduce el mRNA. Por lo que puede suceder que hay una gran cantidad de mRNA en el citoplasma, pero que el mRNA no se está traduciendo, por lo que no se está sintetizando la proteína
También hay señales que permiten la unión del mRNA con proteínas que
se desplazan por el citoesqueleto, por lo que en RNA se puede localizar en lugares específicos dentro de la célula (destinación subcelular)
En la región 3’ hay señales a las que se unen, en este caso, una proteína, pero a esas señales se pueden unir RNA pequeños (micro RNAs), y estos impactar en varios elementos
. Uno impide la unión de factores de inicio de la traducción, por lo que, estando el mRNA en el citosol, no se traduce. Se puede afectar al mRNA a través de la inhibición de la unión de la subunidad ribosomal mayor, por lo que, aunque esté unida la menor, no progresa la traducción
Los microRNAs pueden influir en la vida media del mensajero. Estas proteínas reclutan enzimas que acortan la cola de poli A
ejemplo de una secuencia dentro del 3’ UTR que puede actuar sobre la traducción, sobre el inicio o sobre la elongación de la traducción, y también sobre la vida media del mRNA
Modificaciones químicas como fosforilaciones que regulan la
actividad de una proteína
Cuando la síntesis de la proteína se completa, hay proteínas que
se quedan en el citosol, como las proteínas del citoesqueleto
Otras proteínas que tienen señal de localización nuclear son reconocidas por
importina y se dirigen al núcleo de la célula
Otras tienen señales que las llevan a la mitocondria, la cual sintetiza algunas de
sus propias proteínas, pero muchas otras llegan desde el citosol (tienen otras secuencias nucleotídicas que la destinan a distintos compartimientos subcelulares)
En el caso de destinarse al RER, la proteína no completa su síntesis en el citosol, sino que apenas comienza a ser sintetizada, se dirige a las membranas del RER gracias a que presenta una señal
. En este caso su síntesis se detiene cuando se está sintetizando en el citosol, apenas aparezca la señal de localización. Luego, el ribosoma se transloca a las membranas de retículo
Desde el RER, continúan al Golgi, luego
como gránulos de secreción, y vesículas que exocitan a las proteínas o hacen que estas permanezcan en la membrana
Las proteínas también pueden dirigirse a los cloroplastos, y son proteínas que completan su
síntesis en el citosol van a cloroplastos cuando tienen la secuencia señal que así lo indica
De todas las proteínas que completan su síntesis en el citosol, algunas permanecen ahí y otras
se dirigen a núcleo, mitocondria, cloroplastos, etc.
mientras que hay otras que comienzan su síntesis en el citosol, y poseen una señal que las detiene
y las desplaza hacia el RER para reanudar la traducción para continuar la vía exocítica
Cuando se habla de mutaciones nos referimos a
cambios en el DNA
En el caso de la anemia falciforme, hay una mutación en la secuencia que codifica para
la hemoglobina beta. Este gen de hemoglobina beta se ubica en el cromosoma 11 en su brazo pequeño
Observamos en la mutación que se modifica solo un nucleótido
el efecto de esto en la proteína es que cambia el aminoácido glutámico por el aminoácido valina
Hemoglobina es proteína con estructura cuaternaria
tiene 2 subunidades alfa y 2 beta. Es la proteína que transporta el oxígeno en el glóbulo rojo
Valina es un aminoácido con características hidrofóbicas
mientras que el aminoácido glutámico tiene carga, es decir, hidrofílico
La región de la subunidad beta tiende a asociarse con
otras regiones hidrofóbicas, dado que se encuentra en el citoplasma del glóbulo rojo en un medio hidrofílico
Distintos tetrámeros de hemoglobina tienden a
asociarse unos con otros formando así una proteína filamentosa, que es la que explica esta forma alterada del glóbulo rojo
El glóbulo rojo anémico tiene una vida media mucho más corta
(normalmente 120 días, anémico de 10-20 días), este glóbulo rojo alterado es mucho más frágil y se altera de forma más fácil
mutación puntual en la que cambia un nucleótido
esto provoca un cambio en un aminoácido, es decir, cambia el sentido del código
Mutación puntual-sustitución
Silenciosa
Cambia un nucleótido a nivel de mRNA, pero ambos codones codifican para
el mismo aminoácido
mutación puntual que cambia un nucleótido, resultando en un codón de término
por lo que se cambia un aminoácido por un codón de término (proteína truincada)
En estas mutaciones no se modifica el código genético, sino que
el genoma cambia
No hay un cambio de un nucleótido por otro, sino que se agrega o se elimina
un nucleótido en el mRNA
Estas mutaciones de inserción/deleción pueden ser graves, ya que
modifican todos los aminoácidos que prosiguen a la mutación
