traducción I Flashcards
Regulación de la expresión génica por un estímulo externo
ligando
La protrusión que se observa en el receptor por la unión del ligando muestra
el cambio conformacional de este receptor
De igual forma, la proteína azul gana afinidad por
el receptor y así sucesivamente (la proteína está activa y activa a otras, etc)
La señalización es parte de las estructuras de las proteínas
(no es un agregado postraduccional), por lo que cuando hace un cambio conformacional esta señalización queda expuesta y puede interactúa con otras proteínas como importina
La proteína verde incidió sobre un factor de transcripción
por lo cual comienza a trascribir este gen y cambia su conformación para unirse al gen
- La célula modifica la expresión de sus genes ante
estímulos externos en ella
se sintetizan nuevas proteínas que va a implicar
una función determinada que la célula tiene que cumplir
- Las proteínas que activan o reprimen la expresión de los genes
se sintetiza en el citoplasma, pero ejercen su función en el núcleo
RNAm. Señales de inicio de transcripción
Promotores, enhancer y factores de transcripción
Promotor basal
caja TATA
Enhancer unen otros factores de transcripción
estos últimos se unen al promotor basal
Enhancer son
potenciadores
Hay otras secuencias que son
silenciadoras
Tanto enhancer como silenciadores serán genes que inciden sobre
el promotor basal, estos realizan su efecto a través de la proteína factor de transcripción y de esta forma puede llegar el cambio desde le gen hasta el promotor basal
Los factores de transcripción son comunes para
todos los genes que codifican proteína (TFIIH)
Si se inactiva TBP
entonces se para todos los genes que codifican con TBP
Los potenciadores o silenciadores son muy específicos
se unen a factores específicos de transcripción y se ubican más lejanos al promotor basal
Transcripción
actividad del promotor basal y del enhancer
Todas las células tienen los mismos enhancer e inhibidores, sin embargo
hay diferencia es su expresión por la presencia o ausencia de determinadas proteínas que desencadenan un cambio en la transcripción
En los enhancer se unen
distintas proteínas
Las proteínas estimulan
distintos genes
Las proteínas que se unen al gen se denominan
factores de transcripción–>potenciadores o silenciadores
Factores de transcripción
unión al promotor basal y que afecta su actividad
Enhancer/potenciador
factores de trascripción que pueden aumentar el reclutamiento de Pol II
factores de transcripción también pueden incentivar la desfosforilación
de la cola de Pol II, estas proteínas ayudan a llamar factores que cambian la conformación de la Pol II y genera una pausa en la transcripción
Pueden incorporarse proteínas que bloquean la
unión de los factores de transcripción basales (inhibidor)
Como los potenciadores pueden estar físicamente cerca del
promotor basal, esto tiene que ver con el plegamiento de la proteína
Se generan acumulación de bucles que permite la relación cercana entre
el promotor basal y el enhancer
La cromatina tiene que estar más descompactada para
la unión de los complejos de transcripción
Estos bucles pueden estar
descondensados o muy compactos
Recordar proteínas lámina se asocia a
la cromatina
Recordar proteínas lámina se asocia a
la cromatina
Hay TADs asociados a la periferia del nucleolo
donde hay cromatina muy compactada por lo que no estará expresando
Los TADs que estén asociados a proteínas láminas (la cual atrae a la maquinaria enzimática que produce la modificación postraduccional a las histonas
modificaciones que permiten que las colas de la histona se asocien en sí), por esto, la cromatina que se ve en la periferia se encuentra bastante compacta y por ende, menos activa transcripcionalmente
Los TADs pueden modificar su compactación (es dinámico)
Cuando hay mutación en las proteínas lámina, se genera la progeria
En esta enfermedad hay un cambio radical en la expresión de genes
Procesamiento de mRNAs
- Aplicación de capuchón (cap) en extremo 5’
capuchón es un nucleótido derivado de
guanina y se agrega al primer nucleótido del RNA
este capuchon es incorporada por
distintas enzimas (no Pol II). Se genera un enlace 5’—5’, esta modificación protege y estabiliza al RNA y es importante para la maquinaria de traducción
Señales splicing
- Remoción de intrones
Remoción de algunas secuencias en el DNA
Esto ocurre varias veces y funciona por señales nucleotídicas que se encuentran en el RNA
Las secuencias que se mantienen en el RNA
se denominan exones e intrones se eliminan de la secuencia (se ha encontrado que los intrones se asocian a regulación)
Alteraciones del Splicing
Mutaciones que cambian un sitio de reconocimiento del spliceosoma pueden generar proteínas no funcionales y esto puede ser la base molecular de enfermedades
- Poliadenilación
(cola Poli A) en extremo 3’
Si hay una secuencia específica que este complejo proteico cortará el RNA
mientras que una polimerasa incluirá una poli A (esto ocurre 250-300 veces)
El RNA queda con una cola de A
esta cola no es traducida
Vemos acá que la polimerasa está por hacer una pausa, ante esto
el XRN2 elimina la secuencia restante de RNA y así genera una inestabilidad de la polimerasa II y genera el desprendimiento del complejo y el RNA
El corte se produce por una enzima que se encuentra en el complejo proteico
eso lo hace al detectar la Poli A
En el extremo 3’ del RNA hay un
capuchón
luego del Procesamiento de mRNAs
El RNAm sale unido a varias proteínas
Regulación de la vida medial del mRNA
Vida media
Degradación por RNAsas precio decap, deadenilación o acción endonucleasa
Nivel postrascripcional
- Splicing alternativo
- polyA alternativo
- vida media del RNA
el splicing puede ser intertranscripcional y ocurre a nivel
nuclear
Traducción
Ribosomas tienen subunidad mayor y menor
Los tríos de nucleótidos que codifican para una proteína se denomina codones y estos se leen en el ribosoma
Debía haber una molécula que uniera el aminoácido con el codon particular
Adaptador: tRNA
tRNA son moléculas
cortas, trascritos por pol III y tiene estructura terciaria
El extremo 3’ y el anticodón
Los anticodones interactúan con los codones del
RNAm
Se pueden organizar en una T invertida como estructura 3°
Los tRNA también son procesados
a estos siempre se les agrega el triplete CCA
tRNA + aminoácido = aminoacil tRNA
enzima que modifica al tRNA en 3’, esta enzima cataliza un enlace covalente entre un aminoácido
un tRNA con un anticodón específico
, por esto mismo hay una gran familia de aminoacil tRNA
hay interacciones intermoleculares entre la enzima y el
tRNA
La enzima que une aminoácido necesita ATP
queda con AMP, y ahí se une el aminoácido, por lo que la enzima transfiere AMP al aminoácido y ahí puede unirse al tRNA (lo activa)
La síntesis de proteínas requiere
ATP por esta razón
Los tRNA tiene un
anticodón en particular
Los tRNA con distintos anticodones se unen con
distintos aminoácidos, de esta forma se cumple la función de adaptador
La especificidad de las enzimas tanto para un aminoácido como para un tRNA da las
bases del código genético
¿cuántos sitios tiene un ribosoma?
3 sitios
En P y A se formará un
enlace covalente que unirá a los aminoácidos (enlace peptídico)
Así se libera el primer aminoácido
peptidil tRNA se forma por
el desprendimiento del aminoácido anterior
El tRNA que es liberado se puede
reutilizar, siendo cargado nuevamente con un aminoácido
Peptidil transferasa es una actividad catalítica que
se da en la subunidad mayor (primera actividad catalítica no gatillada por proteína, sino que por tRNA)
