Trafic Intracellulaire des macromolécules et des glycoprotéines Flashcards
Où se fait la synthèse des protéines?
Cytosol, quelques-unes dans la mitochondrie
A quels organites les protéines peuvent-elles être adressées?
- RE
- Motichondrie
- Peroxysome
- Noyau
Quelles potéines ne peuvent pas revenir au cytosol?
Toutes sauf celles du noyau (RE, peroxysome, Mitochondrie)
Quels sont les trois modes de transport des protéines vers les compartiments de la cellule?
- A travers les pores nucléaires
- Translocation à travers la membrane
- Par une vésicule
Quels transports peuvent être effectués par les pores nucléaires?
Cytosol ←→ Noyau (signal non-clivé)
Quels tranports peuvent être effectués par translocation à travers la membrane?
Cytosol → Mitochondrie (clivé)
Cytosol → Peroxysome
Cytosol → RE
(Topologie différente)
Quels transports peuvent être effectués par une vésicule?
RE → Golgi → Lysosomes, Endosomes, Vésicules de sécrétion, Surface cellulaire
(Topologie équivalente)
Quel est le rôle du signal de tri/Séquence signal/Signal d’adressage?
Aide les protéines à s’adresser à leurs compartiments
Les deux caractéristiques du signal de tri/Séquence signal/Signal d’adressage?
■ Nécessaires (Si on l’enlève, prot pas adressée à son comp.)
■ Suffisants (En l’ajoutant, la prot est adressée)
Les deux mécanismes principaux de modulation de la séquence signal?
■ Par interaction protéine-protéine
■ Par modification post-traductionenelle
Que permet la modulation par interaction protéine-protéine?
Masquer la séquence-signal par une prot à proximité
Un exemple de modulation par interaction protéine-protéine?
Les récepteurs nucléaires: facteurs de transcription régulés par fixation d’un ligand
Où se déroulent les modulations par modification post-traductionnelle?
Dans le peptide signal ou à proximité
Un exemple de modulation par modification post-traductionnelle?
Phosphrylation des sérines ou des théronines:
- Par des kinases, apport de charges (-)
- ↑ ou ↓ reconnaissance d peptide signal par son récepteur
- Réversible par déphosporylation via phosphatases
Les deux types de signaux de tri/séquence signal.signaux d’adressage?
♪ Peptide
♪ Patch de signal
Où trouve-t-on le peptide de signal?
Extrémité NH2- terminale ou COOH terminale
Définition d’un patch de signal?
Ensemble d’AA qui se trouvent à un endroit donné suite au repliement de la protéine, n’existe plus quand la protéine est dépliée
pourquoi le repliement des protéines est-il important?
Un repliement correct permet à la protéine d’être fonctionnelle
Les différents mécanismes de repleiement de la protéine?
♠ Liaison non covalente (avec cofacteurs)
♠ Modifications covalentes (glycosylation, phosphorylation)
♠ Association non covalente avec d’autres protéines
Comment la protéine gère-t-elle ses AA hydrophobes?
Elles les enfouit au sein de sa structure tridimentionnelle au fur et à mesure de sa synthèse
Quel critère détermine la conformation finale de la protéine?
Le niveau d’énergie, qui doit être favorable
A quoi servent les chaperons moléculaires?
A faciliter le repliement des protéines (souvent indispensables)
Comment a-t-on mis en évidence/découvert les chaperons moléculaires?
♠ Observations de production +++ en T° anormalement élevées
♠ Mise en évidence + détermination poids moléculaire par électrophorèse
Quelle est la nomenclature des chaperons moléculaires?
HSP + poids en kilodaltons car les CM sont des protéines de choc thermique
Comment les chaperons moléculaires aident-t-ils les protéines à bien se replier?
En se liant de façon non covalent aux résidus hydrophobes exposés
Que permet l’action des chaperons moléculaires, au niveau moléculaire?
A) D’empêcher l’agrégation des prots entre elles
B) Pour leur donner le temps d’adopter la bonne conformation
Que se passe-t-il si le schaperons moléculaires ne sont pas efficaces, ou s’ils prennent trop de temps?
les prots mal conformées sont dirigées vers la voie de protéolyse par le protéasome
Comment fonctionne l’HSP70?
1) Se lie aux résidus hydrophobes émergeant lors de la synthèse par le ribosome
2) ATP apporte l’énergie pour que la prot se replie
3) HSP 70 relarguée pour être réutilisée
Comment fonctionne l’HSP60, ou chaperonine?
→ Sur prots complètements synthétisées only
→ En tonneau: la prot entre, l’ATP forme un couvercle, la prot est correctement repliée à l’intérieur du tonneau puis libérée avce l’hydrolyse de l’ATP
Où trouve-t-on es chaperons moléculaires?
♪ Cytosol
♪ Mitochondrie
♪ RE
Quelles maladies peuvent être engendrées par une agrégation des potéines découlant d’une exposition des parties hyrophobes?
○ Alzheimer
○ Maladies à prions
Définition du protéasome
Système de dégradation des protéines qui n’acquièrent pas leur conformation correcte
Le protéasome est-il un organite? pourquoi?
Non, car il n’a pas de membrane
Avec quoi peut-on observer un protéasome?
MET
Où trouve-t-on des protéasomes?
○ Cytosol
○ Noyau
Quelle est l’abondance des protéasomes?
++: env. 1% des protéines totales de la cellule
De quand date la découverte des protéasomes?
env. 1980,après les lysosomes
Un inhibiteur du protéasome et son utilisation médicale?
Le BORTEZOMIB, pour le traitement du myélome multiple des os
Forme du protéasome?
Un cylindre creux central et 2 coiffes
Où sont les sites actifs du protéasome?
Font face à sa chambre interne
Quelles sont les 3 activités du site actif du protéasome?
- Trypsine
- Chymotrypsine
- Caspase
Que permettent les coiffes du protéasome?
La reconnaissance des protéines à dégrader
Comment la protéine adressée au protéasome est-elle marquée?
Elle est poly-ubiquitinylée (=porte une chaîne de poly-ubiquitines)
Poids et nombre d’AA de l’ubiquitine?
76 AA, env. 8kDa, a un coeur globulaire hydrophobe
Décrire le mécanisme de l’ubiquitinylation?
1) Ubiquitine activée par liaison avec enzyme E1
2) E1 transfère son ubiquitine à E2
3) Formation complexe E2/E3:
- reconnaissance de la prot à dégrader
- Transfert de l’ubiquitine: de sa C-terminale à une lysine de la prot
- D’autres E1 transfèrent leur ubiquitine → formation de la chaîne d’ubiquitine
Quel est le signal de dégradation de la protéine?
Un acide aminé N-terminal déstabilisant (genre Arg à la place de Met)
Les étapes de dégradation par le protéasome?
a) reconnaissance de la prot poly-ubiquitinylée par la coiffe
b) Libération de l’ubiquitine intacte et recyclée (pas dégradée)
c) Dégradation de la prot dans la zone protéolytique: dégradée en peptides eux-mêmes dégradés en AA dans le cytosol
Que nécessitent la translocation de la prot et le relargage de l’ubiquitine?
L’énergie de l’hydrolyse de l’ATP
