Trafic Intracellulaire des macromolécules et des glycoprotéines

Question 1

Où se fait la synthèse des protéines?

Answer 1

Cytosol, quelques-unes dans la mitochondrie

Question 2

A quels organites les protéines peuvent-elles être adressées?

Answer 2

• RE
• Motichondrie
• Peroxysome
• Noyau

Question 3

Quelles potéines ne peuvent pas revenir au cytosol?

Answer 3

Toutes sauf celles du noyau (RE, peroxysome, Mitochondrie)

Question 4

Quels sont les trois modes de transport des protéines vers les compartiments de la cellule?

Answer 4

• A travers les pores nucléaires
• Translocation à travers la membrane
• Par une vésicule

Question 5

Quels transports peuvent être effectués par les pores nucléaires?

Answer 5

Cytosol ←→ Noyau (signal non-clivé)

Question 6

Quels tranports peuvent être effectués par translocation à travers la membrane?

Answer 6

Cytosol → Mitochondrie (clivé)
Cytosol → Peroxysome
Cytosol → RE
(Topologie différente)

Question 7

Quels transports peuvent être effectués par une vésicule?

Answer 7

RE → Golgi → Lysosomes, Endosomes, Vésicules de sécrétion, Surface cellulaire
(Topologie équivalente)

Question 8

Quel est le rôle du signal de tri/Séquence signal/Signal d’adressage?

Answer 8

Aide les protéines à s’adresser à leurs compartiments

Question 9

Les deux caractéristiques du signal de tri/Séquence signal/Signal d’adressage?

Answer 9

■ Nécessaires (Si on l’enlève, prot pas adressée à son comp.)
■ Suffisants (En l’ajoutant, la prot est adressée)

Question 10

Les deux mécanismes principaux de modulation de la séquence signal?

Answer 10

■ Par interaction protéine-protéine

■ Par modification post-traductionenelle

Question 11

Que permet la modulation par interaction protéine-protéine?

Answer 11

Masquer la séquence-signal par une prot à proximité

Question 12

Un exemple de modulation par interaction protéine-protéine?

Answer 12

Les récepteurs nucléaires: facteurs de transcription régulés par fixation d’un ligand

Question 13

Où se déroulent les modulations par modification post-traductionnelle?

Answer 13

Dans le peptide signal ou à proximité

Question 14

Un exemple de modulation par modification post-traductionnelle?

Answer 14

Phosphrylation des sérines ou des théronines:

• Par des kinases, apport de charges (-)
• ↑ ou ↓ reconnaissance d peptide signal par son récepteur
• Réversible par déphosporylation via phosphatases

Question 15

Les deux types de signaux de tri/séquence signal.signaux d’adressage?

Answer 15

♪ Peptide

♪ Patch de signal

Question 16

Où trouve-t-on le peptide de signal?

Answer 16

Extrémité NH2- terminale ou COOH terminale

Question 17

Définition d’un patch de signal?

Answer 17

Ensemble d’AA qui se trouvent à un endroit donné suite au repliement de la protéine, n’existe plus quand la protéine est dépliée

Question 18

pourquoi le repliement des protéines est-il important?

Answer 18

Un repliement correct permet à la protéine d’être fonctionnelle

Question 19

Les différents mécanismes de repleiement de la protéine?

Answer 19

♠ Liaison non covalente (avec cofacteurs)
♠ Modifications covalentes (glycosylation, phosphorylation)
♠ Association non covalente avec d’autres protéines

Question 20

Comment la protéine gère-t-elle ses AA hydrophobes?

Answer 20

Elles les enfouit au sein de sa structure tridimentionnelle au fur et à mesure de sa synthèse

Question 21

Quel critère détermine la conformation finale de la protéine?

Answer 21

Le niveau d’énergie, qui doit être favorable

Question 22

A quoi servent les chaperons moléculaires?

Answer 22

A faciliter le repliement des protéines (souvent indispensables)

Question 23

Comment a-t-on mis en évidence/découvert les chaperons moléculaires?

Answer 23

♠ Observations de production +++ en T° anormalement élevées

♠ Mise en évidence + détermination poids moléculaire par électrophorèse

Question 24

Quelle est la nomenclature des chaperons moléculaires?

Answer 24

HSP + poids en kilodaltons car les CM sont des protéines de choc thermique

Question 25

Comment les chaperons moléculaires aident-t-ils les protéines à bien se replier?

Answer 25

En se liant de façon non covalent aux résidus hydrophobes exposés

Question 26

Que permet l’action des chaperons moléculaires, au niveau moléculaire?

Answer 26

A) D’empêcher l’agrégation des prots entre elles

B) Pour leur donner le temps d’adopter la bonne conformation

Question 27

Que se passe-t-il si le schaperons moléculaires ne sont pas efficaces, ou s’ils prennent trop de temps?

Answer 27

les prots mal conformées sont dirigées vers la voie de protéolyse par le protéasome

Question 28

Comment fonctionne l’HSP70?

Answer 28

1) Se lie aux résidus hydrophobes émergeant lors de la synthèse par le ribosome
2) ATP apporte l’énergie pour que la prot se replie
3) HSP 70 relarguée pour être réutilisée

Question 29

Comment fonctionne l’HSP60, ou chaperonine?

Answer 29

→ Sur prots complètements synthétisées only
→ En tonneau: la prot entre, l’ATP forme un couvercle, la prot est correctement repliée à l’intérieur du tonneau puis libérée avce l’hydrolyse de l’ATP

Question 30

Où trouve-t-on es chaperons moléculaires?

Answer 30

♪ Cytosol
♪ Mitochondrie
♪ RE

Question 31

Quelles maladies peuvent être engendrées par une agrégation des potéines découlant d’une exposition des parties hyrophobes?

Answer 31

○ Alzheimer

○ Maladies à prions

Question 32

Définition du protéasome

Answer 32

Système de dégradation des protéines qui n’acquièrent pas leur conformation correcte

Question 33

Le protéasome est-il un organite? pourquoi?

Answer 33

Non, car il n’a pas de membrane

Question 34

Avec quoi peut-on observer un protéasome?

Answer 34

MET

Question 35

Où trouve-t-on des protéasomes?

Answer 35

○ Cytosol

○ Noyau

Question 36

Quelle est l’abondance des protéasomes?

Answer 36

++: env. 1% des protéines totales de la cellule

Question 37

De quand date la découverte des protéasomes?

Answer 37

env. 1980,après les lysosomes

Question 38

Un inhibiteur du protéasome et son utilisation médicale?

Answer 38

Le BORTEZOMIB, pour le traitement du myélome multiple des os

Question 39

Forme du protéasome?

Answer 39

Un cylindre creux central et 2 coiffes

Question 40

Où sont les sites actifs du protéasome?

Answer 40

Font face à sa chambre interne

Question 41

Quelles sont les 3 activités du site actif du protéasome?

Answer 41

• Trypsine
• Chymotrypsine
• Caspase

Question 42

Que permettent les coiffes du protéasome?

Answer 42

La reconnaissance des protéines à dégrader

Question 43

Comment la protéine adressée au protéasome est-elle marquée?

Answer 43

Elle est poly-ubiquitinylée (=porte une chaîne de poly-ubiquitines)

Question 44

Poids et nombre d’AA de l’ubiquitine?

Answer 44

76 AA, env. 8kDa, a un coeur globulaire hydrophobe

Question 45

Décrire le mécanisme de l’ubiquitinylation?

Answer 45

1) Ubiquitine activée par liaison avec enzyme E1
2) E1 transfère son ubiquitine à E2
3) Formation complexe E2/E3:
- reconnaissance de la prot à dégrader
- Transfert de l’ubiquitine: de sa C-terminale à une lysine de la prot
- D’autres E1 transfèrent leur ubiquitine → formation de la chaîne d’ubiquitine

Question 46

Quel est le signal de dégradation de la protéine?

Answer 46

Un acide aminé N-terminal déstabilisant (genre Arg à la place de Met)

Question 47

Les étapes de dégradation par le protéasome?

Answer 47

a) reconnaissance de la prot poly-ubiquitinylée par la coiffe
b) Libération de l’ubiquitine intacte et recyclée (pas dégradée)
c) Dégradation de la prot dans la zone protéolytique: dégradée en peptides eux-mêmes dégradés en AA dans le cytosol

Question 48

Que nécessitent la translocation de la prot et le relargage de l’ubiquitine?

Answer 48

L’énergie de l’hydrolyse de l’ATP